Result of FASTA (omim) for
pF1KA1611
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1611, 818 aa
1>>>pF1KA1611 818 - 818 aa - 818 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6581+/-0.00131; mu= 11.1709+/- 0.080
mean_var=381.2712+/-76.818, 0's: 0 Z-trim(106.7): 2154 B-trim: 88 in 2/47
Lambda= 0.065684
statistics sampled from 12479 (14805) to 12479 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.451), E-opt: 0.2 (0.174), width: 16
Scan time: 8.900
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 5799 566.3 1.9e-160
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 5799 566.3 1.9e-160
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 5558 543.4 1.4e-153
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 5558 543.4 1.4e-153
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 5558 543.4 1.4e-153
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2726 275.3 1e-72
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2726 275.3 1e-72
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2726 275.3 1e-72
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2726 275.3 1e-72
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2726 275.3 1e-72
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2726 275.4 1e-72
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2726 275.4 1.1e-72
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2636 266.8 3.9e-70
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2636 266.9 4e-70
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2623 265.3 7.2e-70
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2623 265.3 7.2e-70
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2623 265.3 7.5e-70
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2623 265.3 7.5e-70
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2623 265.3 7.6e-70
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2589 262.2 7.3e-69
XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2552 258.6 7.9e-68
XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2552 258.6 7.9e-68
XP_016867774 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2552 258.6 7.9e-68
XP_016867772 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2552 258.6 7.9e-68
>>NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (818 aa)
initn: 5799 init1: 5799 opt: 5799 Z-score: 3001.5 bits: 566.3 E(85289): 1.9e-160
Smith-Waterman score: 5799; 99.9% identity (99.9% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-818)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTRECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 HESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 FKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 HSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 TTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHM
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KA1 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
790 800 810
>>NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (818 aa)
initn: 5799 init1: 5799 opt: 5799 Z-score: 3001.5 bits: 566.3 E(85289): 1.9e-160
Smith-Waterman score: 5799; 99.9% identity (99.9% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-818)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTRECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 HESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKP
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pF1KA1 FKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCI
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550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
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610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 HSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 TTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHM
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KA1 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
790 800 810
>>XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger pro (818 aa)
initn: 5799 init1: 5799 opt: 5799 Z-score: 3001.5 bits: 566.3 E(85289): 1.9e-160
Smith-Waterman score: 5799; 99.9% identity (99.9% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-818)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTRECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 HESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQ
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XP_016 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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>>NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (818 aa)
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NP_001 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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pF1KA1 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
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NP_001 TTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHM
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NP_001 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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>>NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (818 aa)
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pF1KA1 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
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NP_001 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
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NP_001 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
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pF1KA1 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
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NP_001 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
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pF1KA1 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
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pF1KA1 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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NP_001 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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NP_001 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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pF1KA1 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
790 800 810
>>NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (818 aa)
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Smith-Waterman score: 5799; 99.9% identity (99.9% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-818)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
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pF1KA1 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTRECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
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pF1KA1 HESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQ
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pF1KA1 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
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pF1KA1 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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NP_001 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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pF1KA1 GEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKP
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NP_001 GEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKP
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pF1KA1 FKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCI
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pF1KA1 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
790 800 810
>>NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (818 aa)
initn: 5799 init1: 5799 opt: 5799 Z-score: 3001.5 bits: 566.3 E(85289): 1.9e-160
Smith-Waterman score: 5799; 99.9% identity (99.9% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-818)
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pF1KA1 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
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NP_001 MALTQVRLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRILYRDVMLENYWNLVSLGLCHFDMNIISML
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pF1KA1 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTRECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEGKEPWTVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLER
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pF1KA1 HESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQ
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pF1KA1 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNH
190 200 210 220 230 240
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pF1KA1 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNL
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pF1KA1 TIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQ
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NP_001 TIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQ
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pF1KA1 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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pF1KA1 GEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 FKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSM
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pF1KA1 HSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSL
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pF1KA1 TTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHM
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pF1KA1 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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NP_001 AIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
790 800 810
818 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 01:40:04 2016 done: Fri Nov 4 01:40:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]