seq1 = pF1KSDB1483.tfa, 3594 bp
seq2 = pF1KSDB1483/gi568815595r_10228817.tfa (gi568815595r:10228817_10549543), 320727 bp

>pF1KSDB1483 3594
>gi568815595r:10228817_10549543 (Chr3)

(complement)

1-199  (100001-100199)   100% ->
200-397  (138729-138926)   100% ->
398-655  (147196-147453)   100% ->
656-781  (148466-148591)   100% ->
782-907  (161142-161267)   100% ->
908-1066  (171134-171292)   99% ->
1067-1281  (173900-174114)   100% ->
1282-1524  (177493-177735)   99% ->
1525-1766  (189421-189662)   100% ->
1767-2001  (190619-190853)   100% ->
2002-2181  (198967-199146)   100% ->
2182-2269  (199345-199432)   100% ->
2270-2376  (203407-203513)   100% ->
2377-2568  (203969-204160)   100% ->
2569-2782  (206579-206792)   100% ->
2783-2994  (208840-209051)   100% ->
2995-3102  (209195-209302)   100% ->
3103-3285  (211186-211368)   100% ->
3286-3594  (220419-220727)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGACATGACCAACAGCGACTTTTACTCCAAAAACCAAAGAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTGACATGACCAACAGCGACTTTTACTCCAAAAACCAAAGAAATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCGAGCCATGGGGGCGAGTTCGGGTGCACAATGGAGGAGCTCCGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCGAGCCATGGGGGCGAGTTCGGGTGCACAATGGAGGAGCTCCGCTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATGGAGCTGCGGGGCACTGAGGCTGTGGTCAAGATCAAGGAGACTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATGGAGCTGCGGGGCACTGAGGCTGTGGTCAAGATCAAGGAGACTTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGGACACCGAAGCCATCTGCCGGCGCCTCAAAACCTCACCTGTTGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100151 GGGGACACCGAAGCCATCTGCCGGCGCCTCAAAACCTCACCTGTTGAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    200         GTTTGCCGGGCACCGCTCCAGACCTGGAAAAGAGAAAGCAAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TA...CAGGTTTGCCGGGCACCGCTCCAGACCTGGAAAAGAGAAAGCAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTTTGGGCAAAACTTTATACCTCCAAAGAAGCCAAAAACCTTCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138771 TTTTTGGGCAAAACTTTATACCTCCAAAGAAGCCAAAAACCTTCCTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCGTGTGGGAGGCGCTGCAGGACGTGACGCTCATCATCCTGGAGATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138821 CTCGTGTGGGAGGCGCTGCAGGACGTGACGCTCATCATCCTGGAGATTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCCATCATCTCCCTGGGGCTGTCCTTCTACCACCCGCCCGGCGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138871 CGCCATCATCTCCCTGGGGCTGTCCTTCTACCACCCGCCCGGCGAGGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACGAAG         GATGTGCGACGGCCCAGGGTGGGGCAGAGGATGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138921 ACGAAGGTA...CAGGATGTGCGACGGCCCAGGGTGGGGCAGAGGATGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGAGAGGCAGAGGCAGGTTGGATCGAGGGGGCCGCCATTCTCCTCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147231 GGAGAGGCAGAGGCAGGTTGGATCGAGGGGGCCGCCATTCTCCTCTCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TATCTGTGTGGTCCTGGTCACGGCCTTCAATGACTGGAGCAAAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147281 TATCTGTGTGGTCCTGGTCACGGCCTTCAATGACTGGAGCAAAGAGAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGTTCCGGGGCCTGCAGAGCCGCATCGAGCAGGAACAGAAATTTACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147331 AGTTCCGGGGCCTGCAGAGCCGCATCGAGCAGGAACAGAAATTTACCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTCCGGGCTGGCCAGGTGGTCCAGATCCCTGTGGCTGAGATCGTGGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147381 GTCCGGGCTGGCCAGGTGGTCCAGATCCCTGTGGCTGAGATCGTGGTTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGACATAGCCCAGGTCAAATATG         GTGACCTCCTCCCTGCCG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 147431 GGACATAGCCCAGGTCAAATATGGTA...CAGGTGACCTCCTCCCTGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACGGCCTCTTCATCCAGGGCAATGACCTCAAGATTGATGAAAGCTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148484 ACGGCCTCTTCATCCAGGGCAATGACCTCAAGATTGATGAAAGCTCCCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACTGGAGAGTCTGACCAGGTGCGCAAGTCCGTGGACAAGGACCCCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148534 ACTGGAGAGTCTGACCAGGTGCGCAAGTCCGTGGACAAGGACCCCATGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCTGTCAG         GAACCCACGTGATGGAGGGCTCAGGACGGATGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 148584 GCTGTCAGGTG...CAGGAACCCACGTGATGGAGGGCTCAGGACGGATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGTGACTGCTGTGGGTGTGAACTCTCAGACTGGCATCATCTTTACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161175 TGGTGACTGCTGTGGGTGTGAACTCTCAGACTGGCATCATCTTTACCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTGGGGGCTGGTGGTGAAGAGGAAGAGAAGAAAGACAAAAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 161225 CTGGGGGCTGGTGGTGAAGAGGAAGAGAAGAAAGACAAAAAAGGTA...C

