Result of FASTA (omim) for
pF1KA0347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0347, 1255 aa
1>>>pF1KA0347 1255 - 1255 aa - 1255 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7950+/-0.000511; mu= -5.9633+/- 0.031
mean_var=478.6377+/-103.182, 0's: 0 Z-trim(120.7): 90 B-trim: 3116 in 2/54
Lambda= 0.058623
statistics sampled from 36112 (36219) to 36112 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.425), width: 16
Scan time: 14.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_073728 (OMIM: 603426,604348) period circadian p (1255) 8470 732.4 4.5e-210
XP_006712887 (OMIM: 603426,604348) PREDICTED: peri (1255) 8470 732.4 4.5e-210
XP_005246168 (OMIM: 603426,604348) PREDICTED: peri (1255) 8470 732.4 4.5e-210
XP_005256746 (OMIM: 602260) PREDICTED: period circ (1290) 1873 174.5 4.2e-42
NP_002607 (OMIM: 602260) period circadian protein (1290) 1873 174.5 4.2e-42
XP_005256747 (OMIM: 602260) PREDICTED: period circ (1230) 1793 167.7 4.4e-40
NP_001276792 (OMIM: 603427,616882) period circadia (1184) 1741 163.3 9e-39
XP_011540692 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1202) 1735 162.8 1.3e-38
XP_016858214 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1203) 1733 162.6 1.5e-38
NP_058515 (OMIM: 603427,616882) period circadian p (1201) 1726 162.0 2.2e-38
XP_016858215 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1202) 1724 161.8 2.5e-38
NP_001276790 (OMIM: 603427,616882) period circadia (1191) 1576 149.3 1.4e-34
XP_011540687 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1209) 1568 148.6 2.3e-34
XP_016858213 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1208) 1559 147.9 3.9e-34
XP_005263581 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1203) 1543 146.5 1e-33
NP_001276791 (OMIM: 603427,616882) period circadia (1210) 1543 146.5 1e-33
XP_016858212 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1209) 1534 145.8 1.7e-33
XP_016858216 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1154) 1517 144.3 4.5e-33
XP_016858220 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1086) 1516 144.2 4.6e-33
XP_016858221 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1080) 1514 144.0 5.1e-33
XP_016858225 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1028) 1385 133.1 9.5e-30
XP_016858219 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1093) 1349 130.1 8.2e-29
XP_016858217 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1094) 1324 128.0 3.5e-28
XP_016858218 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1089) 1315 127.2 6e-28
XP_016858224 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1034) 1220 119.1 1.5e-25
XP_016858222 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1035) 1195 117.0 6.6e-25
XP_016858223 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri (1035) 1195 117.0 6.6e-25
NP_001276793 (OMIM: 603427,616882) period circadia ( 890) 751 79.4 1.2e-13
XP_016858227 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri ( 745) 442 53.2 7.7e-06
XP_016858226 (OMIM: 603427,616882) PREDICTED: peri ( 746) 403 49.9 7.6e-05
>>NP_073728 (OMIM: 603426,604348) period circadian prote (1255 aa)
initn: 8470 init1: 8470 opt: 8470 Z-score: 3892.4 bits: 732.4 E(85289): 4.5e-210
Smith-Waterman score: 8470; 100.0% identity (100.0% similar) in 1255 aa overlap (1-1255:1-1255)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSSGSSGHETNENCSTGRDSQGSDCDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSSGSSGHETNENCSTGRDSQGSDCDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLMMAKSEHNPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 SGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLMMAKSEHNPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 HLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVKANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 HLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVKANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISDQVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 VTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISDQVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKSFFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 SFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKSFFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSGGQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 LIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSGGQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 WSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 WSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHEDSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 GYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHEDSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 VTEMQTNPPAEKKAVPAMEKDSLGVSFPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 VTEMQTNPPAEKKAVPAMEKDSLGVSFPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ATLKRKCEFPANVPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTGVGTHLTSLALPGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 ATLKRKCEFPANVPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTGVGTHLTSLALPGKA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ESVASLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELEMVEDAASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 ESVASLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELEMVEDAASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEPF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 KKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGLRN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTSQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 TSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTSQSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 CPAVPFPAPVPAAYSLPVFPAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQPPPFPAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 CPAVPFPAPVPAAYSLPVFPAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQPPPFPAPL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 APVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTSIPRQPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 APVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTSIPRQPC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEGGTGAMGTTGATETAAVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 ACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEGGTGAMGTTGATETAAVGA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 DCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAASESLGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 DCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAASESLGSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SLGCDASPSGAGSSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIWLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 SLGCDASPSGAGSSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIWLLM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTGGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 ADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTGGLP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 AAIDVAECVYCENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 AAIDVAECVYCENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
