FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1909, 1271 aa
1>>>pF1KA1909 1271 - 1271 aa - 1271 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6259+/- 0.001; mu= 8.7828+/- 0.061
mean_var=197.5471+/-39.797, 0's: 0 Z-trim(111.9): 53 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.091251
statistics sampled from 12715 (12762) to 12715 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.727), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16
Scan time: 6.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34124.1 PLEKHG4B gene_id:153478|Hs108|chr5 (1271) 8578 1142.8 0
CCDS45512.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16 (1110) 1380 195.2 8.1e-49
CCDS32466.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16 (1191) 1380 195.2 8.6e-49
CCDS32041.1 ARHGEF40 gene_id:55701|Hs108|chr14 (1519) 903 132.5 8.4e-30
CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5 (3097) 715 107.9 4.1e-22
CCDS82829.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1654) 675 102.5 9.7e-21
CCDS3027.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1663) 675 102.5 9.7e-21
CCDS8947.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12 ( 580) 664 100.7 1.2e-20
CCDS44931.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12 ( 619) 664 100.7 1.2e-20
CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1289) 640 97.8 1.9e-19
CCDS33467.1 KIAA1755 gene_id:85449|Hs108|chr20 (1200) 607 93.4 3.7e-18
CCDS81782.1 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 ( 984) 490 78.0 1.4e-13
CCDS9527.3 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 (1123) 490 78.0 1.5e-13
CCDS45070.2 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 (1125) 490 78.0 1.5e-13
CCDS55514.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 821) 462 74.2 1.5e-12
CCDS55515.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 860) 462 74.2 1.6e-12
CCDS14667.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 925) 462 74.3 1.7e-12
CCDS55516.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 941) 462 74.3 1.7e-12
CCDS48175.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 985) 462 74.3 1.8e-12
CCDS55517.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX (1001) 462 74.3 1.8e-12
>>CCDS34124.1 PLEKHG4B gene_id:153478|Hs108|chr5 (1271 aa)
initn: 8578 init1: 8578 opt: 8578 Z-score: 6110.3 bits: 1142.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8578; 99.7% identity (99.8% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEALRNPMPLGSSEEALGDLACSSLTGASRDLGTGAVASGTQEETSGPRGDPQQTPSLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEALRNPMPLGSSEEALGDLACSSLTGASRDLGTGAVASGTQEETSGPRGDPQQTPSLEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ERHTPSRTGPGAAGRTLPRRSRSWERAPRSSRGAQAAACHTSHHSAGSRPGGHLGGQAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERHTPSRTGPGAAGRTLPRRSRSWERAPRSSRGAQAAACHTSHHSAGSRPGGHLGGQAVG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 TPNCVPVEGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGSLHCHNPSGPSDVPARQPHPEQEGWPPGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPNCVPVEGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGSLHCHNPSGPSDVPARQPHPEQEGWPPGTG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DFPSQVPKQVLDVSQELLQSGVVTLPGTRDRHGRAVVQVRTRSLLWTREHSSCAELTRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DFPSQVPKQVLDVSQELLQSGVVTLPGTRDRHGRAVVQVRTRSLLWTREHSSCAELTRLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LYFHSIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPAAPAVSQALSGLQNNTSPIIHSILLLVDKESAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LYFHSIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPAAPAVSQALSGLQNNTSPIIHSILLLVDKESAFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 PDKDAIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGSFPYSHGDWICFRQRLEHFAANCEEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PDKDAIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGSFPYSHGDWICFRQRLEHFAANCEEAI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 IFLQNSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMKLVLEDPLLVSLRLEGGTVLARLRREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IFLQNSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMKLVLEDPLLVSLRLEGGTVLARLRREE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LGTEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNRLQQLEHLRELASLLEGNDQQSCQKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGTEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNRLQQLEHLRELASLLEGNDQQSCQKGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 QLAKENPQRTEEMVQDFRRGLSAVVSQAECREGELARWTRSSELCETVSSWMGPLDPEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QLAKENPQRTEEMVQDFRRGLSAVVSQAECREGELARWTRSSELCETVSSWMGPLDPEAC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PSSPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGAGVAVLKPHALGKPWASQQDLWLQYPQTRLRLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSSPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGAGVAVLKPHALGKPWASQQDLWLQYPQTRLRLEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQ
:::::::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLCGQDGETLRPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 KKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 PQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 KPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 GQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYLR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 HVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS34 HVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRRKSQD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 TYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 AVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSS
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVISDRAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 SQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELETGTQAAVCEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELETGTQAAVCEGA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KA1 PAVLLSRTRQA
:::::::::::
CCDS34 PAVLLSRTRQA
1270
>>CCDS45512.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16 (1110 aa)
initn: 1949 init1: 668 opt: 1380 Z-score: 989.9 bits: 195.2 E(32554): 8.1e-49
Smith-Waterman score: 1920; 36.6% identity (60.7% similar) in 1142 aa overlap (152-1256:41-1070)
130 140 150 160 170
pF1KA1 PNCVPVEGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGSLHCHNPSGPSDVPARQPHPEQ-EGWP----
.: ..: :: :: . :. .: :
CCDS45 SPDSQGHATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDP-GPPRPPAGATQDEELQGSPLSRK
20 30 40 50 60
180 190 200 210
pF1KA1 ---PGTGDFPSQVPKQVLDVSQELLQ----SGVVTL--P---------GTRDRHGRAVVQ
: ..: ... . ... :. : . ::: .: : :::: .::::.
