Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1342
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1342, 425 aa
1>>>pF1KA1342 425 - 425 aa - 425 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4632+/-0.00107; mu= 10.9361+/- 0.064
mean_var=91.6244+/-17.611, 0's: 0 Z-trim(105.1): 105 B-trim: 27 in 1/50
Lambda= 0.133989
statistics sampled from 8136 (8251) to 8136 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 2.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18 ( 425) 2787 549.3 2.5e-156
CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1 ( 431) 1496 299.8 3.4e-81
CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 478) 798 164.9 1.5e-40
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 447) 792 163.7 3.2e-40
CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 403) 788 162.9 5.1e-40
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 ( 425) 763 158.1 1.5e-38
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 760 157.5 2.1e-38
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 386) 757 156.9 3.1e-38
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 ( 419) 757 156.9 3.3e-38
CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12 ( 523) 758 157.2 3.5e-38
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 422) 744 154.4 1.9e-37
CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 419) 743 154.2 2.2e-37
CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11 ( 491) 734 152.5 8.3e-37
CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19 ( 590) 668 139.8 6.8e-33
CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 413) 589 124.5 2e-28
CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 470) 589 124.5 2.2e-28
CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 474) 589 124.5 2.2e-28
CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17 ( 412) 558 118.5 1.2e-26
CCDS8154.1 SYT12 gene_id:91683|Hs108|chr11 ( 421) 496 106.5 5.2e-23
CCDS73103.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 421) 470 101.5 1.7e-21
CCDS7726.2 SYT8 gene_id:90019|Hs108|chr11 ( 401) 433 94.3 2.3e-19
CCDS31470.1 SYT13 gene_id:57586|Hs108|chr11 ( 426) 389 85.8 8.8e-17
CCDS73104.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 390) 372 82.5 7.9e-16
CCDS10666.1 DOC2A gene_id:8448|Hs108|chr16 ( 400) 312 70.9 2.5e-12
CCDS31904.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 690) 303 69.3 1.3e-11
CCDS44979.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 694) 303 69.3 1.4e-11
>>CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18 (425 aa)
initn: 2787 init1: 2787 opt: 2787 Z-score: 2920.0 bits: 549.3 E(32554): 2.5e-156
Smith-Waterman score: 2787; 100.0% identity (100.0% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSLFAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLKGV
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CCDS11 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSLFAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLKGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVPKNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPSDLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVPKNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPSDLEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ATPKLFLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVVNIKEARGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ATPKLFLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVVNIKEARGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQIQELALHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQIQELALHF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELLISLCYQST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELLISLCYQST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNAVFNELFVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNAVFNELFVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 DIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGAAAEGTGGEHWKEICDYPRRQIAKWH
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CCDS11 DIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGAAAEGTGGEHWKEICDYPRRQIAKWH
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VLCDG
:::::
CCDS11 VLCDG
>>CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1 (431 aa)
initn: 1123 init1: 825 opt: 1496 Z-score: 1571.2 bits: 299.8 E(32554): 3.4e-81
Smith-Waterman score: 1496; 53.0% identity (79.5% similar) in 434 aa overlap (1-424:1-430)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSL--FAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLK
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CCDS11 MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKQKNPPYKFIHMLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 GVDIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVP--KNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPS
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CCDS11 GISIYPETLSNKKKIIKVRRD--KDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSR-DKDPRGPSSGS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DLENATPKL----FLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVV
... :. :.. :..: :. :: .: :.. ::.: ::..::: .::.::
CCDS11 CIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKT-TSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQ
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CCDS11 TIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IQELALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELL
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CCDS11 LQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 ISLCYQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLS-DPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPN
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CCDS11 VSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 AVFNELFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGA-AAEGTGGEHWKEICD
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CCDS11 PIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCE
360 370 380 390 400 410
420
pF1KA1 YPRRQIAKWHVLCDG
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CCDS11 SPRKPVAKWHSLSEY
420 430
>>CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 (478 aa)
initn: 792 init1: 411 opt: 798 Z-score: 841.3 bits: 164.9 E(32554): 1.5e-40
Smith-Waterman score: 798; 37.8% identity (65.8% similar) in 392 aa overlap (40-422:94-476)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 EFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSLFAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLKGVDIYPENLNS
: . : .:: .:.. : . .:
CCDS58 GRSEKKAINGTLLSGAKVAAAAGLAVEREGRLGEKPAPVPPPGE-DALRSGGAAPSEPGS
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 KKKFGADDKNEVKNKPAVPKNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPG-SPSDLEN--ATPKLF
: : :... :. : :.: : .:. .: :: .: : . . :.
CCDS58 GGKAGRGRWRTVQSHLAAGK----LNLSKLPAGGKAVNTAPVPGQTPHDESDRRTEPRSS
130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LEGEKESVSPESLKSSTSLTSEE-----KQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVVNIKEARGLP
. .:.. : : : . .: ..:.:: . ::. :::......:.: .:. ::
CCDS58 VSDLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSRENLGRIQFSVGYNFQESTLTVKIMKAQELP
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQIQELALHFT
: : : ::::..:. .::.::::..:.: ::.:.: ..::: : :.:: .. . :..
CCDS58 AKDF-SGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYEKVVQRILYLQ
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELLISLCYQSTT
.:..:::::.: :::: :::. ..:.. . . . .: :..:::::.::::. ..
