seq1 = pF1KSDF0168.tfa, 1701 bp
seq2 = pF1KSDF0168/gi568815579r_49789673.tfa (gi568815579r:49789673_49996054), 206382 bp

>pF1KSDF0168 1701
>gi568815579r:49789673_49996054 (Chr19)

(complement)

6-252  (99997-100240)   98% ->
253-365  (100875-100987)   100% ->
366-567  (101586-101787)   100% ->
568-636  (104582-104650)   100% ->
637-773  (104948-105084)   100% ->
774-1701  (105455-106382)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      6 CCCATTGGCCCTGCACCTCCTCGTCCTCGTCCCCATCCTCCTCAGCCTGG
        ||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 CCCA  G CCCTGCACCTCCTCGTCCTCGTCCCCATCCTCCTCAGCCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     56 TGGCCTCCCAGGACTGGAAGGCTGAACGCAGCCAAGACCCCTTCGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 TGGCCTCCCAGGACTGGAAGGCTGAACGCAGCCAAGACCCCTTCGAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    106 TGCATGCAGGATCCTGACTATGAGCAGCTGCTCAAGGTGGTGACCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100094 TGCATGCAGGATCCTGACTATGAGCAGCTGCTCAAGGTGGTGACCTGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    156 GCTCAATCGGACCCTGAAGCCCCAGAGGGTGATTGTGGTTGGCGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100144 GCTCAATCGGACCCTGAAGCCCCAGAGGGTGATTGTGGTTGGCGCTGGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    206 TGGCCGGGCTGGTGGCCGCCAAGGTGCTCAGCGATGCTGGACACAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100194 TGGCCGGGCTGGTGGCCGCCAAGGTGCTCAGCGATGCTGGACACAAGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    253       GTCACCATCCTGGAGGCAGATAACAGGATCGGGGGCCGCATCTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100244 ...CAGGTCACCATCCTGGAGGCAGATAACAGGATCGGGGGCCGCATCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    297 CACCTACCGGGACCAGAACACGGGCTGGATTGGGGAGCTGGGAGCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100919 CACCTACCGGGACCAGAACACGGGCTGGATTGGGGAGCTGGGAGCCATGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    347 GCATGCCCAGCTCTCACAG         GATCCTCCACAAGCTCTGCCAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100969 GCATGCCCAGCTCTCACAGGTG...CAGGATCCTCCACAAGCTCTGCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    388 GGCCTGGGGCTCAACCTGACCAAGTTCACCCAGTACGACAAGAACACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101608 GGCCTGGGGCTCAACCTGACCAAGTTCACCCAGTACGACAAGAACACGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    438 GACGGAGGTGCACGAAGTGAAGCTGCGCAACTATGTGGTGGAGAAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101658 GACGGAGGTGCACGAAGTGAAGCTGCGCAACTATGTGGTGGAGAAGGTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 CCGAGAAGCTGGGCTACGCCTTGCGTCCCCAGGAAAAGGGCCACTCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101708 CCGAGAAGCTGGGCTACGCCTTGCGTCCCCAGGAAAAGGGCCACTCGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GAAGACATCTACCAGATGGCTCTCAACCAG         GCCCTCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101758 GAAGACATCTACCAGATGGCTCTCAACCAGGTG...CAGGCCCTCAAAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579 CCTCAAGGCACTGGGCTGCAGAAAGGCGATGAAGAAGTTTGAAAGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104593 CCTCAAGGCACTGGGCTGCAGAAAGGCGATGAAGAAGTTTGAAAGGCACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 CGCTCTTG         GAATATCTTCTCGGGGAGGGGAACCTGAGCCGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104643 CGCTCTTGGTA...CAGGAATATCTTCTCGGGGAGGGGAACCTGAGCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670 CCGGCCGTGCAGCTTCTGGGAGACGTGATGTCCGAGGATGGCTTCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104981 CCGGCCGTGCAGCTTCTGGGAGACGTGATGTCCGAGGATGGCTTCTTCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 TCTCAGCTTCGCCGAGGCCCTCCGGGCCCACAGCTGCCTCAGCGACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105031 TCTCAGCTTCGCCGAGGCCCTCCGGGCCCACAGCTGCCTCAGCGACAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 TCCA         