Result of FASTA (omim) for
pF1KA1531
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1531, 1121 aa
1>>>pF1KA1531 1121 - 1121 aa - 1121 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0511+/-0.000387; mu= 10.5459+/- 0.024
mean_var=203.5904+/-41.822, 0's: 0 Z-trim(119.6): 326 B-trim: 1833 in 2/56
Lambda= 0.089887
statistics sampled from 33521 (33923) to 33521 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.398), width: 16
Scan time: 16.870
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_116166 (OMIM: 606823) adhesion G protein-couple (1338) 4002 532.8 5.3e-150
XP_005273528 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G ( 813) 3637 485.2 6.6e-136
XP_011542785 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G (1308) 3637 485.4 9.3e-136
XP_011542783 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G (1361) 3637 485.4 9.6e-136
XP_011542784 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G (1337) 3097 415.4 1.1e-114
XP_005248194 (OMIM: 612303) PREDICTED: adhesion G ( 833) 1772 243.4 4.3e-63
NP_660333 (OMIM: 612303) adhesion G protein-couple (1321) 1772 243.6 6e-63
XP_016863323 (OMIM: 612303) PREDICTED: adhesion G (1124) 1127 159.9 8e-38
XP_011512113 (OMIM: 612303) PREDICTED: adhesion G (1095) 930 134.3 3.9e-30
XP_005252752 (OMIM: 612302) PREDICTED: adhesion G (1279) 783 115.3 2.4e-24
NP_001077378 (OMIM: 612302) adhesion G protein-cou ( 560) 765 112.7 6.6e-24
XP_016872268 (OMIM: 612302) PREDICTED: adhesion G ( 328) 479 75.4 6.5e-13
XP_016874279 (OMIM: 608870) PREDICTED: leucine-ric ( 623) 387 63.7 4e-09
XP_011536195 (OMIM: 608870) PREDICTED: leucine-ric (1041) 387 63.9 5.9e-09
NP_001129523 (OMIM: 608870) leucine-rich repeats a (1059) 387 63.9 5.9e-09
NP_700356 (OMIM: 608870) leucine-rich repeats and (1119) 387 63.9 6.2e-09
XP_011531880 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric (1045) 377 62.6 1.4e-08
XP_016861625 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 375 62.2 1.5e-08
XP_011531881 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 375 62.2 1.5e-08
XP_016861624 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric ( 867) 375 62.3 1.5e-08
XP_016861623 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric (1068) 375 62.3 1.8e-08
NP_056356 (OMIM: 608868) leucine-rich repeats and (1093) 375 62.3 1.8e-08
NP_001299615 (OMIM: 608869,615112) leucine-rich re ( 962) 357 60.0 8.2e-08
NP_055628 (OMIM: 608869,615112) leucine-rich repea (1065) 357 60.0 8.8e-08
XP_011538575 (OMIM: 612302) PREDICTED: adhesion G ( 391) 336 56.9 2.8e-07
NP_001278014 (OMIM: 612302) adhesion G protein-cou ( 463) 336 56.9 3.2e-07
NP_036425 (OMIM: 269400,605158) peroxidasin homolo (1479) 332 56.9 1.1e-06
XP_005271426 (OMIM: 608869,615112) PREDICTED: leuc ( 958) 324 55.7 1.6e-06
XP_016865268 (OMIM: 603745) PREDICTED: slit homolo (1460) 315 54.7 4.8e-06
NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein is (1523) 315 54.7 5e-06
NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein (1530) 315 54.7 5e-06
NP_001010847 (OMIM: 615212) leucine-rich repeat-co ( 294) 295 51.4 9.2e-06
NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein pr (1534) 307 53.7 1e-05
NP_644807 (OMIM: 608302) leucine-rich repeat LGI f ( 548) 292 51.3 1.9e-05
XP_005264764 (OMIM: 269400,605158) PREDICTED: pero (1455) 298 52.5 2.2e-05
XP_011515761 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin ( 757) 291 51.3 2.6e-05
XP_011515759 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 296 52.2 2.6e-05
XP_005269337 (OMIM: 603104) PREDICTED: carboxypept ( 545) 285 50.4 3.5e-05
NP_001278917 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 285 50.4 3.5e-05
NP_001073982 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 285 50.4 3.5e-05
NP_653252 (OMIM: 615904) peroxidasin-like protein (1463) 291 51.6 4.2e-05
NP_644813 (OMIM: 608303) leucine-rich repeat LGI f ( 537) 282 50.0 4.6e-05
XP_016877935 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 468) 280 49.7 4.9e-05
XP_016872400 (OMIM: 600512,604619) PREDICTED: leuc ( 281) 274 48.7 5.9e-05
NP_001295204 (OMIM: 600512,604619) leucine-rich gl ( 291) 274 48.7 6e-05
XP_011515758 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 286 50.9 6.5e-05
NP_001123610 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 280 49.9 6.9e-05
XP_011520143 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745) 280 49.9 6.9e-05
NP_001123609 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 280 49.9 6.9e-05
NP_065902 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfamil ( 745) 280 49.9 6.9e-05
>>NP_116166 (OMIM: 606823) adhesion G protein-coupled re (1338 aa)
initn: 3995 init1: 3995 opt: 4002 Z-score: 2814.0 bits: 532.8 E(85289): 5.3e-150
