Result of FASTA (omim) for
pF1KA0051
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0051, 1657 aa
1>>>pF1KA0051 1657 - 1657 aa - 1657 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4058+/-0.000663; mu= 13.5114+/- 0.041
mean_var=129.9078+/-25.917, 0's: 0 Z-trim(107.7): 69 B-trim: 262 in 2/50
Lambda= 0.112527
statistics sampled from 15658 (15718) to 15658 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.494), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 16.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003861 (OMIM: 603379) ras GTPase-activating-lik (1657) 10681 1747.5 0
NP_001272389 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating- (1525) 4940 815.5 0
XP_005248467 (OMIM: 605401) PREDICTED: ras GTPase- (1548) 4940 815.5 0
NP_006624 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating-lik (1575) 4940 815.5 0
XP_011541410 (OMIM: 605401) PREDICTED: ras GTPase- (1128) 4419 730.9 1.6e-209
XP_005248471 (OMIM: 605401) PREDICTED: ras GTPase- (1128) 4419 730.9 1.6e-209
NP_001272390 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating- (1071) 3884 644.0 2.1e-183
NP_001272391 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating- (1071) 3884 644.0 2.1e-183
XP_016864449 (OMIM: 605401) PREDICTED: ras GTPase- (1518) 3884 644.1 2.8e-183
XP_011537156 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 447) 196 45.1 0.0017
XP_016875518 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 780) 196 45.2 0.0027
XP_016875519 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 780) 196 45.2 0.0027
XP_006719705 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 805) 196 45.2 0.0028
NP_001180449 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 806) 196 45.2 0.0028
XP_006719704 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 806) 196 45.2 0.0028
XP_011537154 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 806) 196 45.2 0.0028
XP_005254007 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 806) 196 45.2 0.0028
NP_001180450 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 776) 194 44.9 0.0034
XP_016875520 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 779) 194 44.9 0.0034
NP_004649 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like pr ( 804) 194 44.9 0.0035
XP_011537155 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 804) 194 44.9 0.0035
NP_001288131 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 805) 194 44.9 0.0035
XP_016875517 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 805) 194 44.9 0.0035
>>NP_003861 (OMIM: 603379) ras GTPase-activating-like pr (1657 aa)
initn: 10681 init1: 10681 opt: 10681 Z-score: 9374.3 bits: 1747.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10681; 100.0% identity (100.0% similar) in 1657 aa overlap (1-1657:1-1657)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSAADEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MSAADEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 NAMDEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NAMDEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EINNMKTELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDRRIPADTFAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EINNMKTELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDRRIPADTFAAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KNPNAMLVNLEEPLASTYQDILYQAKQDKMTNAKNRTENSERERDVYEELLTQAEIQGNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KNPNAMLVNLEEPLASTYQDILYQAKQDKMTNAKNRTENSERERDVYEELLTQAEIQGNI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NKVNTFSALANIDLALEQGDALALFRALQSPALGLRGLQQQNSDWYLKQLLSDKQQKRQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NKVNTFSALANIDLALEQGDALALFRALQSPALGLRGLQQQNSDWYLKQLLSDKQQKRQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GQTDPLQKEELQSGVDAANSAAQQYQRRLAAVALINAAIQKGVAEKTVLELMNPEAQLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GQTDPLQKEELQSGVDAANSAAQQYQRRLAAVALINAAIQKGVAEKTVLELMNPEAQLPQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VYPFAADLYQKELATLQRQSPEHNLTHPELSVAVEMLSSVALINRALESGDVNTVWKQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VYPFAADLYQKELATLQRQSPEHNLTHPELSVAVEMLSSVALINRALESGDVNTVWKQLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SSVTGLTNIEEENCQRYLDELMKLKAQAHAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SSVTGLTNIEEENCQRYLDELMKLKAQAHAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 AIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDESAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDESAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGIFAINEAVESGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGIFAINEAVESGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPEC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GETYHSDLAEAKKKKLAVGDNNSKWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFVQNSMQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GETYHSDLAEAKKKKLAVGDNNSKWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFVQNSMQL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAIT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 CIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYLRSHKDEVVKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHINDII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYLRSHKDEVVKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHINDII
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMVVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVITLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMVVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVITLI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREEY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 LLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEIM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 DDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNMRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNMRA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 NDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNLNDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNLNDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMD
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 ARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRYRQRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRYRQRRK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 AELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGKKSKKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGKKSKKIS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 LKYTAARLHEKGVLLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LKYTAARLHEKGVLLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQ
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650
pF1KA0 DLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK
1630 1640 1650
>>NP_001272389 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating-like (1525 aa)
initn: 5945 init1: 2043 opt: 4940 Z-score: 4337.9 bits: 815.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5947; 58.3% identity (80.3% similar) in 1614 aa overlap (54-1657:1-1525)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 ERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGEDLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGN
::.:: :.::::::::::::::::::::..
