Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1531
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1531, 1121 aa
1>>>pF1KA1531 1121 - 1121 aa - 1121 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1164+/-0.000987; mu= 16.2437+/- 0.060
mean_var=179.6078+/-36.597, 0's: 0 Z-trim(112.2): 144 B-trim: 933 in 2/53
Lambda= 0.095700
statistics sampled from 12865 (13029) to 12865 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.4), width: 16
Scan time: 5.830
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6097.2 ADGRA2 gene_id:25960|Hs108|chr8 (1338) 4002 565.9 2.2e-160
CCDS33964.1 ADGRA3 gene_id:166647|Hs108|chr4 (1321) 1772 258.0 1e-67
CCDS41580.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10 ( 560) 765 118.6 4.1e-26
>>CCDS6097.2 ADGRA2 gene_id:25960|Hs108|chr8 (1338 aa)
initn: 3995 init1: 3995 opt: 4002 Z-score: 2993.0 bits: 565.9 E(32554): 2.2e-160
Smith-Waterman score: 5940; 81.1% identity (81.2% similar) in 1153 aa overlap (186-1121:186-1338)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 PRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEH
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 TLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGN
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 DTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILLAESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQG
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 NASKKVEIVVLETSASYCPAERVANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NASKKVEIVVLETSASYCPAERVANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAP
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 GTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GTRASRRCDRAGRWEPGDYSHCLYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAA
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYVDQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRI
460 470 480 490 500 510
520 530
pF1KA1 VGALERIGGAALSPHAQHISV---------------------------------------
:::::::::::::::::::::
CCDS60 VGALERIGGAALSPHAQHISVNARNVALEAYLIKPHSYVGLTCTAFQRREGGVPGTRPGS
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
CCDS60 PGQNPPPEPEPPADQQLRFRCTTGRPNVSLSSFHIKNSVALASIQLPPSLFSSLPAALAP
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
CCDS60 PVPPDCTLQLLVFRNGRLFHSHSNTSRPGAAGPGKRRGVATPVIFAGTSGCGVGNLTEPV
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 ----------------------------------------------------------EL
::
CCDS60 AVSLRHWAEGAEPVAAWWSQEGPGEAGGWTSEGCQLRSSQPNVSALHCQHLGNVAVLMEL
700 710 720 730 740 750
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 SAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHI
760 770 780 790 800 810
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 AMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGD
820 830 840 850 860 870
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 PALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNYRDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALI
880 890 900 910 920 930
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 LLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLAT
940 950 960 970 980 990
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 GSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYG
1000 1010 1020 1030 1040 1050
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 VAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCPPASPAAPHAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 SLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNN
1120 1130 1140 1150 1160 1170
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 VHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGGLHNSPTDSYLGSSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS60 VHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGSLHNSPTDSYLGSSR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 NSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NSPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSY
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 PLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV
1300 1310 1320 1330
>--
initn: 1243 init1: 1243 opt: 1243 Z-score: 934.3 bits: 185.0 E(32554): 1e-45
Smith-Waterman score: 1243; 100.0% identity (100.0% similar) in 185 aa overlap (1-185:1-185)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRSCKCSGERPKGLSGGVPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNNII
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 STVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDELP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
:::::
CCDS60 ALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLCCE
190 200 210 220 230 240
>>CCDS33964.1 ADGRA3 gene_id:166647|Hs108|chr4 (1321 aa)
initn: 1793 init1: 798 opt: 1772 Z-score: 1329.1 bits: 258.0 E(32554): 1e-67
Smith-Waterman score: 2319; 39.9% identity (59.8% similar) in 1151 aa overlap (4-934:5-1129)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSIRS-CKCSGERPKGLSGGV
: :: :. : ::::: :: ::: . :. : .. . :: .: ::.: .: .
CCDS33 MEPPGRRRGRAQPP-LLLPLS--LLALLALLGGGGGGGAAALPAGCKHDG-RPRG-AGRA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 PGPARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNN
: :. .::::. .: . : ::: ::::.::::::. :.:::: ::::::.::::::
CCDS33 AGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 IISTVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDE
.::...:::: ::. ::::::.:::::::... :.:: :.:::.:::.::::. :.::
CCDS33 LISSIDPGAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGTFDY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLC
: .:. ... ::.: :::.. :. :...... . . : :.::..:.:: . .... :
CCDS33 LASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRD-TRCVYPKSLQAQPVTGVKQELLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 CEGALELHTHHLIPSLRQVVFQGDRLPFQCSASYLGNDTRIRWYHNRAPVEGDEQAGILL
:. ::: . .. :: :::::.:: ::::: :::. .: .. ::.. :: ::. ::..
