seq1 = pF1KSDB0018.tfa, 2640 bp
seq2 = pF1KSDB0018/gi568815581r_35644857.tfa (gi568815581r:35644857_35852850), 207994 bp

>pF1KSDB0018 2640
>gi568815581r:35644857_35852850 (Chr17)

(complement)

1-385  (100001-100385)   100% ->
386-627  (102533-102774)   100% ->
628-735  (103634-103741)   100% ->
736-832  (104906-105002)   100% ->
833-1085  (105583-105835)   100% ->
1086-2640  (106440-107994)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCAGCCTGCGGGAGGCAGGAGGAAGCCCAGGACCCTAGGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCAGCCTGCGGGAGGCAGGAGGAAGCCCAGGACCCTAGGGCCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGTGCAGTATCCGGCCTTTCAAGTCGAGTGAGCAGTACCTGGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGTGCAGTATCCGGCCTTTCAAGTCGAGTGAGCAGTACCTGGAGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAAGGAAGACCTGGCTGAGTGGCTTCGCGACCTCTATGGGCTGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAAGGAAGACCTGGCTGAGTGGCTTCGCGACCTCTATGGGCTGGACATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGCAGCCAACTTCCTGCAGGTGCTGGAAACGGGCCTGGTGCTGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGCAGCCAACTTCCTGCAGGTGCTGGAAACGGGCCTGGTGCTGTGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACACGCCAACGTTGTCACTGACGCTGCCCTGGCCTTCCTGGCTGAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACACGCCAACGTTGTCACTGACGCTGCCCTGGCCTTCCTGGCTGAGGCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGCCCAAGCCCAGAAGATTCCCATGCCCCGGGTCGGGGTCTCCTGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGCCCAAGCCCAGAAGATTCCCATGCCCCGGGTCGGGGTCTCCTGCAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGGCCGCCCAGCCAGGTACCTTCCAGGCCAGGGACAATGTCTCTAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGGCCGCCCAGCCAGGTACCTTCCAGGCCAGGGACAATGTCTCTAACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCCAGTGGTGTCGAAAGGAGATGGGCATCCAAG         AGGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100351 CATCCAGTGGTGTCGAAAGGAGATGGGCATCCAAGGTA...CAGAGGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGATGTTCGAGACGGAGGACTTGGTGCTGCGCAAGAACGTGAAGAACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102539 TGATGTTCGAGACGGAGGACTTGGTGCTGCGCAAGAACGTGAAGAACGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGCTGTGTTTGCTGGAGCTGGGCCGCCGGGCGTGGCGCTTTGGTGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102589 GTGCTGTGTTTGCTGGAGCTGGGCCGCCGGGCGTGGCGCTTTGGTGTTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGCGCCCACACTCGTGCAGCTGGAGGAGGAGATCGAGGAGGAGGTGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102639 GGCGCCCACACTCGTGCAGCTGGAGGAGGAGATCGAGGAGGAGGTGCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGGAGCTGGCCCTGCCCCCGCCCGACCCCTCGCCGCCAGCGCCCCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102689 GGGAGCTGGCCCTGCCCCCGCCCGACCCCTCGCCGCCAGCGCCCCCCAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGCCAGCCCTGCCACTTCCGCAACCTGGACCAGATG         GTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102739 CGCCAGCCCTGCCACTTCCGCAACCTGGACCAGATGGTG...CAGGTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAGCCTTGTGAGCCACTGCACGTGCCCAGTGCAGTTCTCCATGGTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103639 GAGCCTTGTGAGCCACTGCACGTGCCCAGTGCAGTTCTCCATGGTCAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGTCTGAGGGGAAGTACCGTGTGGGTGACTCCAACACCCTCATCTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103689 TGTCTGAGGGGAAGTACCGTGTGGGTGACTCCAACACCCTCATCTTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CGG         ATCCTCCGGAACCATGTGATGGTACGTGTAGGGGGCGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103739 CGGGTA...CAGATCCTCCGGAACCATGTGATGGTACGTGTAGGGGGCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTGGGACACACTGGGCCATTACCTGGACAAACATGACCCCTGCCGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104944 CTGGGACACACTGGGCCATTACCTGGACAAACATGACCCCTGCCGCTGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CATCCCTCT         