Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1745
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1745, 837 aa
1>>>pF1KA1745 837 - 837 aa - 837 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9966+/-0.000764; mu= 18.2575+/- 0.046
mean_var=91.0356+/-18.458, 0's: 0 Z-trim(111.2): 57 B-trim: 526 in 1/51
Lambda= 0.134421
statistics sampled from 12164 (12221) to 12164 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.375), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 5737 1122.9 0
CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 1624 325.2 2.8e-88
CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 1491 299.5 1.7e-80
CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 1461 293.6 8.4e-79
CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 843) 1394 280.6 7.6e-75
CCDS1955.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 770) 1373 276.5 1.2e-73
CCDS55724.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 702) 1315 265.3 2.7e-70
CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 1159 235.0 3.6e-61
CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 1158 234.8 4.1e-61
CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 1152 233.7 9.3e-61
CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 1132 229.8 1.4e-59
CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 1100 223.6 9.4e-58
CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 737) 1088 221.3 5e-57
CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 1017 207.5 7.2e-53
CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 1013 206.7 1.2e-52
CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 754) 898 184.4 6.3e-46
CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3 ( 782) 891 183.1 1.7e-45
CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 819 169.1 2.5e-41
CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 819 169.1 2.6e-41
CCDS62942.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 615) 784 162.3 2.4e-39
CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 629) 655 137.2 8.3e-32
CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 655 137.3 9.7e-32
CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 ( 888) 582 123.2 2e-27
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 506 108.5 6.3e-23
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 506 108.5 6.8e-23
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 506 108.5 7e-23
CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 505 108.3 7.1e-23
CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 505 108.3 7.2e-23
CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 922) 487 104.8 7.3e-22
CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 476) 483 103.8 7.3e-22
CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 930) 487 104.8 7.3e-22
CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 962) 487 104.8 7.5e-22
CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 597) 483 103.9 8.8e-22
CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 998) 483 104.0 1.3e-21
CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011) 483 104.0 1.3e-21
CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017) 483 104.0 1.3e-21
CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073) 483 104.0 1.4e-21
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5 (1074) 438 95.3 6e-19
CCDS53959.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 652) 413 90.3 1.1e-17
CCDS10262.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 666) 413 90.3 1.2e-17
CCDS53958.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 501) 410 89.7 1.4e-17
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 302 69.1 8.2e-11
>>CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 (837 aa)
initn: 5737 init1: 5737 opt: 5737 Z-score: 6009.0 bits: 1122.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5737; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLRTAMGLRSWLAAPWGALPPRPPLLLLLLLLLLLQPPPPTWALSPRISLPLGSEERPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MLRTAMGLRSWLAAPWGALPPRPPLLLLLLLLLLLQPPPPTWALSPRISLPLGSEERPFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RFEAEHISNYTALLLSRDGRTLYVGAREALFALSSNLSFLPGGEYQELLWGADAEKKQQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RFEAEHISNYTALLLSRDGRTLYVGAREALFALSSNLSFLPGGEYQELLWGADAEKKQQC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SFKGKDPQRDCQNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYINMENFTLARDEKGNVLLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SFKGKDPQRDCQNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYINMENFTLARDEKGNVLLED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GKGRCPFDPNFKSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRSQSLRPTKTESSLNWLQDPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GKGRCPFDPNFKSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRSQSLRPTKTESSLNWLQDPAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VASAYIPESLGSLQGDDDKIYFFFSETGQEFEFFENTIVSRIARICKGDEGGERVLQQRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VASAYIPESLGSLQGDDDKIYFFFSETGQEFEFFENTIVSRIARICKGDEGGERVLQQRW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TSFLKAQLLCSRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAVCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TSFLKAQLLCSRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAVCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 