CCDS45 FQLPPAADESGDAQRGTVESSSVLSEGPGPSGVESLLCPMSSHLSLAQGTRDVQGRAVLL
70 80 90 100 110 120
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 VRTRSLLWTREHSSCAELTRLLLYFHSIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPAAPAVSQALSGL
. ..: : . . : :: :::::..:::: ::. :::.:::::: . .. ..:: :
CCDS45 LCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLRSIPRPEVQALGLTVLVDARICAPSSSLFSGLSQL
130 140 150 160 170 180
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 QNNTSPIIHSILLLVDKESAFRPDKDAIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGSFPYS
:. . ....::. :.. . . .: : . : ... . . : ..: :..::
CCDS45 QEAAPGAVYQVLLV---GSTLLKEVPSGLQLEQLPS-QSLLTHIPTAGLPTSLGGGLPYC
190 200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 HGDWICFRQRLEHFAANCEEAIIFLQNSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMKLVLE
: :. ::.::: . ::. : .::... :... : ::..:..: :..:. ::.
CCDS45 HQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQGAIESVKAVPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLD
250 260 270 280 290 300
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 DPLLVSLRLEGGTVLARLRRE--ELG-TEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNRL
.: :. :. .:: :. :..: :. . : : ... : :::::: .:.:.: ::.:.
CCDS45 SPWLAWLQCQGGRELTWLKQEVPEVTLSPDYRTAMDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRI
310 320 330 340 350 360
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 QQLEHLRELASLLEGNDQQSC---QKGLQLAKENPQRTEEMVQDFRRGLSAV--VSQAEC
: :: .. : . : : : : .: . . .:. . . ... . :.: .
CCDS45 QALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQVGWPALEEAGEPSLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQV
370 380 390 400 410 420
520 530 540 550 560
pF1KA1 REGELARWTRSSELCETVSSW-MGPLDPEACPSSPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGAGV
:.:: .. . ...: . ::: :.. ::. : . . :. .
CCDS45 RQGE--------KFLQPLTGWEAAELDP---PGARFLA-LRAQLTEFSRALAQRCQRLAD
430 440 450 460 470
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 A--VLKPHALGKPWASQ-QDLWLQYPQTR--LRLEEALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERA
: ... . :: . : . . : : . :.. . . :.::: : :
CCDS45 AERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELEQERPGVVLQQLQLHWTRHPDLPP------AHFRK
480 490 500 510 520
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 QEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLL
. :. .: :. : .: : :: :: . :
CCDS45 MWALA------------TGLGSEAIRQECRWAWAR---C-QDT------WLALDQKLEAS
530 540 550 560
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 RGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQ
:: .:.: .: : :. . . : :: ..:. ::. .: . .:.
CCDS45 LKLPPVGST------ASLCVSQ----VPAAP-AHPP---LRKAYSFDRNLGQSLSEPACH
570 580 590 600 610
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 PDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSS
:.. :.:. .. : .: . . : .::. :. : :. .
CCDS45 CHHAA----------TIAACRR-P---EAGGGALPQ----ASPTVPPPGSSDPRSL---N
620 630 640 650
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 RLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQ
::. ..:::.::::::.: : :...:::::..: :.::::::.. .:::::::.::: .
CCDS45 RLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCH
660 670 680 690 700 710
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 HFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELG
:::::: : . : :. .::::. :::::..::::::.::::.::.:..::::::. ::
CCDS45 FFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFKDKQQALG
720 730 740 750 760 770
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 DKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDL
:..:::::::.:.::..:::::::.: . .:: . :::. :: :. .: :::::::::
CCDS45 DHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELAR--ACG-GPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDL
780 790 800 810 820
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA1 LAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVY
::::::.:::::::::::: .:::.: ::.: .:..::::.:.:::: .. . :..
CCDS45 LAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRHGPTGVDTF
830 840 850 860 870 880
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA1 LYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILW
::.::: :..:.:: :.:.:::::::::: :..::..::::: .:.::: :...::
CCDS45 AYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEIWFRRR-KARDTFVLQASSLAIKQAWTADISHLLW
890 900 910 920 930 940
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA1 RQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKG
:::....:.:. ::.:::.::. : :. ::. ...::. . ..:
CCDS45 RQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRDI---------------APSEEAINDRTVNYVLKC
950 960 970 980 990
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA1 TESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLW
: . :.: :: ::: . .. :.. .. : :.::::.: . .:: ::
CCDS45 REVRSRASIAV------APFDHDSLYLGASNSLPGDPASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLR
1000 1010 1020 1030 1040
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA1 SPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELETGTQAAVCEGAPAVLLSRTRQA
: . . :: : : : : : ..
CCDS45 CPLYPSFP-------EEAALEAEAELGGQPSLTAEDSEISSQCPSASGSSGSDSSCVSGQ
1050 1060 1070 1080 1090
CCDS45 ALGRGLEDLPCV
1100 1110
>>CCDS32466.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16 (1191 aa)
initn: 2005 init1: 668 opt: 1380 Z-score: 989.4 bits: 195.2 E(32554): 8.6e-49
Smith-Waterman score: 2011; 36.0% identity (59.5% similar) in 1236 aa overlap (40-1256:47-1151)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 LGSSEEALGDLACSSLTGASRDLGTGAVASGTQEETSGPRGDP--QQTPSLEKERHTPSR
: . .: : : .: .: . :.
