seq1 = pF1KSDB0024.tfa, 3741 bp
seq2 = pF1KSDB0024/gi568815586r_81163231.tfa (gi568815586r:81163231_81854221), 690991 bp

>pF1KSDB0024 3741
>gi568815586r:81163231_81854221 (Chr12)

(complement)

1-249  (100001-100249)   100% ->
250-303  (177378-177431)   100% ->
304-405  (396356-396457)   100% ->
406-570  (408502-408666)   100% ->
571-645  (414176-414250)   100% ->
646-762  (448319-448435)   100% ->
763-984  (469978-470199)   100% ->
985-1131  (478280-478426)   100% ->
1132-1266  (479454-479588)   100% ->
1267-1350  (485028-485111)   100% ->
1351-1482  (485366-485497)   100% ->
1483-1545  (487052-487114)   100% ->
1546-1637  (491438-491529)   100% ->
1638-1773  (496005-496140)   100% ->
1774-1994  (500883-501103)   100% ->
1995-2232  (506452-506689)   100% ->
2233-2262  (509529-509558)   100% ->
2263-2393  (513014-513144)   100% ->
2394-2548  (514888-515042)   100% ->
2549-2642  (528352-528445)   100% ->
2643-2724  (554840-554921)   100% ->
2725-2925  (559187-559387)   100% ->
2926-2988  (569919-569981)   100% ->
2989-3018  (571183-571212)   100% ->
3019-3212  (572772-572965)   100% ->
3213-3310  (576808-576905)   100% ->
3311-3491  (586135-586314)   99% ->
3492-3555  (587207-587270)   100% ->
3556-3715  (590832-590991)   100% ->
3716-3741  (594562-594587)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTGTGAAGTGATGCCCACGATTAATGAGGACACCCCAATGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTGTGAAGTGATGCCCACGATTAATGAGGACACCCCAATGAGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGGGGGTCCCAAAGCAGTGGCTCGGACTCAGACTCCCATTTTGAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGGGGGTCCCAAAGCAGTGGCTCGGACTCAGACTCCCATTTTGAGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATGGTGAATATGCTAGATGAAAGGGATCGTCTTCTAGACACCCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGATGGTGAATATGCTAGATGAAAGGGATCGTCTTCTAGACACCCTTCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGACCCAGGAAAGCCTCTCACTTGCCCAGCAAAGACTTCAGGATGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGACCCAGGAAAGCCTCTCACTTGCCCAGCAAAGACTTCAGGATGTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTATGACCGAGACTCACTCCAGAGACAGCTCAATTCAGCCCTGCCACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100201 CTATGACCGAGACTCACTCCAGAGACAGCTCAATTCAGCCCTGCCACAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    250         GATATCGAATCCCTAACAGGAGGGCTGGCTGGTTCTAAGGGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TA...CAGGATATCGAATCCCTAACAGGAGGGCTGGCTGGTTCTAAGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGATCCACCG         GAATTTGCTGCACTGACAAAAGAATTAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 177420 GCTGATCCACCGGTA...CAGGAATTTGCTGCACTGACAAAAGAATTAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCCTGCAGGGAACAACTTCTAGAAAAGGAAGAAGAAATCTCTGAACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 396385 TGCCTGCAGGGAACAACTTCTAGAAAAGGAAGAAGAAATCTCTGAACTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGCTGAAAGAAACAACACAAGA         CTATTACTGGAGCATTTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 396435 AAGCTGAAAGAAACAACACAAGAGTA...TAGCTATTACTGGAGCATTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGTGCCTTGTGTCACGACATGAAAGATCACTAAGAATGACGGTGGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 408520 GAGTGCCTTGTGTCACGACATGAAAGATCACTAAGAATGACGGTGGTAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACGGCAAGCCCAGTCTCCCTCAGGAGTATCCAGTGAAGTTGAAGTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 408570 ACGGCAAGCCCAGTCTCCCTCAGGAGTATCCAGTGAAGTTGAAGTTCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGCACTGAAATCTTTGTTTGAGCACCACAAGGCCTTGGATGAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 408620 AGGCACTGAAATCTTTGTTTGAGCACCACAAGGCCTTGGATGAAAAGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    571       GTAAGGGAGCGACTGAGGGTTTCTTTAGAAAGAGTCTCTGCACT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 408670 ...TAGGTAAGGGAGCGACTGAGGGTTTCTTTAGAAAGAGTCTCTGCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAAGAAGAACTAGCTGCTGCTAATCAGGAG         ATTGTTGCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 414220 GGAAGAAGAACTAGCTGCTGCTAATCAGGAGGTA...CAGATTGTTGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGCGTGAACAAAATGTTCATATACAAAGAAAAATGGCATCAAGCGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 448329 TGCGTGAACAAAATGTTCATATACAAAGAAAAATGGCATCAAGCGAGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TCCACAGAGTCAGAACATCTTGAAGGGATGGAACCTGGACAGAAAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 448379 TCCACAGAGTCAGAACATCTTGAAGGGATGGAACCTGGACAGAAAGTCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAGAAG         CGTTTGTCCAATGGTTCTATAGACTCAACCGATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 448429 TGAGAAGGTA...CAGCGTTTGTCCAATGGTTCTATAGACTCAACCGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAACTAGTCAAATAGTTGAACTACAAGAATTGCTTGAAAAGCAAAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470012 AAACTAGTCAAATAGTTGAACTACAAGAATTGCTTGAAAAGCAAAACTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAAATGGCCCAGATGAAAGAACGTTTAGCAGCCCTTTCTTCCCGAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470062 GAAATGGCCCAGATGAAAGAACGTTTAGCAGCCCTTTCTTCCCGAGTGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGAGGTGGAACAGGAAGCAGAGACAGCAAGAAAGGATCTCATTAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470112 AGAGGTGGAACAGGAAGCAGAGACAGCAAGAAAGGATCTCATTAAAACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AAGAAATGAACACCAAGTATCAAAGGGACATTAGGGAG         GCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 470162 AAGAAATGAACACCAAGTATCAAAGGGACATTAGGGAGGTA...TAGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATGGCACAAAAGGAAGATATGGAAGAAAGAATTACAACCCTTGAAAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 478283 ATGGCACAAAAGGAAGATATGGAAGAAAGAATTACAACCCTTGAAAAGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TTACCTCAGTGCTCAGAGAGAATCTACCTCCATACATGACATGAATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 478333 TTACCTCAGTGCTCAGAGAGAATCTACCTCCATACATGACATGAATGATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AACTAGAAAATGAGTTAGCAAATAAAGAAGCTATCCTGCGGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 478383 AACTAGAAAATGAGTTAGCAAATAAAGAAGCTATCCTGCGGCAGGTT...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1132    ATGGAAGAGAAAAACAGACAGTTACAAGAACGTCTTGAGCTAGCTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 479451 CAGATGGAAGAGAAAAACAGACAGTTACAAGAACGTCTTGAGCTAGCTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ACAAAAGTTGCAGCAGACCATGAGAAAGGCTGAAACCTTGCCTGAAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 479501 ACAAAAGTTGCAGCAGACCATGAGAAAGGCTGAAACCTTGCCTGAAGTAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGGCTGAACTGGCTCAGAGAATTGCAGCCCTAACCAAG         GCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 479551 AGGCTGAACTGGCTCAGAGAATTGCAGCCCTAACCAAGGTA...CAGGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GAAGAGAGACATGGAAATATTGAAGAACGTATGAGACATTTAGAGGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 485031 GAAGAGAGACATGGAAATATTGAAGAACGTATGAGACATTTAGAGGGTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ACTTGAAGAGAAGAATCAAGAACTTCAAAGA         GCTAGGCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 485081 ACTTGAAGAGAAGAATCAAGAACTTCAAAGAGTA...AAGGCTAGGCAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GAGAGAAAATGAATGAGGAGCATAACAAGAGATTATCGGATACGGTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 485376 GAGAGAAAATGAATGAGGAGCATAACAAGAGATTATCGGATACGGTTGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AGACTTCTGACTGAATCCAATGAACGCCTACAACTACACTTAAAGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 485426 AGACTTCTGACTGAATCCAATGAACGCCTACAACTACACTTAAAGGAAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AATGGCTGCTCTAGAAGAAAAG         AATGTTTTAATTCAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 485476 AATGGCTGCTCTAGAAGAAAAGGTA...TAGAATGTTTTAATTCAAGAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CAGAAACTTTCAGAAAGAATCTTGAAGAATCTTTACATGATAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 487071 CAGAAACTTTCAGAAAGAATCTTGAAGAATCTTTACATGATAAGGTA...

