seq1 = pF1KSDB0052.tfa, 1863 bp
seq2 = pF1KSDB0052/gi568815584f_91060295.tfa (gi568815584f:91060295_91324830), 264536 bp

>pF1KSDB0052 1863
>gi568815584f:91060295_91324830 (Chr14)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-257  (106931-107084)   100% ->
258-456  (109709-109907)   100% ->
457-607  (112995-113145)   100% ->
608-730  (115640-115762)   99% ->
731-934  (120892-121095)   100% ->
935-1195  (128616-128876)   100% ->
1196-1295  (136081-136180)   100% ->
1296-1444  (139463-139611)   100% ->
1445-1564  (144412-144531)   100% ->
1565-1716  (155111-155262)   100% ->
1717-1863  (164390-164536)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTTCACACTCCACCTGAGGTCCCGCCTTCCCTCTGCCATAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCTTCACACTCCACCTGAGGTCCCGCCTTCCCTCTGCCATAAGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGATTCTACAAAAGAAACCAAACATCAGAAATACATCCAGCATGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTGATTCTACAAAAGAAACCAAACATCAGAAATACATCCAGCATGGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAG         AGCTCCGACCAGCCAGCCTGGTGGTCCTGCCCAGGTCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGGTA...CAGAGCTCCGACCAGCCAGCCTGGTGGTCCTGCCCAGGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTGCTCCAGCTTTTGAAAGATTCTGCCAGGTCAACACTGGTCCTCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106969 CTTGCTCCAGCTTTTGAAAGATTCTGCCAGGTCAACACTGGTCCTCTACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGCTGGGCCAGAGTGAGCCAGAAAAGTGGATGCTGCCCCCTCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107019 CCTGCTGGGCCAGAGTGAGCCAGAAAAGTGGATGCTGCCCCCTCAAGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTATCTCAGAGACCAG         GATGGGCCATCCCCAGTTCTGGAAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 107069 CTATCTCAGAGACCAGGTA...CAGGATGGGCCATCCCCAGTTCTGGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACGAGTTCGGTGCCTGCACCGGCAGCCTGGCTTCGCTGGAGCAGTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109734 TACGAGTTCGGTGCCTGCACCGGCAGCCTGGCTTCGCTGGAGCAGTACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGCAGCTGAAGGACATGGTGGCCTTCTTCCTGGGCTGCAGCTTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109784 GGAGCAGCTGAAGGACATGGTGGCCTTCTTCCTGGGCTGCAGCTTCTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGAGGAGGCCTTGGAGAAAGCGGGGCTCCCCAGAAGAGACCCAGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109834 TGGAGGAGGCCTTGGAGAAAGCGGGGCTCCCCAGAAGAGACCCAGCAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACAGCCAGGCGGGTGCATACAAG         ACAACAGTGCCTTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 109884 CACAGCCAGGCGGGTGCATACAAGGTA...CAGACAACAGTGCCTTGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TACCCATGCTGGCTTCTGCTGCCCTCTGGTGGTCACGATGAGGCCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113012 TACCCATGCTGGCTTCTGCTGCCCTCTGGTGGTCACGATGAGGCCCATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCAAGGACAAGCTGGAAGGGCTGGTGCGGGCCTGCTGCTCCCTCGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113062 CCAAGGACAAGCTGGAAGGGCTGGTGCGGGCCTGCTGCTCCCTCGGAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGCAGGGGCAACCTGTTCACATGGGCGACCCAG         AACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 113112 GAGCAGGGGCAACCTGTTCACATGGGCGACCCAGGTC...CAGAACTGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGGAATCAAAGAGCTTTCCAAACCTGCCTACGGGGATGCCATGGTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115647 GGGAATCAAAGAGCTTTCCAAACCTGCCTACGGGGATGCCATGGTGTGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCCCAGGGGAGGTTCCAGTGTTCTGGCCTTCTCCGCTGACCAGTCTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115697 CCCCAGGGGAGGTTCCAGTGTTCTGGCCTTCTCCGCTGACCAGTCTCGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCTGTCAGCAACTGTG         AGACCCCACTGGCTTTTGCCAGCAT
        |||||||||| |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 115747 GCTGTCAGCAGCTGTGGTA...TAGAGACCCCACTGGCTTTTGCCAGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCCAGGCTGCACAGTTATGACTGACCTGAAGGATGCAAAGGCTCCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120917 CCCAGGCTGCACAGTTATGACTGACCTGAAGGATGCAAAGGCTCCACCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTTGTCTCACCCCAGAGAGAATTCCAGAGGTCCATCACATTTCCCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120967 GTTGTCTCACCCCAGAGAGAATTCCAGAGGTCCATCACATTTCCCAAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCTCTGCACTACAGCATCGCGTCAGTCTCTGCTTCTCAGAAGATCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121017 CCTCTGCACTACAGCATCGCGTCAGTCTCTGCTTCTCAGAAGATCAGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACTAGAGTCTATGATCGGCATAGACCCAG         GGAACCGGGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 121067 ACTAGAGTCTATGATCGGCATAGACCCAGGTA...CAGGGAACCGGGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTGGGCACCTGCTCTGTAAAGATGAGCTGCTGAAGGCCTCTCTCTCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128628 TTGGGCACCTGCTCTGTAAAGATGAGCTGCTGAAGGCCTCTCTCTCGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TCCCATGCCCGCTCAGTGCTCATCACCACTGGGTTCCCCACACATTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128678 TCCCATGCCCGCTCAGTGCTCATCACCACTGGGTTCCCCACACATTTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TCATGAGCCTCCAGAAGAGACAGATGGCCCACCAGGAGCTGTTGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128728 TCATGAGCCTCCAGAAGAGACAGATGGCCCACCAGGAGCTGTTGCTCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TTGCCTTCCTGCAGGCCTTGGAGAAGGAGGTCGCCATAATCGTTGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128778 TTGCCTTCCTGCAGGCCTTGGAGAAGGAGGTCGCCATAATCGTTGACCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AGAGCCTGGAACTTGCACCAGAAGATTGTTGAAGATGCTGTTGAGCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 128828 AGAGCCTGGAACTTGCACCAGAAGATTGTTGAAGATGCTGTTGAGCAAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1196         GTGTTCTGAAGACGCAGATCCCGATATTAACTTACCAAGGTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128878 TA...AAGGTGTTCTGAAGACGCAGATCCCGATATTAACTTACCAAGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GATCAGTGGAAGCTGCTCAGGCATTCCTGTGCAAAAATGGGGACCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136123 GATCAGTGGAAGCTGCTCAGGCATTCCTGTGCAAAAATGGGGACCCGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ACACCTAG         ATTTGACCACCTGGTGGCCATAGAGCGTGCCGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 136173 ACACCTAGGTA...CAGATTTGACCACCTGGTGGCCATAGAGCGTGCCGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AAGAGCTGCTGATGGCAATTACTACAATGCAAGGAAGATGAACATCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139496 AAGAGCTGCTGATGGCAATTACTACAATGCAAGGAAGATGAACATCAAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ACTTGGTTGACCCCATTGACGATCTTTTTCTTGCTGCGAAGAAGATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139546 ACTTGGTTGACCCCATTGACGATCTTTTTCTTGCTGCGAAGAAGATTCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GGAATCTCATCAACTG         GAGTCGGTGATGGAGGCAACGAGCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 139596 GGAATCTCATCAACTGGTA...CAGGAGTCGGTGATGGAGGCAACGAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGGGATGGGTAAAGTCAAGGAGGCTGTGAGGAGGCACATACGGCACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144437 TGGGATGGGTAAAGTCAAGGAGGCTGTGAGGAGGCACATACGGCACGGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 ATGTCATCGCCTGCGACGTGGAGGCTGACTTTGCCGTCATTGCTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 144487 ATGTCATCGCCTGCGACGTGGAGGCTGACTTTGCCGTCATTGCTGGTG..