CCDS32 HATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDPGPPRPPAGATQDEELQGSPLSRKFQLPPAA
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TGPGAAGRTLPRRSRSWERAPRSSRGAQAAACHTSHHSAGSRPGGHLGGQAVGTPNCVPV
: : : . : ..: : :... : : : . .. :.. ::. :
CCDS32 DESGDAQRGTVESSSVLSEGPGPS-GVESLLCPMSSHLSLAQ------GES-DTPGVGLV
80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGSLHCHNPSGPSDVPARQPHPEQEGWPPGTGDFPSQVP
:: .. : . ...: : : .: : . :. : :.: .:. :
CCDS32 GDPGPSRAMPSGLSPGALDSD--------PVGLGD-PLSEISKLLEAAPSGSG-LPK--P
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 KQVL---DVSQELLQSGVVTLPGTRDRHGRAVVQVRTRSLLWTREHSSCAELTRLLLYFH
. : :. ::: ::..::::::: .::::. . ..: : . . : :: :::::..
CCDS32 ADCLLAQDLCWELLASGMATLPGTRDVQGRAVLLLCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPAAPAVSQALSGLQNNTSPIIHSILLLVDKESAFRPDKD
:::: ::. :::.:::::: . .. ..:: ::. . ....::. :.. .
CCDS32 SIPRPEVQALGLTVLVDARICAPSSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLV---GSTLLKEVP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 AIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGSFPYSHGDWICFRQRLEHFAANCEEAIIFLQ
. .: : . : ... . . : ..: :..:: : :. ::.::: . ::. : .::
CCDS32 SGLQLEQLPS-QSLLTHIPTAGLPTSLGGGLPYCHQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMKLVLEDPLLVSLRLEGGTVLARLRRE--ELG
... :... : ::..:..: :..:. ::..: :. :. .:: :. :..: :.
CCDS32 GAIESVKAVPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRELTWLKQEVPEVT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KA1 -TEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNRLQQLEHLRELASLLEGNDQQSC---QK
. : : ... : :::::: .:.:.: ::.:.: :: .. : . : : :
CCDS32 LSPDYRTAMDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GLQLAKENPQRTEEMVQDFRRGLSAV--VSQAECREGELARWTRSSELCETVSSW-MGPL
: .: . . .:. . . ... . :.: . :.:: .. . ...: . :
CCDS32 GWPALEEAGEPSLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQVRQGE--------KFLQPLTGWEAAEL
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 DPEACPSSPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGAGVA--VLKPHALGKPWASQ-QDLWLQYP
:: :.. ::. : . . :. . : ... . :: . : . .
CCDS32 DP---PGARFLA-LRAQLTEFSRALAQRCQRLADAERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELE
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 QTR--LRLEEALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPA
: : . :.. . . :.:: : : : . :. .: :.
CCDS32 QERPGVVLQQLQLHWTRHPDLP------PAHFRKMWALA------------TGLGSEAIR
590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 QPLSGLPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQT
: .: : :: :: . : :: .:.: .: : :.
CCDS32 QECRWAWAR---C-QDT------WLALDQKLEASLKLPPVGST------ASLCVSQ----
630 640 650 660
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 LASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLW
. . : :: ..:. ::. .: . .:. :.. :.:. .. :
CCDS32 VPAAP-AHPP---LRKAYSFDRNLGQSLSEPACHCHHAA----------TIAACRR-P--
670 680 690 700
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 QHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDN
.: . . : .::. :. : :. .::. ..:::.::::::.: : :...:
CCDS32 -EAGGGALPQ----ASPTVPPPGSSDPRSL---NRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMEN
710 720 730 740 750
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 YFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQ
::::..: :.::::::.. .:::::::.::: . :::::: : . : :. .::::. :
CCDS32 YFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQ
760 770 780 790 800 810
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 FGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDL
::::..::::::.::::.::.:..::::::. :::..:::::::.:.::..:::::::.:
CCDS32 FGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQEL
820 830 840 850 860 870
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 LKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFI
. .:: . :::. :: :. .: :::::::::::::::.:::::::::::: .:::.
CCDS32 AR--ACG-GPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFV
880 890 900 910 920 930
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 VCCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEI
: ::.: .:..::::.:.:::: .. . :.. ::.::: :..:.:: :.:.:::::
CCDS32 VRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRHGPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEI
940 950 960 970 980 990
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 WFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMD
::::: :..::..::::: .:.::: :...:::::....:.:. ::.:::.::. : :
CCDS32 WFRRR-KARDTFVLQASSLAIKQAWTADISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 VKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHST
. ::. ...::. . ..: : . :.: :: ::: .
CCDS32 I---------------APSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRASIAV------APFDHDSLY
1060 1070 1080 1090
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 ISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELET
.. :.. .. : :.::::.: . .:: :: : . . :: : : :
CCDS32 LGASNSLPGDPASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFP-------EEAALEAEAEL
1100 1110 1120 1130 1140
1260 1270
pF1KA1 GTQAAVCEGAPAVLLSRTRQA
: : ..
CCDS32 GGQPSLTAEDSEISSQCPSASGSSGSDSSCVSGQALGRGLEDLPCV
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS32041.1 ARHGEF40 gene_id:55701|Hs108|chr14 (1519 aa)
initn: 1092 init1: 454 opt: 903 Z-score: 648.6 bits: 132.5 E(32554): 8.4e-30
Smith-Waterman score: 1370; 30.7% identity (55.0% similar) in 1193 aa overlap (38-1183:344-1432)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPLGSSEEALGDLACSSLTGASRDLGTGAVASGTQEETSGP-RGDPQQTPSLEKERHTPS
:::. : :: . : ::
CCDS32 ASPESPPGAEAVPEAAVLEVSEPPAEAVGEASGSCPLRPGELRGGGGGGQGAEGPPGTPR
320 330 340 350 360 370
70 80 90 100 110
pF1KA1 RTGPG------AAGR-TLPRRSRSWERAPRSSRGA--QAAACHTSHHSAGSRPGGHLGGQ
::: : :::: .: : . : .: ... : : : . : . : :: .
