Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0347, 1255 aa
1>>>pF1KA0347 1255 - 1255 aa - 1255 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7414+/-0.00125; mu= -5.9664+/- 0.075
mean_var=412.8604+/-86.900, 0's: 0 Z-trim(112.8): 40 B-trim: 470 in 1/51
Lambda= 0.063121
statistics sampled from 13490 (13521) to 13490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.415), width: 16
Scan time: 4.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2528.1 PER2 gene_id:8864|Hs108|chr2 (1255) 8470 786.9 0
CCDS11131.1 PER1 gene_id:5187|Hs108|chr17 (1290) 1873 186.2 4.8e-46
CCDS89.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1201) 1726 172.8 4.8e-42
CCDS76097.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1191) 1576 159.1 6.2e-38
CCDS72695.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1210) 1543 156.1 5e-37
>>CCDS2528.1 PER2 gene_id:8864|Hs108|chr2 (1255 aa)
initn: 8470 init1: 8470 opt: 8470 Z-score: 4187.1 bits: 786.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8470; 100.0% identity (100.0% similar) in 1255 aa overlap (1-1255:1-1255)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSSGSSGHETNENCSTGRDSQGSDCDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSSGSSGHETNENCSTGRDSQGSDCDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLMMAKSEHNPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLMMAKSEHNPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 HLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVKANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVKANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISDQVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISDQVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKSFFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKSFFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSGGQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSGGQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 WSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 WSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHEDSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 GYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHEDSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 VTEMQTNPPAEKKAVPAMEKDSLGVSFPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VTEMQTNPPAEKKAVPAMEKDSLGVSFPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ATLKRKCEFPANVPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTGVGTHLTSLALPGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ATLKRKCEFPANVPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTGVGTHLTSLALPGKA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ESVASLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELEMVEDAASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ESVASLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELEMVEDAASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEPF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 KKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGLRN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTSQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 TSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTSQSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 CPAVPFPAPVPAAYSLPVFPAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQPPPFPAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 CPAVPFPAPVPAAYSLPVFPAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQPPPFPAPL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 APVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTSIPRQPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 APVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTSIPRQPC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEGGTGAMGTTGATETAAVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEGGTGAMGTTGATETAAVGA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 DCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAASESLGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAASESLGSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SLGCDASPSGAGSSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIWLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SLGCDASPSGAGSSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIWLLM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTGGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTGGLP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 AAIDVAECVYCENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AAIDVAECVYCENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDENGSPLNHRIEEQT
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS11131.1 PER1 gene_id:5187|Hs108|chr17 (1290 aa)
initn: 2821 init1: 1712 opt: 1873 Z-score: 940.2 bits: 186.2 E(32554): 4.8e-46
Smith-Waterman score: 3146; 44.5% identity (66.3% similar) in 1298 aa overlap (9-1245:26-1240)
10 20 30 40
pF1KA0 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSS-GSSGHE
:::. : ..: : :: : .:.: .: ::::.:
CCDS11 MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPC-PGPS---LADDTDANSNGSSGNE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KA0 TNENCSTGRDSQGSDCDDSG--KELGMLVEPPDAR----QSPD------TFSLMMAKSEH
.: . : : ....: ..:: :. ..: ... :::. ..::. :.::.
CCDS11 SNGHESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQ
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KA0 -NPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKVHLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVK
:::::::::.::... :.:::. .:.:::..:: ....::...:::::.::: ::::.
CCDS11 DNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQ
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 ANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMESVTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISD
::.:::: ::.::. :. .::.::.: .:::. ..: : :.::::...:.:.:::.
CCDS11 ANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISE
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 QVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFHSFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKS
:.: ...::::.: ..: :.:::.:::::.. :.: .:: :. ..: : .. .:::
CCDS11 QAAVLLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 FFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRDQQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPE
:::. ... ::.:::.:::..:.: ..:: .: ::::.:::.:::::::::::.
CCDS11 VFCRIRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAPAQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPD
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 KRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQDLIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSG
:::::: :::.::::::::::.::::::::::. .:::. ::: :::::::::::::: .
CCDS11 KRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLA
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 GQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINPWSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPC
:::::.::::: ::::::.:.::::..:..:::::..:..::::::..:::::::.
CCDS11 GQPFDHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAP
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 TEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSSGYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHE--
. .: .::::.::::::::::: . .: ..:. : : : ::::::: .
CCDS11 SPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAE
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KA0 ----DSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKSVTEMQTNPPAEKKAVPA------
. .:::. . .:.... .. . .: .. .. . ::.:
CCDS11 GPGPPAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRLPATGTFKAKALPCQSPDPE
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 MEKDSLGVS-----FPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEAATLKRKCEFPAN
.: : :. ::: :. .::::::.::::..::::::: .: :::: ..
