Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1619
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1619, 843 aa
1>>>pF1KA1619 843 - 843 aa - 843 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4438+/-0.000903; mu= 8.8162+/- 0.055
mean_var=218.6042+/-43.770, 0's: 0 Z-trim(113.6): 52 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.086745
statistics sampled from 14200 (14252) to 14200 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.745), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16
Scan time: 4.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 843) 5728 730.1 3.9e-210
CCDS55724.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 702) 3869 497.4 3.7e-140
CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 1789 237.1 9.5e-62
CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 1485 199.1 2.8e-50
CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 1412 189.9 1.4e-47
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 1394 187.7 7.2e-47
CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 1221 166.0 2.2e-40
CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 1186 161.6 4.7e-39
CCDS1955.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 770) 1158 158.1 5.3e-38
CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 1049 144.5 6.6e-34
CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 1011 139.7 1.8e-32
CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 970 134.6 6.3e-31
CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3 ( 782) 910 127.1 1.2e-28
CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 737) 899 125.7 2.9e-28
CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 823 116.2 2.2e-25
CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 777 110.4 1.2e-23
CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 764 108.8 3.5e-23
CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 746 106.5 1.6e-22
CCDS62942.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 615) 699 100.6 8.8e-21
CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 754) 695 100.2 1.4e-20
CCDS77745.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 406) 563 83.4 8.6e-16
CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 629) 491 74.6 6.1e-13
CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 491 74.6 7.1e-13
CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 468 71.9 6.5e-12
CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 468 71.9 6.6e-12
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 467 71.8 7.2e-12
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 467 71.8 7.7e-12
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 467 71.8 7.9e-12
>>CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 (843 aa)
initn: 5728 init1: 5728 opt: 5728 Z-score: 3886.1 bits: 730.1 E(32554): 3.9e-210
Smith-Waterman score: 5728; 100.0% identity (100.0% similar) in 843 aa overlap (1-843:1-843)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MWGRLWPLLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPYEELSGTRHFKGQAQNYSTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MWGRLWPLLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPYEELSGTRHFKGQAQNYSTLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LEEASARLLVGARGALFSLSANDIGDGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LEEASARLLVGARGALFSLSANDIGDGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 FLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTSFEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTSFEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 YTATRYEFRSIPDIRRSRHPHSLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YTATRYEFRSIPDIRRSRHPHSLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVCKGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIPLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVCKGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIPLYE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEYQDGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEYQDGSR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPTRGRPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPTRGRPLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LKRNIRYTHLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQVFRESQSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LKRNIRYTHLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQVFRESQSV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 ENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTHACAAATTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTHACAAATTI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ANRSQGSRTALIQDIERGNRGCESSRDTGPPPPLKTRSVLRGDDVLLPCDQPSNLARALW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ANRSQGSRTALIQDIERGNRGCESSRDTGPPPPLKTRSVLRGDDVLLPCDQPSNLARALW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LLNGSMGLSDGQGGYRVGVDGLLVTDAQPEHSGNYGCYAEENGLRTLLASYSLTVRPATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLNGSMGLSDGQGGYRVGVDGLLVTDAQPEHSGNYGCYAEENGLRTLLASYSLTVRPATP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 APAPKAPATPGAQLAPDVRLLYVLAIAALGGLCLILASSLLYVACLREGRRGRRRKYSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 APAPKAPATPGAQLAPDVRLLYVLAIAALGGLCLILASSLLYVACLREGRRGRRRKYSLG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 RASRAGGSAVQLQTVSGQCPGEEDEGDDEGAGGLEGSCLQIIPGEGAPAPPPPPPPPPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RASRAGGSAVQLQTVSGQCPGEEDEGDDEGAGGLEGSCLQIIPGEGAPAPPPPPPPPPPA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 ELTNGLVALPSRLRRMNGNSYVLLRQSNNGVPAGPCSFAEELSRILEKRKHTQLVEQLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ELTNGLVALPSRLRRMNGNSYVLLRQSNNGVPAGPCSFAEELSRILEKRKHTQLVEQLDE