NP_001 MEVCLVEELPPTTELEEGLRNGVYLAKLAK
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 FFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWLNAMDEIGLPKIFYPETTDIYDRK
::.::.:: ::::: :::::: .:::::::::..::: ::. :::::::::::::.::::
NP_001 FFAPKMVSEKKIYDVEQTRYKKSGLHFRHTDNTVQWLRAMESIGLPKIFYPETTDVYDRK
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 NMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEEEINNMKTELEKYGIQMPAFSKIG
:.:: :::::::::::::::.::::::: ::::::::::.::. ::::::::::.:::::
NP_001 NIPRMIYCIHALSLYLFKLGIAPQIQDLLGKVDFTEEEISNMRKELEKYGIQMPSFSKIG
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 GILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDRRIPADTFAALKNPNAMLVNLEEPLASTYQDILY
::::::::::::::::::::::::... : .: ..:.::::.:. ... :: :: :.
NP_001 GILANELSVDEAALHAAVIAINEAVEKGIAEQTVVTLRNPNAVLTLVDDNLAPEYQKELW
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 QAKQDKMTNAKNRTEN-SERERDVYEELLTQAEIQGNINKVNTFSALANIDLALEQGDAL
.::. : ::. .. ::.:::.::::::::::::::::::
NP_001 DAKKKKEENARLKNSCISEEERDAYEELLTQAEIQGNINKVN------------------
220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 ALFRALQSPALGLRGLQQQNSDWYLKQLLSDKQQKRQSGQTDPLQKEELQSGVDAANSAA
NP_001 ------------------------------------------------------------
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 QQYQRRLAAVALINAAIQKGVAEKTVLELMNPEAQLPQVYPFAADLYQKELATLQRQSPE
: ::: :::.: .: :.:.: : .:::::: :::::: .::.:: .::.:.
NP_001 -----RQAAVDHINAVIPEGDPENTLLALKKPEAQLPAVYPFAAAMYQNELFNLQKQNTM
260 270 280 290 300
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 HNLTHPELSVAVEMLSSVALINRALESGDVNTVWKQLSSSVTGLTNIEEENCQRYLDELM
. :.: :: .::::::.:::.:.::::.:. .: .:: : . ::.:... .:: . :.
NP_001 NYLAHEELLIAVEMLSAVALLNQALESNDLVSVQNQLRSPAIGLNNLDKAYVERYANTLL
310 320 330 340 350 360
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 KLKAQAHAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQ
..: .. ..... ..::.:: :.: :: .:::..:..:.: ::::.:::. .::..:
NP_001 SVKLEVLSQGQDNLSWNEIQNCIDMVNAQIQEENDRVVAVGYINEAIDEGNPLRTLETLL
370 380 390 400 410 420
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 IPAAKLEGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDESAVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQK
.:.:.. : ::::::.: .:: .: . .. : :::::::: .. ..: : ..:..
