FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1339, 642 aa
1>>>pF1KA1339 642 - 642 aa - 642 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7379+/-0.00103; mu= 16.1597+/- 0.063
mean_var=264.5273+/-49.098, 0's: 0 Z-trim(114.7): 901 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.078857
statistics sampled from 14261 (15289) to 14261 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.78), E-opt: 0.2 (0.47), width: 16
Scan time: 4.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5894.1 ZNF398 gene_id:57541|Hs108|chr7 ( 642) 4514 527.3 2.4e-149
CCDS47739.1 ZNF398 gene_id:57541|Hs108|chr7 ( 471) 3377 397.8 1.8e-110
CCDS5895.1 ZNF282 gene_id:8427|Hs108|chr7 ( 671) 1497 184.1 5.3e-46
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1026 130.4 6.4e-30
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1020 129.7 1e-29
CCDS56519.1 ZNF783 gene_id:100289678|Hs108|chr7 ( 546) 974 124.5 3.8e-28
CCDS5896.1 ZNF212 gene_id:7988|Hs108|chr7 ( 495) 961 122.9 1e-27
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 952 122.0 2.2e-27
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 944 121.0 4e-27
CCDS43675.1 ZNF777 gene_id:27153|Hs108|chr7 ( 831) 939 120.8 7.6e-27
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 898 115.9 1.6e-25
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 896 115.8 2e-25
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 890 114.9 2.9e-25
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 890 115.0 3e-25
CCDS78284.1 ZNF282 gene_id:8427|Hs108|chr7 ( 463) 885 114.2 3.9e-25
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 884 114.3 5e-25
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 884 114.4 5.1e-25
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 884 114.4 5.2e-25
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 884 114.4 5.2e-25
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 883 114.4 6.4e-25
CCDS12633.1 ZNF221 gene_id:7638|Hs108|chr19 ( 617) 880 113.9 6.8e-25
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 880 113.9 7.2e-25
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 880 114.0 7.3e-25
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 877 113.5 8.2e-25
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 872 112.8 1.1e-24
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 873 113.0 1.1e-24
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 873 113.1 1.2e-24
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 873 113.1 1.2e-24
CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs108|chr10 ( 561) 868 112.4 1.7e-24
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 868 112.5 1.7e-24
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CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 868 112.6 1.9e-24
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 864 111.9 2.2e-24
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 864 111.9 2.2e-24
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19 ( 463) 860 111.4 2.8e-24
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 858 111.2 3.4e-24
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 858 111.3 3.5e-24
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 861 111.9 3.6e-24
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 858 111.4 4.1e-24
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 855 110.8 4.2e-24
CCDS12954.1 ZNF416 gene_id:55659|Hs108|chr19 ( 594) 855 111.0 4.8e-24
CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 ( 894) 856 111.4 5.5e-24
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 847 110.0 8.5e-24
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 845 109.8 1e-23
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 845 110.1 1.2e-23
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 845 110.1 1.3e-23
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 845 110.1 1.3e-23
CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19 ( 706) 843 109.8 1.4e-23
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 841 109.3 1.4e-23
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 841 109.5 1.5e-23
>>CCDS5894.1 ZNF398 gene_id:57541|Hs108|chr7 (642 aa)
initn: 4514 init1: 4514 opt: 4514 Z-score: 2794.6 bits: 527.3 E(32554): 2.4e-149
Smith-Waterman score: 4514; 100.0% identity (100.0% similar) in 642 aa overlap (1-642:1-642)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAEAAPAPTSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAEAAPAPTSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SRRLLHLEGRTGTAEKKLASCEKTVTELGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRRLLHLEGRTGTAEKKLASCEKTVTELGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SMDYAINQPDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SMDYAINQPDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VGAPPESKESDVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VGAPPESKESDVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QQSTSMTPFGRPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QQSTSMTPFGRPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHLRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHLRVH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NSTERPFPCPDCPKRFADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NSTERPFPCPDCPKRFADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 RPFSCPQCGIDFNGHSALIRHQMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RPFSCPQCGIDFNGHSALIRHQMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 CPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KA1 SGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