Smith-Waterman score: 5940; 81.1% identity (81.2% similar) in 1153 aa overlap (186-1121:186-1338)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 PRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEH
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 PRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEH
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 TLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 TLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGN
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 DTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 DTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQG
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 NASKKVEIVVLETSASYCPAERVANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 NASKKVEIVVLETSASYCPAERVANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAP
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 GTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 GTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAA
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 SFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRI
460 470 480 490 500 510
520 530
pF1KA1 VGALERIGGAALSPHAQHISV---------------------------------------
:::::::::::::::::::::
NP_116 VGALERIGGAALSPHAQHISVNARNVALEAYLIKPHSYVGLTCTAFQRREGGVPGTRPGS
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
NP_116 PGQNPPPEPEPPADQQLRFRCTTGRPNVSLSSFHIKNSVALASIQLPPSLFSSLPAALAP
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
NP_116 PVPPDCTLQLLVFRNGRLFHSHSNTSRPGAAGPGKRRGVATPVIFAGTSGCGVGNLTEPV
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 ----------------------------------------------------------EL
::
NP_116 AVSLRHWAEGAEPVAAWWSQEGPGEAGGWTSEGCQLRSSQPNVSALHCQHLGNVAVLMEL
700 710 720 730 740 750
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 SAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 SAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHI
760 770 780 790 800 810
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 AMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 AMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGD
820 830 840 850 860 870
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 PALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 PALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALI
880 890 900 910 920 930
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 LLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 LLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLAT
940 950 960 970 980 990
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 GSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 GSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYG
1000 1010 1020 1030 1040 1050
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 VAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 VAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 SLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 SLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNN
1120 1130 1140 1150 1160 1170
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 VHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGGLHNSPTDSYLGSSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_116 VHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGSLHNSPTDSYLGSSR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 NSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 NSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSY
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 PLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 PLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
1300 1310 1320 1330
>--
initn: 1243 init1: 1243 opt: 1243 Z-score: 880.3 bits: 175.0 E(85289): 2.7e-42
Smith-Waterman score: 1243; 100.0% identity (100.0% similar) in 185 aa overlap (1-185:1-185)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
:::::
NP_116 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
190 200 210 220 230 240
>>XP_005273528 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G prot (813 aa)
initn: 3905 init1: 3634 opt: 3637 Z-score: 2561.0 bits: 485.2 E(85289): 6.6e-136
Smith-Waterman score: 3637; 96.1% identity (97.3% similar) in 565 aa overlap (1-562:1-561)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERVAN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHISVELSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_005 KELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHISVN---
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KA1 FPREVGGAGAGLHPVVY---PCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFH
:.:. . ..: : :::.
