Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0051
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0051, 1657 aa
1>>>pF1KA0051 1657 - 1657 aa - 1657 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5805+/-0.00164; mu= 12.3187+/- 0.098
mean_var=112.0356+/-22.016, 0's: 0 Z-trim(100.4): 71 B-trim: 36 in 2/48
Lambda= 0.121170
statistics sampled from 6056 (6087) to 6056 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.495), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 6.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10362.1 IQGAP1 gene_id:8826|Hs108|chr15 (1657) 10681 1879.8 0
CCDS1144.1 IQGAP3 gene_id:128239|Hs108|chr1 (1631) 5911 1046.0 0
CCDS75262.1 IQGAP2 gene_id:10788|Hs108|chr5 (1525) 4940 876.2 0
CCDS34188.1 IQGAP2 gene_id:10788|Hs108|chr5 (1575) 4940 876.2 0
CCDS68898.1 IQGAP2 gene_id:10788|Hs108|chr5 (1071) 3884 691.6 3.8e-198
CCDS68897.1 IQGAP2 gene_id:10788|Hs108|chr5 (1071) 3884 691.6 3.8e-198
>>CCDS10362.1 IQGAP1 gene_id:8826|Hs108|chr15 (1657 aa)
initn: 10681 init1: 10681 opt: 10681 Z-score: 10089.3 bits: 1879.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10681; 100.0% identity (100.0% similar) in 1657 aa overlap (1-1657:1-1657)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSAADEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGE
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CCDS10 MSAADEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 NAMDEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NAMDEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EINNMKTELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDRRIPADTFAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EINNMKTELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDRRIPADTFAAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KNPNAMLVNLEEPLASTYQDILYQAKQDKMTNAKNRTENSERERDVYEELLTQAEIQGNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KNPNAMLVNLEEPLASTYQDILYQAKQDKMTNAKNRTENSERERDVYEELLTQAEIQGNI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NKVNTFSALANIDLALEQGDALALFRALQSPALGLRGLQQQNSDWYLKQLLSDKQQKRQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NKVNTFSALANIDLALEQGDALALFRALQSPALGLRGLQQQNSDWYLKQLLSDKQQKRQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GQTDPLQKEELQSGVDAANSAAQQYQRRLAAVALINAAIQKGVAEKTVLELMNPEAQLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GQTDPLQKEELQSGVDAANSAAQQYQRRLAAVALINAAIQKGVAEKTVLELMNPEAQLPQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VYPFAADLYQKELATLQRQSPEHNLTHPELSVAVEMLSSVALINRALESGDVNTVWKQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VYPFAADLYQKELATLQRQSPEHNLTHPELSVAVEMLSSVALINRALESGDVNTVWKQLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SSVTGLTNIEEENCQRYLDELMKLKAQAHAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSVTGLTNIEEENCQRYLDELMKLKAQAHAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHERIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 AIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDESAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDESAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGIFAINEAVESGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGIFAINEAVESGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIPEC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GETYHSDLAEAKKKKLAVGDNNSKWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFVQNSMQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GETYHSDLAEAKKKKLAVGDNNSKWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFVQNSMQL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPAIT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 CIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYLRSHKDEVVKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHINDII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYLRSHKDEVVKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHINDII
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMVVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVITLI
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CCDS10 KIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMVVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVITLI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGLKA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREEY
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CCDS10 LSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQREEY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 LLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKEIM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 DDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNMRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNMRA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAI
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CCDS10 VTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPAI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQSYQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEH
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CCDS10 KFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAPEH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 NDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNLNDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMD
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CCDS10 NDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNLNDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAEMD
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 ARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKMKK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRYRQRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRYRQRRK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 AELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGKKSKKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGKKSKKIS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 LKYTAARLHEKGVLLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LKYTAARLHEKGVLLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQ
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650
pF1KA0 DLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK
1630 1640 1650
>>CCDS1144.1 IQGAP3 gene_id:128239|Hs108|chr1 (1631 aa)
initn: 4867 init1: 1813 opt: 5911 Z-score: 5582.9 bits: 1046.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6368; 59.4% identity (83.7% similar) in 1636 aa overlap (24-1657:14-1631)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSAADEVDGLGVARPHYGSVLDNERLTAEEMDERRRQNVAYEYLCHLEEAKRWMEACLGE
::::::::::.:::::::.:::.:::::::::::: :
CCDS11 MERRAAGPGWAAYERLTAEEMDEQRRQNVAYQYLCRLEEAKRWMEACLKE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DLPPTTELEEGLRNGVYLAKLGNFFSPKVVSLKKIYDREQTRYKATGLHFRHTDNVIQWL
.:: .::::.::::: :::::. :.:.:: :::::: :: ::.:::::::::::. ::
CCDS11 ELPSPVELEESLRNGVLLAKLGHCFAPSVVPLKKIYDVEQLRYQATGLHFRHTDNINFWL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 NAMDEIGLPKIFYPETTDIYDRKNMPRCIYCIHALSLYLFKLGLAPQIQDLYGKVDFTEE
.:. .::::. :.::::::::.::::: .::::::::.::.:::::::.:::::: :: :
CCDS11 SAIAHIGLPSTFFPETTDIYDKKNMPRVVYCIHALSLFLFRLGLAPQIHDLYGKVKFTAE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EINNMKTELEKYGIQMPAFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDRRIPADTFAAL
:..:: .:: :::.:.::::::::::::::::::::.::::.:::::..: . ::.:::
CCDS11 ELSNMASELAKYGLQLPAFSKIGGILANELSVDEAAVHAAVLAINEAVERGVVEDTLAAL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KA0 KNPNAMLVNLEEPLASTYQDILYQAKQDKMTNAKNRTENSERE-RDVYEELLTQAEIQGN
.::.:.: ::.::::..::..: :::..: .::.: ...:: .:.:.. :::::::::
CCDS11 QNPSALLENLREPLAAVYQEMLAQAKMEKAANARN---HDDRESQDIYDHYLTQAEIQGN
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 INKVNTFSALANIDLALEQGDALALFRALQSPALGLRGLQQQNSDWYLKQLLSDKQQKRQ
::.::. .:: .: :::. . ::..:::.:::.:::.... .::::.:: ::..:: :
CCDS11 INHVNVHGALEVVDDALERQSPEALLKALQDPALALRGVRRDFADWYLEQLNSDREQKAQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 S-GQTDPLQKEELQSGVDAANSAAQQYQRRLAAVALINAAIQKGVAEKTVLELMNPEAQL
: .. :.:::.:.:: :::. ..: : : :: :: ::.. :: :: ::: :::::
CCDS11 ELGLVELLEKEEVQAGVAAANTKGDQEQAMLHAVQRINKAIRRRVAADTVKELMCPEAQL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 PQVYPFAADLYQKELATLQRQSPEHNLTHPELSVAVEMLSSVALINRALESGDVNTVWKQ
: ::: :...:: :::.::.:. : : . :: :::::::.:.:::::::. :.. :..
CCDS11 PPVYPVASSMYQLELAVLQQQQGE--LGQEELFVAVEMLSAVVLINRALEARDASGFWSS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LSSSVTGLTNIEEENCQRYLDELMKLKAQAHAENNEFITWNDIQACVDHVNLVVQEEHER
: . .:::...: :: :::.: :.::. : .. ...:..:::.:: :..:: .::: .:
CCDS11 LVNPATGLAEVEGENAQRYFDALLKLR-QERGMGEDFLSWNDLQATVSQVNAQTQEETDR
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 ILAIGLINEALDEGDAQKTLQALQIPAAKLEGVLAEVAQHYQDTLIRAKREKAQEIQDES
.::..:::::::.:. .:::.:: .::: :. : :: .:. :. :::.::: : .
CCDS11 VLAVSLINEALDKGSPEKTLSALLLPAAGLDDVSLPVAPRYHLLLVAAKRQKAQVTGDPG
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 AVLWLDEIQGGIWQSNKDTQEAQKFALGIFAINEAVESGDVGKTLSALRSPDVGLYGVIP
:::::.::. :. ..:.::. ::..:::. :::.:.. : ...: .::.: :.: ::.:
CCDS11 AVLWLEEIRQGVVRANQDTNTAQRMALGVAAINQAIKEGKAAQTERVLRNPAVALRGVVP
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 ECGETYHSDLAEAKKKKLAVGDNNSKWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFVQNSM
.:.. :. : : :: .:. . ::.: .: : :: .:.: .: :..::. :.
CCDS11 DCANGYQRALESAMAKKQRPADT-AFWVQHDMKDGTAYYFHLQTFQGIWEQPPGCPLNTS
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 QLSREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPA
.:.::::::... :::::.:.::: :: :.. .:::: ::.::::.: . .::. .::
CCDS11 HLTREEIQSAVTKVTAAYDRQQLWKANVGFVIQLQARLRGFLVRQKFAEHSHFLRTWLPA
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 ITCIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYLRSHKDEVVKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHIND
. ::..::::.:.: : . : :.... : ..:::. ::: ::..: ::.::. ..:.