GTACAGCCGCATCGTGGGTGGCTGGGACCTGCTGCCG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105081 TCCAGTA...CAGGTACAGCCGCATCGTGGGTGGCTGGGACCTGCTGCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 CGCGCGCTGCTGAGCTCGCTGTCCGGGCTTGTGCTGTTGAACGCGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105492 CGCGCGCTGCTGAGCTCGCTGTCCGGGCTTGTGCTGTTGAACGCGCCCGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 GGTGGCGATGACCCAGGGACCGCACGATGTGCACGTGCAGATCGAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105542 GGTGGCGATGACCCAGGGACCGCACGATGTGCACGTGCAGATCGAGACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 CTCCCCCGGCGCGGAATCTGAAGGTGCTGAAGGCCGACGTGGTGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105592 CTCCCCCGGCGCGGAATCTGAAGGTGCTGAAGGCCGACGTGGTGCTGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 ACGGCGAGCGGACCGGCGGTGAAGCGCATCACCTTCTCGCCGCCGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105642 ACGGCGAGCGGACCGGCGGTGAAGCGCATCACCTTCTCGCCGCCGCTGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CCGCCACATGCAGGAGGCGCTGCGGAGGCTGCACTACGTGCCGGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105692 CCGCCACATGCAGGAGGCGCTGCGGAGGCTGCACTACGTGCCGGCCACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AGGTGTTCCTAAGCTTCCGCAGGCCCTTCTGGCGCGAGGAGCACATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105742 AGGTGTTCCTAAGCTTCCGCAGGCCCTTCTGGCGCGAGGAGCACATTGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GGCGGCCACTCAAACACCGATCGCCCGTCGCGCATGATTTTCTACCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105792 GGCGGCCACTCAAACACCGATCGCCCGTCGCGCATGATTTTCTACCCGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GCCGCGCGAGGGCGCGCTGCTGCTGGCCTCGTACACGTGGTCGGACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105842 GCCGCGCGAGGGCGCGCTGCTGCTGGCCTCGTACACGTGGTCGGACGCGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CGGCAGCGTTCGCCGGCTTGAGCCGGGAAGAGGCGTTGCGCTTGGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105892 CGGCAGCGTTCGCCGGCTTGAGCCGGGAAGAGGCGTTGCGCTTGGCGCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GACGACGTGGCGGCATTGCACGGGCCTGTCGTGCGCCAGCTCTGGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105942 GACGACGTGGCGGCATTGCACGGGCCTGTCGTGCGCCAGCTCTGGGACGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CACCGGCGTCGTCAAGCGTTGGGCGGAGGACCAGCACAGCCAGGGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105992 CACCGGCGTCGTCAAGCGTTGGGCGGAGGACCAGCACAGCCAGGGTGGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTGTGGTACAGCCGCCGGCGCTCTGGCAAACCGAAAAGGATGACTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106042 TTGTGGTACAGCCGCCGGCGCTCTGGCAAACCGAAAAGGATGACTGGACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTCCCTTATGGCCGCATCTACTTTGCCGGCGAGCACACCGCCTACCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106092 GTCCCTTATGGCCGCATCTACTTTGCCGGCGAGCACACCGCCTACCCGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CGGCTGGGTGGAGACGGCGGTCAAGTCGGCGCTGCGCGCCGCCATCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106142 CGGCTGGGTGGAGACGGCGGTCAAGTCGGCGCTGCGCGCCGCCATCAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TCAACAGCCGGAAGGGGCCTGCATCGGACACGGCCAGCCCCGAGGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106192 TCAACAGCCGGAAGGGGCCTGCATCGGACACGGCCAGCCCCGAGGGGCAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GCATCTGACATGGAGGGGCAGGGGCATGTGCATGGGGTGGCCAGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106242 GCATCTGACATGGAGGGGCAGGGGCATGTGCATGGGGTGGCCAGCAGCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CTCGCATGACCTGGCAAAGGAAGAAGGCAGCCACCCTCCAGTCCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106292 CTCGCATGACCTGGCAAAGGAAGAAGGCAGCCACCCTCCAGTCCAAGGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AGTTATCTCTCCAAAACACGACCCACACGAGGACCTCGCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106342 AGTTATCTCTCCAAAACACGACCCACACGAGGACCTCGCAT