XP_005 -ARNVALEAYLIKPHSYVGLTCTAFQRREGGVPGTRPGSPGQNPPPEPEPPADQQLRFRC
540 550 560 570 580 590
>--
initn: 349 init1: 285 opt: 294 Z-score: 218.0 bits: 51.7 E(85289): 2.1e-05
Smith-Waterman score: 294; 75.4% identity (83.6% similar) in 61 aa overlap (530-585:742-802)
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 HLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHIS-----VELSAFPREVGGAGAGLHP
: ::.. .::::::::::::::::::
XP_005 WWSQEGPGEAGGWTSEGCQLRSSQPNVSALHCQHLGNVAVLMELSAFPREVGGAGAGLHP
720 730 740 750 760 770
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 VVYPCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNY
:::::::::::::::::::::::: . . :
XP_005 VVYPCTALLLLCLFATIITYILNHRYVPAPRGSPSGLETPWA
780 790 800 810
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 QMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLRFYLIA
>>XP_011542785 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G prot (1308 aa)
initn: 6500 init1: 3634 opt: 3637 Z-score: 2558.3 bits: 485.4 E(85289): 9.3e-136
Smith-Waterman score: 5900; 79.1% identity (79.1% similar) in 1183 aa overlap (1-966:1-1153)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERVAN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KA1 KELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHISV----
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHISVNARN
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
XP_011 VALEAYLIKPHSYVGLTCTAFQRREGGVPGTRPGSPGQNPPPEPEPPADQQLRFRCTTGR
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
XP_011 PNVSLSSFHIKNSVALASIQLPPSLFSSLPAALAPPVPPDCTLQLLVFRNGRLFHSHSNT
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
XP_011 SRPGAAGPGKRRGVATPVIFAGTSGCGVGNLTEPVAVSLRHWAEGAEPVAAWWSQEGPGE
670 680 690 700 710 720
540 550 560
pF1KA1 ---------------------------------ELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALL
:::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGGWTSEGCQLRSSQPNVSALHCQHLGNVAVLMELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALL
730 740 750 760 770 780
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 LLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGI
790 800 810 820 830 840
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 TLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLR--------------
850 860 870 880
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 ITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ----------------CWLVWRPSLGAFYIPVALILLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKA
890 900 910 920 930
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 GNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLATGSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLATGSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLG
940 950 960 970 980 990
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 ALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVAASALGLFVFTHHCARRRDVRASW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVAASALGLFVFTHHCARRRDVRASW
1000 1010 1020 1030 1040 1050
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 RACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 LAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNR
1120 1130 1140 1150 1160 1170
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA1 LKALRGGAAGALELLSSESGGLHNSPTDSYLGSSRNSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSA
XP_011 LKALRGGAAGALELLSSESGSLHNSPTDSYLGSSRNSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSA
1180 1190 1200 1210 1220 1230
>--
initn: 1005 init1: 1005 opt: 1005 Z-score: 713.7 bits: 144.1 E(85289): 5.2e-33
Smith-Waterman score: 1005; 99.4% identity (100.0% similar) in 155 aa overlap (967-1121:1154-1308)
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 GGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 LLSSESGGLHNSPTDSYLGSSRNSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRR
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLSSESGSLHNSPTDSYLGSSRNSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRR
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 SASRDSLKGGGALEKESHRRSYPLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SASRDSLKGGGALEKESHRRSYPLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWK
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1120
pF1KA1 SETTV
:::::
XP_011 SETTV
>>XP_011542783 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G prot (1361 aa)
initn: 6715 init1: 3634 opt: 3637 Z-score: 2558.1 bits: 485.4 E(85289): 9.6e-136
Smith-Waterman score: 5745; 79.2% identity (79.2% similar) in 1153 aa overlap (1-913:1-1153)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERVAN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KA1 KELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHISV----
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHISVNARN
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
XP_011 VALEAYLIKPHSYVGLTCTAFQRREGGVPGTRPGSPGQNPPPEPEPPADQQLRFRCTTGR
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
XP_011 PNVSLSSFHIKNSVALASIQLPPSLFSSLPAALAPPVPPDCTLQLLVFRNGRLFHSHSNT
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
XP_011 SRPGAAGPGKRRGVATPVIFAGTSGCGVGNLTEPVAVSLRHWAEGAEPVAAWWSQEGPGE
670 680 690 700 710 720
540 550 560
pF1KA1 ---------------------------------ELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALL
:::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGGWTSEGCQLRSSQPNVSALHCQHLGNVAVLMELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALL
