seq1 = pF1KSDB0037.tfa, 1413 bp
seq2 = pF1KSDB0037/gi568815577r_14273620.tfa (gi568815577r:14273620_14481545), 207926 bp

>pF1KSDB0037 1413
>gi568815577r:14273620_14481545 (Chr21)

(complement)

1-25  (98427-98451)   100% ->
26-366  (100003-100343)   100% ->
367-580  (103134-103347)   100% ->
581-748  (105727-105894)   100% ->
749-1413  (107262-107926)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGAGAGATGACGATCTTAG         GATCGGCTGTTTTGAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  98427 ATGGCCAGAGAGATGACGATCTTAGGTG...CAGGATCGGCTGTTTTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCTCCTGTTGGCCGGCTATTTGGCACAACAGTATTTACCATTGCCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 TCTCCTGTTGGCCGGCTATTTGGCACAACAGTATTTACCATTGCCTACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTAAAGTGATTGGTATTGATCTTGGCACCACCTATTGTTCTGTTGGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 CTAAAGTGATTGGTATTGATCTTGGCACCACCTATTGTTCTGTTGGGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTTTTCCTGGCACAGGAAAAGTAAAGGTGATTCCAGATGAAAATGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100119 TTTTTTCCTGGCACAGGAAAAGTAAAGGTGATTCCAGATGAAAATGGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATCAGCATACCCAGCATGGTGTCTTTTACTGACAATGATGTATATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100169 TATCAGCATACCCAGCATGGTGTCTTTTACTGACAATGATGTATATGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATATGAAAGCGTAGAGCTGGCAGATTCAAATCCTCAAAACACAATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100219 GATATGAAAGCGTAGAGCTGGCAGATTCAAATCCTCAAAACACAATATAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATGCCAAAAGATTCATAGGCAAGATTTTTACCGCAGAAGAGTTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100269 GATGCCAAAAGATTCATAGGCAAGATTTTTACCGCAGAAGAGTTGGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGAAATTGGCAGATACCCATTTAAG         GTTTTAAACAAAAATG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100319 TGAAATTGGCAGATACCCATTTAAGGTA...CAGGTTTTAAACAAAAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAATGGTTGAGTTTTCTGTGACAAGTAATGAGACCATCACAGTGTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103150 GAATGGTTGAGTTTTCTGTGACAAGTAATGAGACCATCACAGTGTCCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAATATGTTGGCTCTCGACTATTGTTGAAGTTAAAGGAAATGGCAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103200 GAATATGTTGGCTCTCGACTATTGTTGAAGTTAAAGGAAATGGCAGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATATCTTGGAATGCCAGTTGCCAATGCTGTCATTTCTGTACCAGCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103250 ATATCTTGGAATGCCAGTTGCCAATGCTGTCATTTCTGTACCAGCAGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTGATCTAAAACAGAGAAATTCAACAATTGAAGCTGCTAACCTTGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103300 TTGATCTAAAACAGAGAAATTCAACAATTGAAGCTGCTAACCTTGCAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    581        GACTGAAGATTTTGAGGGTAATAAATGAACCCACAGCAGCAGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103350 A...CAGGACTGAAGATTTTGAGGGTAATAAATGAACCCACAGCAGCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TATGGCCTATGGTCTCCACAAGGCTGACGTCTTCCACGTCTTGGTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105770 TATGGCCTATGGTCTCCACAAGGCTGACGTCTTCCACGTCTTGGTGATAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACTTGGGCGGAGGAACTCTAGATGTGTCTTTACTGAATAAACAAGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105820 ACTTGGGCGGAGGAACTCTAGATGTGTCTTTACTGAATAAACAAGGAGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ATGTTTCTAACCCGAGCAATGTCTG         GAAACAATAAACTTGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105870 ATGTTTCTAACCCGAGCAATGTCTGGTA...CAGGAAACAATAAACTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGGACAGGACTTCAATCAGAGATTGCTTCAGTACTTATATAAACAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107278 AGGACAGGACTTCAATCAGAGATTGCTTCAGTACTTATATAAACAGATCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATCAAACATATGGCTTCGTGCCCTCTAGGAAAGAGGAAATCCACAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107328 ATCAAACATATGGCTTCGTGCCCTCTAGGAAAGAGGAAATCCACAGATTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGACAAGCTGTGGAAATGGTCAAATTAAATCTGACTCTTCATCAATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107378 AGACAAGCTGTGGAAATGGTCAAATTAAATCTGACTCTTCATCAATCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TCAGTTGTCAGTATTACTAACGGTGGAGGAGCAGGACAGGAAGGAACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107428 TCAGTTGTCAGTATTACTAACGGTGGAGGAGCAGGACAGGAAGGAACCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACAGTAGTGACACTGAACTGCCAAAAGACAAACTTTCCTCAGCAGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107478 ACAGTAGTGACACTGAACTGCCAAAAGACAAACTTTCCTCAGCAGATGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CATCGCGTGAACAGTGGGTTTGGACGTGGCCTTTCTGATAAGAAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107528 CATCGCGTGAACAGTGGGTTTGGACGTGGCCTTTCTGATAAGAAAAGTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGAAAGTCAGGTTTTATTTGAAACAGAAATATCACGGAAACTCTTTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107578 AGAAAGTCAGGTTTTATTTGAAACAGAAATATCACGGAAACTCTTTGATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CCCTTAATGAAGACCTCTTTCAGAAAATACTGGTACCCATTCAGCAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107628 CCCTTAATGAAGACCTCTTTCAGAAAATACTGGTACCCATTCAGCAAGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TTGAAAGAAGGCCACCTGGAAAAGACTGAGATTGATGAGGTGGTTTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107678 TTGAAAGAAGGCCACCTGGAAAAGACTGAGATTGATGAGGTGGTTTTAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TGGGGGCTCCACTCGTATTCCTCGGATCCGTCAAGTCATTCAAGAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107728 TGGGGGCTCCACTCGTATTCCTCGGATCCGTCAAGTCATTCAAGAGTTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TTGGAAAAGATCCCAACACATCTGTAGACCCTGACCTAGCAGTAGTAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107778 TTGGAAAAGATCCCAACACATCTGTAGACCCTGACCTAGCAGTAGTAACG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GGAGTGGCTATCCAAGCAGGGATTGATGGAGGCTCTTGGCCTCTCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107828 GGAGTGGCTATCCAAGCAGGGATTGATGGAGGCTCTTGGCCTCTCCAAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1365 CAGTGCTTTAGAAATTCCCAATAAGCATTTACAAAAAACCAACTTCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107878 CAGTGCTTTAGAAATTCCCAATAAGCATTTACAAAAAACCAACTTCAAC