FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0603, 1299 aa
1>>>pF1KA0603 1299 - 1299 aa - 1299 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6953+/-0.000907; mu= 7.8636+/- 0.055
mean_var=153.6859+/-30.808, 0's: 0 Z-trim(112.1): 71 B-trim: 333 in 1/50
Lambda= 0.103456
statistics sampled from 12830 (12901) to 12830 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.396), width: 16
Scan time: 6.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 8634 1301.1 0
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CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 4629 703.3 1e-201
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 2169 336.1 3.3e-91
CCDS58897.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1159) 1573 247.1 2e-64
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 778 128.5 9.6e-29
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 683 114.3 1.4e-24
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 602 102.2 5.9e-21
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 602 102.2 6e-21
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 587 99.9 2.9e-20
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 582 99.2 4.8e-20
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 404 72.5 3.1e-12
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 408 73.2 3.1e-12
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 404 72.5 3.2e-12
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 398 71.7 8.3e-12
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 391 70.7 1.9e-11
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 391 70.7 1.9e-11
>>CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298 aa)
initn: 5821 init1: 5821 opt: 8634 Z-score: 6965.2 bits: 1301.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8634; 99.8% identity (99.9% similar) in 1299 aa overlap (1-1299:1-1298)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMA
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70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVFIFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVFIFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
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pF1KA0 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
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610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
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pF1KA0 AQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQN
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pF1KA0 SGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
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790 800 810 820 830 840
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS41 ASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGEDDPEKIEERKKSKELR
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850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLE-ASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEIS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KA0 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290
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:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS41 KTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
1260 1270 1280 1290
>>CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290 aa)
initn: 7776 init1: 4964 opt: 5747 Z-score: 4636.4 bits: 870.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8560; 99.2% identity (99.3% similar) in 1299 aa overlap (1-1299:1-1290)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMA
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVFIFE
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQ
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
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pF1KA0 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
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pF1KA0 AQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQN
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pF1KA0 SGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SGRLSPQYENEI--------SDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS66 ASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGEDDPEKIEERKKSKELR
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:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLE-ASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEIS
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pF1KA0 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KA0 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
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pF1KA0 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290
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:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS66 KTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
1260 1270 1280 1290
>>CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235 aa)
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Smith-Waterman score: 8101; 94.9% identity (95.1% similar) in 1299 aa overlap (1-1299:1-1235)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVFIFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVFIFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 HKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI
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pF1KA0 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
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pF1KA0 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
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pF1KA0 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
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::::::::::::::::::
CCDS66 AQGVRSPLLRQSSSEQCS------------------------------------------
670
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pF1KA0 SGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ---------------------DGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS66 ASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGEDDPEKIEERKKSKELR
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pF1KA0 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLE-ASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
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pF1KA0 CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQL
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pF1KA0 TAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLL
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pF1KA0 LHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEIS
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pF1KA0 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
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pF1KA0 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
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pF1KA0 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
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pF1KA0 KTVEQLRKLLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
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CCDS66 KTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
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:.. :....: : .: ::: : :: . : .: .. ::: :
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:.. ..:::::: .::: ::: : . : :.::.: : ..::..:::::: .: : .
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:. . .. .:.: :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:::. ...: .
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:: . :: :. : :.:...:. : : . :..
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.: ..:... .: .: :. . . :. . :::.: :.:::::: .:.
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:. :::::::...::::::.:: :::::.:::::::::::: : ...::::::..:
CCDS33 SEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNE
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pF1KA0 SLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVIQRH
.::::.:.::::::..::. :.::. .:::.::..:::::::::::. ..:: .:.:
CCDS33 ALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKH
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pF1KA0 LSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS---
:..::..::: :::.:::..: ..:.::::.: :: : : ::: :.:::: .: .
CCDS33 LTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAA
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pF1KA0 ---NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNS
.: .: .:: ::.::.:::::::::: :::.:.::: :. :: : . ..:
CCDS33 ENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NKARGLQEHSISVDLDSS
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:.: . . . : : : :... . :: .: . :: :
CCDS33 LSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSD-------SESHLPEEP-----
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pF1KA0 LQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLK
.:: : .: . :: ..:. : .: :. .:.
CCDS33 ----------APL----SPQQ-----AFRR---RANTLSHFPIECQEPPQPARGSPGV--
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pF1KA0 SFYQNSGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQR
: : .:.. . .: : .: :.. .:. . ::: : :: ::::.
CCDS33 -----SQRKLMRYHS-VSTETPHERKDFESK-------ANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQ
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::::::.:.. :. . .: . .:: : ::: :. :. :. : :...
CCDS33 IFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPF--------GPPPEEKKRT
670 680 690 700 710
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pF1KA0 SKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWD
:.::: ::.::: :::::::::::::::. ::...: ....::::::. : ::: .:.