FTMKDVQRVFSGLYKEVNRETQQWYTVTHPVPTPRPGACITNSARERKINSSLQLPDRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FTMKDVQRVFSGLYKEVNRETQQWYTVTHPVPTPRPGACITNSARERKINSSLQLPDRVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NFLKDHFLMDGQVRSRMLLLQPQARYQRVAVHRVPGLHHTYDVLFLGTGDGRLHKAVSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NFLKDHFLMDGQVRSRMLLLQPQARYQRVAVHRVPGLHHTYDVLFLGTGDGRLHKAVSVG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PRVHIIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQVPMANCSLYRSCGDCLLARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PRVHIIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQVPMANCSLYRSCGDCLLARD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PYCAWSGSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVVSPSFVPTGEKPCEQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PYCAWSGSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVVSPSFVPTGEKPCEQVQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 FQPNTVNTLACPLLSNLATRLWLRNGAPVNASASCHVLPTGDLLLVGTQQLGEFQCWSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FQPNTVNTLACPLLSNLATRLWLRNGAPVNASASCHVLPTGDLLLVGTQQLGEFQCWSLE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 EGFQQLVASYCPEVVEDGVADQTDEGGSVPVIISTSRVSAPAGGKASWGADRSYWKEFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EGFQQLVASYCPEVVEDGVADQTDEGGSVPVIISTSRVSAPAGGKASWGADRSYWKEFLV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 MCTLFVLAVLLPVLFLLYRHRNSMKVFLKQGECASVHPKTCPVVLPPETRPLNGLGPPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MCTLFVLAVLLPVLFLLYRHRNSMKVFLKQGECASVHPKTCPVVLPPETRPLNGLGPPST
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KA1 PLDHRGYQSLSDSPPGSRVFTESEKRPLSIQDSFVEVSPVCPRPRVRLGSEIRDSVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PLDHRGYQSLSDSPPGSRVFTESEKRPLSIQDSFVEVSPVCPRPRVRLGSEIRDSVV
790 800 810 820 830
>>CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 (833 aa)
initn: 1268 init1: 436 opt: 1624 Z-score: 1698.3 bits: 325.2 E(32554): 2.8e-88
Smith-Waterman score: 1691; 40.7% identity (64.0% similar) in 761 aa overlap (42-787:25-736)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 LAAPWGALPPRPPLLLLLLLLLLLQPPPPTWALSPRISLPLGSEERPFLRFEAEHISNYT
: : :: .. : :: :...
CCDS20 MAPHWAVWLLAARLWGLGIGAEVWWNLVPRKTVSSGELATVVRRFSQTGIQDFL
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 ALLLSRDGRTLYVGAREALFALSSNLSFLPGGEYQELLWGADAEKKQQCSFKGKDPQRDC
.: :.. :::::::::::.: . : :. . : : .::: .: :::. : .:
CCDS20 TLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSMEALELQGA----ISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTEC
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 QNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYINMENFTLARDEKGNVLLEDGKGRCPFDPNF
:.:..: : ..:::..::: ::.: :::.:: .::: :.:. .:::::.::.::
CCDS20 FNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTL---EHGE--FEDGKGKCPYDPAK
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 KSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRSQSLRPT-KTESSLNWLQDPAFVASAYIPESL
..:.::::::..:...: :..: : :... . . ::: ::..: ::.:::.:::.
CCDS20 GHAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAFWLNEPHFVGSAYVPESV
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 GSLQGDDDKIYFFFSETGQEFEFFENTIVSRIARICKGDEGGERVLQQRWTSFLKAQLLC
::. :::::.:::: : . : . . . .:.:.::.:::: :: :.::..::.::::.: :
CCDS20 GSFTGDDDKVYFFFRERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLAC
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 SRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAVCVFTMKDVQRVF
: :. . :: :: . ::. . .:..: :.::: .:: : ::.: . ....::::
CCDS20 SAPNWQLYFNQLQAMHTLQDT--SWHNTTFFGVFQAQW--GDMYLSAICEYQLEEIQRVF
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 SGLYKEVNRETQQWYTVTHPVPTPRPGACITNSARERKINSSLQLPDRVLNFLKDHFLMD
: ::: ..:.:.: : :::.::::.::.: :.. .:::.::: .:::.: : ::.
CCDS20 EGPYKEYHEEAQKWDRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLME
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480
pF1KA1 GQVR---SRMLLLQPQARYQRVAVHRVPGLHH-TYDVLFLGTGDGRLHKAVSVGPRVHII
:: :: ::.. . . .... :: :: :: :::.::::: : ::::.:: ::.:
CCDS20 EQVGPRWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLI
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EELQIFSSGQPVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQVPMANCSLYRSCGDCLLARDPYCAWS
::::.:.. .:...:.:. . ::.:.:.: .::.:.:.: ::::.::.::::::::::
CCDS20 EELQLFDQ-EPMRSLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWS
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 --GSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVVSPSFVPTGEKPCEQVQFQPN
: : :. .. .: :: . .... .:. . : . :: : ... .