CCDS11 VIKIQAHWRGYRQRKIYLEWLQYFKANLDAIIKIQAWARMWAARRQYLRRLHYFQKNVNS
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 IIKIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMVVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVIT
:.:::::.:: ::.:::. :..: ::. :::.:.:::.::.::: : .:.:..:::.
CCDS11 IVKIQAFFRARKAQDDYRILVHAPHPPLSVVRRFAHLLNQSQQDFLAEAELLKLQEEVVR
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 LIRSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGL
::::::::.:::.:::::::::::.::::.:::: :::::.:::::::::...:::: :
CCDS11 KIRSNQQLEQDLNIMDIKIGLLVKNRITLQEVVSHCKKLTKRNKEQLSDMMVLDKQKG-L
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 KALSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQRE
:.::::::.::::::::::::::.: :::::::::::::.::::..:::.::::::..::
CCDS11 KSLSKEKRQKLEAYQHLFYLLQTQPIYLAKLIFQMPQNKTTKFMEAVIFSLYNYASSRRE
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 EYLLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKE
::::.::::::::::::::.: :..:::::::...:: : :..:::.::..::. :...
CCDS11 AYLLLQLFKTALQEEIKSKVEQPQDVVTGNPTVVRLVVRFYRNGRGQSALQEILGKVIQD
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 IMDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNM
...:: :...:::: .::.:.:: :.:::. :.:::::::::::.: ::. ::: ..::.
CCDS11 VLEDKVLSVHTDPVHLYKNWINQTEAQTGQRSHLPYDVTPEQALSHPEVQRRLDIALRNL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 RAVTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNP
:.::::: ::.::::.::::::..::::: .: :::::: ..:. :..:::::::..::
CCDS11 LAMTDKFLLAITSSVDQIPYGMRYVAKVLKATLAEKFPDATDSEVYKVVGNLLYYRFLNP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 AIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQS
:.::::::::. ..::: :.. ::. ::..:..:::::..: : :.. :: ..:.:: ..
CCDS11 AVVAPDAFDIVAMAAGGALAAPQRHALGAVAQLLQHAAAGKAFSGQSQHLRVLNDYLEET
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 YQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAP
. :::.:.. ::.::: ...: ::::::.:...::..::..::..::: :::.::: :::
CCDS11 HLKFRKFIHRACQVPEPEERFAVDEYSDMVAVAKPMVYITVGELVNTHRLLLEHQDCIAP
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 EHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNLNDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAE
.:.::.::::.::::.::: .::::: . .. :.: ::::::::::. . .
CCDS11 DHQDPLHELLEDLGELPTIPDLIGES---IAADGHTDLSKLEVSLTLTNKFEGLEADADD
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..:..::.::.:..:.:.:.::.:: ::: :. :::: :.. :.:: :.::. .
CCDS11 SNTRSLLLSTKQLLADIIQFHPGDTLKEILSLSASREQEAAHKQLMSRRQACTAQTPEPL
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pF1KA0 KKSKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRYRQR
.. .:. : : : ::.... .:..: :: :. .: :: :....:.:::::.:.:.:
CCDS11 RRHRSLTAHSLLPLAEKQRRVLRNLRRLEALGLVSARNGYQGLVDELAKDIRNQHRHRHR
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pF1KA0 RKAELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGKKSKK
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CCDS11 RKAELVKLQATLQGLSTKTTFYEEQGDYYSQYIRACLDHLAPDSKSS-------GKGKKQ
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pF1KA0 ISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLH
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CCDS11 PSLHYTAAQLLEKGVLVEIEDLPASHFRNVIFDITPGDEAGKFEVNAKFLGVDMERFQLH
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CCDS11 YQDLLQLQYEGVAVMKLFNKAKVNVNLLIFLLNKKFLRK
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..: .. ..... ..::.:: :.: :: .:::..:..:.: ::::.:::. .::..:
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.:.:.. : ::::::.: .:: .: . .. : :::::::: .. ..: : ..:..
CCDS75 LPTANISDVDPAHAQHYQDVLYHAKSQKLGDSESVSKVLWLDEIQQAVDDANVDKDRAKQ
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.. . .:. .:. . ::.:.: . .::::.. :.. :..::. : ...