CCDS32 RTGKGNRRKKRAAGRGALSRGGDSAPLSPGDKEDASHQEALGNLPSPSEHKLPECHLVKE
380 390 400 410 420 430
120 130 140 150 160
pF1KA1 AV---GTPNCVPVEGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGS---------LHCH-NPSGPSDVP
: :. : : ..: : : :: :. :. : : . .::
CCDS32 EYEGSGKPESEPKELKTAGEKEPQL-SEACGPTEEGAGERELEGPGLLCMAGHTGPEGPL
440 450 460 470 480 490
170 180 190 200 210
pF1KA1 ARQPHPEQEGWPPGTGDFPSQVPKQVL--------DVSQELLQSGVVTLPGTRDRHGRAV
. : : : : :: ..:...: ::. .:. :: . : : :. :::.
CCDS32 SDTPTPPLETVQEGKGD---NIPEEALAVSVSDHPDVAWDLMASGFLILTGGVDQSGRAL
500 510 520 530 540
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 VQVRTRSLLWTREHSSCAELTRLLLYFHSIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPA-APAVSQAL
. . : . : :. : :.::. : ... ::: ::.: :..: ::. ::
CCDS32 LTI-TPPCPPEEPPPSRDTLNTTLHYLHSLLRPDLQTLGLSVLLDLRQAPPLPPALIPAL
550 560 570 580 590 600
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 SGLQNNTSP-IIHSILLLVDKESAFRPDKDAIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGS
: ::.. .: ... .:.:. . : . .: : : . ... . .: .: :
CCDS32 SQLQDSGDPPLVQRLLILIHDDL---PTELCGFQGAEVLSENDLKRVAKPEELQWELGGH
610 620 630 640 650 660
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FPYSHGDWICFRQRLEHFAANCEEAIIFLQNSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMK
: . :. ..:.. .. :. .. ..... :. : : : . . . ..:
CCDS32 RDPSPSHWVEIHQEVVRLCRLCQGVLGSVRQAIEELEGAAEP----EEEEAVGMPKPLQK
670 680 690 700 710 720
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 LVLEDPLLVSLRLEGGTVLARLRREELGTEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNR
:: :: :..:. .::..: ::: .: .:. .. ..::..::: .:.:: :: .
CCDS32 -VLADPRLTALQRDGGAILMRLR----STPSSKLEGQGPATLYQEVDEAIHQLVRLSNLH
730 740 750 760 770
460 470 480 490 500
pF1KA1 LQQLEHLRELASLLEGNDQQSCQKGLQLAK-ENPQRTEEMVQDFR---RGLSAVVSQ--A
.:: :. . : : . . : :::. : : .:. . :..:: :.. :
CCDS32 VQQQEQRQCLRRLQQVLQWLSGPGEEQLASFAMPGDTLSALQETELRFRAFSAEVQERLA
780 790 800 810 820 830
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 ECREG-ELARWTRSSELCETVSSWMGPLDPEACPSSPVAECLRSCHQ---EATSVAAEAF
. ::. : . . :... . . . .. . . . ... :. :. . : :
CCDS32 QAREALALEENATSQKVLDIFEQRLEQVESGLHRALRLQRFFQQAHEWVDEGFARLAGAG
840 850 860 870 880 890
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 PGAGVAVLKPHALGKPWASQQDLWLQYPQTRLRL--EEALSEAAP-DPSLPPLAQSPPKH
:: ::: :: . . . .. : : :: : . . : . .:
CCDS32 PGRE-AVLAALALRRAPEPSAGTFQEMRALALDLGSPAALREWGRCQARCQELERRIQQH
900 910 920 930 940 950
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 ERAQEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPL
..:: : . ...:::. : : .: .:.: .: :
CCDS32 V-GEEASPRGYRRRRADGASSGGAQWGPRSP------------------SPSLSSLLLPS
960 970 980 990
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 SLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRD
: :: . .: :: : ...: :. .:.
CCDS32 S-----PGPRPAPSH------CSLAPCG------------------EDYEEEGPELAPEA
1000 1010 1020
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 SCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLH-PAEEDGRQQ
.: . .:. .::::::: .... .:. . ..:. ..: :. : : :.
CCDS32 EGRPPR-AVLIRGLEVTSTEVVDRTCSPREHVL---LGRARGPDGPWGVGTPRMERKRSI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 VGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHD
...:: ..:.:: :..:. :. . ::. :. ::: . .. :.:..
CCDS32 SAQQRL---VSELIACEQDYVATLSEPVPPPGPELT----PE-LRGTWAAALSARERLRS
1090 1100 1110 1120 1130
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 FHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQ
::. ::::::. : :: .: :::: .::..:. : :.. . . :.. . .. .
CCDS32 FHRTHFLRELQGCATHPLRIGACFLRHGDQFSLYAQYVKHRHKLENGLAALSP--LSKGS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 RELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRH
: : . : : .:......:. ::..::.:: : ..: : :: .. : .
