seq1 = pF1KSDB3041.tfa, 3696 bp
seq2 = pF1KSDB3041/gi568815575f_70190459.tfa (gi568815575f:70190459_70520262), 329804 bp

>pF1KSDB3041 3696
>gi568815575f:70190459_70520262 (ChrX)

1-120  (100001-100120)   99% ->
121-235  (100233-100347)   100% ->
236-426  (106540-106730)   100% ->
427-516  (108655-108744)   100% ->
517-683  (111442-111608)   100% ->
684-778  (111846-111940)   100% ->
779-895  (138947-139063)   100% ->
896-1071  (139699-139874)   100% ->
1072-1133  (143170-143231)   100% ->
1134-1266  (151341-151473)   99% ->
1267-1325  (153245-153303)   100% ->
1326-1431  (153419-153524)   100% ->
1432-1488  (162142-162198)   100% ->
1489-1674  (163164-163349)   99% ->
1675-1778  (183693-183796)   100% ->
1779-1923  (184746-184890)   100% ->
1924-2034  (185642-185752)   100% ->
2035-2118  (196160-196243)   100% ->
2119-2232  (196726-196839)   100% ->
2233-2388  (205213-205368)   100% ->
2389-2489  (205491-205591)   100% ->
2490-2619  (212108-212237)   100% ->
2620-2790  (213406-213576)   100% ->
2791-2898  (214257-214364)   100% ->
2899-2976  (215370-215447)   100% ->
2977-3072  (215801-215896)   100% ->
3073-3255  (216435-216617)   100% ->
3256-3372  (227430-227546)   100% ->
3373-3495  (229203-229325)   100% ->
3496-3696  (229604-229804)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGAAGAGGTGAAGGGAATTCCTGTAAGAGTGGCGCTGCGTTGTCG
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGAAGAGGTGAAGGGAATTCCCGTAAGAGTGGCGCTGCGTTGTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTCTGGTCCCCAAAGAGATTAGCGAGGGCTGCCAGATGTGCCTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTCTGGTCCCCAAAGAGATTAGCGAGGGCTGCCAGATGTGCCTTTCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGTGCCCGGAGAGCCTCAG         GTGGTGGTTGGTACAGATAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 TCGTGCCCGGAGAGCCTCAGGTG...TAGGTGGTGGTTGGTACAGATAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCTTCACCTACGATTTTGTATTTGATCCCTCTACTGAACAGGAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100254 TCCTTCACCTACGATTTTGTATTTGATCCCTCTACTGAACAGGAAGAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCAATACAGCAGTAGCGCCACTCATAAAAGGTGTATTTAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100304 CTTCAATACAGCAGTAGCGCCACTCATAAAAGGTGTATTTAAAGGTA...

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    236    GATATAATGCAACGGTCCTGGCCTATGGGCAGACTGGCTCTGGAAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106537 CAGGATATAATGCAACGGTCCTGGCCTATGGGCAGACTGGCTCTGGAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCTATTCAATGGGAGGTGCATATACTGCAGAGCAAGAGAATGAACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106587 ACCTATTCAATGGGAGGTGCATATACTGCAGAGCAAGAGAATGAACCAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGTTGGGGTTATTCCTAGGGTAATACAACTGCTCTTCAAAGAAATTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106637 AGTTGGGGTTATTCCTAGGGTAATACAACTGCTCTTCAAAGAAATTGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAAAGAGTGACTTTGAATTTACTCTGAAAGTGTCTTACTTAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106687 AAAAGAGTGACTTTGAATTTACTCTGAAAGTGTCTTACTTAGAGGTA...