1210 1220 1230 1240 1250
>>XP_006712887 (OMIM: 603426,604348) PREDICTED: period c (1255 aa)
initn: 8470 init1: 8470 opt: 8470 Z-score: 3892.4 bits: 732.4 E(85289): 4.5e-210
Smith-Waterman score: 8470; 100.0% identity (100.0% similar) in 1255 aa overlap (1-1255:1-1255)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSSGSSGHETNENCSTGRDSQGSDCDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSSGSSGHETNENCSTGRDSQGSDCDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLMMAKSEHNPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLMMAKSEHNPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 HLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVKANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVKANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISDQVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISDQVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKSFFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKSFFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQD
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 LIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSGGQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSGGQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 WSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 WSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSS
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pF1KA0 GYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHEDSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHEDSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKS
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 VTEMQTNPPAEKKAVPAMEKDSLGVSFPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VTEMQTNPPAEKKAVPAMEKDSLGVSFPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ATLKRKCEFPANVPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTGVGTHLTSLALPGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ATLKRKCEFPANVPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTGVGTHLTSLALPGKA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ESVASLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELEMVEDAASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ESVASLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELEMVEDAASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEPF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGLRN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTSQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTSQSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 CPAVPFPAPVPAAYSLPVFPAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQPPPFPAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CPAVPFPAPVPAAYSLPVFPAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQPPPFPAPL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 APVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTSIPRQPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 APVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTSIPRQPC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEGGTGAMGTTGATETAAVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEGGTGAMGTTGATETAAVGA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 DCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAASESLGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAASESLGSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SLGCDASPSGAGSSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIWLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SLGCDASPSGAGSSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIWLLM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTGGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTGGLP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 AAIDVAECVYCENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AAIDVAECVYCENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
1210 1220 1230 1240 1250
>>XP_005246168 (OMIM: 603426,604348) PREDICTED: period c (1255 aa)
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10 20 30 40 50 60
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XP_005 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSSGSSGHETNENCSTGRDSQGSDCDD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLMMAKSEHNPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKV
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ATLKRKCEFPANVPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTGVGTHLTSLALPGKA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTSQSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 APVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTSIPRQPC
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XP_005 ACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEGGTGAMGTTGATETAAVGA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAASESLGSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLGCDASPSGAGSSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIWLLM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTGGLP
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1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 AAIDVAECVYCENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AAIDVAECVYCENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
1210 1220 1230 1240 1250
>>XP_005256746 (OMIM: 602260) PREDICTED: period circadia (1290 aa)
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10 20 30 40
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:::. : ..: : :: : .:.: .: ::::.:
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50 60 70 80 90
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.: . : : ....: ..:: :. ..: ... :::. ..::. :.::.
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100 110 120 130 140
pF1KA0 -NPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKVHLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVK
:::::::::.::... :.:::. .:.:::..:: ....::...:::::.::: ::::.
XP_005 DNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQ
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 ANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMESVTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISD
::.:::: ::.::. :. .::.::.: .:::. ..: : :.::::...:.:.:::.
XP_005 ANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISE
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 QVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFHSFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKS
:.: ...::::.: ..: :.:::.:::::.. :.: .:: :. ..: : .. .:::
XP_005 QAAVLLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 FFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRDQQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPE
:::. ... ::.:::.:::..:.: ..:: .: ::::.:::.:::::::::::.