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SSV
:::
CCDS75 SSV
>>CCDS55724.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 (702 aa)
initn: 3869 init1: 3869 opt: 3869 Z-score: 2629.8 bits: 497.4 E(32554): 3.7e-140
Smith-Waterman score: 3869; 100.0% identity (100.0% similar) in 569 aa overlap (1-569:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MWGRLWPLLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPYEELSGTRHFKGQAQNYSTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MWGRLWPLLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPYEELSGTRHFKGQAQNYSTLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LEEASARLLVGARGALFSLSANDIGDGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LEEASARLLVGARGALFSLSANDIGDGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 FLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTSFEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTSFEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 YTATRYEFRSIPDIRRSRHPHSLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YTATRYEFRSIPDIRRSRHPHSLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVCKGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIPLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVCKGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIPLYE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEYQDGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEYQDGSR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPTRGRPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPTRGRPLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LKRNIRYTHLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQVFRESQSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKRNIRYTHLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQVFRESQSV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 ENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTHACAAATTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTHACAAATTI
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 ANRSQGSRTALIQDIERGNRGCESSRDTGPPPPLKTRSVLRGDDVLLPCDQPSNLARALW
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ANRSQGSRTALIQDIERGNRGCESSRDTGRALQVHMGSMSPPSAWPCVLDGPETRQDLCQ
550 560 570 580 590 600
>>CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 (833 aa)
initn: 1648 init1: 533 opt: 1789 Z-score: 1222.1 bits: 237.1 E(32554): 9.5e-62
Smith-Waterman score: 1881; 42.8% identity (66.5% similar) in 830 aa overlap (34-830:29-821)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 RLWPLLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPYEELSGT-RHFKGQA-QNYSTLLL
:: :. ::. . :.:. . :.. :: :
CCDS20 MAPHWAVWLLAARLWGLGIGAEVWWNLVPRKTVSSGELATVVRRFSQTGIQDFLTLTL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EEASARLLVGARGALFSLSANDIG-DGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVR
: .. : :::: :::..: . . .:: : ::: : ...: :::::::::::: .:
CCDS20 TEPTGLLYVGAREALFAFSMEALELQGA---ISWEAPVEKKTECIQKGKNNQTECFNFIR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KA1 FLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTS-FEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGG
::: :..:::.:::.:::: :. .. .::: . ::.:: :::::::.: .::..::
CCDS20 FLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKGHAGLLVDGE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LYTATRYEFRSI-PDIRRSRHPH-SLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDK
::.:: .: . : : :. :: :..:: . :::. .:: :. : :: .: .:::::
CCDS20 LYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHSMKTEYLAF-WLNEPHFVGSAYVPESVGSFTGDDDK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VYYFFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVCKGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIP
::.:: :::.: .. . . :::::::::::.:: . ::.:::.:::::: : :
CCDS20 VYFFFRERAVE------SDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLACSAP
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 ---LY-ETLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYM
:: . :... .:. . : :...: ..:: . ::::.:.: ::: :: :::
CCDS20 NWQLYFNQLQAMHTLQDTSWHNTTFFGVF--QAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFEGPYK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 EYQDGSRRWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVP
::.. ...: :: :: :::::::.. : .::.:: .::. .:.::: :::: . : :
CCDS20 EYHEEAQKWDRYTDPVPSPRPGSCINNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHPLMEEQVGP
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 TRGRPLLLKRNIRYTHLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQV
.::::.:.. .:::.. :: : :: .::.::.:::. ::: :: .:.::: :.