730 740 750 760 770 780
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 LLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGI
790 800 810 820 830 840
630 640 650 660
pF1KA1 TLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLR--------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLRYILSIPALQLGRDS
850 860 870 880 890 900
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ---------FYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NAGVGNLPRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILL
910 920 930 940 950 960
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLATGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLATGS
970 980 990 1000 1010 1020
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 ARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 ASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 KSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVH
:::::::::::::
XP_011 KSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
>--
initn: 1382 init1: 1382 opt: 1382 Z-score: 977.6 bits: 193.0 E(85289): 1e-47
Smith-Waterman score: 1382; 99.5% identity (100.0% similar) in 208 aa overlap (914-1121:1154-1361)
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 AAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 PAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESG
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 GLHNSPTDSYLGSSRNSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSL
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLHNSPTDSYLGSSRNSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 KGGGALEKESHRRSYPLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGGGALEKESHRRSYPLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
1310 1320 1330 1340 1350 1360
>>XP_011542784 (OMIM: 606823) PREDICTED: adhesion G prot (1337 aa)
initn: 5940 init1: 3095 opt: 3097 Z-score: 2179.7 bits: 415.4 E(85289): 1.1e-114
Smith-Waterman score: 5702; 79.1% identity (79.2% similar) in 1153 aa overlap (209-1121:185-1337)
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLC
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLC
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 CEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 AESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERV
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 YTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVD
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 QIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHISV--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERIGGAALSPHAQHISVNA
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
XP_011 RNVALEAYLIKPHSYVGLTCTAFQRREGGVPGTRPGSPGQNPPPEPEPPADQQLRFRCTT
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
XP_011 GRPNVSLSSFHIKNSVALASIQLPPSLFSSLPAALAPPVPPDCTLQLLVFRNGRLFHSHS
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
XP_011 NTSRPGAAGPGKRRGVATPVIFAGTSGCGVGNLTEPVAVSLRHWAEGAEPVAAWWSQEGP
640 650 660 670 680 690
540 550 560
pF1KA1 -----------------------------------ELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTA
:::::::::::::::::::::::::
XP_011 GEAGGWTSEGCQLRSSQPNVSALHCQHLGNVAVLMELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTA
700 710 720 730 740 750
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 LLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAV
760 770 780 790 800 810
630 640 650 660
pF1KA1 GITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLR------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLRYILSIPALQLGR
820 830 840 850 860 870
670 680 690 700 710
pF1KA1 -----------FYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSNAGVGNLPRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALI
880 890 900 910 920 930
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 LLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLAT
940 950 960 970 980 990
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 GSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYG
1000 1010 1020 1030 1040 1050
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 VAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 SLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNN
1120 1130 1140 1150 1160 1170
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 VHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGGLHNSPTDSYLGSSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_011 VHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGSLHNSPTDSYLGSSR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 NSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSY
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 PLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
1300 1310 1320 1330
>--
initn: 830 init1: 786 opt: 786 Z-score: 560.0 bits: 115.7 E(85289): 1.9e-24
Smith-Waterman score: 1224; 88.5% identity (88.5% similar) in 208 aa overlap (1-208:1-184)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
XP_011 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTL------------------------DLRNNII
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
160 170 180 190 200 210
>>XP_005248194 (OMIM: 612303) PREDICTED: adhesion G prot (833 aa)
initn: 1270 init1: 798 opt: 1772 Z-score: 1253.7 bits: 243.4 E(85289): 4.3e-63
Smith-Waterman score: 1775; 51.6% identity (75.8% similar) in 545 aa overlap (4-537:5-543)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRS-CKCSGERPKGLSGGV
: :: :. : ::::: :: ::: . :. : .. . :: .: ::.: .: .