XP_005 VFCRIRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAPAQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPD
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330 340 350 360 370 380
pF1KA0 KRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQDLIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSG
:::::: :::.::::::::::.::::::::::. .:::. ::: :::::::::::::: .
XP_005 KRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLA
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 GQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINPWSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPC
:::::.::::: ::::::.:.::::..:..:::::..:..::::::..:::::::.
XP_005 GQPFDHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAP
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 TEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSSGYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHE--
. .: .::::.::::::::::: . .: ..:. : : : ::::::: .
XP_005 SPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAE
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KA0 ----DSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKSVTEMQTNPPAEKKAVPA------
. .:::. . .:.... .. . .: .. .. . ::.:
XP_005 GPGPPAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRLPATGTFKAKALPCQSPDPE
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 MEKDSLGVS-----FPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEAATLKRKCEFPAN
.: : :. ::: :. .::::::.::::..::::::: .: :::: ..
XP_005 LEAGSAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSS
600 610 620 630 640 650
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pF1KA0 VPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTG--------VGTHLTSLALPGKAESVA
. .:: . ..: . . .::: . : : :: :. ::: .:::::.
XP_005 YTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEGATPRKEPVVGGTLSPLALANKAESVV
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KA0 SLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELE--MVEDA---ASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEP
:.:::::.:::::::::::: :: . :.:: : :: .:: . .. . :
XP_005 SVTSQCSFSSTIVHVGDKKP-PESDIIMMEDLPGLAPGPAP-----SPAPSPTVAPDPAP
720 730 740 750 760 770
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 --FKKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPG
.. .:::: ::. :::::::.::..:... .: .: : :::.
XP_005 DAYRPVGLTKAVLSLHTQKEEQAFLSRFRDLGRL---------------RGLDSSSTAPS
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780 790 800 810 820 830
pF1KA0 LRNTSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTS
. : .. .. .:: . : .. : . : :. . . : .:
XP_005 ALGERGCHHGPAPPSRRHHCRSKAKRSRHHQN------PRAEAPCYVSHPSPV--PPSTP
820 830 840 850 860
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. ::. :::: : : :::: : : :::: .:: :
XP_005 WPTPPATTPFPAVVQP-YPLPVFSPRGGPQPLPPAPT----SVP-------------PAA
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:::::. :..:..::.: ::. . . : . . . . : : :: : ::
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: : : .:: : . :::.:: ::::::::::::: :.. :... : :..
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: : ... .:.: :. : ....:.:::: :: ::.:::.:: :..::::
XP_005 ------AGPPPPSAEAAEPEARLA--EVTESSNQDALSGSSDLLELLLQEDSRSGTGSAA
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: ::::: . ..: : : ::..:::::::::::::: . : . : : .
XP_005 SGSLGSGLGSGSGSGSHEGGSTSASITRSSQSSHTSKYFGSIDSSEAEAGAARG-GAEPG
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pF1KA0 EHFIKCVLQDPIWLLMADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQK
.. :: :::::::::::.::. ::::::.:::.. .:::.:::.:. .:: ::::.:.:.
XP_005 DQVIKYVLQDPIWLLMANADQRVMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQR
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pF1KA0 QELREVHQWMQTGGLPAAIDVAECVYC--ENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDE
.:: ::.:.. : :: :.:: :: : ... :. : .. .::: : . :
XP_005 RELGAVHSWVRKGQLPRALDVMACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGL-EPMEEGGGE
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1250
pF1KA0 NGSPLNHRIEEQT
.::
XP_005 QGSSGGGSGEGEGCEEAQGGAKASSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS
1240 1250 1260 1270 1280 1290
>>NP_002607 (OMIM: 602260) period circadian protein homo (1290 aa)
initn: 2821 init1: 1712 opt: 1873 Z-score: 876.9 bits: 174.5 E(85289): 4.2e-42
Smith-Waterman score: 3146; 44.5% identity (66.3% similar) in 1298 aa overlap (9-1245:26-1240)
10 20 30 40
pF1KA0 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSS-GSSGHE
:::. : ..: : :: : .:.: .: ::::.:
NP_002 MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPC-PGPS---LADDTDANSNGSSGNE
10 20 30 40 50
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pF1KA0 TNENCSTGRDSQGSDCDDSG--KELGMLVEPPDAR----QSPD------TFSLMMAKSEH
.: . : : ....: ..:: :. ..: ... :::. ..::. :.::.