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    908   CCAAACAGCAGGACGGGGCAGCCGCCATGGAGATGCAGCCCCTCAAGA
        >>||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171132 AGCCAAACAACAGGACGGGGCAGCCGCCATGGAGATGCAGCCCCTCAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GTGCCGAGGGCGGCGACGCTGACGACAGGAAGAAGGCCAGCATGCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171182 GTGCCGAGGGCGGCGACGCTGACGACAGGAAGAAGGCCAGCATGCACAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AAGGAGAAGTCCGTGCTGCAGGGCAAGCTCACCAAGCTGGCTGTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171232 AAGGAGAAGTCCGTGCTGCAGGGCAAGCTCACCAAGCTGGCTGTGCAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CGGGAAGGCGG         GCTTGGTGATGTCAGCCATCACGGTGATCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 171282 CGGGAAGGCGGGTG...CAGGCTTGGTGATGTCAGCCATCACGGTGATCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TCCTGGTGCTCTACTTCACTGTGGACACCTTCGTGGTCAACAAGAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173930 TCCTGGTGCTCTACTTCACTGTGGACACCTTCGTGGTCAACAAGAAGCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TGGCTGCCTGAGTGCACGCCCGTCTACGTGCAGTACTTTGTCAAGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173980 TGGCTGCCTGAGTGCACGCCCGTCTACGTGCAGTACTTTGTCAAGTTCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CATCATTGGCGTGACGGTGCTGGTGGTCGCCGTGCCCGAGGGGCTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174030 CATCATTGGCGTGACGGTGCTGGTGGTCGCCGTGCCCGAGGGGCTCCCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TGGCCGTCACCATCTCGTTGGCCTATTCGGTGAAG         AAAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 174080 TGGCCGTCACCATCTCGTTGGCCTATTCGGTGAAGGTG...CAGAAAATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ATGAAGGACAACAATCTGGTACGCCACCTGGATGCCTGTGAGACCATGGG
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177499 ATGAAGGACAACAACCTGGTACGCCACCTGGATGCCTGTGAGACCATGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CAATGCCACAGCCATCTGCTCAGACAAGACAGGCACGCTGACCACCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177549 CAATGCCACAGCCATCTGCTCAGACAAGACAGGCACGCTGACCACCAATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 GCATGACAGTGGTACAGGCCTATGTCGGTGACGTCCACTATAAAGAGATC
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 177599 GCATGACAGTGGTACAGGCCTATGTCGGCGACGTCCACTATAAAGAGATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CCCGACCCCAGCTCCATCAACACCAAGACCATGGAGCTGCTGATCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177649 CCCGACCCCAGCTCCATCAACACCAAGACCATGGAGCTGCTGATCAATGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CATCGCCATCAACAGCGCCTACACCACCAAGATTCTG         CCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 177699 CATCGCCATCAACAGCGCCTACACCACCAAGATTCTGGTA...CAGCCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CAGAGAAGGAGGGCGCCCTGCCTCGGCAGGTGGGCAACAAGACGGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189425 CAGAGAAGGAGGGCGCCCTGCCTCGGCAGGTGGGCAACAAGACGGAGTGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GGCCTGCTGGGCTTCGTGCTGGACCTGAAGCAGGACTACGAGCCCGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189475 GGCCTGCTGGGCTTCGTGCTGGACCTGAAGCAGGACTACGAGCCCGTGCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CAGCCAGATGCCAGAGGAGAAGTTGTACAAAGTGTACACCTTCAACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189525 CAGCCAGATGCCAGAGGAGAAGTTGTACAAAGTGTACACCTTCAACTCCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 TGCGCAAGTCCATGAGCACTGTCATCAAGCTGCCCGACGAGAGCTTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189575 