CCDS33 SRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQ-ASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWE
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pF1KA0 KKLLN-CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYK
: : . :.::. ::: .:. . .:::. .:::::.::: :..:.:..:.:::: :. ::
CCDS33 KMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYK
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pF1KA0 ELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISF
:::::::.::::::.:::::::::::::.::: :::::.:.::::::::.:::::::.::
CCDS33 ELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSF
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pF1KA0 VAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHL
:::.::::::::.::.::::::.:.:.::::::::. :::::::::::::::::::::::
CCDS33 VAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHL
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pF1KA0 EENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIME
::.::.:::::::::::.::::: :::::::::.:::::::::::::::::.:.. ::..
CCDS33 EEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQ
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pF1KA0 CESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSC
:..:.::.:.:.:::... .::: :.:::::::.:::.::::::::::.:: .::
CCDS33 HENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSS-PL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KA0 EDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQ
:.. ..:::..::.:..::.::::.::::. .::.::...:.::. :.:.:. . :::
CCDS33 SDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLEL
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pF1KA0 EKMAYQKTVEQLRK--LLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
:. : .:::.::. :.: .:
CCDS33 ERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 CIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMAEIRRR
: : ::. . ::.:::::..::.::
CCDS58 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRL
10 20 30 40 50
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pF1KA0 SQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVF--IFEHKA
:.. :....: : .: ::: : :: . : .: .. ::: :
CCDS58 SRQSTRK---EPVTKQVRLCVSPSGLRCEPEPG---------RSQQWDPLIYSSIFECKP
60 70 80 90
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pF1KA0 QHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKAAMK
:.. ..:::::: .::: ::: : . : :.::.: : ..::..:::::: .: : .
CCDS58 QRVHKLIHNSHDPSYFACLIK--EDAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQ
100 110 120 130 140 150
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pF1KA0 EDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQGEQ
:. . .. .:.: :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:::. ...: .
CCDS58 EELHCPSEFDDTF--SKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIEKFN-------HVSG-S
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pF1KA0 RGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERILED
:: . :: :. : :.:...:. : : . :..
CCDS58 RGSE--------------SPRPNPPHAA---------PTGSQEPVRRPMRKSFSQPGLRS
210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQVGR
.: ..:... .: .: :. . . :. . :::.: :.:::::: .:.
CCDS58 LAF--RKELQDGGLRSSGFFSSFEE----SDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQ
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pF1KA0 FEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQCASE
:. :::::::...::::::.:: :::::.:::::::::::: : ...::::::..:
CCDS58 SEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNE
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.::::.:.::::::..::. :.::. .:::.::..:::::::::::. ..:: .:.:
CCDS58 ALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKH
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pF1KA0 LSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS---
:..::..::: :::.:::..: ..:.::::.: :: : : ::: :.:::: .: .
CCDS58 LTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAA
420 430 440 450 460 470
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pF1KA0 ---NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNS
.: .: .:: ::.::.:::::::::: :::.:.::: :. :: : . ..:
CCDS58 ENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NKARGLQEHSISVDLDSS
480 490 500 510 520 530
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pF1KA0 LAS------------EKDYSP-GDSPPGTPPASPP--SSAWQTFPEEDSD-SPQ--FRRR
:.: ::. : ..: .: :.. . .::: . ::: ::::
CCDS58 LSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRR
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pF1KA0 AHTFSHPPSSTKRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSS------SEQCSNLSSVRRMYKESNSS
:.:.:: : .. . : . :.: : :. . : : . :. ..
CCDS58 ANTLSHFPIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHERNVDPSPVGES-KHRPGQ
600 610 620 630 640 650
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pF1KA0 SSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQNS-----GRLSPQ---YENEIRQDTASESS----
:: :. .. :: ..:.:.: . .:: : :. :.: .:. : ::
CCDS58 SSAPAPPPRLN-PSASSPNFFKYLKHNSSGEQSGNAVPKSISYRNALRKKLHSSSSVPNF
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pF1KA0 -------------DGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRVASPMNKSP
: . :: . .:. . ::: : :: ::::.::::::.:..
CCDS58 LKFLAPVDENNTSDFMNTKRDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACD
720 730 740 750 760 770
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:. . .: . .:: : ::: :. :. :. : :... :.::: ::.:::
CCDS58 SSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPF--------GPPPEEKKRTSRELRELWQKAIL
780 790 800 810 820
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:::::::::::::::. ::...: ....::::::. : ::: .:.: : . :.::.
CCDS58 QQILLLRMEKENQKLQ-ASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKF
830 840 850 860 870 880
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pF1KA0 DMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHAI
::: .:. . .:::. .:::::.::: :..:.:..:.:::: :. :::::::::.:::::
CCDS58 DMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAI
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pF1KA0 LVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQ
:.:::::::::::::.::: :::::.:.::::::::.:::::::.:::::.::::::::.