NP_002 SNGHESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQ
60 70 80 90 100 110
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pF1KA0 -NPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKVHLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVK
:::::::::.::... :.:::. .:.:::..:: ....::...:::::.::: ::::.
NP_002 DNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQ
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150 160 170 180 190 200
pF1KA0 ANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMESVTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISD
::.:::: ::.::. :. .::.::.: .:::. ..: : :.::::...:.:.:::.
NP_002 ANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISE
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pF1KA0 QVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFHSFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKS
:.: ...::::.: ..: :.:::.:::::.. :.: .:: :. ..: : .. .:::
NP_002 QAAVLLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKS
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pF1KA0 FFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRDQQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPE
:::. ... ::.:::.:::..:.: ..:: .: ::::.:::.:::::::::::.
NP_002 VFCRIRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAPAQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPD
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pF1KA0 KRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQDLIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSG
:::::: :::.::::::::::.::::::::::. .:::. ::: :::::::::::::: .
NP_002 KRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLA
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pF1KA0 GQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINPWSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPC
:::::.::::: ::::::.:.::::..:..:::::..:..::::::..:::::::.
NP_002 GQPFDHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAP
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pF1KA0 TEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSSGYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHE--
. .: .::::.::::::::::: . .: ..:. : : : ::::::: .
NP_002 SPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAE
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. .:::. . .:.... .. . .: .. .. . ::.:
NP_002 GPGPPAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRLPATGTFKAKALPCQSPDPE
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 MEKDSLGVS-----FPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEAATLKRKCEFPAN
.: : :. ::: :. .::::::.::::..::::::: .: :::: ..
NP_002 LEAGSAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSS
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KA0 VPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTG--------VGTHLTSLALPGKAESVA
. .:: . ..: . . .::: . : : :: :. ::: .:::::.
NP_002 YTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEGATPRKEPVVGGTLSPLALANKAESVV
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KA0 SLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELE--MVEDA---ASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEP
:.:::::.:::::::::::: :: . :.:: : :: .:: . .. . :
NP_002 SVTSQCSFSSTIVHVGDKKP-PESDIIMMEDLPGLAPGPAP-----SPAPSPTVAPDPAP
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720 730 740 750 760 770
pF1KA0 --FKKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPG
.. .:::: ::. :::::::.::..:... .: .: : :::.
NP_002 DAYRPVGLTKAVLSLHTQKEEQAFLSRFRDLGRL---------------RGLDSSSTAPS
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780 790 800 810 820 830
pF1KA0 LRNTSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTS
. : .. .. .:: . : .. : . : :. . . : .:
NP_002 ALGERGCHHGPAPPSRRHHCRSKAKRSRHHQN------PRAEAPCYVSHPSPV--PPSTP
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. ::. :::: : : :::: : : :::: .:: :
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pF1KA0 FPAPLA-PVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTS
:::::. :..:..::.: ::. . . : . . . . : : :: : ::
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pF1KA0 IPRQPCACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEG-GTGAMGTTGAT
: : : .:: : . :::.:: ::::::::::::: :.. :... : :..
NP_002 -PSLPALAP----SPPH---RPDSPLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPRAEGAAVAGGPGSS
960 970 980 990 1000
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pF1KA0 ETAAVGADCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAA
: : ... .:.: :. : ....:.:::: :: ::.:::.:: :..::::
NP_002 ------AGPPPPSAEAAEPEARLA--EVTESSNQDALSGSSDLLELLLQEDSRSGTGSAA
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1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 SESLGSGSLGCDASPSGAG---------SSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEES
: ::::: . ..: : : ::..:::::::::::::: . : . : : .
NP_002 SGSLGSGLGSGSGSGSHEGGSTSASITRSSQSSHTSKYFGSIDSSEAEAGAARG-GAEPG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KA0 EHFIKCVLQDPIWLLMADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQK
.. :: :::::::::::.::. ::::::.:::.. .:::.:::.:. .:: ::::.:.:.