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    427    ATTTACAATGAAGAAATTTTGGATCTTCTATGCCCATCTCGTGAGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108652 CAGATTTACAATGAAGAAATTTTGGATCTTCTATGCCCATCTCGTGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGCTCAAATAAATATACGAGAGGATCCTAAGGAAGGCATAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 108702 AGCTCAAATAAATATACGAGAGGATCCTAAGGAAGGCATAAAGGTG...T

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    517   ATTGTGGGACTCACTGAGAAGACTGTTTTGGTTGCCTTGGATACTGTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111440 AGATTGTGGGACTCACTGAGAAGACTGTTTTGGTTGCCTTGGATACTGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCCTGTTTGGAACAGGGCAACAACTCTAGGACTGTGGCCTCCACGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111490 TCCTGTTTGGAACAGGGCAACAACTCTAGGACTGTGGCCTCCACGGCTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAACTCCCAGTCGTCCCGATCTCATGCCATCTTTACAATCTCCTTAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111540 GAACTCCCAGTCGTCCCGATCTCATGCCATCTTTACAATCTCCTTAGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAAGAAAGAAAAGTGACAA         GAATAGCAGCTTTCGCTCCAAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 111590 AAAGAAAGAAAAGTGACAAGTA...CAGGAATAGCAGCTTTCGCTCCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGCATCTTGTAGACCTCGCTGGATCAGAAAGACAGAAGAAAACCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111868 CTGCATCTTGTAGACCTCGCTGGATCAGAAAGACAGAAGAAAACCAAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAAGGGGATCGTCTAAAAGAGG         GTATTAATATTAACCGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 111918 TGAAGGGGATCGTCTAAAAGAGGGTA...TAGGTATTAATATTAACCGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCCTCCTATGCTTGGGAAATGTAATCAGTGCTCTTGGAGATGACAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138965 GCCTCCTATGCTTGGGAAATGTAATCAGTGCTCTTGGAGATGACAAAAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGTGGCTTTGTGCCCTACAGAGATTCCAAGTTGACTCGACTGCTTCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 139015 GGTGGCTTTGTGCCCTACAGAGATTCCAAGTTGACTCGACTGCTTCAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    896         ATTCTCTAGGAGGTAATAGCCATACTCTTATGATAGCCTGTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139065 TA...CAGATTCTCTAGGAGGTAATAGCCATACTCTTATGATAGCCTGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGAGTCCTGCTGACTCCAATCTAGAGGAAACATTAAATACCCTTCGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139741 TGAGTCCTGCTGACTCCAATCTAGAGGAAACATTAAATACCCTTCGCTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GCTGACAGAGCAAGAAAAATCAAGAACAAACCTATTGTTAATATTGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139791 GCTGACAGAGCAAGAAAAATCAAGAACAAACCTATTGTTAATATTGATCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCAGACAGCTGAACTTAATCATCTAAAGCAACAG         GTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 139841 CCAGACAGCTGAACTTAATCATCTAAAGCAACAGGTA...CAGGTACAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGCTACAAGTCTTGTTGCTACAGGCCCATGGAGGTACCCTGCCTGGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143177 AGCTACAAGTCTTGTTGCTACAGGCCCATGGAGGTACCCTGCCTGGATCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATAAC         TGTGGAACCATCAGAGAATCTACAATCCCTGATGGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143227 ATAACGTA...TAGTGTGGAACCATCAGAGAATCTACAATCCCTGATGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GAAGAATCAGTCCCTGGTAGAGGAGAATGAAAAATTAAGTCGTGGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151377 GAAGAATCAGTCCCTGGTAGAGGAGAATGAAAAATTAAGTCGTGGTCTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCGAGGCAGCTGGTCAGACAGCCCAGATGTTGGAGAGGATCATTTGG   
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |>>>
 151427 GCGAGGCAGCTGGTCAGACAGCCCAGATGTTGGAGAGGATCATTTTGGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1267       ACAGAGCAAGCGAATGAAAAAATGAACGCCAAGCTAGAAGAGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151477 ...CAGACAGAGCAAGCGAATGAAAAAATGAACGCCAAGCTAGAAGAGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAGGCAGCATGCGGC         CTGCAAACTGGATCTTCAAAAGCTAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 153289 CAGGCAGCATGCGGCGTA...CAGCTGCAAACTGGATCTTCAAAAGCTAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TGGAGACTTTGGAAGACCAGGAATTGAAAGAAAATGTAGAGATAATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153445 TGGAGACTTTGGAAGACCAGGAATTGAAAGAAAATGTAGAGATAATTTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AACCTGCAGCAATTGATTACCCAGTTATCG         GATGAAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 153495 AACCTGCAGCAATTGATTACCCAGTTATCGGTA...CAGGATGAAACTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TGCTTGCATGGCTGCAGCCATTGATACTGCGGTGGAGCAAGAAGCC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 162153 TGCTTGCATGGCTGCAGCCATTGATACTGCGGTGGAGCAAGAAGCCGTA.

