Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0931
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0931, 1256 aa
1>>>pF1KA0931 1256 - 1256 aa - 1256 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3833+/-0.00118; mu= 12.3081+/- 0.071
mean_var=124.1620+/-26.572, 0's: 0 Z-trim(105.8): 138 B-trim: 480 in 2/49
Lambda= 0.115101
statistics sampled from 8438 (8610) to 8438 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 3.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73910.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16 (1256) 8297 1390.3 0
CCDS32479.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16 (1323) 4572 771.8 0
CCDS45881.2 PHLPP1 gene_id:23239|Hs108|chr18 (1717) 2002 345.1 9.4e-94
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 582) 466 89.8 2.3e-17
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 536) 434 84.4 8.4e-16
CCDS81341.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1495) 401 79.2 9e-14
CCDS645.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1537) 401 79.2 9.2e-14
CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1630) 374 74.7 2.2e-12
CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1655) 374 74.7 2.2e-12
CCDS55124.1 LRRD1 gene_id:401387|Hs108|chr7 ( 860) 366 73.2 3.1e-12
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 ( 524) 343 69.3 2.9e-11
CCDS646.1 LRRC40 gene_id:55631|Hs108|chr1 ( 602) 337 68.3 6.5e-11
>>CCDS73910.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16 (1256 aa)
initn: 8297 init1: 8297 opt: 8297 Z-score: 7448.1 bits: 1390.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8297; 100.0% identity (100.0% similar) in 1256 aa overlap (1-1256:1-1256)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKRNGSRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MKRNGSRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 RQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQST
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 NDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 AMVVYLNIGEEGCTCEMNGLTLPGPVGFASTTTIKDAPKPATPSSSSGIASEFSSEMSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AMVVYLNIGEEGCTCEMNGLTLPGPVGFASTTTIKDAPKPATPSSSSGIASEFSSEMSTS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 EVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRPERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRPERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 DSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 QNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCLYGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCLYGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 YFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS32479.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16 (1323 aa)
initn: 4387 init1: 4387 opt: 4572 Z-score: 4104.8 bits: 771.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7901; 94.8% identity (94.8% similar) in 1288 aa overlap (36-1256:36-1323)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 SRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSSDLHLV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSSDLHLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 YASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KA0 SSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALN----------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNLRYLNASANS
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ---------------------------------------------------------KLN
:::
CCDS32 LESLPSACTGEESLSMLQLLYLTNNLLTDQCIPVLVGHLHLRILHLANNQLQTFPASKLN
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 KLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDL
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 TEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWS
730 740 750 760 770 780
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 HGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQ
790 800 810 820 830 840
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 STNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVL
850 860 870 880 890 900
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 CRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPK
910 920 930 940 950 960
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 PHISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PHISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDN
970 980 990 1000 1010 1020
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 VGAMVVYLNIGEEGCTCEMNGLTLPGPVGFASTTTIKDAPKPATPSSSSGIASEFSSEMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VGAMVVYLNIGEEGCTCEMNGLTLPGPVGFASTTTIKDAPKPATPSSSSGIASEFSSEMS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 TSEVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRPERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSEVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRPERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 GLDSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GLDSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 RRQNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCLYGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RRQNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCLYGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 TGYFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TGYFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
>>CCDS45881.2 PHLPP1 gene_id:23239|Hs108|chr18 (1717 aa)
initn: 2843 init1: 1096 opt: 2002 Z-score: 1796.6 bits: 345.1 E(32554): 9.4e-94
Smith-Waterman score: 4029; 51.8% identity (75.5% similar) in 1233 aa overlap (84-1230:470-1680)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 SSSSSSSDLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSR
.::.::::. .:::: :.:::: ::: .
CCDS45 AAAVAPGGLQSTPGRSGVTAEKAPPPPPPPTLYVQLHGETTRRLEAEEKPLQIQNDYLFQ
440 450 460 470 480 490
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQL--HKWAE
::: . :.:::. . ..::.::::. :: .:: :::.::::::: :: ..:..
CCDS45 LGFGELWRVQEEGMDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMYNVRKGKMQLPVNRWTR
500 510 520 530 540 550
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 RLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFE
: :.::::::::::::: :::::.:::.:::.::::..:. :::::.: :.:::.. :.
CCDS45 RQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLAFSSSGPQSQTYYICFD
560 570 580 590 600 610
240 250 260 270 280
pF1KA0 TLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQ----LE
:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:.:::..::.. :
CCDS45 TFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLP
620 630 640 650 660 670
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 RPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNL
::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.:::.....:. .: . ::
CCDS45 AARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNL
680 690 700 710 720 730
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 QTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLN
::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: :::: .:.. :.:::.:.:
CCDS45 QTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLR
740 750 760 770 780 790
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHC
: .: .: ::::::::.: .. .. .... .:.:..:::::.: ::: . ..: :::
CCDS45 LQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHC
800 810 820 830 840 850
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 GRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKI
:::: : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::: :: ::.:.::..:.
