seq1 = pF1KSDB0032.tfa, 1437 bp
seq2 = pF1KSDB0032/gi568815590r_73452009.tfa (gi568815590r:73452009_73788815), 336807 bp

>pF1KSDB0032 1437
>gi568815590r:73452009_73788815 (Chr8)

(complement)

1-18  (50515-50532)   100% ->
19-178  (100003-100162)   100% ->
179-314  (115574-115709)   100% ->
315-474  (171365-171524)   100% ->
475-582  (173034-173141)   100% ->
583-795  (174860-175072)   100% ->
796-933  (184953-185090)   100% ->
934-1065  (193519-193650)   100% ->
1066-1126  (205986-206046)   100% ->
1127-1437  (236497-236807)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTCAAATAAATCAG         ATGTTCTCAGTGCAGCTGAGTCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  50515 ATGCTTCAAATAAATCAGGTG...AAGATGTTCTCAGTGCAGCTGAGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGGTGAGCAGACATGGGAATCCGAAGGCAGCAGTATAAAGAAGGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100026 TGGTGAGCAGACATGGGAATCCGAAGGCAGCAGTATAAAGAAGGCTCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGCTGTTGCCAATAAAGCTTTGACTGAATCTACGCTTCCCAAACCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100076 AGGCTGTTGCCAATAAAGCTTTGACTGAATCTACGCTTCCCAAACCAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGAAGCCACCCAAAAGTAATGTTAACAATAACCCAG         GCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100126 CAGAAGCCACCCAAAAGTAATGTTAACAATAACCCAGGTA...CAGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TATAACTCCAACTGTGGAACTGAATGGGCTTGCTATGAAAAGGGGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115578 TATAACTCCAACTGTGGAACTGAATGGGCTTGCTATGAAAAGGGGAGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGCCATCTACAGGCCATTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATTATAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115628 CTGCCATCTACAGGCCATTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATTATAGAGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATTACAACTTTCGGGGCATGTACAATCAGAG         GTATCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 115678 AATTACAACTTTCGGGGCATGTACAATCAGAGGTT...TAGGTATCATTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCAGTGCCTAAGATCTTTTATGTTCAGCTCACTGTAGGAAATAATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171374 CCCAGTGCCTAAGATCTTTTATGTTCAGCTCACTGTAGGAAATAATGAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTTTTGGGGAAGGAAAGACTCGACAAGCTGCTAGACACAATGCTGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171424 TTTTTGGGGAAGGAAAGACTCGACAAGCTGCTAGACACAATGCTGCAATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAAGCCCTCCAAGCACTGCAGAATGAACCTATTCCAGAAAGATCTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171474 AAAGCCCTCCAAGCACTGCAGAATGAACCTATTCCAGAAAGATCTCCTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 G         AATGGTGAATCAGGAAAGGATGTGGATGATGACAAAGATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171524 GGTG...TAGAATGGTGAATCAGGAAAGGATGTGGATGATGACAAAGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAAATAAGTCTGAGATCAGCTTAGTGTTTGAAATTGCTCTGAAGCGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173074 CAAATAAGTCTGAGATCAGCTTAGTGTTTGAAATTGCTCTGAAGCGAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGCCTGTCAGTTTTGAG         GTTATTAAAGAAAGTGGACCACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 173124 ATGCCTGTCAGTTTTGAGGTA...TAGGTTATTAAAGAAAGTGGACCACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACATATGAAAAGCTTTGTTACTCGAGTGTCAGTAGGAGAGTTCTCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174883 ACATATGAAAAGCTTTGTTACTCGAGTGTCAGTAGGAGAGTTCTCTGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAGGAGAAGGAAATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGCGCTGCGACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174933 AAGGAGAAGGAAATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGCGCTGCGACCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTCTTACAGGAGCTTAAAAAACTTCCACCTCTTCCTGTGGTGGAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174983 GTCTTACAGGAGCTTAAAAAACTTCCACCTCTTCCTGTGGTGGAAAAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 175033 AAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTAAAGGTA...TAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCGGACCAGAATATGGCCAAGGGATGAACCCTATTAGCCGCCTGGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184954 CCGGACCAGAATATGGCCAAGGGATGAACCCTATTAGCCGCCTGGCGCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATTCAACAGGCCAAAAAGGAAAAGGAGCCGGATTATGTTTTGCTTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185004 ATTCAACAGGCCAAAAAGGAAAAGGAGCCGGATTATGTTTTGCTTTCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AAGAGGAATGCCTCGACGTCGAGAATTTGTGATGCAG         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 185054 AAGAGGAATGCCTCGACGTCGAGAATTTGTGATGCAGGTA...CAGGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGGTAGGCAATGAAGTTGCTACAGGAACAGGACCTAATAAAAAGATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193523 AGGTAGGCAATGAAGTTGCTACAGGAACAGGACCTAATAAAAAGATAGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAAAAAAATGCTGCAGAAGCAATGCTGTTACAACTTGGTTATAAAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193573 AAAAAAAATGCTGCAGAAGCAATGCTGTTACAACTTGGTTATAAAGCATC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CACTAATCTTCAGGATCAACTTGAGAAG         ACAGGGGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 193623 CACTAATCTTCAGGATCAACTTGAGAAGGTA...CAGACAGGGGAAAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AAGGATGGAGTGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCTGAACCAACAAATAATA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 205999 AAGGATGGAGTGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCTGAACCAACAAATAATAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1127        CTCCAAAAGGAATTCTTCATTTGTCTCCTGATGTTTATCAAGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206049 A...TAGCTCCAAAAGGAATTCTTCATTTGTCTCCTGATGTTTATCAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GATGGAAGCCAGCCGCCACAAAGTAATCTCTGGCACTACTCTAGGCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236540 GATGGAAGCCAGCCGCCACAAAGTAATCTCTGGCACTACTCTAGGCTATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TGTCACCCAAAGATATGAACCAACCTTCAAGCTCTTTCTTCAGTATATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236590 TGTCACCCAAAGATATGAACCAACCTTCAAGCTCTTTCTTCAGTATATCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CCCACATCGAATAGTTCAGCTACAATTGCCAGGGAACTCCTTATGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236640 CCCACATCGAATAGTTCAGCTACAATTGCCAGGGAACTCCTTATGAATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AACATCTTCTACAGCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236690 AACATCTTCTACAGCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CCCCTTGTTCTCCAGTACAACCTTCAAAACAACTGGAATATTTAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236740 CCCCTTGTTCTCCAGTACAACCTTCAAAACAACTGGAATATTTAGCAAGG

   1500     .    :    .
   1420 ATTCAAGGCTTTCAGGTA
        ||||||||||||||||||
 236790 ATTCAAGGCTTTCAGGTA