CCDS32 MEAGPYLPRA--LQQPLEQLTRYGRLLEELLREA--GPELSSECRALGAAVQLLREQEAR
1200 1210 1220 1230 1240
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA1 GNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVEGS
: ::::..:.:::...::::::: :: : : ::::: :::::::: :.:::: . ::.
CCDS32 GRDLLAVEAVRGCEIDLKEQGQLLHRDPFTVICGRKKCLRHVFLFEHLLLFSKLKGPEGG
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA1 HDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIG
....:::.::::..:.:::.::::: ::.::::: .....: :::.: :.: ::. :.
CCDS32 SEMFVYKQAFKTADMGLTENIGDSGLCFELWFRRR-RAREAYTLQATSPEIKLKWTSSIA
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA1 RILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDS
..::::: ...:::.:.:.::::::.::.:.: ....:. ..
CCDS32 QLLWRQAAHNKELRVQQMVSMGIGNKPFLDIK-------------------ALGERTLSA
1370 1380 1390 1400
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA1 IVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAH
.. : .. :.:.:::: .::.:
CCDS32 LLTGRAARTRASVAVSSFEHAGPSLPGLSPGACSLPARVEEEAWDLDVKQISLAPETLDS
1410 1420 1430 1440 1450 1460
>>CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5 (3097 aa)
initn: 689 init1: 464 opt: 715 Z-score: 510.4 bits: 107.9 E(32554): 4.1e-22
Smith-Waterman score: 776; 28.7% identity (56.3% similar) in 726 aa overlap (553-1249:1733-2413)
530 540 550 560 570
pF1KA1 ELCETVSSWMGPLDPEACPSSPVAECLRSCHQEATSVAA-EAFPGAGVAVLKPHALGK--
:... ::.. .: : :.:: :.:: .:
CCDS38 RSPAAEGLVPCGSLCIAHSRSSMEMEGIFNHKDSLSVSSNDASPPASVASLQPHMIGAQS
1710 1720 1730 1740 1750 1760
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 ---PWASQQDL--WLQYPQTRLRLEEALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQEAMRRHQKP
: . : :: : :: : . : . ::. ::....: .:.
CCDS38 SPGPKRPGNTLRKWLTSPVRRL------SSGKADGHVKKLAH---KHKKSRE-VRKSADA
1770 1780 1790 1800 1810
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 PSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATT
: . :: .: : . :: .: :. : . : :. . :
CCDS38 GS--QKDSDDSAATPQDETVEERGR-------NEGLSSGTLSK----SSSSGMQSCGEEE
1820 1830 1840 1850
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 AHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKG
.. : ..: : ... .. .:... : .. . . : .: :. . . :
CCDS38 GE-EGADAVPLPPPMAIQQHSLLQPDSQDDKASSRLLVR-----PTSSETPSAAELVSAI
1860 1870 1880 1890 1900 1910
760 770 780 790 800
pF1KA1 LE-VTSTVATEKK---LPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRH-I
: : : .: : . : . : : : . . : :. : .: ... .: . :: .
CCDS38 EELVKSKMALEDRPSSLLVDQGDSSSPSFNPSDNSLLSSSSPIDEMEERKSSSLKRRHYV
1920 1930 1940 1950 1960 1970
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 MAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRE
. :.. :::.:.: ::::...:. :.. .:. ..:: ...:::.....:.:.. :: :
CCDS38 LQELVETERDYVRDLGYVVEGYMALMKEDGVPDDMKGKDKIVFGNIHQIYDWHRDFFLGE
1980 1990 2000 2010 2020 2030
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 LERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDL
::.: . : .: :..::... ::. : .:::.:. ..: . ..::.: ...:: ...:
CCDS38 LEKCLEDPEKLGSLFVKHERRLHMYIAYCQNKPKSEHIVSEYIDTFFEDLKQRLGHRLQL
2040 2050 2060 2070 2080 2090
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 ASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDA
.. :..::::. :: :::.:.:: .. . . .:: ::.::. :. :. ::.. .
CCDS38 TDLLIKPVQRIMKYQLLLKDFLKYSKKASLDTSELE--RAVEVM-CIVPRRCNDMMNVGR
2100 2110 2120 2130 2140 2150
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA1 IRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYL-----RHVFLFEDLILFSKT-QKVEG-SHD
..: : .. ::.: .: :.: : :..::::....::. .: .: :
CCDS38 LQGFDGKIVAQGKLLLQDTFLVTDQDAGLLPRCRERRIFLFEQIVIFSEPLDKKKGFSMP
2160 2170 2180 2190 2200 2210
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA1 VYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRI
.:.:.:.:.. . . ::: .. .: . : .:.::..:: :...: :..:
CCDS38 GFLFKNSIKVSCLCLEENVENDPCKFAL-TSRTGDVVETFILHSSSPSVRQTWIHEINQI
2220 2230 2240 2250 2260
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA1 LWRQ-----ALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRV
: : :: : .. :. : : :. . . :::. . .
CCDS38 LENQRNFLNALTS-PIEYQRNHSGGGGGGG-----SGGSGGGGGSGGGGAPSGGSGHSGG
2270 2280 2290 2300 2310 2320
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA1 PDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSS
:.: :. : :. : : : : . ::..::....... :. :
CCDS38 PSS-CGGAPSTSRSRP----SRIPQPV-RHHPPVLVSSAASSQAEADKMSGTSTPGPSLP
2330 2340 2350 2360 2370
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA1 P--AHP--GLWSPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELETGTQAAVCEGAPAVLLSRTRQA
: : : : .:.. : ..: .. .: :: :...
