seq1 = pF1KSDF0187.tfa, 1689 bp
seq2 = pF1KSDF0187/gi568815591f_99923507.tfa (gi568815591f:99923507_100134194), 210688 bp

>pF1KSDF0187 1689
>gi568815591f:99923507_100134194 (Chr7)

1-426  (100001-100426)   100% ->
427-580  (100648-100801)   100% ->
581-672  (106355-106446)   100% ->
673-799  (106743-106869)   100% ->
800-1689  (109799-110688)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGACTGCTGAATCACGGGAAGCCACGGGTCTGTCCCCACAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGACTGCTGAATCACGGGAAGCCACGGGTCTGTCCCCACAGGCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGGAGAAGGATGGTATCGTAATAGTGAAGGTGGAAGAGGAAGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAGGAGAAGGATGGTATCGTAATAGTGAAGGTGGAAGAGGAAGATGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGACCACATGTGGGGGCAGGATTCCACCCTACAGGACACGCCTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGACCACATGTGGGGGCAGGATTCCACCCTACAGGACACGCCTCCTCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCCAGAGATATTCCGCCAACGCTTCAGGCGCTTCTGTTACCAGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACCCAGAGATATTCCGCCAACGCTTCAGGCGCTTCTGTTACCAGAACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTTGGGCCCCGAGAGGCTCTCAGTCGGCTGAAGGAACTTTGTCATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTTGGGCCCCGAGAGGCTCTCAGTCGGCTGAAGGAACTTTGTCATCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCTGCGGCCAGAAATAAACACCAAGGAACAGATCCTGGAGCTTCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCTGCGGCCAGAAATAAACACCAAGGAACAGATCCTGGAGCTTCTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTAGAGCAGTTTCTTTCCATCCTGCCCAAGGAGCTCCAGGTCTGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTAGAGCAGTTTCTTTCCATCCTGCCCAAGGAGCTCCAGGTCTGGCTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAATACCGCCCCGATAGTGGAGAGGAGGCCGTGACCCTTCTAGAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAATACCGCCCCGATAGTGGAGAGGAGGCCGTGACCCTTCTAGAAGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAGCTTGATTTATCAGGACAACAG         GTCCCAGGTCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100401 TGGAGCTTGATTTATCAGGACAACAGGTA...CAGGTCCCAGGTCAAGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CATGGACCTGAGATGCTCGCAAGGGGGATGGTGCCTCTGGATCCAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100663 CATGGACCTGAGATGCTCGCAAGGGGGATGGTGCCTCTGGATCCAGTTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGAGTCCTCGAGCTTTGACCTTCATCACGAGGCCACCCAGTCCCACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100713 GGAGTCCTCGAGCTTTGACCTTCATCACGAGGCCACCCAGTCCCACTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AACATTCGTCTCGGAAACCCCGCCTCTTACAGTCACGAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100763 AACATTCGTCTCGGAAACCCCGCCTCTTACAGTCACGAGGTA...CAGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTTCCTGCTGCCCACATTCCTGCACCCCCTCATGAGGGTAGTCCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106357 CTTCCTGCTGCCCACATTCCTGCACCCCCTCATGAGGGTAGTCCCAGAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCAGGCGATGGCATCTGCACTATTCACAGCGGATTCCCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106407 CCAGGCGATGGCATCTGCACTATTCACAGCGGATTCCCAGGTG...TAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAATGGTGAAGATCGAGGACATGGCTGTGTCCCTCATTCTGGAGGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106744 CAATGGTGAAGATCGAGGACATGGCTGTGTCCCTCATTCTGGAGGAATGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGATGTCAGAATCTGGCTCGGAGGAATCTCAGTAGGGACAACAGGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106794 GGATGTCAGAATCTGGCTCGGAGGAATCTCAGTAGGGACAACAGGCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAATTATGGGAGCGCATTTCCCCAGG         GTGGTGAAAACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106844 