CCDS45 ERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKL
860 870 880 890 900 910
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 EVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPD
::::...: . :.:.:.. . :::::. :::.. :: .:. .::::.::: : .::
CCDS45 EVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPP
920 930 940 950 960 970
590
pF1KA0 TLFSKA-----LN-----------------------------------------------
.:. :: ::
CCDS45 NLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPLLTGHPHLK
980 990 1000 1010 1020 1030
600 610 620 630 640
pF1KA0 ---------------KLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFP
:. :::.:::..:::::::.::::: ::.:.::..:::: : .::
CCDS45 ILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCRRMHTVIAHSNCIEVFP
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pF1KA0 EILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKI
:..:::.:. ::::::.:.:. .:: :: ::.:::::: :::.::::.....: .::
CCDS45 EVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKI
1100 1110 1120 1130 1140 1150
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pF1KA0 DQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEE
:: :.: :.. . . :::: .: .: .:::::.::....: .. :.::.:::::: :
CCDS45 DQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNREALYGVFDGDRNVE
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pF1KA0 LPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTAD
.: ::::::.:.: ::.:.. :. .:.:::.: .:::: ::::::..:.::.:. : .:
CCDS45 VPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLGGAAVLCHIKHDPVD
1220 1230 1240 1250 1260 1270
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pF1KA0 PASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGV
:..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . . . :: .:.:..:::::::.:::::
CCDS45 PGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRIKQHKAIITEDGKVNGV
1280 1290 1300 1310 1320 1330
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 TCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDP
: ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::. :: :::.:::.: :
CCDS45 TESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSVEEAVEAVRNVPDA
1340 1350 1360 1370 1380 1390
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 LAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLTLPGPVG--FASTTT--
::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : ..: : : ...
CCDS45 LAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPPPSPGIFPPSVNMV
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 IKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRP-ERR
::: :. . .::::::.:::.:::.::::.::::::::::: :.:. : :.:
CCDS45 IKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGALSENSPAYPSEQR
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 CSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGR
: ::: :. :::: ::::::: :::::::::..:.:::.::::.::::::::: :..
CCDS45 CMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSRVEVEVDIHCSRAK
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 DLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCL--
. :.. :.. :. :.: :... ..:. : .. . : .
CCDS45 EKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANEDEPGLPRKADFSAVGT
1580 1590 1600 1610
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pF1KA0 YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQ
:.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.:::..: .:::::::
CCDS45 IGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEI
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pF1KA0 MKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
::.
CCDS45 MKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
1680 1690 1700 1710
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pF1KA0 RILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSSVK-DCQTGKMHILPLVGGKIEEVK
: .:.. : . ..:::: .. ..
CCDS75 SVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLT
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pF1KA0 R-RQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVS--QRISTVDLSCYSLEEVP
. :: ..: :.. :.. ::: . . .. ... .:: .:.:.:
CCDS75 ELYLYSNKLQSLPAEVGCL-VNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIP
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 EHLFYSQDITYLNLRHNFMQ-LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTL
.. ...: : :: : . .:. . ..:.:. :.. .::. .: . :. .:
CCDS75 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKD-----IKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNL
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 TELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIP
:... : .. ::..::: .. .: :. : : ::. .:::..:: ::. .: .: ::
CCDS75 ITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIP
250 260 270 280 290 300
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pF1KA0 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV
. : . :... . .: . .: ..:. . ... . : : .. . . . . : .
CCDS75 RSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSL
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 DLRDNRLTDLDL---SSLCSLEQLHCGRNQLRELTL---SGFSLRTLYASSNRLTAV--N
... ::.. . . : : .:. ::: : : . :. : ..:.:: . .
CCDS75 NMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPED
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 VYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLG
: . :: ... :: :::. .: . .:.. ::. : : .: .: .:.::.:
CCDS75 VSGLVSLEVLI-LSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLT
430 440 450 460 470
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pF1KA0 HNHVQNLPTLVEHIP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGN-KLK
.:.. .:: . :. : : : .: ::.::. ... ::.:::: :. : .:.
CCDS75 NNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE--------EIGTLENLEELYLNDNPNLH
480 490 500 510 520 530
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pF1KA0 TIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDL
..: .: :..: . .. .: .: :::
CCDS75 SLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLP-----PQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
540 550 560 570 580
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pF1KA0 DLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVS
>>CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 (536 aa)
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pF1KA0 ITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNG
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CCDS58 PNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLTELYLYSNK
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pF1KA0 FHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTML
...::...: :.::.:: :. : ::.::. : ::..: : . :.. .:: : .: :
CCDS58 LQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSL
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pF1KA0 DRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGN-KHITHVDLRDNRLT
. . : . ... . : ..... ...: :..: . : :: . .... :: :::.
CCDS58 TTLYLRFNRITTVEKDIKN-LSKLSMLSIRENKIKQLPAEI--GNLSSLSRLGLRYNRLS
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. : . :: ::.:. :.. : : .: : : . . . ..::: :: ..
CCDS58 AIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTI
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pF1KA0 --LDLSRNLLECVP-DWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNL
:.. .: .. .: .:: . :... : :: .:. . . :. .: :. :.. ..