TGCGCAAGTCCATGAGCACTGTCATCAAGCTGCCCGACGAGAGCTTCCGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 ATGTACAGCAAGGGGGCTTCTGAGATCGTGCTCAAGAA         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 189625 ATGTACAGCAAGGGGGCTTCTGAGATCGTGCTCAAGAAGTA...TAGGTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 CTGCAAAATCCTCAATGGGGCGGGAGAGCCTCGTGTCTTCCGGCCCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190622 CTGCAAAATCCTCAATGGGGCGGGAGAGCCTCGTGTCTTCCGGCCCCGCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 ACCGGGACGAGATGGTAAAGAAGGTGATTGAGCCCATGGCTTGCGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190672 ACCGGGACGAGATGGTAAAGAAGGTGATTGAGCCCATGGCTTGCGATGGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 CTCCGCACTATCTGCGTGGCCTACCGCGACTTCCCCAGCAGCCCGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190722 CTCCGCACTATCTGCGTGGCCTACCGCGACTTCCCCAGCAGCCCGGAGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 GGACTGGGACAATGAGAATGACATCCTCAACGAACTCACCTGCATCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190772 GGACTGGGACAATGAGAATGACATCCTCAACGAACTCACCTGCATCTGCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 TGGTGGGCATCGAGGACCCGGTGCGGCCAGAG         GTCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 190822 TGGTGGGCATCGAGGACCCGGTGCGGCCAGAGGTA...CAGGTCCCAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GCCATCCGCAAGTGCCAGCGGGCAGGCATCACGGTCCGCATGGTCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198976 GCCATCCGCAAGTGCCAGCGGGCAGGCATCACGGTCCGCATGGTCACTGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 CGACAATATCAACACGGCTCGGGCCATCGCCATCAAGTGTGGCATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199026 CGACAATATCAACACGGCTCGGGCCATCGCCATCAAGTGTGGCATCATCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 ATCCTGGGGAGGACTTTCTGTGCCTCGAGGGCAAGGAGTTCAACAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199076 ATCCTGGGGAGGACTTTCTGTGCCTCGAGGGCAAGGAGTTCAACAGGAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 ATCCGCAACGAGAAGGGGGAG         ATTGAGCAGGAGCGAATTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 199126 ATCCGCAACGAGAAGGGGGAGGTG...CAGATTGAGCAGGAGCGAATTGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 CAAGATCTGGCCAAAGCTGCGGGTGCTGGCTCGCTCCTCCCCAACGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199365 CAAGATCTGGCCAAAGCTGCGGGTGCTGGCTCGCTCCTCCCCAACGGACA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 AGCATACCCTGGTTAAAG         GCATCATCGACAGCACACACACT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 199415 AGCATACCCTGGTTAAAGGTA...CAGGCATCATCGACAGCACACACACT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 GAGCAGCGGCAGGTGGTGGCCGTGACGGGGGACGGGACCAACGACGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203430 GAGCAGCGGCAGGTGGTGGCCGTGACGGGGGACGGGACCAACGACGGGCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 TGCACTCAAGAAGGCCGACGTGGGCTTCGCCATG         GGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 203480 TGCACTCAAGAAGGCCGACGTGGGCTTCGCCATGGTA...CAGGGCATCG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 CAGGCACTGACGTGGCCAAGGAGGCCTCAGACATCATCCTGACAGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203976 CAGGCACTGACGTGGCCAAGGAGGCCTCAGACATCATCCTGACAGACGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 AATTTCAGCAGCATCGTCAAGGCAGTGATGTGGGGCCGCAACGTCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204026 AATTTCAGCAGCATCGTCAAGGCAGTGATGTGGGGCCGCAACGTCTATGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 CAGCATCTCCAAATTCTTGCAGTTCCAGCTCACCGTCAACGTGGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204076 CAGCATCTCCAAATTCTTGCAGTTCCAGCTCACCGTCAACGTGGTGGCCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 TGATTGTGGCCTTCACAGGCGCCTGCATCACGCAG         GACTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 204126 TGATTGTGGCCTTCACAGGCGCCTGCATCACGCAGGTG...CAGGACTCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 CCTCTGAAGGCCGTGCAGATGCTCTGGGTGAACCTCATCATGGACACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206585 CCTCTGAAGGCCGTGCAGATGCTCTGGGTGAACCTCATCATGGACACGTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 TGCCTCGCTGGCACTGGCCACTGAGCCGCCCACGGAGACCCTGCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206635 