CCDS38 PPGAAPEAGPSAPSRRPPGADAEGSEREAEPIPKMKVLESPRKGAANASGSSPDAPAKDA
2380 2390 2400 2410 2420 2430
CCDS38 RASLGTLPLGKPRAGAASPLNSPLSSAVPSLGKEPFPPSSPLQKGGSFWSSIPASPASRP
2440 2450 2460 2470 2480 2490
>--
initn: 721 init1: 335 opt: 644 Z-score: 459.9 bits: 98.6 E(32554): 2.7e-19
Smith-Waterman score: 644; 35.2% identity (66.4% similar) in 324 aa overlap (791-1108:1280-1595)
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 VATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREY
: .:. :. .. : . ::::.: ::. :
CCDS38 SDSNKSSKSLQLDIIPASIPGSEVKLRDAAHELNEEKRK--SARRKEFIMAELIQTEKAY
1250 1260 1270 1280 1290 1300
830 840 850 860 870
pF1KA1 IRCLGYVIDNYFPEMER--MDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPL
.: : .:.:. :: ..: :. .:. .::::......::.. ::.:::. .. :
CCDS38 VRDLRECMDTYLWEMTSGVEEIPPGIVNKELIIFGNMQEIYEFHNNIFLKELEKYEQLPE
1310 1320 1330 1340 1350 1360
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 AVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQ
::. :. ..: ::: : ::::.: :. :....: . :.. : ...:::..:::
CCDS38 DVGHCFVTWADKFQMYVTYCKNKPDSTQLILEHAGSYFDEIQQRHGLANSISSYLIKPVQ
1370 1380 1390 1400 1410 1420
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 RVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLK
:..:: :::..:: .: .:. ::.. . :. ...:: . .. ..: : :..
CCDS38 RITKYQLLLKELL---TC-CEEGK--GEIKDGLEVMLSVPKRANDAMHLSMLEGFDENIE
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 EQGQLRCRDEFIV----CCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVYLYKQSFKTAE
::.: .. : : :: ::.:::: ..::: : .... ::::... :.:
CCDS38 SQGELILQESFQVWDPKTLIRKGRERHLFLFEMSLVFSKEVKDSSGRSKYLYKSKLFTSE
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 IGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQALKSRELR
.:.::.: . .: .: : :.. .:.::: : :. : : ... ....
CCDS38 LGVTEHVEGDPCKFALWVGRTPTSDNKIVLKASSIENKQDWIKHIREVIQERTIHLKGAL
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 IQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTA
CCDS38 KEPIHIPKTAPATRQKGRRDGEDLDSQGDGSSQPDTISIASRTSQNTLDSDKLSGGCELT
1610 1620 1630 1640 1650 1660
>>CCDS82829.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1654 aa)
initn: 746 init1: 359 opt: 675 Z-score: 485.8 bits: 102.5 E(32554): 9.7e-21
Smith-Waterman score: 675; 32.6% identity (63.6% similar) in 396 aa overlap (776-1162:1245-1630)
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 DHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSR
: ..: .. .. : ..:. :. :.:
CCDS82 SLRMGKYRYSLEKALGVNTEDNKDLELDIIPASLSDREVKLRDANHEVNEEKRK---SAR
1220 1230 1240 1250 1260 1270
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 LRH-IMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMER--MDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFH
.. ::::.. ::. :.: : ...:. :: ..: :. .:.:.::::.....:::
CCDS82 KKEFIMAELLQTEKAYVRDLHECLETYLWEMTSGVEEIPPGILNKEHIIFGNIQEIYDFH
1280 1290 1300 1310 1320 1330
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 QQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRE
.. ::.:::. .. : ::. :. ..: ::: : ::::.:. :. :...:: . :..
CCDS82 NNIFLKELEKYEQLPEDVGHCFVTWADKFQMYVTYCKNKPDSNQLILEHAGTFFDEIQQR
1340 1350 1360 1370 1380 1390
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 LGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGN
: ...:::..::::..:: :::..:: .: .:. :::. . :. ...:
CCDS82 HGLANSISSYLIKPVQRITKYQLLLKELL---TC-CEEGK--GELKDGLEVMLSVPKKAN
1400 1410 1420 1430 1440
990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 DLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIV----CCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVE
: . .. ..: : :: ::.: .: : : :: ::.:::: ..::: :
CCDS82 DAMHVSMLEGFDENLDVQGELILQDAFQVWDPKSLIRKGRERHLFLFEISLVFSKEIKDS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 GSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDV
..: :.::... :.:.:.::.: . .: .: : .:.. .:.::. :.:. :
CCDS82 SGHTKYVYKNKLLTSELGVTEHVEGDPCKFALWSGRTPSSDNKTVLKASNIETKQEWIKN
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA1 IGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGA--PKCAVMSDR
: ... .. .. . ..: .. . . :: . : .::. : ...:
CCDS82 IREVIQERIIHLKGA-LKEPLQLPKTPAKQRNNSKRDGVEDIDSQGDGSSQPDTISIASR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA1 VPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSS
. .. :
CCDS82 TSQNTVDSDKDGNLVPRWHLGPGDPFSTYV
1630 1640 1650
>>CCDS3027.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1663 aa)
initn: 746 init1: 359 opt: 675 Z-score: 485.8 bits: 102.5 E(32554): 9.7e-21
Smith-Waterman score: 675; 32.6% identity (63.6% similar) in 396 aa overlap (776-1162:1254-1639)
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 DHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSR
: ..: .. .. : ..:. :. :.:
CCDS30 SLRMGKYRYSLEKALGVNTEDNKDLELDIIPASLSDREVKLRDANHEVNEEKRK---SAR
1230 1240 1250 1260 1270 1280
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 LRH-IMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMER--MDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFH
.. ::::.. ::. :.: : ...:. :: ..: :. .:.:.::::.....:::
CCDS30 KKEFIMAELLQTEKAYVRDLHECLETYLWEMTSGVEEIPPGILNKEHIIFGNIQEIYDFH
1290 1300 1310 1320 1330 1340
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 QQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRE
.. ::.:::. .. : ::. :. ..: ::: : ::::.:. :. :...:: . :..