GAATTATGGGAGCGCATTTCCCCAGGGTA...CAGGTGGTGAAAACAGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATGAGAACGAGGAGTCAACCTCAAAGGCTGAAACCTCGGAAGATTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109814 ATGAGAACGAGGAGTCAACCTCAAAGGCTGAAACCTCGGAAGATTCAGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TCACGCGGGGAGACAACAGGAAGATCCCAGAAAGAGTTTGGAGAGAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109864 TCACGCGGGGAGACAACAGGAAGATCCCAGAAAGAGTTTGGAGAGAAACG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGACCAGGAGGGCAAAACAGGAGAAAGACAGCAGAAAAACCCTGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109914 TGACCAGGAGGGCAAAACAGGAGAAAGACAGCAGAAAAACCCTGAGGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AAACCAGGAAAGAGAAAAGAGATTCAGGGCCAGCTATAGGAAAGGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109964 AAACCAGGAAAGAGAAAAGAGATTCAGGGCCAGCTATAGGAAAGGACAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AAAACCATCACAGGAGAGAGAGGTCCAAGGGAGAAGGGGAAAGGATTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110014 AAAACCATCACAGGAGAGAGAGGTCCAAGGGAGAAGGGGAAAGGATTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AAGAAGCTTCAGTCTGAGCTCCAACTTCACCACCCCTGAAGAAGTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110064 AAGAAGCTTCAGTCTGAGCTCCAACTTCACCACCCCTGAAGAAGTTCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CGGGAACAAAGTCTCACAGATGTGATGAATGTGGTAAATGCTTCACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110114 CGGGAACAAAGTCTCACAGATGTGATGAATGTGGTAAATGCTTCACGAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 AGTTCAAGCCTTATCCGCCATAAAATAATCCACACTGGAGAAAAGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110164 AGTTCAAGCCTTATCCGCCATAAAATAATCCACACTGGAGAAAAGCCCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TGAATGTAGTGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGTCTTAACTCCAACCTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110214 TGAATGTAGTGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGTCTTAACTCCAACCTTGTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TGCATCAGAGGATCCACACAGGAGAGAAACCTCATGAATGTAACGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110264 TGCATCAGAGGATCCACACAGGAGAGAAACCTCATGAATGTAACGAGTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GGCAAGGCCTTCAGCCACAGTTCCAATCTCATCCTCCATCAGCGCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110314 GGCAAGGCCTTCAGCCACAGTTCCAATCTCATCCTCCATCAGCGCATCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CTCTGGAGAGAAACCTTATGAATGTAATGAGTGCGGGAAGGCCTTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110364 CTCTGGAGAGAAACCTTATGAATGTAATGAGTGCGGGAAGGCCTTCAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 AGAGCTCGGACCTCACCAAGCATCAGAGAATTCACACGGGGGAGAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110414 AGAGCTCGGACCTCACCAAGCATCAGAGAATTCACACGGGGGAGAAACCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 TATGAATGTAGTGAATGTGGAAAAGCTTTCAACCGAAACTCATACCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110464 TATGAATGTAGTGAATGTGGAAAAGCTTTCAACCGAAACTCATACCTGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 TTTGCATCGGAGAATTCACACTCGAGAAAAGCCCTACAAGTGCACTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110514 TTTGCATCGGAGAATTCACACTCGAGAAAAGCCCTACAAGTGCACTAAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 GTGGCAAGGCCTTCACCCGCAGCTCCACCCTCACTCTGCATCACAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110564 GTGGCAAGGCCTTCACCCGCAGCTCCACCCTCACTCTGCATCACAGAATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 CATGCCAGAGAGAGAGCCTCTGAGTACAGCCCAGCCTCCCTTGATGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110614 CATGCCAGAGAGAGAGCCTCTGAGTACAGCCCAGCCTCCCTTGATGCATT

   1700     .    :    .    :    .
   1665 TGGCGCGTTCCTGAAAAGTTGTGTG
        |||||||||||||||||||||||||
 110664 TGGCGCGTTCCTGAAAAGTTGTGTG