NP_001 LPTANISDVDPAHAQHYQDVLYHAKSQKLGDSESVSKVLWLDEIQQAVDDANVDEDRAKQ
430 440 450 460 470 480
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 FALGIFAINEAVESGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPECGETYHSDLAEAKKKKLAVGDNN
.. . .:. .:. . ::.:.: . .::::.. :.. :..::. : ...
NP_001 WVTLVVDVNQCLEGKKSSDILSVLKSSTSNANDIIPECADKYYDALVKAKELKSERVSSD
490 500 510 520 530 540
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 SKWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFVQNSMQLSREEIQSSISGVTAAYNREQLW
..:.: .. : ::.: ...:..: : . . . :. .::.. : ::..: ::..:
NP_001 GSWLKLNLHKKYDYYYNTDSKESSWVTPESCLYKESWLTGKEIEDIIEEVTVGYIRENIW
550 560 570 580 590 600
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 LANEGLITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAITCIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYL
:.: :. :.:: : ..:.::..: .::..: .. ::. :.::::.: :. : .
NP_001 SASEELLLRFQATSSGPILREEFEARKSFLHEQEENVVKIQAFWKGYKQRKEYMHRRQTF
610 620 630 640 650 660
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 RSHKDEVVKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHINDIIKIQAFIRANKARDDYKTLINAE
.. : .::::: :: ::: : .:::::::: :.:.:::...::::::::::::...:
NP_001 IDNTDSIVKIQSWFRMATARKSYLSRLQYFRDHNNEIVKIQSLLRANKARDDYKTLVGSE
670 680 690 700 710 720
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 DPPMVVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVITLIRSNQQLENDLNLMDIKIGLLVK
.::..:.::::.:::::: ::::::.. ..::::.: ::.:::::.::::::::::::::
NP_001 NPPLTVIRKFVYLLDQSDLDFQEELEVARLREEVVTKIRANQQLEKDLNLMDIKIGLLVK
730 740 750 760 770 780
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 NKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKALSKEKREKLEAYQHLFYLLQTN
:.:::.::.::::::.::. .. .. : .. :.:.::::.:. ::.::.::::::::
NP_001 NRITLEDVISHSKKLNKKKGGEME--ILNNTDNQGIKSLSKERRKTLETYQQLFYLLQTN
790 800 810 820 830 840
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 PTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREEYLLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQ
: :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::.:::::::::.:
NP_001 PLYLAKLIFQMPQNKSTKFMDTVIFTLYNYASNQREEYLLLKLFKTALEEEIKSKVDQVQ
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pF1KA0 EIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEIMDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQM
.:::::::::::::::::::::::.:::.::::::::.::::: :.:.::..::.::::.
NP_001 DIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNTLRQLLAPVVKEIIDDKSLIINTNPVEVYKAWVNQL
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pF1KA0 ESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNMRAVTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRF
:.::::::::::::: ::::.. :::..:..::.:.: :::: :..:.::.: .:::.:.
NP_001 ETQTGEASKLPYDVTTEQALTYPEVKNKLEASIENLRRVTDKVLNSIISSLDLLPYGLRY
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pF1KA0 IAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQR
::::::.:.::::::: :::::::.:::::::::::::::::.:::::..::::...:::
NP_001 IAKVLKNSIHEKFPDATEDELLKIVGNLLYYRYMNPAIVAPDGFDIIDMTAGGQINSDQR
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pF1KA0 RNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVD
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NP_001 RNLGSVAKVLQHAASNKLFEGENEHLSSMNNYLSETYQEFRKYFKEACNVPEPEEKFNMD
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pF1KA0 EYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIG
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NP_001 KYTDLVTVSKPVIYISIEEIISTHSLLLEHQDAIAPEKNDLLSELLGSLGEVPTVESFLG
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pF1KA0 ESSGNLNDPNKEA----LAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMDARTILLNTKRLIVDVIRF
:.. . ::::: :.:::.::.::.:.:. ... .:.:.....::.::.::::
NP_001 EGAVDPNDPNKANTLSQLSKTEISLVLTSKYDI--EDGEAIDSRSLMIKTKKLIIDVIRN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KA0 QPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKKSKSVKEDSNLTLQEKKEK
:::.:::::::::::..::..: : ::. :..::..::.:.:. ::..: :..::.:
NP_001 QPGNTLTEILETPATAQQEVDHATDMVSRAMIDSRTPEEMKHSQSMIEDAQLPLEQKKRK
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pF1KA0 IQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRYRQRRKAELVKLQQTYAALNSKAT
:: .:. : . : :. .::::...:.::.:::::: ::. :::::.::::: :::.::.