CACACAAGCCAGGCAGCTTCCTGAAGCCCCCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 104994 CATCCCTCTGTG...TAGCACACAAGCCAGGCAGCTTCCTGAAGCCCCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GCCCCACCAGTGCAGCATGAAGTAAGGGTACAGGATGGACCCTCACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105615 GCCCCACCAGTGCAGCATGAAGTAAGGGTACAGGATGGACCCTCACAGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCAGCCTACAATGACCATCAGCCGCTCACAGAGCCCACCACCCCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105665 CCAGCCTACAATGACCATCAGCCGCTCACAGAGCCCACCACCCCCTGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACTGGAAGACATATACCTCTTCAGACCGAAGGCTGAGGCCCCCCACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105715 ACTGGAAGACATATACCTCTTCAGACCGAAGGCTGAGGCCCCCCACCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TCCTCCCCCAGACCCCGCAGGGAACGGGGAGCAGGGACGGGGGCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105765 TCCTCCCCCAGACCCCGCAGGGAACGGGGAGCAGGGACGGGGGCCTCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGAGATGGCACCATTCCTGAG         GTGCCAGGAGAGGTCTCTCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105815 AGAGATGGCACCATTCCTGAGGTA...CAGGTGCCAGGAGAGGTCTCTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TCCCATCTTGGAGGCAGCCGACAGCTGGGGACAGCCCACCCAGCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106460 TCCCATCTTGGAGGCAGCCGACAGCTGGGGACAGCCCACCCAGCCCCCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TCCTCATCTACCCAAAAAGGCCGAGACCCACAGTGTACCTCGTCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106510 TCCTCATCTACCCAAAAAGGCCGAGACCCACAGTGTACCTCGTCAGGAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GAGGGAGGAGAGATACCCCCCTGAACTCCCCAGGGGAAGGATTCCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106560 GAGGGAGGAGAGATACCCCCCTGAACTCCCCAGGGGAAGGATTCCCACAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CTTGGGTTCATGAAGAAACAGACAGCTGGGGAACCGACGCCGGGAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106610 CTTGGGTTCATGAAGAAACAGACAGCTGGGGAACCGACGCCGGGAACCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ACCCCACAAAGACTCCGAGCCATTGAGGCCACCACCAAAGGGATATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106660 ACCCCACAAAGACTCCGAGCCATTGAGGCCACCACCAAAGGGATATCAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 AAGAGGACCATCTCCCCTGCCTCGTTCCTTTGGCCCAGCCGAGTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106710 AAGAGGACCATCTCCCCTGCCTCGTTCCTTTGGCCCAGCCGAGTGCCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GCCTCAGGCTGCCACTCCGGGATGAGGCCAAGGGTGCGTTCTTCCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106760 GCCTCAGGCTGCCACTCCGGGATGAGGCCAAGGGTGCGTTCTTCCAGTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 AGGGAGCCAGAGTCTGTCCGTTCTCCAACCCCTGTCCAAGGCCTAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106810 AGGGAGCCAGAGTCTGTCCGTTCTCCAACCCCTGTCCAAGGCCTAACCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 GATCCCCATCCGGCTGCCCCCTGCTCGCCCCCCAACACCAGGAAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106860 GATCCCCATCCGGCTGCCCCCTGCTCGCCCCCCAACACCAGGAAGGAGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 TTCCTGGTGCTACAAGTGGAAGTCCCAGGACAGAACTTGGGAGAGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106910 TTCCTGGTGCTACAAGTGGAAGTCCCAGGACAGAACTTGGGAGAGACCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 ATCCCACTAAGGGCCGTCACTGTGGACCTGGCTGGGTCCACGCATGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106960 ATCCCACTAAGGGCCGTCACTGTGGACCTGGCTGGGTCCACGCATGGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CTGCTCTGTGGAAGTGAGGCAGGAGGACCAGCAGCTGGACATCCAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107010 CTGCTCTGTGGAAGTGAGGCAGGAGGACCAGCAGCTGGACATCCAGGTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 TGGCAGAGGCCAGAGAGTCCTGGGACCTGGGCCTACAGGAGCAGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107060 