CCDS20 VNTSRCVAVGGHSGSL----LIQHVMTSDTSGICNLRG--SKKVRPT---P-KNITVVAG
530 540 550 560 570
610 620 630 640 650
pF1KA1 TVNTLACPLLSNLATRLWLRNGAPVNASASCHVLPTGDL--LLVGTQQ---LGEFQCWSL
: .: : : :::: : .: . : : . : :.: . : : ..:.:
CCDS20 TDLVLPCHLSSNLAHARWTFGGRDLPAEQPGSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSE
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 EEGFQQLVASYCPEVVEDGVADQTDEGGSVPVIISTSRVSAPAGGKASWGADRSYWKEFL
:.: . . .: :: : :: : .. :: . : :
CCDS20 EQGARLAAEGYLVAVVA---------GPSV-----TLEARAPL---ENLGL---VW----
640 650 660
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 VMCTLFVLAVLLPVLFLLYRHRNSMKVFLKQGECASVHPKTCPVVLP--PETRPLNGLGP
. .. . :: : .:.:. : .. :..: :. . . :. :: : . :.
CCDS20 -LAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLVYPLELPKEPTSPPFRPCPE
670 680 690 700 710 720
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 PSTPL-DHRGYQSLSDSPPGSRVFTESEKRPLSIQDSFVEVSPVCPRPRVRLGSEIRDSV
:. : : ::
CCDS20 PDEKLWDPVGYYYSDGSLKIVPGHARCQPGGGPPSPPPGIPGQPLPSPTRLHLGGGRNSN
730 740 750 760 770 780
>>CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 (862 aa)
initn: 1396 init1: 725 opt: 1491 Z-score: 1558.7 bits: 299.5 E(32554): 1.7e-80
Smith-Waterman score: 1621; 40.7% identity (67.7% similar) in 706 aa overlap (24-701:6-682)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLRTAMGLRSWLAAPWGALPPRPPLLLLLLLLLLLQPPPPTWALSPRISLPLGSEERPFL
:. ::. : .. ..: :::. .: ..
CCDS66 MRMCTPIRGLLMALAVMFGTAMAFAPIPRITWE--HREVHLV
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KA1 RFEAEHISNYTALLLSRDGRTLYVGAREALFALSS-NLSFLPGGEYQELLWGADAEKKQQ
.:. : ::.:::::.: :::.:::::.::... :.: . .:. : .. .:: .
CCDS66 QFHEPDIYNYSALLLSEDKDTLYIGAREAVFAVNALNISE----KQHEVYWKVSEDKKAK
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 CSFKGKDPQRDCQNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYINMENFT-LARDEKGNVLL
:. :::. : .: :::..: :::.. :..::: ::.: : ..:. .: :...:
CCDS66 CAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLSATSLYVCGTNAFQPACDHLNLTSFKFLGKNE------
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 EDGKGRCPFDPNFKSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRSQSLRPTKTESSLNWLQDP
:::::::::: . :...::::::.:: .: :..: :::..: : .:: .. ::..:
CCDS66 -DGKGRCPFDPAHSYTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRNSSHSPLRTEYAIPWLNEP
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 AFVASAYIPESLGSLQGDDDKIYFFFSETGQEFEFFENTIVSRIARICKGDEGGERVLQQ
.:: . : .: : .:.::..::::.:.. :.:: ... ::::.::::.:: :.::.
CCDS66 SFVFADVIRKSPDSPDGEDDRVYFFFTEVSVEYEFVFRVLIPRIARVCKGDQGGLRTLQK
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 RWTSFLKAQLLCSRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAV
.:::::::.:.:::::.:. ::::.:::.: :: . .::..:: : . .. :::
CCDS66 KWTSFLKARLICSRPDSGLVFNVLRDVFVLR-SP-GLKVPVFYALFTPQLN--NVGLSAV
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 CVFTMKDVQRVFS-GLYKE---VNRETQQWYTVTHPVPTPRPGACITNSARERKINSSLQ
:..... ...::: : : . :.. .: . ::: ::::::: . :: . .:::.