NP_001 IQRNLRTLEQTGHVSSENKYQDILNEIAKDIRNQRIYRKLRKAELAKLQQTLNALNKKAA
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pF1KA0 FYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKG-----KVSKKPREMKGKKSKKISLKYTAARLHEKGV
:: ::..:: .::::::::: :. :.. : : :: : : .:::::.::::::
NP_001 FYEEQINYYDTYIKTCLDNLKRKNTRRSIKLDGKG-EPKGAKRAK-PVKYTAAKLHEKGV
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pF1KA0 LLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVM
::.:.:::.:::::: :.: ::.:: :.:..::.::.:: .:. :::::.::::::::
NP_001 LLDIDDLQTNQFKNVTFDIIATEDVGIFDVRSKFLGVEMEKVQLNIQDLLQMQYEGVAVM
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NP_001 KMFDKVKVNVNLLIYLLNKKFYGK
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::::::::.::::::::::::::::.:: :
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.::::::::::::::::::::..::.::.:: ::::: :::::: .:::::::::..:::
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::.::. ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::... : .: ..:
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.::::.:. ... :: :: :..::. : ::. .. ::.:::.:::::::::::::
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:::::
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: . ::.:... .:: . :...: .. ..... ..::.:: :.: :: .:::..:.
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.:.: ::::.:::. .::..: .:.:.. : ::::::.: .:: .: . .. :
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:::::::: .. ..: : ..:.... . .:. .:. . ::.:.: . .:::
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:.. :.. :..::. : .....:.: .. : ::.: ...:..: : . . .
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:. .::.. : ::..: ::..: :.: :. :.:: : ..:.::..: .::..: .
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pF1KA0 TCIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYLRSHKDEVVKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHINDI
. ::. :.::::.: :. : . .. : .::::: :: ::: : .:::::::: :.:
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.:::...::::::::::::...:.::..:.::::.:::::: ::::::.. ..::::.:
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::.:::::.:::::::::::::::.:::.::.::::::.::. .. .. : .. :.:
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.::::.:. ::.::.::::::::: :::::::::::::::::::.:::::::::::::::
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pF1KA0 MDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNMR
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:::: :..:.::.: .:::.:.::::::.:.::::::: :::::::.::::::::::::
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pF1KA0 IVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSY
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pF1KA0 QKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPE
:.::..:. ::.::: ..:::.:.:.::::..:::::::: :::.::.:::.::::::::
XP_005 QEFRKYFKEACNVPEPEEKFNMDKYTDLVTVSKPVIYISIEEIISTHSLLLEHQDAIAPE
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pF1KA0 HNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNLNDPNKEA----LAKTEVSLTLTNKFDVPGDE
.:: . ::: .::::::.::..::.. . ::::: :.:::.::.::.:.:. :
XP_005 KNDLLSELLGSLGEVPTVESFLGEGAVDPNDPNKANTLSQLSKTEISLVLTSKYDIEDGE