XP_005 MEPPGRRRGRAQPP-LLLPLS--LLALLALLGGGGGGGAAALPAGCKHDG-RPRG-AGRA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 PGPARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNN
: :. .::::. .: . : ::: ::::.::::::. :.:::: ::::::.::::::
XP_005 AGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 IISTVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDE
.::...:::: ::. ::::::.:::::::... :.:: :.:::.:::.::::. :.::
XP_005 LISSIDPGAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGTFDY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLC
: .:. ... ::.: :::.. :. :...... . . : :.::..:.:: . .... :
XP_005 LASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRD-TRCVYPKSLQAQPVTGVKQELLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 CEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILL
:. ::: . .. :: :::::.:: ::::: :::. .: .. ::.. :: ::. ::..
XP_005 CDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQCMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQGIFV
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 AESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERV
...::.:..:.: ::.:.: . ..:.: : :. .:: .. :.:::::.::.::: :::
XP_005 EKNMIHNCSLIASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYCPPERV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTR-ASRRCDRAGRWEPGDYSHC
.::.::::::::::::::: .: . : :. : : :::::.: : :::.:
XP_005 VNNKGDFRWPRTLAGITAYLQCTRNTHGSGIYPGNPQDERKAWRRCDRGGFWADDDYSRC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 LYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYV
:.::.::::: : ::.: .::.. :.:: .::.:::.::: :::..::.::.:: ..
XP_005 QYANDVTRVLYMFNQMPLNLTNAVATARQLLAYTVEAANFSDKMDVIFVAEMIEKFGRFT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KA1 --DQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERI------GGAAL-S
.. ::: .::::.:::.::.::..::::::: ::::::: :.:: ::: . :
XP_005 KEEKSKELGDVMVDIASNIMLADERVLWLAQREAKACSRIVQCLQRIATYRLAGGAHVYS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 PHAQHISVELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGW
.. .:..:
XP_005 TYSPNIALEAYVIKSTGFTGMTCTVFQKVAASDRTGLSDYGRRDPEGNLDKQLSFKCNVS
540 550 560 570 580 590
>--
initn: 298 init1: 298 opt: 304 Z-score: 224.9 bits: 53.0 E(85289): 8.7e-06
Smith-Waterman score: 304; 57.0% identity (79.7% similar) in 79 aa overlap (548-626:755-832)
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 ALERIGGAALSPHAQHISVELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILN
:.. :::::: . .:::::.:.:..:: .
XP_005 SDENITTIQCYSLSNYAVLMDLTGSELYTQAASLLHPVVYTTAIILLLCLLAVIVSYIYH
730 740 750 760 770 780
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 HSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMG
:: ::.: :.::::.:::::: .: .::.:::: : .:::. .: :
XP_005 HSLIRISLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFVGGITQTRNASICQAA-VTTHL
790 800 810 820 830
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pF1KA1 VKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHS
>>NP_660333 (OMIM: 612303) adhesion G protein-coupled re (1321 aa)
initn: 1793 init1: 798 opt: 1772 Z-score: 1251.1 bits: 243.6 E(85289): 6e-63
Smith-Waterman score: 2319; 39.9% identity (59.8% similar) in 1151 aa overlap (4-934:5-1129)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRS-CKCSGERPKGLSGGV
: :: :. : ::::: :: ::: . :. : .. . :: .: ::.: .: .