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1546    GAAAGATTAGCAGAAGAAATTGAAAAGCTGAGATCTGAACTTGACCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 491435 TAGGAAAGATTAGCAGAAGAAATTGAAAAGCTGAGATCTGAACTTGACCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 ATTGAAAATGAGAACTGGCTCTTTAATTGAACCCACAATACCAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 491485 ATTGAAAATGAGAACTGGCTCTTTAATTGAACCCACAATACCAAGGTA..

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638     AACTCATCTAGACACCTCAGCTGAGTTGCGGTACTCAGTGGGATCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 491535 .CAGAACTCATCTAGACACCTCAGCTGAGTTGCGGTACTCAGTGGGATCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CTAGTGGACAGCCAGTCTGATTACAGAACAACTAAAGTAATAAGAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 496051 CTAGTGGACAGCCAGTCTGATTACAGAACAACTAAAGTAATAAGAAGACC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AAGGAGAGGCCGCATGGGTGTGCGAAGAGATGAGCCAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 496101 AAGGAGAGGCCGCATGGGTGTGCGAAGAGATGAGCCAAAGGTT...CAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGAAATCTCTTGGGGATCACGAGTGGAATAGAACTCAACAGATTGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 500884 TGAAATCTCTTGGGGATCACGAGTGGAATAGAACTCAACAGATTGGAGTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CTAAGCAGCCACCCTTTTGAAAGTGACACTGAAATGTCTGATATTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 500934 CTAAGCAGCCACCCTTTTGAAAGTGACACTGAAATGTCTGATATTGATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TGATGACAGAGAAACAATTTTTAGCTCAATGGATCTTCTCTCTCCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 500984 TGATGACAGAGAAACAATTTTTAGCTCAATGGATCTTCTCTCTCCAAGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 GTCATTCCGATGCCCAGACGCTAGCCATGATGCTTCAGGAACAATTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 501034 GTCATTCCGATGCCCAGACGCTAGCCATGATGCTTCAGGAACAATTGGAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GCCATCAACAAAGAAATCAG         GCTAATTCAGGAAGAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 501084 GCCATCAACAAAGAAATCAGGTA...CAGGCTAATTCAGGAAGAAAAAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 ATCTACAGAGTTGCGTGCTGAAGAAATTGAAAATAGAGTGGCTAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506473 ATCTACAGAGTTGCGTGCTGAAGAAATTGAAAATAGAGTGGCTAGTGTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GCCTCGAAGGCCTGAATTTGGCAAGGGTCCACCCAGGTACCTCCATTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506523 GCCTCGAAGGCCTGAATTTGGCAAGGGTCCACCCAGGTACCTCCATTACT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GCCTCTGTTACAGCTTCATCGCTGGCCAGTTCATCTCCCCCCAGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506573 GCCTCTGTTACAGCTTCATCGCTGGCCAGTTCATCTCCCCCCAGTGGACA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CTCAACTCCAAAGCTCACCCCTCGAAGCCCTGCCAGGGAAATGGATCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506623 CTCAACTCCAAAGCTCACCCCTCGAAGCCCTGCCAGGGAAATGGATCGGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TGGGAGTCATGACACTG         CCAAGTGATCTGAGGAAACATCGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 506673 TGGGAGTCATGACACTGGTA...CAGCCAAGTGATCTGAGGAAACATCGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 AGAAAG         ATTGCAGTTGTGGAAGAAGATGGTCGAGAGGACAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 509553 AGAAAGGTA...TAGATTGCAGTTGTGGAAGAAGATGGTCGAGAGGACAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 AGCAACAATTAAATGTGAAACTTCTCCTCCTCCTACCCCTAGAGCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 513049 AGCAACAATTAAATGTGAAACTTCTCCTCCTCCTACCCCTAGAGCCCTCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 GAATGACTCACACTCTCCCTTCTTCCTACCACAATGATGCTCGAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 513099 GAATGACTCACACTCTCCCTTCTTCCTACCACAATGATGCTCGAAGGTA.