CCDS30 NNIFLKELEKYEQLPEDVGHCFVTWADKFQMYVTYCKNKPDSNQLILEHAGTFFDEIQQR
1350 1360 1370 1380 1390 1400
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 LGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGN
: ...:::..::::..:: :::..:: .: .:. :::. . :. ...:
CCDS30 HGLANSISSYLIKPVQRITKYQLLLKELL---TC-CEEGK--GELKDGLEVMLSVPKKAN
1410 1420 1430 1440 1450
990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 DLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIV----CCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVE
: . .. ..: : :: ::.: .: : : :: ::.:::: ..::: :
CCDS30 DAMHVSMLEGFDENLDVQGELILQDAFQVWDPKSLIRKGRERHLFLFEISLVFSKEIKDS
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 GSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDV
..: :.::... :.:.:.::.: . .: .: : .:.. .:.::. :.:. :
CCDS30 SGHTKYVYKNKLLTSELGVTEHVEGDPCKFALWSGRTPSSDNKTVLKASNIETKQEWIKN
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA1 IGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGA--PKCAVMSDR
: ... .. .. . ..: .. . . :: . : .::. : ...:
CCDS30 IREVIQERIIHLKGA-LKEPLQLPKTPAKQRNNSKRDGVEDIDSQGDGSSQPDTISIASR
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA1 VPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSS
. .. :
CCDS30 TSQNTVDSDKDGNLVPRWHLGPGDPFSTYV
1640 1650 1660
>>CCDS8947.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12 (580 aa)
initn: 648 init1: 443 opt: 664 Z-score: 484.4 bits: 100.7 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 683; 28.1% identity (62.2% similar) in 481 aa overlap (686-1148:51-518)
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 LPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRP
:: . .. .. : .:. :: : ...
CCDS89 AKCGCCFARGGRESYSIAGSEGSISASAASGLAAPSGPSSGL-SSGPCSPGPPGPVSGLR
30 40 50 60 70
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 RKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARS
: ..: .... : . ..:: .. . . . . .. : . ..: . : .
CCDS89 RWLDHSKHCLSVET-EADSGQAGPYENWMLEPALATGEELPELTLLTTLLEGP--GDKTQ
80 90 100 110 120 130
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 PPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEM
:: . ..::. : :. ... . : ....:.. ::. :. :: ....:. :
CCDS89 PP--EEETLSQA----PESEEEQKKKALERSMYVLSELVETEKMYVDDLGQIVEGYMATM
140 150 160 170 180 190
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 ERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYV
. .:..:::. ...:::.......:...::.::.:: . : ... :..::... :::
CCDS89 AAQGVPESLRGRDRIVFGNIQQIYEWHRDYFLQELQRCLKDPDWLAQLFIKHERRLHMYV
200 210 220 230 240 250
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 IYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEAS
.: .:::.:. ..: :...:.. ...:: ...: . :..::::. :: :::.:.:: .
CCDS89 VYCQNKPKSEHVVSEFGDSYFEELRQQLGHRLQLNDLLIKPVQRIMKYQLLLKDFLKYYN
260 270 280 290 300 310
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 CGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGR
:.. ..:. : :.:: .. ::.... .:: . .: ::.: .: : : .
CCDS89 ---RAGMDTADLEQAVEVMCFVPKRCNDMMTLGRLRGFEGKLTAQGKLLGQDTFWVTEPE
320 330 340 350 360
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 KKYL-------RHVFLFEDLILFSKTQK--VEG-SHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSG
: :.:::::..:.::.. :.: .. :.::.:.:.. .:. :. .
CCDS89 AGGLLSSRGRERRVFLFEQIIIFSEALGGGVRGGTQPGYVYKNSIKVSCLGLEGNLQGDP
370 380 390 400 410 420
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 LRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQ-----ALKS---RELRIQE
:: . : . . . :.:::.. ...:: ...:: : ::.: . : ..
CCDS89 CRFALTSRGPEGGIQRYVLQAADPAISQAWIKHVAQILESQRDFLNALQSPIEYQRRESQ
430 440 450 460 470 480
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 MASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSS
:.: : . : . : : : .:
CCDS89 TNSLGRPRGPGVGSPGRIQLGDQAQGSTHTPINGSLPSLLLSPKGEVARALLPLDKQALG
490 500 510 520 530 540
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 SDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRA
CCDS89 DIPQAPHDSPPVSPTPKTPPCQARLAKLDEDEL
550 560 570 580
>>CCDS44931.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12 (619 aa)
initn: 648 init1: 443 opt: 664 Z-score: 484.0 bits: 100.7 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 683; 28.1% identity (62.2% similar) in 481 aa overlap (686-1148:90-557)
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 LPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRP
:: . .. .. : .:. :: : ...