TGCCTCGCTGGCACTGGCCACTGAGCCGCCCACGGAGACCCTGCTGCTGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 GGAAGCCGTACGGCCGCAACAAGCCGCTCATCTCCAGGACCATGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206685 GGAAGCCGTACGGCCGCAACAAGCCGCTCATCTCCAGGACCATGATGAAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 AACATCCTGGGCCATGCTGTCTACCAGCTTGCCCTCATCTTCACCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206735 AACATCCTGGGCCATGCTGTCTACCAGCTTGCCCTCATCTTCACCCTGCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2775 CTTTGTTG         GCGAGAAGATGTTCCAGATCGACAGCGGGAGGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 206785 CTTTGTTGGTG...CAGGCGAGAAGATGTTCCAGATCGACAGCGGGAGGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2816 ACGCGCCCCTGCATTCGCCACCCTCAGAACATTACACCATCATCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208873 ACGCGCCCCTGCATTCGCCACCCTCAGAACATTACACCATCATCTTCAAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2866 ACCTTCGTCATGATGCAGCTCTTCAACGAGATCAACGCCCGCAAGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208923 ACCTTCGTCATGATGCAGCTCTTCAACGAGATCAACGCCCGCAAGATCCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2916 CGGCGAGCGCAATGTCTTTGACGGCATCTTCCGGAACCCCATCTTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208973 CGGCGAGCGCAATGTCTTTGACGGCATCTTCCGGAACCCCATCTTCTGCA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2966 CCATCGTGCTGGGCACCTTTGCCATCCAG         ATAGTGATCGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 209023 CCATCGTGCTGGGCACCTTTGCCATCCAGGTA...CAGATAGTGATCGTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3007 CAGTTTGGAGGGAAGCCATTCAGCTGCTCTCCACTGCAGCTGGACCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209207 CAGTTTGGAGGGAAGCCATTCAGCTGCTCTCCACTGCAGCTGGACCAGTG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3057 GATGTGGTGCATATTCATTGGGTTAGGAGAGCTCGTTTGGGGCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 209257 GATGTGGTGCATATTCATTGGGTTAGGAGAGCTCGTTTGGGGCCAGGTA.

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3103      GTCATCGCCACCATCCCGACCAGCAGACTCAAGTTCCTCAAGGAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209307 ..CAGGTCATCGCCACCATCCCGACCAGCAGACTCAAGTTCCTCAAGGAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148 GCAGGCAGGCTCACACAGAAGGAGGAGATCCCGGAGGAGGAGCTCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211231 GCAGGCAGGCTCACACAGAAGGAGGAGATCCCGGAGGAGGAGCTCAACGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3198 GGACGTGGAGGAGATCGACCACGCGGAGCGGGAGCTGCGGCGGGGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211281 GGACGTGGAGGAGATCGACCACGCGGAGCGGGAGCTGCGGCGGGGCCAGA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3248 TCCTGTGGTTCCGAGGCCTGAATCGGATCCAGACACAG         ATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 211331 TCCTGTGGTTCCGAGGCCTGAATCGGATCCAGACACAGGTA...CAGATC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3289 CGCGTCGTGAAGGCGTTCCGTAGCTCTCTCTATGAAGGTTTAGAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220422 CGCGTCGTGAAGGCGTTCCGTAGCTCTCTCTATGAAGGTTTAGAAAAGCC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3339 TGAATCTCGAACCTCCATCCATAACTTCATGGCTCATCCTGAATTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220472 TGAATCTCGAACCTCCATCCATAACTTCATGGCTCATCCTGAATTCCGGA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3389 TCGAAGATTCCCAGCCCCACATCCCCCTCATTGATGACACCGACCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220522 TCGAAGATTCCCAGCCCCACATCCCCCTCATTGATGACACCGACCTGGAA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3439 GAAGATGCCGCGCTCAAGCAGAACTCGAGCCCGCCGTCATCCCTCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220572 GAAGATGCCGCGCTCAAGCAGAACTCGAGCCCGCCGTCATCCCTCAACAA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3489 GAACAACAGCGCCATCGACAGTGGGATCAACCTGACGACCGACACAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220622 GAACAACAGCGCCATCGACAGTGGGATCAACCTGACGACCGACACAAGCA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3539 AATCAGCTACCTCTTCAAGTCCAGGGAGCCCCATCCACAGCCTGGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220672 AATCAGCTACCTCTTCAAGTCCAGGGAGCCCCATCCACAGCCTGGAGACG

   3750     .
   3589 TCGCTT
        ||||||
 220722 TCGCTT