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pF1KA0 NAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTP
.:.:.....::.::.:::: :::.:::::::::::..::..: : ::. :..::
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pF1KA0 DKMKKSKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRY
..::.:.:. ::..: :..::.::: .:. : . : :. .::::...:.::.:::::: :
XP_005 EEMKHSQSMIEDAQLPLEQKKRKIQRNLRTLEQTGHVSSENKYQDILNEIAKDIRNQRIY
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pF1KA0 RQRRKAELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKG-----KVSKKPRE
:. :::::.::::: :::.::.:: ::..:: .::::::::: :. :.. : :
XP_005 RKLRKAELAKLQQTLNALNKKAAFYEEQINYYDTYIKTCLDNLKRKNTRRSIKLDGKG-E
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pF1KA0 MKGKKSKKISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGV
:: : : .:::::.::::::::.:.:::.:::::: :.: ::.:: :.:..::.::
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pF1KA0 QMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK
.:: .:. :::::.:::::::::.::..::::::::.:::::::::
XP_005 EMEKVQLNIQDLLQMQYEGVAVMKMFDKVKVNVNLLIYLLNKKFYGK
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initn: 6200 init1: 2043 opt: 4940 Z-score: 4337.7 bits: 815.5 E(85289): 0
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSAADEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGE
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NP_006 ELPPTTELEEGLRNGVYLAKLAKFFAPKMVSEKKIYDVEQTRYKKSGLHFRHTDNTVQWL
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pF1KA0 NAMDEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEE
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NP_006 RAMESIGLPKIFYPETTDVYDRKNIPRMIYCIHALSLYLFKLGIAPQIQDLLGKVDFTEE
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 EINNMKTELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDRRIPADTFAAL
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NP_006 EISNMRKELEKYGIQMPSFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAVEKGIAEQTVVTL
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 KNPNAMLVNLEEPLASTYQDILYQAKQDKMTNAKNRTEN-SERERDVYEELLTQAEIQGN
.::::.:. ... :: :: :..::. : ::. .. ::.:::.:::::::::::::
NP_006 RNPNAVLTLVDDNLAPEYQKELWDAKKKKEENARLKNSCISEEERDAYEELLTQAEIQGN
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:::::
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: ::: :::.: .: :.:.: : .::::::
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: . ::.:... .:: . :...: .. ..... ..::.:: :.: :: .:::..:.
NP_006 RSPAIGLNNLDKAYVERYANTLLSVKLEVLSQGQDNLSWNEIQNCIDMVNAQIQEENDRV
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pF1KA0 LAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDESA
.:.: ::::.:::. .::..: .:.:.. : ::::::.: .:: .: . .. :
NP_006 VAVGYINEAIDEGNPLRTLETLLLPTANISDVDPAHAQHYQDVLYHAKSQKLGDSESVSK
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pF1KA0 CGETYHSDLAEAKKKKLAVGDNNSKWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFVQNSMQ
:.. :.. :..::. : .....:.: .. : ::.: ...:..: : . . .
NP_006 CADKYYDALVKAKELKSERVSSDGSWLKLNLHKKYDYYYNTDSKESSWVTPESCLYKESW
580 590 600 610 620 630
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pF1KA0 LSREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAI
:. .::.. : ::..: ::..: :.: :. :.:: : ..:.::..: .::..: .