CCDS11 LEAGSAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSS
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KA0 VPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTG--------VGTHLTSLALPGKAESVA
. .:: . ..: . . .::: . : : :: :. ::: .:::::.
CCDS11 YTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEGATPRKEPVVGGTLSPLALANKAESVV
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KA0 SLTSQCSYSSTIVHVGDKKPQPELE--MVEDA---ASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEP
:.:::::.:::::::::::: :: . :.:: : :: .:: . .. . :
CCDS11 SVTSQCSFSSTIVHVGDKKP-PESDIIMMEDLPGLAPGPAP-----SPAPSPTVAPDPAP
720 730 740 750 760 770
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 --FKKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPG
.. .:::: ::. :::::::.::..:... .: .: : :::.
CCDS11 DAYRPVGLTKAVLSLHTQKEEQAFLSRFRDLGRL---------------RGLDSSSTAPS
780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 LRNTSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTS
. : .. .. .:: . : .. : . : :. . . : .:
CCDS11 ALGERGCHHGPAPPSRRHHCRSKAKRSRHHQN------PRAEAPCYVSHPSPV--PPSTP
820 830 840 850 860
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 QSSCPAV-PFPAPVPAAYSLPVF-PAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQPPP
. ::. :::: : : :::: : : :::: .:: :
CCDS11 WPTPPATTPFPAVVQP-YPLPVFSPRGGPQPLPPAPT----SVP-------------PAA
870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 FPAPLA-PVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTS
:::::. :..:..::.: ::. . . : . . . . : : :: : ::
CCDS11 FPAPLVTPMVALVLPNYLFPTPS-SYPYGALQTPAEGPPTP------ASHS----PS---
910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 IPRQPCACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEG-GTGAMGTTGAT
: : : .:: : . :::.:: ::::::::::::: :.. :... : :..
CCDS11 -PSLPALAP----SPPH---RPDSPLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPRAEGAAVAGGPGSS
960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 ETAAVGADCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAA
: : ... .:.: :. : ....:.:::: :: ::.:::.:: :..::::
CCDS11 ------AGPPPPSAEAAEPEARLA--EVTESSNQDALSGSSDLLELLLQEDSRSGTGSAA
1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 SESLGSGSLGCDASPSGAG---------SSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEES
: ::::: . ..: : : ::..:::::::::::::: . : . : : .
CCDS11 SGSLGSGLGSGSGSGSHEGGSTSASITRSSQSSHTSKYFGSIDSSEAEAGAARG-GAEPG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 EHFIKCVLQDPIWLLMADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQK
.. :: :::::::::::.::. ::::::.:::.. .:::.:::.:. .:: ::::.:.:.
CCDS11 DQVIKYVLQDPIWLLMANADQRVMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQR
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 QELREVHQWMQTGGLPAAIDVAECVYC--ENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDE
.:: ::.:.. : :: :.:: :: : ... :. : .. .::: : . :
CCDS11 RELGAVHSWVRKGQLPRALDVMACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGL-EPMEEGGGE
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1250
pF1KA0 NGSPLNHRIEEQT
.::
CCDS11 QGSSGGGSGEGEGCEEAQGGAKASSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS
1240 1250 1260 1270 1280 1290
>>CCDS89.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1201 aa)
initn: 1452 init1: 529 opt: 1726 Z-score: 868.3 bits: 172.8 E(32554): 4.8e-42
Smith-Waterman score: 2194; 39.1% identity (64.1% similar) in 1232 aa overlap (68-1218:19-1186)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 SSGHETNENCSTGRDSQGSDCDDSGKELGMLVEPPDARQSPDTFSLM--MAKSEHNPSTS
: : : ::. : :. .: : :
CCDS89 MPRGEAPGPGRRGAKDEALGEESGERWSPE-FHLQRKLADSSH-----
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 GCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKVHLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVKANEEYY
:.:... . .::: ...:.: ..:.... .: ::: .:.:::: :..:.:: :..
CCDS89 ---SEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERR--NKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFF
50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 QLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMESVTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISDQVASIF
:.: :..: : ::: :..::. ...::: ::.: :... :..::....::.:.: :.
CCDS89 QIL-SQNGAP-QADVSMYSLEELATIASEHTSKNTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALIL
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 HCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFHSFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKSFFCRVS
. :.:......::..:::.:. ::.. :. .::.:. . . :: : ::::.