CCDS33 CDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQCMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQGIFV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 AESLIHDCTFITSELTLSHIGVWASGEWECTVSMAQGNASKKVEIVVLETSASYCPAERV
...::.:..:.: ::.:.: . ..:.: : :. .:: .. :.:::::.::.::: :::
CCDS33 EKNMIHNCSLIASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYCPPERV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ANNRGDFRWPRTLAGITAYQSCLQYPFTSVPLGGGAPGTR-ASRRCDRAGRWEPGDYSHC
.::.::::::::::::::: .: . : :. : : :::::.: : :::.:
CCDS33 VNNKGDFRWPRTLAGITAYLQCTRNTHGSGIYPGNPQDERKAWRRCDRGGFWADDDYSRC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 LYTNDITRVLYTFVLMPINASNALTLAHQLRVYTAEAASFSDMMDVVYVAQMIQKFLGYV
:.::.::::: : ::.: .::.. :.:: .::.:::.::: :::..::.::.:: ..
CCDS33 QYANDVTRVLYMFNQMPLNLTNAVATARQLLAYTVEAANFSDKMDVIFVAEMIEKFGRFT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KA1 --DQIKELVEVMVDMASNLMLVDEHLLWLAQREDKACSRIVGALERI------GGAAL--
.. ::: .::::.:::.::.::..::::::: ::::::: :.:: ::: .
CCDS33 KEEKSKELGDVMVDIASNIMLADERVLWLAQREAKACSRIVQCLQRIATYRLAGGAHVYS
480 490 500 510 520 530
530
pF1KA1 --SPHA--------------------QHIS------------------------------
::. :...
CCDS33 TYSPNIALEAYVIKSTGFTGMTCTVFQKVAASDRTGLSDYGRRDPEGNLDKQLSFKCNVS
540 550 560 570 580 590
540
pF1KA1 ------------VELSA-----------------------------------FP------
:: : ::
CCDS33 NTFSSLALKNTIVEASIQLPPSLFSPKQKRELRPTDDSLYKLQLIAFRNGKLFPATGNST
600 610 620 630 640 650
550
pF1KA1 ------------------------------------REVG-GA-------------GAG-
:... :: : :
CCDS33 NLADDGKRRTVVTPVILTKIDGVNVDTHHIPVNVTLRRIAHGADAVAARWDFDLLNGQGG
660 670 680 690 700 710
560
pF1KA1 --------------------------------------------LHPVVYPCTALLLLCL
:::::: . .:::::
CCDS33 WKSDGCHILYSDENITTIQCYSLSNYAVLMDLTGSELYTQAASLLHPVVYTTAIILLLCL
720 730 740 750 760 770
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 FATIITYILNHSSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHY
.:.:..:: .:: ::.: :.::::.:::::: .: .::.:::: : .:::::: :::
CCDS33 LAVIVSYIYHHSLIRISLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFVGGITQTRNASICQAVGIILHY
780 790 800 810 820 830
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 SSLSTLLWMGVKARVLHKELTWRAPPPQEGDPALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAA
:.:.:.::.:: :: ..:..: .: :. : : : ::::::::.::::.:.::::::
CCDS33 STLATVLWVGVTARNIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGITAA
840 850 860 870 880 890
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 VNIHNY--RDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGN
.::.:: : ..::::..:.::::::: :...: ... .::: ..:. ..:.
CCDS33 ANIKNYGSRPNAPYCWMAWEPSLGAFYGPASFITFVNCMYFLSIFIQLK----RHPE---
900 910 920 930 940
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 SRASLEAGEELRGSTRLRGSGPL-LSDSGSL-LATGSARVGTPGPPEDGDSLYSPGVQLG
. :. : . .: . .:: :: : . :: :. ...: ::
CCDS33 RKYELKEPTEEQQRLAANENGEINHQDSMSLSLISTSAL-------ENEHTFHSQ--LLG
950 960 970 980 990
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 ALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVAASALGLFVFTHHCARRRDVRASW
: .: .::.:.: :::::: . .: : ..:... ... : .:::. :.::: .:
CCDS33 ASLTL-LLYVALWMFGALAVSLYYPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHCVNREDVRLAW
1000 1010 1020 1030 1040 1050
870 880 890 900 910
pF1KA1 -RACCPPASPAAPHA---PPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSGHPLALGPCKL
.::: : . .. :: . . .: . . . : .. :.:: . . : :::
CCDS33 IMTCCPGRSSYSVQVNVQPPNSNGTNGE-APKCPNSSAESSCTNKSASSFKNSSQG-CKL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
920 930 940 950 960 970
pF1KA1 TNLQLAQSQVCEAGAAAGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEAC
:::: : .: :.:..