NP_006 LTGKEIEDIIEEVTVGYIRENIWSASEELLLRFQATSSGPILREEFEARKSFLHEQEENV
640 650 660 670 680 690
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. ::. :.::::.: :. : . .. : .::::: :: ::: : .:::::::: :.:
NP_006 VKIQAFWKGYKQRKEYMHRRQTFIDNTDSIVKIQSWFRMATARKSYLSRLQYFRDHNNEI
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840 850 860 870 880 890
pF1KA0 IKIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMVVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVITL
.:::...::::::::::::...:.::..:.::::.:::::: ::::::.. ..::::.:
NP_006 VKIQSLLRANKARDDYKTLVGSENPPLTVIRKFVYLLDQSDLDFQEELEVARLREEVVTK
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pF1KA0 IRSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLK
::.:::::.:::::::::::::::.:::.::.::::::.::. .. .. : .. :.:
NP_006 IRANQQLEKDLNLMDIKIGLLVKNRITLEDVISHSKKLNKKKGGEME--ILNNTDNQGIK
820 830 840 850 860 870
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pF1KA0 ALSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREE
.::::.:. ::.::.::::::::: :::::::::::::::::::.:::::::::::::::
NP_006 SLSKERRKTLETYQQLFYLLQTNPLYLAKLIFQMPQNKSTKFMDTVIFTLYNYASNQREE
880 890 900 910 920 930
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pF1KA0 YLLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEI
::::.::::::.:::::::::.:.:::::::::::::::::::::::.:::.::::::::
NP_006 YLLLKLFKTALEEEIKSKVDQVQDIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNTLRQLLAPVVKEI
940 950 960 970 980 990
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pF1KA0 MDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNMR
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NP_006 IDDKSLIINTNPVEVYKAWVNQLETQTGEASKLPYDVTTEQALTYPEVKNKLEASIENLR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KA0 AVTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPA
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NP_006 RVTDKVLNSIISSLDLLPYGLRYIAKVLKNSIHEKFPDATEDELLKIVGNLLYYRYMNPA
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KA0 IVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSY
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NP_006 IVAPDGFDIIDMTAGGQINSDQRRNLGSVAKVLQHAASNKLFEGENEHLSSMNNYLSETY
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pF1KA0 QKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPE
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NP_006 QEFRKYFKEACNVPEPEEKFNMDKYTDLVTVSKPVIYISIEEIISTHSLLLEHQDAIAPE
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pF1KA0 HNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNLNDPNKEA----LAKTEVSLTLTNKFDVPGDE
.:: . ::: .::::::.::..::.. . ::::: :.:::.::.::.:.:. ..
NP_006 KNDLLSELLGSLGEVPTVESFLGEGAVDPNDPNKANTLSQLSKTEISLVLTSKYDI--ED
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pF1KA0 NAEMDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTP
. .:.:.....::.::.:::: :::.:::::::::::..::..: : ::. :..::
NP_006 GEAIDSRSLMIKTKKLIIDVIRNQPGNTLTEILETPATAQQEVDHATDMVSRAMIDSRTP
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pF1KA0 DKMKKSKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRY
..::.:.:. ::..: :..::.::: .:. : . : :. .::::...:.::.:::::: :
NP_006 EEMKHSQSMIEDAQLPLEQKKRKIQRNLRTLEQTGHVSSENKYQDILNEIAKDIRNQRIY
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pF1KA0 RQRRKAELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKG-----KVSKKPRE
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pF1KA0 MKGKKSKKISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGV
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.:: .:. :::::.:::::::::.::..::::::::.:::::::::
NP_006 EMEKVQLNIQDLLQMQYEGVAVMKMFDKVKVNVNLLIYLLNKKFYGK
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..:.: ::::.:::. .::..: .:.:..
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pF1KA0 EGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDESAVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGIF
: ::::::.: .:: .: . .. : :::::::: .. ..: : ..:.... .
XP_011 SDVDPAHAQHYQDVLYHAKSQKLGDSESVSKVLWLDEIQQAVDDANVDKDRAKQWVTLVV
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.. : ::.: ...:..: : . . . :. .::.. : ::..: ::..: :.: :
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.::::: :: ::: : .:::::::: :.:.:::...::::::::::::...:.::..:
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XP_011 IRKFVYLLDQSDLDFQEELEVARLREEVVTKIRANQQLEKDLNLMDIKIGLLVKNRITLE
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::.::::::.::. .. .. : .. :.:.::::.:. ::.::.::::::::: ::::
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:::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::.:::::::::.:.:::::
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::::::::::::::::::.:::.::::::::.::::: :.:.::..::.::::.:.::::
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pF1KA0 ASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNMRAVTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLK
::::::::: ::::.. :::..:..::.:.: :::: :..:.::.: .:::.:.::::::
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.:.::::::: :::::::.:::::::::::::::::.:::::..::::...::::::::.