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565     GTGTTTCTAACTGGGGAGGCTATGCCCTGGCCTGCGCACTCTACAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144537 .TAGGTGTTTCTAACTGGGGAGGCTATGCCCTGGCCTGCGCACTCTACAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CCTGTACTCATGTGCTGTCCACAGTCAGTACCTGAGGAAAGCAGTCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155157 CCTGTACTCATGTGCTGTCCACAGTCAGTACCTGAGGAAAGCAGTCGGAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CCTCCAGGGCACCTGGAGATCAGGCCTGGACTCAGGCCCTCCCGTCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155207 CCTCCAGGGCACCTGGAGATCAGGCCTGGACTCAGGCCCTCCCGTCGGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 ATTAAG         GAAGAAAAAATGCTGGGCATCTTGGTGCAGCACAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155257 ATTAAGGTA...CAGGAAGAAAAAATGCTGGGCATCTTGGTGCAGCACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 AGTCCGGAGTGGCGTCTCGGGCATCGTGGGCATGGAGGTGGATGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164425 AGTCCGGAGTGGCGTCTCGGGCATCGTGGGCATGGAGGTGGATGGGCTGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CCTTCCACAACACCCACGCCGAGATGATCCAGAAGCTGGTGGACGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164475 CCTTCCACAACACCCACGCCGAGATGATCCAGAAGCTGGTGGACGTCACC

   1950     .    :
   1852 ACGGCACAGGTG
        ||||||||||||
 164525 ACGGCACAGGTG