CCDS20 RWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWVHLIEELQL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 FRESQSVENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTHA
: ... ...::.: .. :..:. : ..:::...: .:::: ::.:::::::.:. .:
CCDS20 F-DQEPMRSLVLSQSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLARDPYCAWSVNTSR
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KA1 CAAATTIANRSQGSRTALIQDIERGNRG--CE--SSRDTGPPPPLKTRSVLRGDDVLLPC
:.: ....: :: ::: . .. . :. .:. . : : :. .:. : :..:::
CCDS20 CVA---VGGHS-GS--LLIQHVMTSDTSGICNLRGSKKVRPTP--KNITVVAGTDLVLPC
530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 DQPSNLARALWLLNGSMGLSDGQGG---YRVGVDGLLVTDAQPEHSGNYGCYAEENGLRT
::::.: : ..: : : : : . ...:.: :::.:.: : :..::.: :
CCDS20 HLSSNLAHARWTFGGR-DLPAEQPGSFLYDARLQALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARL
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 LLASYSLTVRPATPAPAPKAPATPGAQLAPDVRLLYVLAIAALGGLCLILASSLLYVACL
.: ..: : :. . .: : : .:. : ::..:::..::.: :: : :
CCDS20 AAEGYLVAVV-AGPSVTLEARA-PLENLG-----LVWLAVVALGAVCLVL---LLLVLSL
640 650 660 670 680
710 720 730 740 750
pF1KA1 REGRRGRRRKYSLGRAS-RAGGSAVQL--QTVSGQ---CPGEEDEG--DDEGAGGLEGSC
: :: :.. . ..:. :. ..: . .: :: : :: : : .::
CCDS20 R--RRLREELEKGAKATERTLVYPLELPKEPTSPPFRPCP-EPDEKLWDPVGYYYSDGS-
690 700 710 720 730 740
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 LQIIPGEGAPAPPPPPPPPPPAELTNGLVALPSRL-----RRMNGNSYVLLR---QSNNG
:.:.::.. : :: :::. . . . :.:: : :.:.:: :. .. .:
CCDS20 LKIVPGHARCQPGGGPPSPPPG-IPGQPLPSPTRLHLGGGRNSNANGYVRLQLGGEDRGG
750 760 770 780 790 800
820 830 840
pF1KA1 VPAGPCSFAEELSRILEKRKHTQLVEQLDESSV
. .:.:: : :..:.
CCDS20 LGHPLPELADELRRKLQQRQPLPDSNPEESSV
810 820 830
>>CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 (862 aa)
initn: 721 init1: 721 opt: 1485 Z-score: 1016.3 bits: 199.1 E(32554): 2.8e-50
Smith-Waterman score: 1485; 38.8% identity (66.3% similar) in 665 aa overlap (34-678:28-672)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 RLWPLLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPYEELSGTRHFKGQAQNYSTLLLEE
::.: ..:. .. . . :::.::: :
CCDS66 MRMCTPIRGLLMALAVMFGTAMAFAPIPRITWEHREVHLVQFHEPDIYNYSALLLSE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ASARLLVGARGALFSLSANDIGDGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVRFLQ
. : .::: :.:...: .:.. : :..:..: . ..:: .:::..::::.:..: ::
CCDS66 DKDTLYIGAREAVFAVNALNISEKQH-EVYWKVSEDKKAKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTSFEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGLYTA
:..: ::.:::.:::: : .. .: . . :.:: .::.:::...:....:: ::..
CCDS66 PLSATSLYVCGTNAFQPACDHLNLTSFKFLGKNEDGKGRCPFDPAHSYTSVMVDGELYSG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 TRYEFR-SIPDIRRSRHPHSLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYYFF
: :.: : : : :. :::: . . :::. :::. ..:.: : :.::.::.::
CCDS66 TSYNFLGSEPIISRNSSHSPLRTEYA-IPWLNEPSFVFADVIRKSPDSPDGEDDRVYFFF
180 190 200 210 220 230
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:: ..: :. . :.::::::: :: . ::::::::::::::: : .
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...:: : : . . ::: :: : ... ::.: :.:. . ::. : ::.
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pF1KA1 YQDGSRRWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPT
... .: ::.: ::.::::.:: . :. .:.:: .::. .:.::: :::: :.:
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pF1KA1 RGRPLLLKRNIRYTHLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGWIHKAVVLGSGMHIIEETQVF
.:: :.:... ::... . . : .::..:..: : .:::. : ..:::::::.:
CCDS66 DNRPRLIKKDVNYTQIVVDRTQALDGTVYDVMFVSTDRGALHKAISLEHAVHIIEETQLF
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pF1KA1 RESQSVENLVISLLQHS--LYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTH
.. . :..:..: . . .:.:. :::.: ::. :... .: ::.:::::::.:.: :
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pF1KA1 ACAAATTIANRSQGSRTALIQDIERGNRGCESSRDTGPPPPLKTRSVLRGDDVLLPCDQP
.:.: . :.: :::.. :. . ... : . . .: . : :.:
CCDS66 TCVALHQTESPSRG----LIQEMS-GDASVCPDKSKGS---YRQHFFKHGGTAELKCSQK
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:::::..: . :: . . . : .: .::. . . :: : : .:: . . .