NP_002 DQVIKYVLQDPIWLLMANADQRVMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQR
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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pF1KA0 QELREVHQWMQTGGLPAAIDVAECVYC--ENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDE
.:: ::.:.. : :: :.:: :: : ... :. : .. .::: : . :
NP_002 RELGAVHSWVRKGQLPRALDVMACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGL-EPMEEGGGE
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1250
pF1KA0 NGSPLNHRIEEQT
.::
NP_002 QGSSGGGSGEGEGCEEAQGGAKASSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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.: . : : ....: ..:: :. ..: ... :::. ..::. :.::.
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:::::::::.::... :.:::. .:.:::..:: ....::...:::::.::: ::::.
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::.:::: ::.::. :. .::.::.: .:::. ..: : :.::::...:.:.:::.
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:.: ...::::.: ..: :.:::.:::::.. :.: .:: :. ..: : .. .:::
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:::. ... ::.:::.:::..:.: ..:: .: ::::.:::.:::::::::::.
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:::::: :::.::::::::::.::::::::::. .:::. ::: :::::::::::::: .
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:::::.::::: ::::::.:.::::..:..:::::..:..::::::..:::::::.
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. .: .::::.::::::::::: . .: ..:. : : : ::::::: .
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. .:::. . .:.... .. . .: .. .. . ::.:
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.: : :. ::: :. .::::::.::::..::::::: .: :::: ..
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. .:: . .::: :
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: :: :: .: . : :: .:: . .. . : .. .:::: ::
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.. .. .:: . : .. : . : :. . . : .: . ::. ::::
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: : :::: : : :::: .:: : :::::. :..:..
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::.: ::. :: :.: . . . . : :.. : : :
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.:: : . :::.:: ::::::::::::: :.. :... : :.. : : .
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.. .:.: :. : ....:.:::: :: ::.:::.:: :..::::: ::::: . ..
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pF1KA0 SPSGAG---------SSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIW
: : : ::..:::::::::::::: . : . : : ... :: :::::::
XP_005 SGSHEGGSTSASITRSSQSSHTSKYFGSIDSSEAEAGAARG-GAEPGDQVIKYVLQDPIW
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pF1KA0 LLMADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTG
::::.::. ::::::.:::.. .:::.:::.:. .:: ::::.:.:..:: ::.:.. :
XP_005 LLMANADQRVMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRELGAVHSWVRKG
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pF1KA0 GLPAAIDVAECVYC--ENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
:: :.:: :: : ... :. : .. .::: : . :.::
XP_005 QLPRALDVMACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGL-EPMEEGGGEQGSSGGGSGEGEG
1140 1150 1160 1170 1180 1190
XP_005 CEEAQGGAKASSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS
1200 1210 1220 1230
>>NP_001276792 (OMIM: 603427,616882) period circadian pr (1184 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KA0 SSGHETNENCSTGRDSQGSDCDDSGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLM--MAKSEHNPSTS
: : : ::. : :. .: : :
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10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
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:.:... . .::: ...:.: ..:.... .: ::: .:.:::: :..:.:: :..
NP_001 ---SEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERR--NKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFF
50 60 70 80 90
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pF1KA0 QLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMESVTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISDQVASIF
:.: :..: : ::: :..::. ...::: ::.: :... :..::....::.:.: :.
NP_001 QIL-SQNGAP-QADVSMYSLEELATIASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALIL
100 110 120 130 140 150
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pF1KA0 HCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFHSFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKSFFCRVS
. :.:......::..:::.:. ::.. :. .::.:. . . :: : ::::.
NP_001 NRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIR
160 170 180 190 200 210
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pF1KA0 VRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD--QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIF
.....: . :::. :::..:. : ::. ::: ..:..:::::::::: .::::
NP_001 GGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHHPAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIF
220 230 240 250 260 270
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pF1KA0 TTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQDLIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSGGQP-
::::::.:.: .:::.::::::::::::: : .: ::: :: ::.:::.:.:. .:.:
NP_001 TTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLPQDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPP
280 290 300 310 320 330
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pF1KA0 FDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINPWSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEE
:..::::: ..::.:: ::.:::::.:::::::::::::::::..:::::::: :.