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2394      TAGTTTATCTGTCTCTCTTGAGCCAGAAAGCCTCGGGCTTGGTAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 513149 ..CAGTAGTTTATCTGTCTCTCTTGAGCCAGAAAGCCTCGGGCTTGGTAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 TGCCAACAGCAGCCAAGACTCTCTTCACAAAGCCCCCAAGAAGAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 514933 TGCCAACAGCAGCCAAGACTCTCTTCACAAAGCCCCCAAGAAGAAAGGAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 TCAAGTCTTCAATAGGACGTTTGTTTGGTAAAAAAGAAAAAGCTCGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 514983 TCAAGTCTTCAATAGGACGTTTGTTTGGTAAAAAAGAAAAAGCTCGACTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 GGGCAGCTCC         GAGGCTTTATGGAGACTGAAGCTGCAGCTCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 515033 GGGCAGCTCCGTA...CAGGAGGCTTTATGGAGACTGAAGCTGCAGCTCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 GGAGTCCCTGGGGTTAGGCAAACTCGGAACTCAAGCTGAGAAGGATCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 528383 GGAGTCCCTGGGGTTAGGCAAACTCGGAACTCAAGCTGAGAAGGATCGAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 GACTAAAGAAAAA         GCATGAACTTCTTGAAGAAGCTCGGAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 528433 GACTAAAGAAAAAGTA...CAGGCATGAACTTCTTGAAGAAGCTCGGAGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 AAGGGATTACCTTTTGCCCAGTGGGATGGGCCAACTGTGGTCGCATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 554868 AAGGGATTACCTTTTGCCCAGTGGGATGGGCCAACTGTGGTCGCATGGCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 AGAG         CTTTGGTTGGGAATGCCTGCGTGGTACGTGGCAGCCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 554918 AGAGGTA...CAGCTTTGGTTGGGAATGCCTGCGTGGTACGTGGCAGCCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 GCCGAGCCAACGTGAAGAGTGGTGCCATCATGTCTGCTTTATCTGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 559224 GCCGAGCCAACGTGAAGAGTGGTGCCATCATGTCTGCTTTATCTGACACT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 GAGATCCAGAGAGAAATTGGAATCAGCAATCCACTGCATCGCTTAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 559274 GAGATCCAGAGAGAAATTGGAATCAGCAATCCACTGCATCGCTTAAAACT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 TCGATTAGCAATCCAGGAGATGGTTTCCCTAACAAGTCCTTCAGCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 559324 TCGATTAGCAATCCAGGAGATGGTTTCCCTAACAAGTCCTTCAGCTCCTC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2912 CAACATCTCGAACT         CCTTCAGGCAACGTTTGGGTGACTCAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 559374 CAACATCTCGAACTGTG...TAGCCTTCAGGCAACGTTTGGGTGACTCAT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 GAAGAAATGGAAAATCTTGCAGCTCCAGCAAAAACG         AAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 569946 GAAGAAATGGAAAATCTTGCAGCTCCAGCAAAAACGGTT...CAGAAAGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 ATCTGAGGAAGGAAGCTGGGCCCAG         TGTCCGGTTTTTCTAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 571188 ATCTGAGGAAGGAAGCTGGGCCCAGGTA...TAGTGTCCGGTTTTTCTAC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3035 AGACCCTGGCTTATGGAGATATGAATCATGAGTGGATTGGAAATGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 572788 AGACCCTGGCTTATGGAGATATGAATCATGAGTGGATTGGAAATGAATGG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3085 CTTCCCAGCTTGGGGTTACCTCAGTACAGAAGTTACTTTATGGAATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 572838 CTTCCCAGCTTGGGGTTACCTCAGTACAGAAGTTACTTTATGGAATGCTT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3135 GGTAGATGCAAGAATGTTAGATCACCTAACAAAAAAAGATCTCCGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 572888 GGTAGATGCAAGAATGTTAGATCACCTAACAAAAAAAGATCTCCGTGTCC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3185 ATTTAAAAATGGTGGATAGTTTCCATCG         AACAAGTTTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 572938 ATTTAAAAATGGTGGATAGTTTCCATCGGTA...AAGAACAAGTTTACAA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3226 TATGGAATTATGTGCTTAAAGAGGTTGAATTATGACAGAAAAGAACTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 576821 TATGGAATTATGTGCTTAAAGAGGTTGAATTATGACAGAAAAGAACTAGA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3276 AAGAAGACGGGAAGCAAGCCAACATGAAATAAAAG         ACGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 576871 AAGAAGACGGGAAGCAAGCCAACATGAAATAAAAGGTA...TAGACGTGT