CCDS66 CAYNLSTAEEVFSHGKYMQSTTVEQSHTKWVRYNGPVPKPRPGACIDSEARAANYTSSLN
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 LPDRVLNFLKDHFLMDGQVR---SRMLLLQPQARYQRVAVHRVPGLHHT-YDVLFLGTGD
:::..:.:.::: ::: .: .: :.. .. : ...: :. .: : :::.:..:
CCDS66 LPDKTLQFVKDHPLMDDSVTPIDNRPRLIKKDVNYTQIVVDRTQALDGTVYDVMFVSTDR
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520
pF1KA1 GRLHKAVSVGPRVHIIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRG--LLYAASHSGVVQVPMANCSL
: ::::.:. :::::: :.:.. .:::.:::....: ..::.:.:::::.:.: :.
CCDS66 GALHKAISLEHAVHIIEETQLFQDFEPVQTLLLSSKKGNRFVYAGSNSGVVQAPLAFCGK
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530 540 550 560 570 580
pF1KA1 YRSCGDCLLARDPYCAWSGSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVVSPSF
. .: ::.:::::::::: . :.:.: . .: ::.. : .. .: .: . :.
CCDS66 HGTCEDCVLARDPYCAWSPPTATCVALHQTESPSRGLIQEMSGDAS--VCPDKS--KGSY
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 VPTGEKPCEQVQFQPNTVNTLACPLLSNLATRLW-LRNGAPVNASASCHVLPTGDLLLVG
.: :. . . : : :::: .: ..::. : . .. .::. .
CCDS66 --------RQHFFKHGGTAELKCSQKSNLARVFWKFQNGVLKAESPKYGLMGRKNLLIFN
570 580 590 600 610
650 660 670 680 690
pF1KA1 TQQ--LGEFQCWSLE----EGFQQLVASYCPEV--VEDGVADQT-----DEGGSVP--VI
.. : .:: : : . :.::.. :: : :. : ::. . :.
CCDS66 LSEGDSGVYQCLSEERVKNKTVFQVVAKHVLEVKVVPKPVVAPTLSVVQTEGSRIATKVL
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700 710 720 730 740 750
pF1KA1 ISTSRVSAPAGGKASWGADRSYWKEFLVMCTLFVLAVLLPVLFLLYRHRNSMKVFLKQGE
..... :.:
CCDS66 VASTQGSSPPTPAVQATSSGAITLPPKPAPTGTSCEPKIVINTVPQLHSEKTMYLKSSDN
680 690 700 710 720 730
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10 20 30 40 50 60
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:. ::. : .. ..: :::. .: ..
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10 20 30 40
70 80 90 100 110
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CCDS47 QFHEPDIYNYSALLLSEDKDTLYIGAREAVFAVNALNISE----KQHEVYWKVSEDKKAK
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pF1KA1 CSFKGKDPQRDCQNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYINMENFT-LARDEKGNVLL
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CCDS47 CAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLSATSLYVCGTNAFQPACDHLNLTSFKFLGKNE------
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pF1KA1 EDGKGRCPFDPNFKSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRSQSLRPTKTESSLNWLQDP
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CCDS47 -DGKGRCPFDPAHSYTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRNSSHSPLRTEYAIPWLNEP
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pF1KA1 AFVASAYIPESLGSLQGDDDKIYFFFSETGQEFEFFENTIVSRIARICKGDEGGERVLQQ
.:: . : .: : .:.::..::::.:.. :.:: ... ::::.::::.:: :.::.
CCDS47 SFVFADVIRKSPDSPDGEDDRVYFFFTEVSVEYEFVFRVLIPRIARVCKGDQGGLRTLQK
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pF1KA1 RWTSFLKAQLLCSRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAV
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CCDS47 KWTSFLKARLICSRPDSGLVFNVLRDVFVLR-SP-GLKVPVFYALFTPQLN--NVGLSAV
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:..... ...::: : : . :.. .: . ::: ::::::: . :: . .:::.
CCDS47 CAYNLSTAEEVFSHGKYMQSTTVEQSHTKWVRYNGPVPKPRPGACIDSEARAANYTSSLN
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pF1KA1 LPDRVLNFLKDHFLMDGQVR---SRMLLLQPQARYQRVAVHRVPGLHHT-YDVLFLGTGD
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CCDS47 LPDKTLQFVKDHPLMDDSVTPIDNRPRLIKKDVNYTQIVVDRTQALDGTVYDVMFVSTDR
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pF1KA1 GRLHKAVSVGPRVHIIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRG--LLYAASHSGVVQVPMANCSL
: ::::.:. :::::: :.:.. .:::.:::....: ..::.:.:::::.:.: :.