CCDS58 LIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEE
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 AFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAP
::.::::::.:.:.::::::::. ::
CCDS58 AFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQ----------------------------------
1010 1020
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 WFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFENIVEFLKN
CCDS58 ------------------------------------------------------------
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 TLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETLEKLERAN
::: :.:::::::.:::.::::::::::.:: .:: :.. ..:::..:
CCDS58 ---------MEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSS-PLSDNQRMDKLEKTN
1030 1040 1050 1060 1070
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 SQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLR
:.:..::.::::.::::. .::.::...:.::. :.:.:. . ::: :. : .:::.::
CCDS58 SSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELR
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pF1KA0 K--LLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
. :.: .:
CCDS58 RRSAEPSDREPECTQPEPTGD
1140 1150
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: ...: :: . : . . .. ... .:
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...:::.. :::.::.:: . : : .: :. :. . . :. :: :..:::
CCDS68 VRNGVPEALRGEVWQLLAGCHNNDH-LVEK-------YRILITKESPQDSAITRDINRTF
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:.: :.:. .. .. .:. ..::: ::...: :::::. . . .::. ::::::..
CCDS68 MFDYGLRELFKQNFEDLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTA
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CCDS68 KFPLYMVFHIIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLT--DFEGALKFFRVQLPKRYR
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:: .:.. . .: :: :.:. :: :::..... .. :: .:..:: : .:.
CCDS68 SEENAKKLMELACNMKISQKKLKKYEKEYHTMREQQAQQ----EDP--IERFERENRRLQ
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pF1KA0 RQNMDL-LEKLQVAHTKIQ---ALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLR
. :: : :. ..:: . ::...:.: : : .: . : . :. . :. :
CCDS68 EANMRLEQENDDLAHELVTSKIALRKDLDNA---EEKADALNKELLMTKQKLIDAEEEKR
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pF1KA0 KLLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
.:
CCDS68 RLEEESAQLKEMCRRELDKAESEIKKNSSIIGDYKQICSQLSERLEKQQTANKVEIEKIR
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: ...: .: . : . .... . . ::.: :::.. :.:.::.:: . ..
CCDS13 CPEKILYSWGELLGKWHSNLGARPKGLSTLVKSGVPEALRAEVWQLLAGCH-------DN
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.::::: ::.:.:::::: ::::: .: .::: :.: :: .. .:. ..::: ::...
CCDS13 IGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFCVLVKIMYDYGLRDLYRNNFEDLHCKFYQLERLMQE
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::..:. . .. .::. ::::::...: : .: ...:... .: ..::.:::.::
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.... ... . ::. ..:.. :: .: .... :. .. . .:.:. :: ::..
CCDS13 KTSKEDLLQAD-FEGALKFFRVQLPKRYRAEENARRLMEQACNIKVPTKKLKKYEKEYQT
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CCDS13 MRESQLQQEDPMDRYKFVYL
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.:.. . . :.::. :::::: . : : ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ...
CCDS12 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA
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CCDS12 ELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMK-----
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: :.. ...: :....: .: .. ::: :: :. : : : .. :: . ..
CCDS12 -SKEMEEQIEIKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQV--TRAQEAEENY--VIKRELAVVRQQ
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. .. . :.:..::..
CCDS12 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV
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CCDS54 MASPTLSPDSSSQEA------LSAPTCSPTSDSEN
10 20
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. ::. : . ...: ::. ...... ..:: . : :. . ... ....
CCDS54 LSPDELELLAK--LEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTW
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CCDS54 ILWGR-IANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATD----MPVKNQ---
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CCDS54 --YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQ
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CCDS54 GSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDL
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.:.. . . :.::. :::::: . : : ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ...
CCDS54 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA
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.:. . .:.. .... ..: . : .:.. ..... . :... : :: ..... .:
CCDS54 ELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEME
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. . .: ..: . . :.... : ..: : :. : : : .. :: . .
CCDS54 EQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESAALADRLIQGQVTRAQEAEENY--VIKRELAVVR
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. . .. . :.:..::..
CCDS54 QQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQD
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CCDS30 SSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETD-SKSLRSV-------------
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. ... :.: .: . .:.. : .. : : . ..: .: : ...
CCDS30 --NGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLE-----EDSWILWGR-IVNEWEDVRKKKEKQVKE
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CCDS30 LVHKGIPHHFRAIVWQLLCSA----QSMPIKDQ-----YSELLKMTSPCEKLIRRDIART
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CCDS30 YPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVK
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CCDS30 LMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFL
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CCDS30 TTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLD-MEGMLQHFQKVIPHQFD
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CCDS30 GVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEME-----EQVE-IKRL-RTENRLLKQ
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CCDS30 RIETLEKHKCSSNYNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDE
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CCDS30 NNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNE
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1299 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:50:03 2016 done: Fri Nov 4 00:50:04 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]