Result of SIM4 for
pF1KSDB0004
seq1 = pF1KSDB0004.tfa, 3258 bp
seq2 = pF1KSDB0004/gi568815582f_446839.tfa (gi568815582f:446839_653513), 206675 bp
>pF1KSDB0004 3258
>gi568815582f:446839_653513 (Chr16)
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0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCCACGGTCGGAGAGTGGTCCTGTGTGCGCTGCACCTTCCTGAACCC
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100001 ATGGCCACGGTCGGAGAGTGGTCCTGTGTGCGCTGCACCTTCCTGAACCC
50 . : . : . : . : . :
51 GGCCGGCCAGCGCCAGTGCTCCATCTGCGAGGCTCCCCGGCACAAGCCCG
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100051 GGCCGGCCAGCGCCAGTGCTCCATCTGCGAGGCTCCCCGGCACAAGCCCG
100 . : . : . : . : . :
101 ACCTCAACCACATCCTGCGGCTCAGCGTGGAGGAGCAGAAATGGCCCTGC
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100101 ACCTCAACCACATCCTGCGGCTCAGCGTGGAGGAGCAGAAATGGCCCTGC
150 . : . : . : . : . :
151 GCCCGCTGCACCTTCCGCAACTTCCTGGGCAAGGAGGCCTGCGAGGTGTG
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100151 GCCCGCTGCACCTTCCGCAACTTCCTGGGCAAGGAGGCCTGCGAGGTGTG
200 . : . : . : . : . :
201 CGGCTTCACCCCGGAGCCTGCGCCTGGGGCTGCCTTCCTGCCAGTCCTCA
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100201 CGGCTTCACCCCGGAGCCTGCGCCTGGGGCTGCCTTCCTGCCAGTCCTCA
250 . : . : . : . : . :
251 ACGGGGTCCTCCCCAAGCCACCCGCCATCCTGGGGGAGCCCAAGGGCAGC
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100251 ACGGGGTCCTCCCCAAGCCACCCGCCATCCTGGGGGAGCCCAAGGGCAGC
300 . : . : . : . : . :
301 TGCCAGGAGGAAGCAGGTCCAGTGAGGACTGCGGGGCTGGTGGCCACGGA
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100301 TGCCAGGAGGAAGCAGGTCCAGTGAGGACTGCGGGGCTGGTGGCCACGGA
350 . : . : . : . : . :
351 GCCCGCCAGGGGGCAGTGCGAGGACAAGGACGAGGAGGAGAAGGAGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 GCCCGCCAGGGGGCAGTGCGAGGACAAGGACGAGGAGGAGAAGGAGGAGC
400 . : . : . : . : . :
401 AGGAGGAGGAGGAGGGAGCGGCGGAGCCCAGAGGGGGCTGGGCGTGTCCG
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100401 AGGAGGAGGAGGAGGGAGCGGCGGAGCCCAGAGGGGGCTGGGCGTGTCCG
450 . : . : . : . : . :
451 CGTTGCACGCTGCACAACACGCCCGTGGCCAGCTCCTGCTCCGTCTGCGG
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100451 CGTTGCACGCTGCACAACACGCCCGTGGCCAGCTCCTGCTCCGTCTGCGG
500 . : . : . : . : . :
501 GGGCCCACGCAGGCTCTCGCTGCCACGGATCCCTCCTGAGGCCCTGGTGG
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100501 GGGCCCACGCAGGCTCTCGCTGCCACGGATCCCTCCTGAGGCCCTGGTGG
550 . : . : . : . : . :
551 TCCCGGAAGTGGTGGCCCCGGCCGGCTTCCACGTCGTGCCTGCCGCGCCT
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100551 TCCCGGAAGTGGTGGCCCCGGCCGGCTTCCACGTCGTGCCTGCCGCGCCT
600 . : . : . : . : . :
601 CCACCTGGCCTCCCCGGGGAAGGTGCCGAGGCCAACCCCCCAGCCACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 CCACCTGGCCTCCCCGGGGAAGGTGCCGAGGCCAACCCCCCAGCCACCAG
650 . : . : . : . : . :
651 CCAGGGCCCAGCTGCCGAACCAGAGCCGCCCAGGGTCCCGCCCTTCAGCC
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100651 CCAGGGCCCAGCTGCCGAACCAGAGCCGCCCAGGGTCCCGCCCTTCAGCC
700 . : . : . : . : . :
701 CCTTCTCGTCCACCCTGCAGAACAACCCCGTGCCGCGCAGCCGACGCGAG
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100701 CCTTCTCGTCCACCCTGCAGAACAACCCCGTGCCGCGCAGCCGACGCGAG
750 . : . : . : . : . :
751 GTTCCCCCCCAGCTGCAGCCACCGGTGCCTGAGGCTGCCCAGCCGTCACC
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100751 GTTCCCCCCCAGCTGCAGCCACCGGTGCCTGAGGCTGCCCAGCCGTCACC
800 . : . : . : . : . :
801 CTCTGCCGGCTGCAGGGGAGCCCCCCAGGGCTCGGGCTGGGCTGGGGCCT
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100801 CTCTGCCGGCTGCAGGGGAGCCCCCCAGGGCTCGGGCTGGGCTGGGGCCT