CCDS47 GALHKAISLEHAVHIIEETQLFQDFEPVQTLLLSSKKGNRFVYAGSNSGVVQAPLAFCGK
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pF1KA1 YRSCGDCLLARDPYCAWSGSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVVSPSF
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CCDS47 HGTCEDCVLARDPYCAWSPPTATCVALHQTESPSRGLIQEMSGDAS--VCPAS---SPKP
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pF1KA1 VPTGEKPCEQVQFQPNTVNTLACPLLSNLATRL-------WLRNGAPVNASASCHVLPTG
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CCDS47 LP------------PPGSSSLSC--LGHVGDRRLSSPWTPWPASGAGPDSSSRVSLLPPF
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CCDS47 LSDQAQHVHALGNFYLFCQATGPADIRFVWEKNGRALETCVPVQTHALPDGRAHALSWLQ
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CCDS75 EELSGTRHFKGQAQNYSTLLLEEASARLLVGARGALFSLSAND--IGDGAHKEIHWEASP
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:: ::...::..:::::::.:.: : ...:. : .:. .. : ::..::
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. ::: .::. ::.:.: : :: : :.: :::. . :: ... : :. :
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pF1KA1 YDVLFLGTGDGRLHKAVSVGPRVHIIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQ
::.:::::.:: .:::: .: .::::: :.: .: :.::... . ::... :::.:
CCDS75 YDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQVFRESQSVENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQ
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.:...:: :::: ::.:::::::.:. :. .: .. . : . ::::: ..
CCDS75 LPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTHACAAATTIANRSQGSRTALIQDIERGNRG-
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CCDS75 -CESSRDTGP---PPPLK--TRSVLRGDDV-LLPCDQPSNLARALWLLNGSMGLSDGQGG
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pF1KA1 HVLPTGDLLLVGTQ--QLGEFQCWSLEEGFQQLVASYCPEVVEDGVADQTDEGGSVPVII
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CCDS75 YRVGVDGLLVTDAQPEHSGNYGCYAEENGLRTLLASYSLTVRPATPAPAPKAPATPGAQL
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pF1KA1 STSRVSAPAGGKASWGADRSYWKEFLVMCTLFVLAVLLPVLFLLYRHRNSMKVFLKQGEC
CCDS75 APDVRLLYVLAIAALGGLCLILASSLLYVACLREGRRGRRRKYSLGRASRAGGSAVQLQT
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CCDS19 SEADSCLTRFAVPHTYNYSVLLVDPASHTLYVGARDTIFALS--LPF-SGERPRRIDWMV
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..:.: ::: . .:.:...:: ..:::.:::: ::.: : :.. : . :
CCDS19 PEAHRQNCRKKGKK-EDECHNFVQILAIANASHLLTCGTFAFDPKCGVIDVSRFQQV--E
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pF1KA1 KGNVLLEDGKGRCPFDPNFKSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRS--QSLRPTKTES
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CCDS19 R----LESGRGKCPFEPAQRSAAVMAGGVLYAATVKNYLGTEPIITRAVGRAEDWIRTDT
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pF1KA1 SLNWLQDPAFVAS-AYIPESLGSLQGDDDKIYFFFSETGQEFEFFENTIVSRIARICKGD
.::. :::::. : : :. .:::. :::::.::.. :. .: : :.::.: ::
CCDS19 LPSWLNAPAFVAAVALSPAEWGDEDGDDE-IYFFFTETSRAFDSYERIKVPRVARVCAGD
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pF1KA1 EGGERVLQQRWTSFLKAQLLCSRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFTSQWH
::...::::::.::::.::: :. : .::::: .: : .:::.:.:::.
CCDS19 LGGRKTLQQRWTTFLKADLLCPGPEHGRASSVLQDVAVLRPE-LGAGTPIFYGIFSSQWE
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pF1KA1 RGTTEGSAVCVFTMKDVQRVFSGLYKEVNRETQQWYTVT-HPVPTPRPGACITNSARERK
.: ::::.: .:.. :..: ..:.... .. :. . :: :::: ::::. . :.