CCDS58 YSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKI
320 330 340 350 360 370
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: : . :::: :..: : .:: . :..:..:.::.: :::...:. ::
CCDS58 PEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLP--------HGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAY
380 390 400 410 420
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pF1KA0 CKRLHTLVAHSNNISIFPE-ILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPA--TLQDLDLTGN
: :. :: .:... .:. : .: .. . :. : ::.. :: . . .:..: :. :
CCDS58 LKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHL--PEEIGTLENLEELYLNDN
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 TNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMD
:: : . :... ..:.. ::
CCDS58 PNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
490 500 510 520 530
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pF1KA0 YHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQ
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CCDS81 IISVLDYSHCSLQQVPKEVFNFERTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLS
30 40 50 60 70 80
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pF1KA0 LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLL
. : :. .. .:: :..:.: . :: . . :: .. : : . ::. . .::
CCDS81 -NLP---TTIASLVNLKELDISKNGVQEFPENIKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLL
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pF1KA0 NLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEV
:: : :. :: :: ..: : .: : . :... .:. ..::..:.:. ...: .
CCDS81 NLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLRILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGE
150 160 170 180 190 200
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pF1KA0 LNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGN-KHITHVDLRDNRL--TDLDLSSLCSL
: ::....... .: :.. .:. . :. : ....:. ::. .:.:.:. .:
CCDS81 LPE-VLDQIQNLR--ELWMDNNALQVLPGSIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEAL
210 220 230 240 250 260
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pF1KA0 EQLHCGRNQLRELTLS-GF--SLRTLYASSNRLTAV-NVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVP
:.: . :.:..: : :. .: :: ...:.:: . :. ::: .: : : :: .:
CCDS81 EDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVDDNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNELESLP
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. .....: :. :.: :.: .: : .. . : :... :: . .. :.::.:
CCDS81 STIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSCKNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQKLRVLNL
330 340 350 360 370 380
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pF1KA0 QHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGNKLKT-IPTTIANCKRLHTLVAHSNNI
. : : :: :: ..::..: : :: :. :. ::
CCDS81 SDNRLKNLP---FS-----FTKLKELAALWLSDNQSKALIPLQTEAHPETKQRVLTNYMF
390 400 410 420 430
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pF1KA0 SIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHIT
CCDS81 PQQPRGDEDFQSDSDSFNPTLWEEQRQQRMTVAFEFEDKKEDDENAGKVKDLSCQAPWER
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Smith-Waterman score: 401; 31.0% identity (62.3% similar) in 371 aa overlap (256-617:53-408)
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pF1KA0 YHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQ
:. ..::.:..:: : . :.. : ..
CCDS64 IISVLDYSHCSLQQVPKEVFNFERTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLS
30 40 50 60 70 80
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLL
. : :. .. .:: :..:.: . :: . . :: .. : : . ::. . .::
CCDS64 -NLP---TTIASLVNLKELDISKNGVQEFPENIKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLL
90 100 110 120 130
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 NLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEV
:: : :. :: :: ..: : .: : . :... .:. ..::..:.:. ...: .
CCDS64 NLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLRILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGE
140 150 160 170 180 190
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pF1KA0 LNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGN-KHITHVDLRDNRL--TDLDLSSLCSL
: ::....... .: :.. .:. . :. : ....:. ::. .:.:.:. .:
CCDS64 LPE-VLDQIQNLR--ELWMDNNALQVLPGSIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEAL
200 210 220 230 240 250
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pF1KA0 EQLHCGRNQLRELTLS-GF--SLRTLYASSNRLTAV-NVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVP
:.: . :.:..: : :. .: :: ...:.:: . :. ::: .: : : :: .:
CCDS64 EDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVDDNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNELESLP
260 270 280 290 300 310
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 DWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIP-LEVLDL
. .....: :. :.: :.: .: : .. . : :... :: . .. :.::.:
CCDS64 STIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSCKNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQKLRVLNL
320 330 340 350 360 370
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pF1KA0 QHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGNKLKT-IPTTIANCKRLHTLVAHSNNI
. : : :: :: ..::..: : :: :. :. ::
CCDS64 SDNRLKNLP---FS-----FTKLKELAALWLSDNQSKALIPLQTEAHPETKQRVLTNYMF
380 390 400 410 420
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pF1KA0 SIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHIT
CCDS64 PQQPRGDEDFQSDSDSFNPTLWEEQRQQRMTVAFEFEDKKEDDENAGKVKDLSCQAPWER
430 440 450 460 470 480
>>CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1630 aa)
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Smith-Waterman score: 374; 29.9% identity (58.8% similar) in 391 aa overlap (300-676:13-382)
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pF1KA0 YSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEIS-TLTELN
...... : .: : . . : .: ::
CCDS64 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELL
10 20 30 40
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 LSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYE
:. : ...::. . ::::. : :. : . :: :..:..:: : .: :.. .::: .
CCDS64 LDANQLRELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIK
50 60 70 80 90 100
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