CCDS44 REHEVLAGALQPESYSIAGSEGSISASAASGLAAPSGPSSGL-SSGPCSPGPPGPVSGLR
60 70 80 90 100 110
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 RKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARS
: ..: .... : . ..:: .. . . . . .. : . ..: . : .
CCDS44 RWLDHSKHCLSVET-EADSGQAGPYENWMLEPALATGEELPELTLLTTLLEGP--GDKTQ
120 130 140 150 160 170
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 PPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEM
:: . ..::. : :. ... . : ....:.. ::. :. :: ....:. :
CCDS44 PP--EEETLSQA----PESEEEQKKKALERSMYVLSELVETEKMYVDDLGQIVEGYMATM
180 190 200 210 220
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 ERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYV
. .:..:::. ...:::.......:...::.::.:: . : ... :..::... :::
CCDS44 AAQGVPESLRGRDRIVFGNIQQIYEWHRDYFLQELQRCLKDPDWLAQLFIKHERRLHMYV
230 240 250 260 270 280
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 IYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEAS
.: .:::.:. ..: :...:.. ...:: ...: . :..::::. :: :::.:.:: .
CCDS44 VYCQNKPKSEHVVSEFGDSYFEELRQQLGHRLQLNDLLIKPVQRIMKYQLLLKDFLKYYN
290 300 310 320 330 340
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 CGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGR
:.. ..:. : :.:: .. ::.... .:: . .: ::.: .: : : .
CCDS44 ---RAGMDTADLEQAVEVMCFVPKRCNDMMTLGRLRGFEGKLTAQGKLLGQDTFWVTEPE
350 360 370 380 390 400
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 KKYL-------RHVFLFEDLILFSKTQK--VEG-SHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSG
: :.:::::..:.::.. :.: .. :.::.:.:.. .:. :. .
CCDS44 AGGLLSSRGRERRVFLFEQIIIFSEALGGGVRGGTQPGYVYKNSIKVSCLGLEGNLQGDP
410 420 430 440 450 460
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 LRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQ-----ALKS---RELRIQE
:: . : . . . :.:::.. ...:: ...:: : ::.: . : ..
CCDS44 CRFALTSRGPEGGIQRYVLQAADPAISQAWIKHVAQILESQRDFLNALQSPIEYQRRESQ
470 480 490 500 510 520
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 MASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSS
:.: : . : . : : : .:
CCDS44 TNSLGRPRGPGVGSPGRIQLGDQAQGSTHTPINGSLPSLLLSPKGEVARALLPLDKQALG
530 540 550 560 570 580
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 SDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRA
CCDS44 DIPQAPHDSPPVSPTPKTPPCQARLAKLDEDEL
590 600 610
>>CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1289 aa)
initn: 471 init1: 297 opt: 640 Z-score: 462.4 bits: 97.8 E(32554): 1.9e-19
Smith-Waterman score: 640; 26.9% identity (66.8% similar) in 398 aa overlap (774-1158:202-590)
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 QPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGS
..: ..... :. . ::. . ..
CCDS30 VPTAADLVNAIEKLVKNKLSLEGSSYRGSLKDPAGCLNEGMAPPTPPKNPEEEQKAKALR
180 190 200 210 220 230
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 SRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQ
.:. .. :.. ::..:.. :: :..... ..:. .:. .::: ...:::.....:.:.
CCDS30 GRM-FVLNELVQTEKDYVKDLGIVVEGFMKRIEEKGVPEDMRGKDKIVFGNIHQIYDWHK
240 250 260 270 280 290
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 QHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQREL
. :: :::.: . ... :..::... .:: : .:::.:. ... . .:.:.. ..:.
CCDS30 DFFLAELEKCIQEQDRLAQLFIKHERKLHIYVWYCQNKPRSEYIVAEY-DAYFEEVKQEI
300 310 320 330 340
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 GDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGND
.... :...:..:.::..:: :::.:.:. . : : .... : ..:. .. ::
CCDS30 NQRLTLSDFLIKPIQRITKYQLLLKDFLRYSE---KAGLECSDIEKAVELMCLVPKRCND
350 360 370 380 390 400
990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 LLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVC---CGRKKYL--RHVFLFEDLILFSKTQKVE
.. . ..: . .: ::.: .: : : : .. :.:::::....::. .
CCDS30 MMNLGRLQGFEGTLTAQGKLLQQDTFYVIELDAGMQSRTKERRVFLFEQIVIFSELLRKG
410 420 430 440 450 460
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 GSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDV
. :..:.:.: . . ::: .. .: . : .... .:::..:....::..
CCDS30 SLTPGYMFKRSIKMNYLVLEENVDNDPCKFALMNR---ETSERVVLQAANADIQQAWVQD
470 480 490 500 510 520
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA1 IGRILWRQ-----ALKSR-ELRIQEMASMGIGNQP--FMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKC
:...: : ::.: : . .: .. . .:: . ...:: . . . :. ::
CCDS30 INQVLETQRDFLNALQSPIEYQRKERSTAVMRSQPARLPQASPRPYS-SVPAGSEKPPKG
530 540 550 560 570 580
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA1 AVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSL
. .. .:
CCDS30 SSYNPPLPPLKISTSNGSPGFEYHQPGDKFEASKQNDLGGCNGTSSMAVIKDYYALKENE
590 600 610 620 630 640
1271 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 06:58:39 2016 done: Sat Nov 5 06:58:40 2016
Total Scan time: 6.320 Total Display time: 0.470
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]