610 620 630 640
>>CCDS47739.1 ZNF398 gene_id:57541|Hs108|chr7 (471 aa)
initn: 3377 init1: 3377 opt: 3377 Z-score: 2096.8 bits: 397.8 E(32554): 1.8e-110
Smith-Waterman score: 3377; 100.0% identity (100.0% similar) in 471 aa overlap (172-642:1-471)
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 PVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLISMDYAINQPDVLSQIQPEGEH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MKGNYESLISMDYAINQPDVLSQIQPEGEH
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 NTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQVGAPPESKESDVYKSTYADEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQVGAPPESKESDVYKSTYADEE
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 LVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKSQQSTSMTPFGRPATDLPEASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKSQQSTSMTPFGRPATDLPEASE
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 GQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTP
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 QADLSSTSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHLRVHNSTERPFPCPDCPKRFADQAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QADLSSTSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHLRVHNSTERPFPCPDCPKRFADQAR
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 LTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFNGHSALIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFNGHSALIRH
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 QMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIH
340 350 360 370 380 390
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 TGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLG
400 410 420 430 440 450
630 640
pF1KA1 VNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
:::::::::::::::::::::
CCDS47 VNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
460 470
>>CCDS5895.1 ZNF282 gene_id:8427|Hs108|chr7 (671 aa)
initn: 1599 init1: 750 opt: 1497 Z-score: 939.4 bits: 184.1 E(32554): 5.3e-46
Smith-Waterman score: 1564; 43.4% identity (65.3% similar) in 643 aa overlap (1-607:47-668)
10 20
pF1KA1 MAEAAPA-PTSEWDSECLTSLQPLPLPTPP
:::. : ..::: . . .:.:. ::
CCDS58 GLGLDSGSWSWAQALPPEEVCHQEPALRGEMAEGMPPMQAQEWD---MDARRPMPFQFPP
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70
pF1KA1 AANEA-----------HLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIHSRRLLHLEGRTGTAEKKL
..: .: :: :::::::::.::.::::. .. .::.::::::::::::
CCDS58 FPDRAPVFPDRMMREPQLPTAEISLWTVVAAIQAVERKVDAQASQLLNLEGRTGTAEKKL
80 90 100 110 120 130
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 ASCEKTVTELGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNFWILRLPPGIKGDI
:.::::..:.::..:.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::.
CCDS58 ADCEKTAVEFGNHMESKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNFWVLRLPPGSKGEA
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 PKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLISMDY--AINQPDVLSQIQ
:::::.: :...::: ::..:.:::::::.:..: ::..:.:.: .. .::. : .
CCDS58 PKVPVTFVDIAVYFSEDEWKNLDEWQKELYNNLVKENYKTLMSLDAEGSVPKPDAPVQAE
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 PEGEHNTEDQAGPEESEIPTDP--SEEPGISTSDILSWIKQEE----EPQVGAPPESKES
:. : . .: ::: ::: :: . :: . ..: : .:.:. . : : .. .
CCDS58 PREEPCVWEQRHPEEREIPMDPEAGAEPLVPAQDASSQVKREDTLCVRGQRGLEERAIPT
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300
pF1KA1 D-VYKSTYADEELV--IKAEGLA----RSSLCP-EVPV-PFSSPPAAAKDAFSDVAFKSQ
. . : . ..:. :: : ...: ..:. : : .:.: .: . .
CCDS58 ESITDSPISAQDLLSRIKQEEHQCVWDQQDLADRDIPTDPNSESLISAHDILSWI----K
320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QSTSMTPFG-RPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTH
: . :.: : . : : . . .: :::. : . . : .: .
CCDS58 QEEQPYPWGPRDSMD-GELGLDSGPSDSLLMVKNPPPAPPQ----PQPQPQPPQPQLQS-
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410
pF1KA1 QCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQ----DHAS-ETPPTCPHCARTFTHPSRLTY
: . . :. :. : .. :.. : ...: :.:: . . .
CCDS58 QPQPQSLPPIAVAENPGGPPSRGLLDDGFQVLPGERGSGEAPPGGDRSTGGGGGDGG-GG
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 HLRVHNSTERPFPCPDC-PKRFADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQ
.. .: : .: : . . : : : .:. : .::.::... ::..:.
CCDS58 GGGAEAGTGAGGGCGSCCPGGL--RRSLLLH---GARSKPYSCPECGKSFGVRKSLIIHH
490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 RGHAQERPFSCPQCGIDFNGHSALIRHQMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHT
:.:..:::. : .: .:: ::.:::::: : ::::: :..: :.. ::::: ::.::::
CCDS58 RSHTKERPYECAECEKSFNCHSGLIRHQMTHRGERPYKCSECEKTYSRKEHLQNHQRLHT
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 GERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGC
:::::.: ::::::::..:.:::::::::::: :. ::.:::::..:::::: :.::
CCDS58 GERPFQCALCGKSFIRKQNLLKHQRIHTGERPYTCGECGKSFRYKESLKDHLRV-HSGG-
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640
pF1KA1 GGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
: . : :: :
CCDS58 PGPGAPRQLPPPPERD
660 670
>>CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 (555 aa)
initn: 4043 init1: 677 opt: 1026 Z-score: 650.6 bits: 130.4 E(32554): 6.4e-30
Smith-Waterman score: 1026; 34.2% identity (63.8% similar) in 500 aa overlap (129-617:5-495)
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LGTLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWE
:: : : :.. ..:.::.. .: ::.