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1489      CAAGTAGAAACCAGTCCAGAGACGAGCAGGTCTTCTGACGCTTTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162203 ..CAGCAAGTAGAAACCAGTCCAGAGACGAGCAGGTCTTCTGACGCTTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 ACCACTCAGCATGCTCTCCGTCAAGCGCAGATGTCTAAGGAGCTGGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163209 ACCACTCAGCATGCTCTCCGTCAAGCGCAGATGTCTAAGGAGCTGGTTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GTTGAATAAAGCGCTTGCACTGAAAGAGGCCCTGGCTAGGAAGATGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163259 GTTGAATAAAGCGCTTGCACTGAAAGAGGCCCTGGCTAGGAAGATGACTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AGAATGACAGCCAACTGCAGCCTATTCAGTACCAATACCAG         
        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||>>>...>>>
 163309 AGAATGACAGCCAACTGCAGCCCATTCAGTACCAATACCAGGTA...TAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GATAACATAAAAGAGCTAGAATTAGAAGTCATCAATCTGCAAAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183693 GATAACATAAAAGAGCTAGAATTAGAAGTCATCAATCTGCAAAAGGAAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GGAAGAATTGGTTCTTGAACTTCAGACAGCAAAGAAGGATGCCAACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183743 GGAAGAATTGGTTCTTGAACTTCAGACAGCAAAGAAGGATGCCAACCAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 CCAA         GTTGAGTGAGCGCCGCCGCAAACGTCTCCAGGAGCTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183793 CCAAGTA...TAGGTTGAGTGAGCGCCGCCGCAAACGTCTCCAGGAGCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GAGGGTCAAATTGCTGATCTGAAGAAGAAACTGAATGAGCAGTCCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184783 GAGGGTCAAATTGCTGATCTGAAGAAGAAACTGAATGAGCAGTCCAAACT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TCTGAAACTAAAGGAATCCACAGAGCGTACTGTCTCCAAACTGAACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184833 TCTGAAACTAAAGGAATCCACAGAGCGTACTGTCTCCAAACTGAACCAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 AGATACGG         ATGATGAAAAACCAGCGGGTACAGTTAATGCGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 184883 AGATACGGGTA...TAGATGATGAAAAACCAGCGGGTACAGTTAATGCGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CAAATGAAAGAAGATGCTGAGAAGTTTAGACAGTGGAAGCAGAAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185675 CAAATGAAAGAAGATGCTGAGAAGTTTAGACAGTGGAAGCAGAAAAAAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CAAAGAAGTAATACAGTTAAAAGAACGA         GACCGTAAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 185725 CAAAGAAGTAATACAGTTAAAAGAACGAGTA...CAGGACCGTAAGAGGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 AATATGAGCTGCTGAAACTTGAAAGAAACTTCCAGAAACAATCCAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196173 AATATGAGCTGCTGAAACTTGAAAGAAACTTCCAGAAACAATCCAATGTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CTCAGACGTAAAACGGAGGAG         GCAGCAGCTGCCAACAAGCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 196223 CTCAGACGTAAAACGGAGGAGGTA...TAGGCAGCAGCTGCCAACAAGCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 TCTCAAGGATGCTCTCCAGAAACAACGGGAGGTTGCAGATAAGCGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196746 TCTCAAGGATGCTCTCCAGAAACAACGGGAGGTTGCAGATAAGCGGAAAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 AGACTCAGAGCCGTGGAATGGAAGGCACTGCAGCTCGAGTGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 196796 AGACTCAGAGCCGTGGAATGGAAGGCACTGCAGCTCGAGTGAAGGTA...