NP_660 MEPPGRRRGRAQPP-LLLPLS--LLALLALLGGGGGGGAAALPAGCKHDG-RPRG-AGRA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 PGPARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNN
: :. .::::. .: . : ::: ::::.::::::. :.:::: ::::::.::::::
NP_660 AGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNN
60 70 80 90 100 110
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pF1KA1 IISTVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDE
.::...:::: ::. ::::::.:::::::... :.:: :.:::.:::.::::. :.::
NP_660 LISSIDPGAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGTFDY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLC
: .:. ... ::.: :::.. :. :...... . . : :.::..:.:: . .... :
NP_660 LASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRD-TRCVYPKSLQAQPVTGVKQELLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 CEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILL
:. ::: . .. :: :::::.:: ::::: :::. .: .. ::.. :: ::. ::..
NP_660 CDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQCMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQGIFV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 AESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERV
...::.:..:.: ::.:.: . ..:.: : :. .:: .. :.:::::.::.::: :::
NP_660 EKNMIHNCSLIASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYCPPERV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTR-ASRRCDRAGRWEPGDYSHC
.::.::::::::::::::: .: . : :. : : :::::.: : :::.:
NP_660 VNNKGDFRWPRTLAGITAYLQCTRNTHGSGIYPGNPQDERKAWRRCDRGGFWADDDYSRC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 LYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYV
:.::.::::: : ::.: .::.. :.:: .::.:::.::: :::..::.::.:: ..
NP_660 QYANDVTRVLYMFNQMPLNLTNAVATARQLLAYTVEAANFSDKMDVIFVAEMIEKFGRFT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KA1 --DQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERI------GGAAL--
.. ::: .::::.:::.::.::..::::::: ::::::: :.:: ::: .
NP_660 KEEKSKELGDVMVDIASNIMLADERVLWLAQREAKACSRIVQCLQRIATYRLAGGAHVYS
480 490 500 510 520 530
530
pF1KA1 --SPHA--------------------QHIS------------------------------
::. :...
NP_660 TYSPNIALEAYVIKSTGFTGMTCTVFQKVAASDRTGLSDYGRRDPEGNLDKQLSFKCNVS
540 550 560 570 580 590
540
pF1KA1 ------------VELSA-----------------------------------FP------
:: : ::
NP_660 NTFSSLALKNTIVEASIQLPPSLFSPKQKRELRPTDDSLYKLQLIAFRNGKLFPATGNST
600 610 620 630 640 650
550
pF1KA1 ------------------------------------REVG-GA-------------GAG-
:... :: : :
NP_660 NLADDGKRRTVVTPVILTKIDGVNVDTHHIPVNVTLRRIAHGADAVAARWDFDLLNGQGG
660 670 680 690 700 710
560
pF1KA1 --------------------------------------------LHPVVYPCTALLLLCL
:::::: . .:::::
NP_660 WKSDGCHILYSDENITTIQCYSLSNYAVLMDLTGSELYTQAASLLHPVVYTTAIILLLCL
720 730 740 750 760 770
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 FATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHY
.:.:..:: .:: ::.: :.::::.:::::: .: .::.:::: : .:::::: :::
NP_660 LAVIVSYIYHHSLIRISLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFVGGITQTRNASICQAVGIILHY
780 790 800 810 820 830
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 SSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAA
:.:.:.::.:: :: ..:..: .: :. : : : ::::::::.::::.:.::::::
NP_660 STLATVLWVGVTARNIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGITAA
840 850 860 870 880 890
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 VNIHNY--RDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGN
.::.:: : ..::::..:.::::::: :...: ... .::: ..:. ..:.