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pF1KA0 AKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLV
::.::::::::.: :.: ::: .:.:::..::.::..:. ::.::: ..:::.:.:.:::
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:..:::::::: :::.::.:::.::::::::.:: . ::: .::::::.::..::.. .
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::::: :.:::.::.::.:.:. : .:.:.....::.::.:::: :::.::
XP_011 NDPNKANTLSQLSKTEISLVLTSKYDIEDGE--AIDSRSLMIKTKKLIIDVIRNQPGNTL
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pF1KA0 TEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKKSKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLK
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pF1KA0 KLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRYRQRRKAELVKLQQTYAALNSKATFYGEQV
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XP_011 TLEQTGHVSSENKYQDILNEIAKDIRNQRIYRKLRKAELAKLQQTLNALNKKAAFYEEQI
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pF1KA0 DYYKSYIKTCLDNLASKG-----KVSKKPREMKGKKSKKISLKYTAARLHEKGVLLEIED
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XP_011 NYYDTYIKTCLDNLKRKNTRRSIKLDGKG-EPKGAKRAK-PVKYTAAKLHEKGVLLDIDD
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pF1KA0 LQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVMKLFDRA
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XP_011 LQTNQFKNVTFDIIATEDVGIFDVRSKFLGVEMEKVQLNIQDLLQMQYEGVAVMKMFDKV
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pF1KA0 KVNVNLLIFLLNKKFYGK
::::::::.:::::::::
XP_011 KVNVNLLIYLLNKKFYGK
1120
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initn: 4095 init1: 2043 opt: 4419 Z-score: 3882.8 bits: 730.9 E(85289): 1.6e-209
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510 520 530 540 550 560
pF1KA0 HAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKL
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XP_005 MGCFKGVVAVGYINEAIDEGNPLRTLETLLLPTANI
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570 580 590 600 610 620
pF1KA0 EGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDESAVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGIF
: ::::::.: .:: .: . .. : :::::::: .. ..: : ..:.... .
XP_005 SDVDPAHAQHYQDVLYHAKSQKLGDSESVSKVLWLDEIQQAVDDANVDKDRAKQWVTLVV
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XP_005 DVNQCLEGKKSSDILSVLKSSTSNANDIIPECADKYYDALVKAKELKSERVSSDGSWLKL
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XP_005 NLHKKYDYYYNTDSKESSWVTPESCLYKESWLTGKEIEDIIEEVTVGYIRENIWSASEEL
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pF1KA0 ITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAITCIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYLRSHKDE
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XP_005 LLRFQATSSGPILREEFEARKSFLHEQEENVVKIQAFWKGYKQRKEYMHRRQTFIDNTDS
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XP_005 IRKFVYLLDQSDLDFQEELEVARLREEVVTKIRANQQLEKDLNLMDIKIGLLVKNRITLE
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.. : ::.: ...:..: : . : .: ::..
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NP_001 KVNVNLLIYLLNKKFYGK
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pF1KA0 HAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKL
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: ::::::.: .:: .: . .. : :::::::: .. ..: : ..:.... .
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.:. .:. . ::.:.: . .::::.. :.. :..::. : .....:.:
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::.::. ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::... : .: ..:
XP_016 EISNMRKELEKYGIQMPSFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAVEKGIAEQTVVTL
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pF1KA0 KNPNAMLVNLEEPLASTYQDILYQAKQDKMTNAKNRTEN-SERERDVYEELLTQAEIQGN
.::::.:. ... :: :: :..::. : ::. .. ::.:::.:::::::::::::
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:::::
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: ::: :::.: .: :.:.: : .::::::
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:::::: .::.:: .::.:. . :.: :: .::::::.:::.:.::::.:. .: .::
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: . ::.:... .:: . :...: .. ..... ..::.:: :.: :: .:::..:.
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.:.: ::::.:::. .::..: .:.:.. : ::::::.: .:: .: . .. :
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