CCDS66 SNLARVFWKFQNGVLKAESPKYGL-MGRKNLLIFNLSEGDSGVYQCLSEERVKNKTVFQV
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pF1KA1 LASYSLTVRPATPAP--APKAPA--TPGAQLAPDVRLLYVLAIAALGGLCLILASSLLYV
.:.. : :. ..: : :: . : :...: :
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CCDS66 PPKPAPTGTSCEPKIVINTVPQLHSEKTMYLKSSDNRLLMSLFLFFFVLFLCLFFYNCYK
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10 20 30 40 50 60
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: :.: : : : :. :::: . . :::. :::. ..:.: : :.::.::.::
CCDS47 TSYNFLGSEPIISRNSSHSPLRTEYA-IPWLNEPSFVFADVIRKSPDSPDGEDDRVYFFF
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:: ..: :. : . :.::::::: :: . ::::::::::::::: : .
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...:: : : . . ::: :: : ... ::.: :.:. . ::. : ::.
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.:: :.:... ::... . . : .::..:..: : .:::. : ..:::::::.:
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pF1KA1 RESQSVENLVISLLQHS--LYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRSCYDCILARDPYCGWDPGTH
.. . :..:..: . . .:.:. :::.: ::. :... .: ::.:::::::.:.: :
CCDS47 QDFEPVQTLLLSSKKGNRFVYAGSNSGVVQAPLAFCGKHGTCEDCVLARDPYCAWSPPTA
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pF1KA1 ACAAATTIANRSQGSRTALIQDIERGNRGCESSRDTGPPPPLKTRSVLRGDDVLLPCDQP
.:.: . :.: :::.. : .: :::
CCDS47 TCVALHQTESPSRG----LIQEMSGDASVCPASSPKPLPPPGSSSLSCLGHVGDRRLSSP
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pF1KA1 SNLARALWLLNGSMGLSDGQGGYRVGVDGLLVTDAQPEHSGNYGCYAEENGLRTLLASYS
CCDS47 WTPWPASGAGPDSSSRVSLLPPFLSDQAQHVHALGNFYLFCQATGPADIRFVWEKNGRAL
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:: : . .::..::: . . : :::: :::.::.: . : ..:. : :.
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pF1KA1 EMQSKCHQKGKNNQTECFNHVRFLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEAFTLPTS---
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CCDS45 EKKQQCSFKGKDPQRDCQNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYINMENFTLARDEKG
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pF1KA1 ---FEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGLYTATRYEFRSI-PDIRRSRHPHSLRTEETPMH
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.::. : :.::.: . . ..: ::.: : : . ...: :: ::::.:::.: :
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CCDS45 YDVLFLGTGDGRLHKAVSVGPRVHIIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQ
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.:...:: :::: ::.:::::::.:. :. .: .. . : . ::::: ..
