seq1 = pF1KSDB2506.tfa, 1209 bp
seq2 = pF1KSDB2506/gi568815582r_19760503.tfa (gi568815582r:19760503_19972845), 212343 bp

>pF1KSDB2506 1209
>gi568815582r:19760503_19972845 (Chr16)

(complement)

1-1030  (100001-101030)   100% ->
1031-1167  (110873-111009)   100% ->
1168-1209  (112302-112343)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCGTGGCATCAGAGAGAAAGATGAGAGCTCACCAGGTGCTCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCGTGGCATCAGAGAGAAAGATGAGAGCTCACCAGGTGCTCACCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCTGCTCTTCGTGATCACCTCGGTGGCCTCTGAAAACGCCAGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCCTGCTCTTCGTGATCACCTCGGTGGCCTCTGAAAACGCCAGCACAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGAGGCTGTGGGCTGGACCTCCTCCCTCAGTACGTGTCCCTGTGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGAGGCTGTGGGCTGGACCTCCTCCCTCAGTACGTGTCCCTGTGCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGACGCCATCTGGGGCATTGTGGTGGAGGCGGTGGCCGGGGCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGACGCCATCTGGGGCATTGTGGTGGAGGCGGTGGCCGGGGCGGGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGATCACACTGCTCCTGATGCTCATCCTCCTGGTGCGGCTGCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGATCACACTGCTCCTGATGCTCATCCTCCTGGTGCGGCTGCCCTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAAGGAGAAGGAGAAGAAGAGCCCTGTGGGCCTCCACTTTCTGTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAAGGAGAAGGAGAAGAAGAGCCCTGTGGGCCTCCACTTTCTGTTCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGGGACCCTGGGCCTCTTTGGGCTGACGTTTGCCTTCATCATCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGGGACCCTGGGCCTCTTTGGGCTGACGTTTGCCTTCATCATCCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGACGAGACCATCTGCTCTGTCCGCCGCTTCCTCTGGGGCGTCCTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGACGAGACCATCTGCTCTGTCCGCCGCTTCCTCTGGGGCGTCCTCTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGCTCTGCTTCTCCTGCCTGCTGAGCCAGGCATGGCGCGTGCGGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGCTCTGCTTCTCCTGCCTGCTGAGCCAGGCATGGCGCGTGCGGAGGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGCGGCATGGCACGGGCCCCGCGGGCTGGCAGCTGGTGGGCCTGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGCGGCATGGCACGGGCCCCGCGGGCTGGCAGCTGGTGGGCCTGGCGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTGCCTGATGCTGGTGCAAGTCATCATCGCTGTGGAGTGGCTGGTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTGCCTGATGCTGGTGCAAGTCATCATCGCTGTGGAGTGGCTGGTGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGTGCTGCGTGACACAAGGCCAGCCTGCGCCTACGAGCCCATGGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGTGCTGCGTGACACAAGGCCAGCCTGCGCCTACGAGCCCATGGACTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGATGGCCCTCATCTACGACATGGTACTGCTTGTGGTCACCCTGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGATGGCCCTCATCTACGACATGGTACTGCTTGTGGTCACCCTGGGGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCCCTCTTCACTCTGTGCGGCAAGTTCAAGAGGTGGAAGCTGAACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCCCTCTTCACTCTGTGCGGCAAGTTCAAGAGGTGGAAGCTGAACGGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTTCCTCCTCATCACAGCCTTCCTCTCTGTGCTCATCTGGGTGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTTCCTCCTCATCACAGCCTTCCTCTCTGTGCTCATCTGGGTGGCCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGACCATGTACCTCTTCGGCAATGTCAAGCTGCAGCAGGGGGATGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATGACCATGTACCTCTTCGGCAATGTCAAGCTGCAGCAGGGGGATGCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAACGACCCCACCTTGGCCATCACGCTGGCGGCCAGCGGCTGGGTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAACGACCCCACCTTGGCCATCACGCTGGCGGCCAGCGGCTGGGTCTTCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCATCTTCCACGCCATCCCTGAGATCCACTGCACCCTTCTGCCAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCATCTTCCACGCCATCCCTGAGATCCACTGCACCCTTCTGCCAGCCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGGAGAACACGCCCAACTACTTCGACACGTCGCAGCCCAGGATGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGGAGAACACGCCCAACTACTTCGACACGTCGCAGCCCAGGATGCGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GACGGCCTTCGAGGAGGACGTGCAGCTGCCGCGGGCCTATATGGAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GACGGCCTTCGAGGAGGACGTGCAGCTGCCGCGGGCCTATATGGAGAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGCCTTCTCCATGGATGAACACAATGCAG         CTCTCCGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101001 AGGCCTTCTCCATGGATGAACACAATGCAGGTA...CAGCTCTCCGAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GCAGGATTTCCCAACGGCAGCTTGGGAAAAAGACCCAGTGGCAGCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110884 GCAGGATTTCCCAACGGCAGCTTGGGAAAAAGACCCAGTGGCAGCTTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GAAAAGACCCAGCGCTCCGTTTAGAAGCAACGTGTATCAGCCAACTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110934 GAAAAGACCCAGCGCTCCGTTTAGAAGCAACGTGTATCAGCCAACTGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TGGCCGTCGTGCTCAACGGTGGGACC         ATCCCAACTGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 110984 TGGCCGTCGTGCTCAACGGTGGGACCGTA...CAGATCCCAACTGCTCCG

   1200     .    :    .    :    .
   1183 CCAAGTCACACAGGAAGACACCTTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||
 112317 CCAAGTCACACAGGAAGACACCTTTGG