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.. : .::::: :: ::: : .:::::::: :.:.:::...::::::::::::...:
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::::::.:.::::::: :::::::.:::::::::::::::::.:::::..::::...:::
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:::::.::.::::::::.: :.: ::: .:.:::..::.::..:. ::.::: ..:::.:
CCDS75 RNLGSVAKVLQHAASNKLFEGENEHLSSMNNYLSETYQEFRKYFKEACNVPEPEEKFNMD
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.:.::::..:::::::: :::.::.:::.::::::::.:: . ::: .::::::.::..:
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:.. . ::::: :.:::.::.::.:.:. ... .:.:.....::.::.::::
CCDS75 EGAVDPNDPNKANTLSQLSKTEISLVLTSKYDI--EDGEAIDSRSLMIKTKKLIIDVIRN
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:::.:::::::::::..::..: : ::. :..::..::.:.:. ::..: :..::.:
CCDS75 QPGNTLTEILETPATAQQEVDHATDMVSRAMIDSRTPEEMKHSQSMIEDAQLPLEQKKRK
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:: .:. : . : :. .::::...:.::.:::::: ::. :::::.::::: :::.::.
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:: ::..:: .::::::::: :. :.. : : :: : : .:::::.::::::
CCDS75 FYEEQINYYDTYIKTCLDNLKRKNTRRSIKLDGKG-EPKGAKRAK-PVKYTAAKLHEKGV
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pF1KA0 LLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLHYQDLLQLQYEGVAVM
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CCDS75 LLDIDDLQTNQFKNVTFDIIATEDVGIFDVRSKFLGVEMEKVQLNIQDLLQMQYEGVAVM
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pF1KA0 KLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK
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CCDS75 KMFDKVKVNVNLLIYLLNKKFYGK
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CCDS34 ELPPTTELEEGLRNGVYLAKLAKFFAPKMVSEKKIYDVEQTRYKKSGLHFRHTDNTVQWL
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CCDS34 RAMESIGLPKIFYPETTDVYDRKNIPRMIYCIHALSLYLFKLGIAPQIQDLLGKVDFTEE
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CCDS34 EISNMRKELEKYGIQMPSFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAVEKGIAEQTVVTL
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CCDS34 RNPNAVLTLVDDNLAPEYQKELWDAKKKKEENARLKNSCISEEERDAYEELLTQAEIQGN
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:::::
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: ::: :::.: .: :.:.: : .::::::
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: . ::.:... .:: . :...: .. ..... ..::.:: :.: :: .:::..:.
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.:.: ::::.:::. .::..: .:.:.. : ::::::.: .:: .: . .. :
CCDS34 VAVGYINEAIDEGNPLRTLETLLLPTANISDVDPAHAQHYQDVLYHAKSQKLGDSESVSK
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:::::::: .. ..: : ..:.... . .:. .:. . ::.:.: . .:::
CCDS34 VLWLDEIQQAVDDANVDKDRAKQWVTLVVDVNQCLEGKKSSDILSVLKSSTSNANDIIPE
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CCDS34 CADKYYDALVKAKELKSERVSSDGSWLKLNLHKKYDYYYNTDSKESSWVTPESCLYKESW
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CCDS34 LTGKEIEDIIEEVTVGYIRENIWSASEELLLRFQATSSGPILREEFEARKSFLHEQEENV
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CCDS34 VKIQAFWKGYKQRKEYMHRRQTFIDNTDSIVKIQSWFRMATARKSYLSRLQYFRDHNNEI
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.:::...::::::::::::...:.::..:.::::.:::::: ::::::.. ..::::.:
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CCDS34 IRANQQLEKDLNLMDIKIGLLVKNRITLEDVISHSKKLNKKKGGEME--ILNNTDNQGIK
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CCDS34 SLSKERRKTLETYQQLFYLLQTNPLYLAKLIFQMPQNKSTKFMDTVIFTLYNYASNQREE
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CCDS34 YLLLKLFKTALEEEIKSKVDQVQDIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNTLRQLLAPVVKEI
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CCDS34 IDDKSLIINTNPVEVYKAWVNQLETQTGEASKLPYDVTTEQALTYPEVKNKLEASIENLR
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pF1KA0 AVTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNPA
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CCDS34 QEFRKYFKEACNVPEPEEKFNMDKYTDLVTVSKPVIYISIEEIISTHSLLLEHQDAIAPE
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CCDS34 KNDLLSELLGSLGEVPTVESFLGEGAVDPNDPNKANTLSQLSKTEISLVLTSKYDI--ED
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..::.:.:. ::..: :..::.::: .:. : . : :. .::::...:.::.:::::: :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]