CCDS58 VLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLTQMQTFWKD--LKPCSDGSGSRGELLLSLCYNPSA
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NTLTVVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNAVFNELFVFD
:.. : ..:::.: :..: ::::::: :.. ::. :::: . : . : .::: :.::
CCDS58 NSIIVNIIKARNLKAMDIGGTSDPYVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMKRNLNPIFNESFAFD
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 IPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGAAAEGTGG-EHWKEICDYPRRQIAKWH
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CCDS58 IPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLSWKS-GPGEVKHWKDMIARPRQPVAQWH
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 VLCDG
:
CCDS58 QLKA
>>CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 (447 aa)
initn: 792 init1: 411 opt: 792 Z-score: 835.5 bits: 163.7 E(32554): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 792; 39.9% identity (69.2% similar) in 341 aa overlap (88-422:111-445)
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 KGVDIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVPKNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPSD
:. ::.: . .: : . : . ::
CCDS73 NNESTVQQKWSSYPPKEFILNISPYAPYGDPRLSLKLPAGGKAVNTA-PVPGQTPHDESD
90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LENATPKLFLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEE-----KQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVV
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CCDS73 -RRTEPRSSVSDLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSRENLGRIQFSVGYNFQESTLTV
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQ
.: .:. ::: : : ::::..:. .::.::::..:.: ::.:.: ..::: : :.:: .
CCDS73 KIMKAQELPAKDF-SGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYEK
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IQELALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELL
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CCDS73 VVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLTQMQTFWKD--LKPCSDGSGSRGELL
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 ISLCYQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNA
.::::. ..:.. : ..:::.: :..: ::::::: :.. ::. :::: . : . :
CCDS73 LSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTSDPYVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMKRNLNP
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 VFNELFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGAAAEGTGG-EHWKEICDY
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CCDS73 IFNESFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLSWKS-GPGEVKHWKDMIAR
380 390 400 410 420 430
420
pF1KA1 PRRQIAKWHVLCDG
::. .:.:: :
CCDS73 PRQPVAQWHQLKA
440
>>CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 (403 aa)
initn: 792 init1: 411 opt: 788 Z-score: 832.0 bits: 162.9 E(32554): 5.1e-40
Smith-Waterman score: 796; 37.5% identity (65.5% similar) in 397 aa overlap (27-422:32-401)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSLFAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHV
: .: : :::: .: ::
CCDS31 YRDPEAASPGAPSRDVLLVSAIITVSLSVTVVLCGLCHW--CQRKLGKR-----YKNSLE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 LKGVDIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVPKNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPS
:. .. . :: . ... : :: .. : . ..: . :.... :
CCDS31 TVGTPDSGRGRSEKKAIKLPAGGKAVNTAPVPGQTPHDESDRR----TEPRSSV-----S
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DLENATPKLFLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVVNIKE
:: :. : .: .:: : .. . ..:.:: . ::. :::......:.: .
CCDS31 DLVNS-----LTSEMLMLSPGSEEDEAHEGC--SRENLGRIQFSVGYNFQESTLTVKIMK
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 ARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQIQEL
:. ::: : : ::::..:. .::.::::..:.: ::.:.: ..::: : :.:: .. .
CCDS31 AQELPAKDF-SGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYEKVVQR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 ALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELLISLC
:.. .:..:::::.: :::: :::. ..:.. . . . .: :..:::::.:::
CCDS31 ILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLTQMQTFWKD--LKPCSDGSGSRGELLLSLC
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 YQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNAVFNE
:. ..:.. : ..:::.: :..: ::::::: :.. ::. :::: . : . : .:::
CCDS31 YNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTSDPYVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMKRNLNPIFNE
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 LFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGAAAEGTGG-EHWKEICDYPRRQ
:.:::: : :.. .. . :.:... :::.:::.. :. . : : .:::.. ::.
CCDS31 SFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLSWKS-GPGEVKHWKDMIARPRQP
340 350 360 370 380 390
420
pF1KA1 IAKWHVLCDG
.:.:: :
CCDS31 VAQWHQLKA
400
>>CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 (425 aa)
initn: 677 init1: 529 opt: 763 Z-score: 805.5 bits: 158.1 E(32554): 1.5e-38
Smith-Waterman score: 773; 39.5% identity (70.5% similar) in 329 aa overlap (100-424:104-413)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 KKKFGADDKNEVKNKPAVPKNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPSDLENATPKLFLEG
: ....: . .: : . .. :.:.
CCDS87 LQRQTTEPASSTRHTSFKRHLPRQMHVSSVDYGNELPPAAEQPTSIGRIK---PELY---
80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVVNIKEARGLPAMDEQSMT
...::. :. :: : .. : . :::.:..: ....: : .: ::: : . .
CCDS87 KQKSVDGEDAKS-------EATKSCGKINFSLRYDYETETLIVRILKAFDLPAKDFCG-S
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQIQELALHFTILSFDRFS
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250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGR----GELLISLCYQSTTNTLT
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pF1KA1 VVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNAVFNELFVFDIPCE
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CCDS87 LTVIKCRNLKAMDITGYSDPYVKVSLLCDGRRLKKKKTTIKKNTLNPVYNEAIIFDIPPE
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pF1KA1 GLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGAAAEGTGGEHWKEICDYPRRQIAKWHVLCDG
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360 370 380 390 400 410
CCDS87 KKSFKEGNPRL
420
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pF1KA1 KMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQIQELALHFTILSFDRFSRDDII
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pF1KA1 FFSLEYNFERKAFVVNIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDP
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CCDS12 QYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD-LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTLNP
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pF1KA1 AFDETFTFYGIPYTQIQELALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMN-RE
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CCDS12 HFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVDL--GRPVQAWRE
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CCDS12 LQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHLLQGGK
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pF1KA1 AEGTGGEHWKEICDYPRRQIAKWHVLCDG
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CCDS12 AGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
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pF1KA1 SEEKQ-EKLGTLFFSLEYNFERKAFVVNIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHK
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CCDS14 EEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALD-MGGTSDPYVKVFLLPDKKKK
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CCDS14 LGQ-PIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKMDVGGLSDP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]