CCDS89 NRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQLPFWNNWTQRAA-RYECAPVKPFFCRIR
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 VRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD--QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIF
.....: . :::. :::..:. : ::. ::: ..:..:::::::::: .::::
CCDS89 GGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHHPAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIF
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 TTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQDLIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSGGQP-
::::::.:.: .:::.::::::::::::: : .: ::: :: ::.:::.:.:. .:.:
CCDS89 TTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLPQDLIGTSILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPP
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 FDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINPWSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEE
:..::::: ..::.:: ::.:::::.:::::::::::::::::..:::::::: :.
CCDS89 FEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFA----TKI
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: .. . : :: :::..:::::: : :::::::::.::.:.:.: .:::...:: :
CCDS89 KKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVE
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pF1KA0 DSRRRRA---EICKNGNKTKNRSHYSH-ESGEQKK-KSVTEMQTNPPA--EKKAVPAME-
... .. .. . :: :: .. . :: ... : :: .:.: . : :. ...
CCDS89 ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGECKTFTSFHQ
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pF1KA0 --KDSLGVSFPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEAATLKRKCEFPANVPALR
:.. . : : ... . :::::.:.:::::::.: : : ::::: .:. .
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: ::. :: . .:: : : :.. :.: :: :. .. : :. :..:
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:::.:::::::: : :: : .:. .: :..:. ::..::
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: ::.::::::::....::.: .:..: :::..:... . : ...
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pF1KA0 SPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSES-TGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTS--QSSCP
: . ::... .: .: ::: : :::: .:. :: :: .: ..: :
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. : : :: : : .:.:: :.... : : :.: : . ..:: : :: :
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: :. .::. : .:. :: :. . . :...: :. . .: :: ::
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:. : .. :. :.. ::::::::::::: :: :. . . .:
CCDS89 REEEKWEA------QSEGH---PFITSRSSSPLQLNLLQ-EEMPRPSESPDQMRRNTCPQ
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pF1KA0 TE---TAAVGADCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSAS
:: :. :.. .:.:. . .: :..:: : ::::.: .. : . .::
CCDS89 TEYCVTGNNGSESSPATTGALSTGSP-PRENPSHPTAS-ALSTGSPPMK---NPSHPTAS
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pF1KA0 ----GS----------AASESLG----------------SGSLGCDASPSGAGS--SDTS
:: :.. :.: .:: . ::: .:: : .:
CCDS89 ALSTGSPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPPSE-SPSRTGSAASGSS
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pF1KA0 HTSKYF-GSIDSSENNHKAKMNTGMEESEHFIKCVLQDPIWLLMADADSSVMMTYQLPSR
.: :. .:. ::. ....... ....: : : ..::: .. .. ..::::.: :
CCDS89 DSSIYLTSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETF-PNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPER
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pF1KA0 NLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQELREVHQWMQTGGLPAAIDVAECVYCENKEK
:.::::: :::. ... ::.:...::.:: .:..:.:. . ::. :: :::...
CCDS89 VKEVVLKEDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCENEDS
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..
CCDS89 ADGAATSCGQVLVEDSC
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. :.:......::..:::.:. ::.. :. .::.:. . . :: : ::::.
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.....: . :::. :::..:. : ::. ::: ..:..:::::::::: .::::
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CCDS76 FEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFA----TKI
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CCDS76 KKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVE
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::..::: ::.::::::::....::.: .:..: :::..:... . :
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:. ....... ....: : : ..::: .. .. ..::::.: : :.::::: ::
CCDS76 SKISQNGQQSQDVQKKETF-PNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQVPERVKEVVLKEDLEK
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CCDS76 VEDSC
1190
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CCDS72 ---SEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERR--NKPSTLDALNYALRCVHSVQANSEFF
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CCDS72 NRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQLPFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIR
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pF1KA0 VRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRD--QQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPEKRIF
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CCDS72 GGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVHHPAQPELESEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIF
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pF1KA0 FDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINPWSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPCTEE
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CCDS72 FEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRKISFIIGRHKVRTSPLNEDVFA----TKI
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pF1KA0 KALHPS---IQELTEQIHRLLLQPVPHSGSSGYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGH--E
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CCDS72 KKMNDNDKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGSLGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVE
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CCDS72 ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKSSFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECK
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pF1KA0 LGVSFPEELA--------CKN----QPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEAATLKRKCEFP
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CCDS72 TFTSFHQTLKNNSVYTEPCEDLRNDEHSPSYQQINCIDSVIRYLKSYNIPA-LKRKCISC
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CCDS72 PSVTSQRREEEKWEA------QSEGH---PFITSRSSSPLQLNLLQ-EEMPRPSESPDQM
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