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2233    AATTGGCTTGGAAACGAAATTGAGGTTATGGTCAGTACTGAGGAAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205210 CAGAATTGGCTTGGAAACGAAATTGAGGTTATGGTCAGTACTGAGGAAGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 CAAACGCCATCTGAATGACCTCCTTGAAGATAGAAAGATCCTGGCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205260 CAAACGCCATCTGAATGACCTCCTTGAAGATAGAAAGATCCTGGCTCAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 ATGTGGCTCAACTCAAAGAAAAAAAGGAATCTGGGGAGAATCCACCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205310 ATGTGGCTCAACTCAAAGAAAAAAAGGAATCTGGGGAGAATCCACCTCCT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 AAACTCCGG         AGGCGTACATTCTCCCTTACTGAAGTGCGTGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 205360 AAACTCCGGGTA...CAGAGGCGTACATTCTCCCTTACTGAAGTGCGTGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 TCAAGTTTCGGAGTCAGAAGATTCTATTACAAAGCAGATTGAAAGCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205523 TCAAGTTTCGGAGTCAGAAGATTCTATTACAAAGCAGATTGAAAGCCTAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 AGACTGAAATGGAATTCAG         GAGTGCTCAGATTGCTGACCTA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 205573 AGACTGAAATGGAATTCAGGTA...AAGGAGTGCTCAGATTGCTGACCTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2512 CAGCAGAAGCTGCTGGATGCAGAAAGTGAAGACAGACCAAAACAACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212130 CAGCAGAAGCTGCTGGATGCAGAAAGTGAAGACAGACCAAAACAACGCTG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 GGAGAATATTGCCACCATTCTGGAAGCCAAGTGTGCCCTGAAATATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212180 GGAGAATATTGCCACCATTCTGGAAGCCAAGTGTGCCCTGAAATATTTGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 TTGGAGAG         CTGGTCTCCTCCAAAATACAGGTCAGCAAACTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 212230 TTGGAGAGGTA...CAGCTGGTCTCCTCCAAAATACAGGTCAGCAAACTT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 GAAAGCAGCCTGAAACAGAGCAAGACCAGCTGTGCTGACATGCAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213439 GAAAGCAGCCTGAAACAGAGCAAGACCAGCTGTGCTGACATGCAGAAGAT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 GCTGTTTGAGGAACGAAATCATTTTGCCGAGATAGAGACAGAGTTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213489 GCTGTTTGAGGAACGAAATCATTTTGCCGAGATAGAGACAGAGTTACAAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2753 CTGAGCTGGTCAGAATGGAGCAACAGCACCAAGAGAAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 213539 CTGAGCTGGTCAGAATGGAGCAACAGCACCAAGAGAAGGTA...TAGGTG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2794 CTGTACCTTCTCAGCCAGCTGCAGCAAAGCCAAATGGCAGAGAAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214260 CTGTACCTTCTCAGCCAGCTGCAGCAAAGCCAAATGGCAGAGAAGCAGTT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 AGAGGAATCAGTCAGTGAAAAGGAACAGCAGCTGCTGAGCACACTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214310 AGAGGAATCAGTCAGTGAAAAGGAACAGCAGCTGCTGAGCACACTGAAGT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2894 GTCAG         GATGAAGAACTTGAGAAAATGCGAGAAGTGTGTGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214360 GTCAGGTA...TAGGATGAAGAACTTGAGAAAATGCGAGAAGTGTGTGAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2935 CAAAATCAGCAGCTTCTCCGAGAGAATGAAATCATCAAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 215406 CAAAATCAGCAGCTTCTCCGAGAGAATGAAATCATCAAGCAGGTA...TA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2977  AAACTGACCCTCCTCCAGGTAGCCAGCAGACAGAAACATCTTCCTAAGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215800 GAAACTGACCCTCCTCCAGGTAGCCAGCAGACAGAAACATCTTCCTAAGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3026 ATACCCTTCTATCTCCAGACTCTTCTTTTGAATATGTCCCACCTAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 215850 ATACCCTTCTATCTCCAGACTCTTCTTTTGAATATGTCCCACCTAAGGTA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3073       CCAAAACCTTCTCGTGTTAAAGAAAAGTTCCTGGAGCAAAGCAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215900 ...TAGCCAAAACCTTCTCGTGTTAAAGAAAAGTTCCTGGAGCAAAGCAT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3117 GGACATCGAGGATCTAAAATATTGTTCAGAGCATTCTGTGAATGAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216479 GGACATCGAGGATCTAAAATATTGTTCAGAGCATTCTGTGAATGAGCATG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3167 AGGATGGTGATGGTGATGATGATGAGGGGGATGACGAGGAATGGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216529 AGGATGGTGATGGTGATGATGATGAGGGGGATGACGAGGAATGGAAGCCA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3217 ACAAAATTAGTTAAGGTGTCCAGGAAGAACATCCAAGGG         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 216579 ACAAAATTAGTTAAGGTGTCCAGGAAGAACATCCAAGGGGTA...CAGTG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3258 TTCCTGCAAGGGCTGGTGTGGAAACAAGCAGTGTGGGTGCAGGAAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227432 TTCCTGCAAGGGCTGGTGTGGAAACAAGCAGTGTGGGTGCAGGAAGCAAA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3308 AGTCAGACTGTGGTGTGGACTGTTGCTGTGACCCCACAAAGTGTCGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227482 AGTCAGACTGTGGTGTGGACTGTTGCTGTGACCCCACAAAGTGTCGGAAC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3358 CGCCAGCAAGGCAAG         GATAGCTTGGGCACTGTTGAACGGAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 227532 CGCCAGCAAGGCAAGGTA...CAGGATAGCTTGGGCACTGTTGAACGGAC