NP_001 FEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFA----TKI
340 350 360 370 380 390
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pF1KA0 KALHPS---IQELTEQIHRLLLQPVPHSGSSGYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGH--E
: .. . : :: :::..:::::: : :::::::::.::.:.:.: .:::...:: :
NP_001 KKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVE
400 410 420 430 440 450
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pF1KA0 DSRRRRA---EICKNGNKTKNRSHYSH-ESGEQKK-KSVTEMQTNPPA--EKKAVPAME-
... .. .. . :: :: .. . :: ... : :: .:.: . : :. ...
NP_001 ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGECKTFTSFHQ
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:.. . : : ... . :::::.:.:::::::.: : : ::::: .:. .
NP_001 TLKNNSVYTEPCEDLRNDEHSPSYQQINCIDSVIRYLKSYNIPA-LKRKCISCTNTTSSS
520 530 540 550 560 570
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pF1KA0 SS-DKR--KATVSPGPHAG---EAEPPSRV--NSR---TGVGT-HLTSLALPGKAESVAS
: ::. :: . .:: : : :.. :.: :: :. .. : :. :..:
NP_001 SEEDKQNHKADDVQALQAGLQIPAIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAM----LSLGS
580 590 600 610 620
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pF1KA0 LTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELEMVEDAASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEPFKKLGL
:::.:::::::: : :: : .:. .: :..:. ::..::
NP_001 GISQCGYSSTIVHV----PPPETARDATLFCEPWTLNMQPAP-----LTSEE--FKHVGL
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pF1KA0 TKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGLRNTSGID
: ::.::::::::....::.: .:..: :::..:... . : ...
NP_001 TAAVLSAHTQKEEQNYVDKFRE----KILSSPYSSYLQQESRSKAKYSYFQGDSTSKQTR
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pF1KA0 SPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSES-TGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTS--QSSCP
: . ::... .: .: ::: : :::: .:. :: :: .: ..: :
NP_001 SAGCRKGKHKR--KKLPEPPDSSSSNTGSGPRRGAHQ-----NAQPCCPSAASSPHTSSP
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pF1KA0 AVPFPAPVP--AAYSLPVFPAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQP-PPFPAP
. : : :: : : .:.:: :.... : : :.: : . ..:: : :: :
NP_001 TFPPAAMVPSQAPYLVPAFPLPAATS-PGREYAAPGTAPEGLHGLPLSEGLQPYPAFPFP
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pF1KA0 -LAPVMAFMLPSYSF-PSGTPN-LPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTSIP
: :. .::. : .:. :: :. . . :...: :. . .: :: ::
NP_001 YLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFLPCPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLDPP-PSVTSQR
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:. : .. :. :.. ::::::::::::: :: :. . . .:
NP_001 REEEKWEA------QSEGH---PFITSRSSSPLQLNLLQ-EEMPRPSESPDQMRRNTCPQ
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pF1KA0 TE---TAAVGADCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSS-----------GLLN
:: :. :.. .:.:. . .: :..:: : ::::.: . :.
NP_001 TEYCVTGNNGSESSPATTGALSTGSP-PRENPSHPTAS-ALSTGSPPMKNPSHPTASTLS
960 970 980 990 1000 1010
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. : . . .:. : :: . ::: .:: : .: .: :. .:. ::. ....
NP_001 MGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPP---SESPSRTGSAASGSSDSSIYLTSSVYSSKISQNG
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... ....: : : ..::: .. .. ..::::.: : :.::::: :::. ...
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..
XP_011 ADGAATSCGQVLVEDSC
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XP_016 SEEDKQNHKADDVQALQAGLQIPAIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAM----LSLGS
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NP_058 ---SEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERR--NKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFF
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NP_058 NRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQLPFWNNWTQRAA-RYECAPVKPFFCRIR
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NP_058 FEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFA----TKI
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