CCDS33 TNLQAAAAQ-CHANSLPLNSTPQLDNSLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRTNVHSSRHHKN
1120 1130 1140 1150 1160 1170
>>CCDS41580.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10 (560 aa)
initn: 1075 init1: 605 opt: 765 Z-score: 582.2 bits: 118.6 E(32554): 4.1e-26
Smith-Waterman score: 1210; 42.0% identity (62.0% similar) in 595 aa overlap (549-1121:14-560)
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 LERIGGAALSPHAQHISVELSAFPREVGGAGAGLHPVVYPCTALLLLCLFATIITYILNH
: :::::: :::..::::.:...:::...
CCDS41 MDLKTVLSLPRYPGEFLHPVVYACTAVMLLCLLASFVTYIVHQ
10 20 30 40
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SSIRVSRKGWHMLLNLCFHIAMTSAVFAGGITLTNYQMVCQAVGITLHYSSLSTLLWMGV
:.::.:::: : :::.::: :.: .::::::. :.: ..::::::.::::.:::.::.::
CCDS41 SAIRISRKGRHTLLNFCFHAALTFTVFAGGINRTKYPILCQAVGIVLHYSTLSTMLWIGV
50 60 70 80 90 100
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 KARVLHKELTWRAPPPQEGD-PALPTPSPMLRFYLIAGGIPLIICGITAAVNIHNY---R
:: ..:..: .:: . : : : .:.:::::..::.:.::::.:::.::.::
CCDS41 TARNIYKQVTKKAPLCLDTDQPPYPR-QPLLRFYLVSGGVPFIICGVTAATNIRNYGTED
110 120 130 140 150 160
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 DHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILLITWIYFLCAGLRLRGPLAQNPKAGNSRASLEAGE
. . :::..:.::::::: :.:.: :.: .::: . ..:: ..: : :
CCDS41 EDTAYCWMAWEPSLGAFYGPAAIITLVTCVYFLGTYVQLR----RHP--GRRYELRTQPE
170 180 190 200 210
760 770 780 790 800
pF1KA1 ELRGSTRLRGSGPLLSDSGSLLATGSARVGTPGPPED--GDSL----YSPGVQLGALVTT
: : : . : ..: . : ::: : .: : :. .: .:: : . :
CCDS41 EQR-----RLATP---EGGR-----GIRPGTP-PAHDAPGASVLQNEHSFQAQLRAAAFT
220 230 240 250 260
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 HFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVAASALGLFVFTHHCARRRDVRASWRACCP
::. : :: ::::::: . .: :::::. .:::::. ::::.:.:: : ::::
CCDS41 LFLFTATWAFGALAVSQGHFLDMVFSCLYGAFCVTLGLFVLIHHCAKREDVWQCWWACCP
270 280 290 300 310 320
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 PASPAAP--HAPPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSGHPLALGPCKLTNLQLAQ
: . : : : :: :: :: .:. : : . :: ::::.:::: ::
CCDS41 PRKDAHPALDANGAALGRAACLHSPGLGQ--------PRGFA-HPP--GPCKMTNLQAAQ
330 340 350 360 370
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 SQV-CEAGAA---AGGEGEPEPAGTRGNLAHRHPNNVHHGRRAHKSRAKGHRAGEACGKN
... : . :. : . :: : . :: : . ..: .: . .: :..
CCDS41 GHASCLSPATPCCAKMHCEPLTA----DEAHVHLQ--EEGAFGHDPHLHGCLQGRTKPPY
380 390 400 410 420
990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 RLKALRGGAAGALELLSSESGGLHNSPTDSYLGSSRNSPGAGLQL----EGEP--MLTPS
. : .. :: .:. ..: ::: :: ..:.. : .:.: :.:
CCDS41 FSRHPAEEPEYAYHIPSSLDGSPRSSRTDSP-PSSLDGPAGTHTLACCTQGDPFPMVTQP
430 440 450 460 470 480
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 EGSDTSAAPLSEAGRAGQRRSASRDSLKGGGALEKESHRRSYPLNAASLNGAPKGGKYDD
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