TGGCAGAGGCCAGAGAGTCCTGGGACCTGGGCCTACAGGAGCAGGAGGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CGGTACACACCTCTGCCCTTGGGCGGGAACAAGGAGCAAGCCATCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107110 CGGTACACACCTCTGCCCTTGGGCGGGAACAAGGAGCAAGCCATCTACTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 TAGCCTTGAAGAGGAGATTTTGGGCAACATGAAGCTGCTAGAAGTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107160 TAGCCTTGAAGAGGAGATTTTGGGCAACATGAAGCTGCTAGAAGTCAGGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 GTGCCTGTCCGCAGGGCACAAGGTCTGGGGTCATCCCTCGCAGTGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107210 GTGCCTGTCCGCAGGGCACAAGGTCTGGGGTCATCCCTCGCAGTGGGGTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 TACATCCCCAGGCTGGCTGGGCAGTGGCCTGAGCCTGGGGGTCCTTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107260 TACATCCCCAGGCTGGCTGGGCAGTGGCCTGAGCCTGGGGGTCCTTATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 CAAAGCCATCCAAGAACTGGCTCAGGGGTCCCCATCCCTCCTTAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107310 CAAAGCCATCCAAGAACTGGCTCAGGGGTCCCCATCCCTCCTTAAAGTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 ACCTGGAAGCCTGGAAGGCAGCCCCGACTGGCTCCCCTAAGCCAGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107360 ACCTGGAAGCCTGGAAGGCAGCCCCGACTGGCTCCCCTAAGCCAGCTGTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 ACCCCAGGACCGGGAAGCCTCAAAGGGAAGTTGGGAGCCAGACAGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107410 ACCCCAGGACCGGGAAGCCTCAAAGGGAAGTTGGGAGCCAGACAGAGTGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 GCCCAGGACAAAGGCAAGCCTGAGTGCCAAGGGCACCCACATGAGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107460 GCCCAGGACAAAGGCAAGCCTGAGTGCCAAGGGCACCCACATGAGGAAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 TCCCACCTCAGGGAGGGCAGGACTGCTCGGCTTCTACTGTGTCTGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107510 TCCCACCTCAGGGAGGGCAGGACTGCTCGGCTTCTACTGTGTCTGCCAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 CCGGAGGCCCCCACACCTTCGCCCTTGGACCCCAACTCTGACAAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107560 CCGGAGGCCCCCACACCTTCGCCCTTGGACCCCAACTCTGACAAAGCCAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 GGCATGTCTGAGCAAGGGCAGGAGAACTCTCCGGAAGCCCAAGAGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107610 GGCATGTCTGAGCAAGGGCAGGAGAACTCTCCGGAAGCCCAAGAGGGTCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 CGTCCATCTACAAGCTGAAGCTGAGACCCAGGATTCGGCCCCGGAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107660 CGTCCATCTACAAGCTGAAGCTGAGACCCAGGATTCGGCCCCGGAGAGAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2356 CACAGGCCTGAGAAGCAGCCTTCACGAATCCCCAGGCCACTGGCCTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107710 CACAGGCCTGAGAAGCAGCCTTCACGAATCCCCAGGCCACTGGCCTATGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2406 CTTCCTGGGTCCAGCCAGGCAGCCCCCCAAGGACAGGCTGTTGAGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107760 CTTCCTGGGTCCAGCCAGGCAGCCCCCCAAGGACAGGCTGTTGAGAGCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2456 TGCTGGGCAGCAAGGGAGGGGAGGCATCCCGGGTGGATGGAGCTTCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107810 TGCTGGGCAGCAAGGGAGGGGAGGCATCCCGGGTGGATGGAGCTTCAGTA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2506 GGTGAGGAGGAGGAGGAAGGAAAGGAGGAGAAAGAGCCAGCCGCTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107860 GGTGAGGAGGAGGAGGAAGGAAAGGAGGAGAAAGAGCCAGCCGCTCCATT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2556 GGAGAGCAGCCCCCAACCTCCAGAGGGCCTGCAACCTCACTGGCTTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107910 GGAGAGCAGCCCCCAACCTCCAGAGGGCCTGCAACCTCACTGGCTTAATC

   2650     .    :    .    :    .    :    .
   2606 AAGCTCCACTTCCACCTGAGGAGGAGTCCTGGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107960 AAGCTCCACTTCCACCTGAGGAGGAGTCCTGGGTC