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3399 CCAGGATTCCGAAGGCTCCTTCAAACTGGAGGATCCTACCGAGGTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229229 CCAGGATTCCGAAGGCTCCTTCAAACTGGAGGATCCTACCGAGGTGACCC

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3449 CAGGATTGAGCTTCTTTAATCCCGTCTGTGCCACCCCCAATAGCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 229279 CAGGATTGAGCTTCTTTAATCCCGTCTGTGCCACCCCCAATAGCAAGGTA

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3496       ATCCTGAAAGAGATGTGCGATGTGGAGCAGGTGCTGTCAAAGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229329 ...TAGATCCTGAAAGAGATGTGCGATGTGGAGCAGGTGCTGTCAAAGAA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3540 GACTCCCCCAGCTCCCTCCCCTTTTGACCTCCCAGAGTTGAAACATGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229648 GACTCCCCCAGCTCCCTCCCCTTTTGACCTCCCAGAGTTGAAACATGTAG

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3590 CAACAGAATACCAAGAAAACAAGGCTCCAGGGAAGAAAAAGAAACGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229698 CAACAGAATACCAAGAAAACAAGGCTCCAGGGAAGAAAAAGAAACGGGCT

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3640 CTGGCCAGCAACACCAGCTTCTTCTCTGGCTGCTCCCCTATCGAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229748 CTGGCCAGCAACACCAGCTTCTTCTCTGGCTGCTCCCCTATCGAAGAAGA

   3950     .
   3690 GGCCCAC
        |||||||
 229798 GGCCCAC