CCDS55 MAAARLLPVPAG--PQAKLTFEDVAVLLSQDEWD
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 KLEEWQKELYKNIMKGNYESLISMDYAINQPDVLSQIQPEGEHN-TEDQAGPEESE-IPT
.: :. ::.:.: .: ...:. ..::..::.. .:: . :. : ..:. . .
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pF1KA1 DPSEEPGISTSDILSWIKQEEEP-QVGAPPESKESDVYKSTYADEELVIKAEG-LAR-SS
: :.. . . . . : . . ::...:. . .:. :: .. :.: ..
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:. : : .. .: :: : .:: . :. . : : : . .:
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. : .::. . : ::: .::. .:. :. :. :.: : .: : : ..::..
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pF1KA1 TSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHLRVHNSTERPFPCPDCPKRFADQARLTSHRR
. :..: : : .: ..::. :.: : :.: . :::. :: : : : .. : ::.:
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.:..:.: :: .::..::.: .:: ::: :. :.:..: .:: :. .:.::.:. .:::
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:.:: :..:.:.: .. :.::.:.:: :.:..: .:::.:... ::..:::.::::.::
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:. ::..: ...: .: : :.: . :. . . ::. :.:
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pF1KA1 WEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLISMDYAINQPDVLSQIQPEGEHN-TEDQAGPEESE-I
:..: :. ::.:.: .: ...:. ..::..::.. .:: . :. : ..:. .
CCDS34 WDRLCPAQRGLYRNVMMETYGNVVSLGLPGSKPDIISQLE-RGEDPWVLDRKGAKKSQGL
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.: :.. . . . . : . . ::...:. . .:. :: .. :.:
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.. :. : : .. .: :: : .:: . :. . : : : .
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.:. : .::. . : ::: .::. .:. :. :. :.: : .: : : ..::
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.. . :..: : : .: ..::. :.: : :.:.. :::. :: : : : .. : ::
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:: :. ::..: ...: .: : :.: . :. . . ::. :.:
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CCDS56 LSPAQEELKEGQAPKQQQDSEARVAPAGPEAGGGVAIKTEAQ-SEDEMTPERLFLGVS-R
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:... ..: .:: .: . : . .:. .. :. .:.: : : .... .:
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.... : . . : .: .: . .: :: :: . ..:..: : :. . ::
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CCDS58 RNRNFWILRLPPGSKGEAPKVSRSLENDGVCFTEQEWENLEDWQKELYRNVMESNYETLV
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: .: . . . : : : : .: :: . ..:. ::
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: :.. : :. :.. . . :: . . . . .: : :::: :.::. :::
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: :: : . . :. .: :: : . .. : :.::: . :. :.:.:
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:::::.:: .: :::..:.::..::.:: ::
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CCDS12 MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNLYRKVM
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::.::.:. ....:::.: . :.. : .:. :. : ...:.. :
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CCDS12 QETYEESSKVVTVGARHLSYSLDYPSLREDCQSEDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKEILP
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CCDS12 HRKVYVEKKLLKCNDCEKVFNQSSSLTLHQRIHTGEKPYACVECGKTFSQSANLAQHKRI
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CCDS12 HTGEKPYECKECRKAFSQNAHLAQHQRVH-TGEKPYQCKECKKAFSQIAHLTQHQRVHTG
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::::.: .::..:: : ::: :. :.:. : :: :. .. :: :: ::::::::
CCDS12 ERPFECIECGKAFSNGSFLAQHQRIHTGEKPYVCNVCGKAFSHRGYLIVHQRIHTGERPY
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CCDS12 ECKECRKAFSQYAHLAQHQRVHTGEKPYECKVCRKAFSQIAYLDQHQRVHTGEKPYECIE
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CCDS12 CGKAFSNSSSLAQHQRS-HTGEKPYMCKECRKTFSQNAGLAQHQRIHTGEKPYECNVCGK
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CCDS43 MAKRPGPPGSREMGLLTFRDIAIEFSLEEWQCLD
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CCDS43 CAQRNLYRDVMLENYRNLVSLGIAVSKPDLITCLEQNKESQNIKRNEMVAKHPVTRSHFT
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: . : ::. : .. .. : .:. : .: : .:.:. :.. . ...
CCDS43 QDLQPEQGIKDSLQKVIPRTYGKCGHEKLQFKKCCKSVGEYEVHKGGYSEVNQCLSTTQN
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:. ..:..:::... .. ::. :. :.: : .: : :. .:.:.
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