CCDS45 VPMANCSLYRSCGDCLLARDPYCAWS-GS-SCKHVSLY--QPQLATRPWIQDIEGASAKD
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pF1KA1 -CESSRDTGP---PPPLKT--RSVLRGDDV-LLPCDQPSNLARALWLLNGSMGLSDGQGG
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CCDS45 LCSASSVVSPSFVPTGEKPCEQVQFQPNTVNTLACPLLSNLATRLWLRNGA-PVNASASC
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CCDS45 HVLPTGDLLLVGTQ--QLGEFQCWSLEEGFQQLVASYCPEVVEDGVADQTDEGGSVPVII
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pF1KA1 APDVRLLYVLAIAALGGLCLILASSLLYVACLREGRRGRRRKYSLGRASRAGGSAVQLQT
CCDS45 STSRVSAPAGGKASWGADRSYWKEFLVMCTLFVLAVLLPVLFLLYRHRNSMKVFLKQGEC
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pF1KA1 YSTLLLEEASARLLVGARGALFSLSANDIGDGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTEC
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CCDS55 YHTFLLDEERSRLYVGAKDHIFSFDLVNIKD--FQKIVWPVSYTRRDECKWAGKDILKEC
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pF1KA1 FNHVRFLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDA------EAFTLPTS-FEEGKEKCPYDPA
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CCDS55 ANFIKVLKAYNQTHLYACGTGAFHPICTYIEIGHHPEDNIFKLENSHFENGRGKSPYDPK
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pF1KA1 RGFTGLIIDGGLYTATRYEF--RSIPDIRRSRHPHSLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRE
..:.::: ::..: .: :.. .: : : .:::. .:::: .:. . :. :
CCDS55 LLTASLLIDGELYSGTAADFMGRDFAIFRTLGHHHPIRTEQHDSRWLNDPKFISAHLISE
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pF1KA1 SKASAVGDDDKVYYFFTERATE-EGSGSFTQSRSSHRVARVARVCKGDLGGKKILQKKWT
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CCDS55 SDNP---EDDKVYFFFRENAIDGEHSG-----KATH--ARIGQICKNDFGGHRSLVNKWT
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.:::::::: .: .. :. : .. . . :..:: :.. ...::.:
CCDS55 TFLKARLICSVPGPNGIDTHFDELQDVFLMNFKDPKNPVVYGVFTTSSN--IFKGSAVCM
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CCDS55 YSMSDVRRVFLGPYAHRDGPNYQWVPYQGRVPYPRPGTCPSKTF--GGFDSTKDLPDDVI
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CCDS55 TFARSHPAMYNPVFPMNNRPIVIKTDVNYQFTQIVVDRVDAEDGQ-YDVMFIGTDVGTVL
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pF1KA1 KAVVLGSGMH------IIEETQVFRESQSVENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSR
:.: . . ..:: :::: .. . .: :..::.:. .:: :::: :.
CCDS55 KVVSIPKETWYDLEEVLLEEMTVFREPTAISAMELSTKQQQLYIGSTAGVAQLPLHRCDI
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: ..: .: :::::::.:: :. ::. :.: .: :::. :. : . .
CCDS55 YGKACAECCLARDPYCAWD-GS-ACSRYFPTAKRR--TRR---QDIRNGDPLTHCSDLHH
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pF1KA1 DT--GPPPPLKTRSVLRGDDVLLPCDQPSNLARALWLLNGSMGLSDGQ---GGYRVGVD-
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CCDS55 DNHHGHSPEERIIYGVENSSTFLECSPKSQRALVYWQFQRRNEERKEEIRVDDHIIRTDQ
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pF1KA1 GLLVTDAQPEHSGNYGCYAEENGLRTLLASYSLTVRPATPAPAPKAPATPGAQLAPDVRL
:::. . : . :::: :.: :.:. : . .: :
CCDS55 GLLLRSLQQKDSGNYLCHAVEHGFIQTLLKVTLEVIDTEHLEELLHKDDDGDGSKTKEMS
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pF1KA1 LYVLAIAALGGLCLILASSLLYVACLREGRRGRRRKYSLGRASRAGGSAVQLQTVSGQCP
CCDS55 NSMTPSQKVWYRDFMQLINHPNLNTMDEFCEQVWKRDRKQRRQRPGHTPGNSNKWKHLQE
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10 20 30 40
pF1KA1 MWGRLWPLLLSILTATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPYEEL---S
:.: :. .:. : . : .... ::. . :..: .
CCDS34 MNANKDERLKARSQDFHLFPALM-MLSMTMLFLPVTGTLKQNI---PRLKLTYKDLLLSN
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pF1KA1 GTRHFKGQAQ--NYSTLLLEEASARLLVGARGALFSLSANDIGDGAHKEIHWEASPEMQS
. : :... ...::::.: .:::.::. .: :: :. . :.:.: :. :
CCDS34 SCIPFLGSSEGLDFQTLLLDEERGRLLLGAKDHIFLLSLVDL-NKNFKKIYWPAAKERVE
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pF1KA1 KCHQKGKNNQTECFNHVRFLQRLNSTHLYACGTHAFQPLCAAIDAEA------FTLPT-S
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CCDS34 LCKLAGKDANTECANFIRVLQPYNKTHIYVCGTGAFHPICGYIDLGVYKEDIIFKLDTHN
120 130 140 150 160 170
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pF1KA1 FEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGLYTATRYEFRSIPD-IRRSRHP----HSLRTEETPM
.: :. :::.:: . :.... : ::..: .: . . :: : : .::. .
