seq1 = pF1KSDF0390.tfa, 825 bp
seq2 = pF1KSDF0390/gi568815579f_5814074.tfa (gi568815579f:5814074_6015319), 201246 bp

>pF1KSDF0390 825
>gi568815579f:5814074_6015319 (Chr19)

1-236  (100001-100236)   100% ->
237-341  (100312-100416)   100% ->
342-519  (100490-100667)   100% ->
520-726  (100867-101073)   100% ->
727-825  (101148-101246)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTGCCACAGGGATCTGGCTCTGTCCCAGGCCCTGTGGGGCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTGCCACAGGGATCTGGCTCTGTCCCAGGCCCTGTGGGGCTGGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGAGTAAGCAGTCAGGCTGGGCGCACCCATCCCTCCCCCACTCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTGAGTAAGCAGTCAGGCTGGGCGCACCCATCCCTCCCCCACTCCCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCAGCACAGTGCATTCATGCAGCTGGGCCCCACCCCATCTCCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCCAGCACAGTGCATTCATGCAGCTGGGCCCCACCCCATCTCCAGAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACCTTCCACTAGCAACAGTCTCCCCAGGCACAACACAGCTAACACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACCTTCCACTAGCAACAGTCTCCCCAGGCACAACACAGCTAACACAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCGCAGGCAGGACTCTGGGACAGACGCAGGCCAG         CTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100201 CCCCGCAGGCAGGACTCTGGGACAGACGCAGGCCAGGTG...CAGCTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGAGCCCAGACCAAGCATGGACGCCGTGGATGCCACCATGGAGAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100317 CAGAGCCCAGACCAAGCATGGACGCCGTGGATGCCACCATGGAGAAACTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGGGCACAGTGCCTGTCCCGCGGGGCCTCGGGCATCCAGGGCCTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100367 CGGGCACAGTGCCTGTCCCGCGGGGCCTCGGGCATCCAGGGCCTGGCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342          GTTTTTCCGCCAACTAGACCGGGACGGGAGCAGATCCCTGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100417 GTG...CAGGTTTTTCCGCCAACTAGACCGGGACGGGAGCAGATCCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACGCTGATGAGTTCCGGCAGGGTCTGGCCAAACTCGGGCTGGTGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100531 ACGCTGATGAGTTCCGGCAGGGTCTGGCCAAACTCGGGCTGGTGCTGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGGCGGAGGCAGAGGGTGTGTGCAGGAAGTGGGACCGCAATGGCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100581 CAGGCGGAGGCAGAGGGTGTGTGCAGGAAGTGGGACCGCAATGGCAGCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GACGCTGGATCTGGAGGAGTTCCTTCGGGCGCTGCGG         CCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100631 GACGCTGGATCTGGAGGAGTTCCTTCGGGCGCTGCGGGTG...CAGCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCATGTCCCAGGCCCGGGAGGCTGTCATCGCAGCTGCATTTGCCAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100871 CCATGTCCCAGGCCCGGGAGGCTGTCATCGCAGCTGCATTTGCCAAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACCGCAGTGGGGACGGCGTCGTGACGGTGGACGACCTCCGCGGGGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100921 GACCGCAGTGGGGACGGCGTCGTGACGGTGGACGACCTCCGCGGGGTGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAGTGGCCGTGCCCACCCCAAGGTGCGCAGTGGGGAGTGGACCGAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100971 CAGTGGCCGTGCCCACCCCAAGGTGCGCAGTGGGGAGTGGACCGAGGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGGTGCTGCGCCGCTTCCTGGACAACTTCGACTCCTCTGAGAAGGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101021 AGGTGCTGCGCCGCTTCCTGGACAACTTCGACTCCTCTGAGAAGGACGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CAG         GTCACACTGGCGGAATTCCAGGACTACTACAGCGGCGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101071 CAGGTG...CAGGTCACACTGGCGGAATTCCAGGACTACTACAGCGGCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAGTGCCTCCATGAACACGGATGAGGAGTTCGTGGCCATGATGACCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101186 GAGTGCCTCCATGAACACGGATGAGGAGTTCGTGGCCATGATGACCAGTG

    850     .    :
    815 CCTGGCAGCTG
        |||||||||||
 101236 CCTGGCAGCTG