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3317 TGGTGTGGAGCAATGACCGAGTTATTCGCTGGATACAAGCAATTGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 586141 TGGTGTGGAGCAATGACCGAGTTATTCGCTGGATACAAGCAATTGGACTT

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3367 CGAGAATATGCAAATAATATACTTGAGAGCGGTGTGCATGGCTCACTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 586191 CGAGAATATGCAAATAATATACTTGAGAGCGGTGTGCATGGCTCACTTAT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3417 AGCCCTGGATGAAAACTTTGACTACAGCAGCTTAGCTTTATTATTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 586241 AGCCCTGGATGAAAACTTTGACTACAGCAGCTTAGCTTTATTATTACAGA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3467 TTCCAACACAGAACACCCAGGCAAG         GCAGATTCTTGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||->>>...>>>||||||||||||||||
 586291 TTCCAACACAGAACACCCAGGCAA GTC...AAGGCAGATTCTTGAAAGA

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3508 GAATACAATAACCTCTTGGCCCTGGGAACTGAAAGGCGACTGGATGAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 587223 GAATACAATAACCTCTTGGCCCTGGGAACTGAAAGGCGACTGGATGAAGT

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3556        AGTGATGACAAGAACTTCAGACGTGGATCAACCTGGAGAAGGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 587273 A...CAGAGTGATGACAAGAACTTCAGACGTGGATCAACCTGGAGAAGGC

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3599 AGTTTCCTCCTCGTGAAGTACATGGAATCAGCATGATGCCTGGGTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 590875 AGTTTCCTCCTCGTGAAGTACATGGAATCAGCATGATGCCTGGGTCCTCA

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3649 GAAACATTACCAGCTGGATTTAGGTTAACCACAACCTCTGGGCAGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 590925 GAAACATTACCAGCTGGATTTAGGTTAACCACAACCTCTGGGCAGTCAAG

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3699 AAAAATGACAACAGATG         ATGGCGTCTTTTCAGTCTACTCTA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 590975 AAAAATGACAACAGATGGTA...TAGATGGCGTCTTTTCAGTCTACTCTA

   4000 
   3740 CC
        ||
 594586 CC