CCDS34 LESGRLKCPFDPQQPFASVMTDEYLYSGTASDFLGKDTAFTRSLGPTHDHHYIRTDISEH
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220 230 240 250 260 270
pF1KA1 HWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYYFFTERATEEGSGSFTQSRSSHRVARVARVC
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CCDS34 YWLNGAKFIGTFFIPDTYNP---DDDKIYFFFRE-SSQEGS---TSDKTI--LSRVGRVC
240 250 260 270 280
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pF1KA1 KGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIP-------LYETLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFT
:.:.::.. : .:::.:::::::: :: .. :. . : .. :..::
CCDS34 KNDVGGQRSLINKWTTFLKARLICSIPGSDGADTYFDELQDIYLLPTRDERNPVVYGVFT
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330 340 350 360 370 380
pF1KA1 LSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEYQDGSRRWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLR
... ...::.: :..:.:.::: ::: . .....:: .:.: .: ::::.: . .
CCDS34 TTSS--IFKGSAVCVYSMADIRAVFNGPYAHKESADHRWVQYDGRIPYPRPGTCPSKTY-
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390 400 410 420 430 440
pF1KA1 SQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPTRGRPLLLKRNIRY--THLTGTPVTTPAGP
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CCDS34 DPLIKSTRDFPDDVISFIKRHSVMYKSVYPVAGGPTFKRINVDYRLTQIVVDHVIAEDGQ
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KA1 TYDLLFLGTADGWIHKAVVLGS---GMH--IIEETQVFRESQSVENLVISLLQHSLYVGA
::..:::: : . :.: ... .:. ..:: :.:..:. . :. .:: :..::.:.
CCDS34 -YDVMFLGTDIGTVLKVVSISKEKWNMEEVVLEELQIFKHSSIILNMELSLKQQQLYIGS
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pF1KA1 PSGVIQLPLSSCSRY-RSCYDCILARDPYCGWDPGTHACAAATTIANRSQGSRTALIQDI
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CCDS34 RDGLVQLSLHRCDTYGKACADCCLARDPYCAWDG--NAC---SRYAPTSK--RRARRQDV
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CCDS34 KYGDPITQCWDIEDSISHETADEKVIFGIEFNSTFLECIPKSQQATIKWYIQRSGDEHRE
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CCDS34 ELKPDERIIKTEYGLLIRSLQKKDSGMYYCKAQEHTFIHTIVKLTLNVIENEQMENTQRA
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CCDS34 EHEEGKVKDLLAESRLRYKDYIQILSSPNFSLDQYCEQMWHREKRRQRNKGGPKWKHMQE
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CCDS19 AVALSPAEWGDEDGDDEIYFFFTET-----SRAF-DSYERIKVPRVARVCAGDLGGRKTL
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.:.:: .:. . ..:. .: : : :::. : :: : ::. . : :. ..:.: .:
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CCDS19 LGILAASLTLILIGR--RQQRRRQRELLARDKVGLDLGAPPSGTTSYSQDPPSPSPEDER
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CCDS77 LERTCCYQALLVDEERGRLFVGAENHVASLNLDNISKRA-KKLAWPAPVEWREECNWAGK
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CCDS77 DIGTECMNFVKLLHAYNRTHLLACGTGAFHPTCAFVEVGHRAEEPVLRLDPGRIEDGKGK
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CCDS77 SPYDPRHRAASVLVGEELYSGVAADLMGRDFTIFRSLGQRPSLRTEPHDSRWLNEPKFVK
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CCDS77 VFWIPESENP---DDDKIYFFFRETAVEAAPA---LGRLS--VSRVGQICRNDVGGQRSL
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CCDS77 HW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]