CCDS19 GATI--SAVCAFRPQDIRTVLNGPFRELKHDCNRGLPVVDNDVPQPRPGECITNNMKLRH
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pF1KA1 INSSLQLPDRVLNFLKDHFLMDGQV---RSRMLLLQPQARYQRVAVHRVPGLH-HTYDVL
..:::.::::::.:..:: ::: : .. ::. .. : ::..::: .: . ::::
CCDS19 FGSSLSLPDRVLTFIRDHPLMDRPVFPADGHPLLVTTDTAYLRVVAHRVTSLSGKEYDVL
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pF1KA1 FLGTGDGRLHKAVSVGPRVHIIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQVPMA
.::: ::.::.:: .: .. ..:.: .: :::.:. : ... : ..:.. :.:: .
CCDS19 YLGTEDGHLHRAVRIGAQLSVLEDLALFPEPQPVENMKL--YHSWLLVGSRTEVTQVNTT
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pF1KA1 NCSLYRSCGDCLLARDPYCAWSGSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVV
::. .::..:.::.:: :::: . :. . : .::::.:....::
CCDS19 NCGRLQSCSECILAQDPVCAWSFRLDECVAHAGEH---RGLVQDIESADVSSLC------
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pF1KA1 SPSFVPTGEKPCE-QVQFQPNTVNTLACPLLSNLATRLWLRNGAPVNASASCHVLPTGDL
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CCDS19 -PK--EPGERPVVFEVPVATAAHVVLPCSPSSAWASCVWHQ---PSGVTA---LTPRRDG
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pF1KA1 L--LVGTQQLGEFQCWSLEEGFQQLVASYCPEVVEDGVADQTDEGGSVPVIISTSRVSAP
: .: .: . : : : ..::.:
CCDS19 LEVVVTPGAMGAYACECQEGGAAHVVAAYSLVWGSQRDAPSRAHTVGAGLAGFFLGILAA
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pF1KA1 MLRTAMGLRSWLAAPWGALPPRPPLLLLLLLLLLLQPPP----PTWAL--SPRISLPLGS
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CCDS55 MWGRLWP----LLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPY--
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CCDS55 EELSGTRHFKGQAQNYSTLLLEEASARLLVGARGALFSLSAND--IGDGAHKEIHWEASP
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pF1KA1 EKKQQCSFKGKDPQRDCQNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYINMENFTLARDEKG
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CCDS55 EMQSKCHQKGKNNQTECFNHVRFLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTS---
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pF1KA1 NVLLEDGKGRCPFDPNFKSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRSQSLRPTKTESS-LN
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CCDS55 ---FEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGLYTATRYEFR-SIPDIRRSRHPHSLRTEETPMH
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pF1KA1 WLQDPAFVASAYIPESLGSLQGDDDKIYFFFSETGQEF---EFFENTI---VSRIARICK
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CCDS55 WLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYYFFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVCK
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pF1KA1 GDEGGERVLQQRWTSFLKAQLLCSRPDDGFPFNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFT--
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CCDS55 GDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIP----LYETLRGVCSLDAETSS--RTHFYAAFTLS
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pF1KA1 SQWHRGTTEGSAVCVFTMKDVQRVFSGLYKEVNRETQQWYTVTHPVPTPRPGACITNSAR
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CCDS55 TQWK--TLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEYQDGSRRWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLR
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pF1KA1 ERKINSSLQLPDRVLNFLKDHFLMDGQV---RSRMLLLQPQARYQRVAVHRV--PGLHHT
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CCDS55 SQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPTRGRPLLLKRNIRYTHLTGTPVTTPA-GPT
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pF1KA1 YDVLFLGTGDGRLHKAVSVGPRVHIIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQ
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CCDS55 YDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQVFRESQSVENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQ
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pF1KA1 VPMANCSLYRSCGDCLLARDPYCAWS-GS-SCKHVSLY--QPQLATRPWIQDIEGA----
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CCDS55 LPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTHACAAATTIANRSQGSRTALIQDIERGNRGC
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pF1KA1 -SAKDLCSASSVVSPSFVPTGEKPCEQVQFQPNTVNTLACPLLSNLATRLWLRNGAPVNA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]