NP_660 ANIKNYGSRPNAPYCWMAWEPSLGAFYGPASFITFVNCMYFLSIFIQLK----RHPE---
900 910 920 930 940
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 SRASLEAGEELRGSTRLRGSGPL-LSDSGSL-LATGSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLG
. :. : . .: . .:: :: : . :: :. ...: ::
NP_660 RKYELKEPTEEQQRLAANENGEINHQDSMSLSLISTSAL-------ENEHTFHSQ--LLG
950 960 970 980 990
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 ALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVAASALGLFVFTHHCARRRDVRASW
: .: .::.:.: :::::: . .: : ..:... ... : .:::. :.::: .:
NP_660 ASLTL-LLYVALWMFGALAVSLYYPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHCVNREDVRLAW
1000 1010 1020 1030 1040 1050
870 880 890 900 910
pF1KA1 -RACCPPASPAAPHA---PPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSGHPLALGPCKL
.::: : . .. :: . . .: . . . : .. :.:: . . : :::
NP_660 IMTCCPGRSSYSVQVNVQPPNSNGTNGE-APKCPNSSAESSCTNKSASSFKNSSQG-CKL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
920 930 940 950 960 970
pF1KA1 TNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEAC
:::: : .: :.:..
NP_660 TNLQAAAAQ-CHANSLPLNSTPQLDNSLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRTNVHSSRHHKN
1120 1130 1140 1150 1160 1170
>>XP_016863323 (OMIM: 612303) PREDICTED: adhesion G prot (1124 aa)
initn: 1726 init1: 626 opt: 1127 Z-score: 800.0 bits: 159.9 E(85289): 8e-38
Smith-Waterman score: 1674; 36.8% identity (56.3% similar) in 950 aa overlap (204-934:4-932)
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 GVFDELPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQ
:...... . . : :.::..:.:: . ...
XP_016 MHRWVKEKNITVRD-TRCVYPKSLQAQPVTGVK
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 EAQLCCEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQ
. : :. ::: . .. :: :::::.:: ::::: :::. .: .. ::.. :: ::.
XP_016 QELLTCDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQCMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDES
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 AGILLAESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYC
::.. ...::.:..:.: ::.:.: . ..:.: : :. .:: .. :.:::::.::.::
XP_016 QGIFVEKNMIHNCSLIASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYC
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 PAERVANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTR-ASRRCDRAGRWEPG
: :::.::.::::::::::::::: .: . : :. : : :::::.: :
XP_016 PPERVVNNKGDFRWPRTLAGITAYLQCTRNTHGSGIYPGNPQDERKAWRRCDRGGFWADD
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 DYSHCLYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQK
:::.: :.::.::::: : ::.: .::.. :.:: .::.:::.::: :::..::.::.:
XP_016 DYSRCQYANDVTRVLYMFNQMPLNLTNAVATARQLLAYTVEAANFSDKMDVIFVAEMIEK
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520
pF1KA1 FLGYV--DQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERI------GG
: .. .. ::: .::::.:::.::.::..::::::: ::::::: :.:: ::
XP_016 FGRFTKEEKSKELGDVMVDIASNIMLADERVLWLAQREAKACSRIVQCLQRIATYRLAGG
280 290 300 310 320 330
530
pF1KA1 AAL----SPHA--------------------QHIS-------------------------
: . ::. :...
XP_016 AHVYSTYSPNIALEAYVIKSTGFTGMTCTVFQKVAASDRTGLSDYGRRDPEGNLDKQLSF
340 350 360 370 380 390
540
pF1KA1 -----------------VELSA-----------------------------------FP-
:: : ::
XP_016 KCNVSNTFSSLALKNTIVEASIQLPPSLFSPKQKRELRPTDDSLYKLQLIAFRNGKLFPA
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 -------------REV--------------------------------------------
: :
XP_016 TGNSTNLADDGKRRTVVTPVILTKIDGVNVDTHHIPVNVTLRRIAHGADAVAARWDFDLL
460 470 480 490 500 510
550 560
pF1KA1 ---GG----------------------------------------AGAGLHPVVYPCTAL
:: :.. :::::: . .
XP_016 NGQGGWKSDGCHILYSDENITTIQCYSLSNYAVLMDLTGSELYTQAASLLHPVVYTTAII
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
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: ::::.:.:.::.:: :: ..:..: .: :. : : : ::::::::.::::.:.:
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::
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1121 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Thu Nov 3 11:16:33 2016 done: Thu Nov 3 11:16:36 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]