850 . : . : . : . : . :
851 CCCGCCTAGCAGAGTTGCTGTCTGGCAAGCGGCTGAGTGTGCTGGAGGAA
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100851 CCCGCCTAGCAGAGTTGCTGTCTGGCAAGCGGCTGAGTGTGCTGGAGGAA
900 . : . : . : . : . :
901 GAGGCCACGGAGGGTGGCACCAGCCGCGTAGAGGCCGGCAGCTCCACCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 GAGGCCACGGAGGGTGGCACCAGCCGCGTAGAGGCCGGCAGCTCCACCTC
950 . : . : . : . : . :
951 GGGCAGTGACATCATTGACCTGGCCGGAGACACCGTGCGTTACACGCCCG
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100951 GGGCAGTGACATCATTGACCTGGCCGGAGACACCGTGCGTTACACGCCCG
1000 . : . : . : . : . :
1001 CCAGCCCCTCCAGCCCCGACTTCACCACCTGGTCATGTGCCAAGTGCACG
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101001 CCAGCCCCTCCAGCCCCGACTTCACCACCTGGTCATGTGCCAAGTGCACG
1050 . : . : . : . : . :
1051 CTCAGAAACCCCACAGTGGCCCCCAGGTGCTCGGCCTGCGGCTGCTCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 CTCAGAAACCCCACAGTGGCCCCCAGGTGCTCGGCCTGCGGCTGCTCCAA
1100 . : . : . : . : . :
1101 ACTGCACGGCTTCCAGGAGCATGGCGAGCCCCCCACCCACTGCCCCGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 ACTGCACGGCTTCCAGGAGCATGGCGAGCCCCCCACCCACTGCCCCGACT
1150 . : . : . : . : . :
1151 GTGGGGCCGACAAGCCCAGCCCCTGCGGCAGAAGCTGCGGACGGGTGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 GTGGGGCCGACAAGCCCAGCCCCTGCGGCAGAAGCTGCGGACGGGTGTCC
1200 . : . : . : . : . :
1201 TCGGCCCAGAAGGCCGCCCGCGTCCTGCCCGAGCGCCCGGGCCAGTGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 TCGGCCCAGAAGGCCGCCCGCGTCCTGCCCGAGCGCCCGGGCCAGTGGGC
1250 . : . : . : . : . :
1251 CTGCCCTGCCTGTACCCTGCTCAACGCACTGCGGGCCAAGCACTGCGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 CTGCCCTGCCTGTACCCTGCTCAACGCACTGCGGGCCAAGCACTGCGCCG
1300 . : . : . : . : . :
1301 CCTGCCACACGCCTCAGCTCCTGGTGGCCCAGCGGCGGGGGGCCGCGCCC
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101301 CCTGCCACACGCCTCAGCTCCTGGTGGCCCAGCGGCGGGGGGCCGCGCCC
1350 . : . : . : . : . :
1351 CTGAGGCGCAGGGAGAGCATGCACGTGGAGCAGCGGCGGCAGACAGACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 CTGAGGCGCAGGGAGAGCATGCACGTGGAGCAGCGGCGGCAGACAGACGA
1400 . : . : . : . : . :
1401 GGGCGAGGCCAAGGCACTCTGGGAGAACATCGTGGCCTTCTGCCGGGAG
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101401 GGGCGAGGCCAAGGCACTCTGGGAGAACATCGTGGCCTTCTGCCGGGAGG
1450 . : . : . : . : . :
1450 AACAATGTGAGCTTCGTGGATGACAGCTTCCCTCCCGGGCCC
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101451 TG...CAGAACAATGTGAGCTTCGTGGATGACAGCTTCCCTCCCGGGCCC
1500 . : . : . : . : . :
1492 GAGTCTGTCGGCTTCCCCGCGGGTGACAGCGTGCAGCAGCGTGTGAGGCA
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102197 GAGTCTGTCGGCTTCCCCGCGGGTGACAGCGTGCAGCAGCGTGTGAGGCA
1550 . : . : . : . : . :
1542 GTGGCTGCGACCCCAGGAGATCAACTGCTCCGTCTTCAGGGACCACAGGG
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102247 GTGGCTGCGACCCCAGGAGATCAACTGCTCCGTCTTCAGGGACCACAGGG
1600 . : . : . : . : . :
1592 CCACGTGGTCTGTGTTCCACACACTGCGGCCCTCAGACATCCTGCAGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102297 CCACGTGGTCTGTGTTCCACACACTGCGGCCCTCAGACATCCTGCAGGGG
1650 . : . : . : . : . :
1642 CTGCTGGGGAACTGCTG GTTCCTGAGCGCCCTGGCGGTGCT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
102347 CTGCTGGGGAACTGCTGGTG...CAGGTTCCTGAGCGCCCTGGCGGTGCT
1700 . : . : . : . : . :
1683 GGCGGAGCGGCCGGACCTGGTGGAGCGGGTGATGGTCACGCGCAGCCTGT
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102474 GGCGGAGCGGCCGGACCTGGTGGAGCGGGTGATGGTCACGCGCAGCCTGT
1750 . : . : . : . : . :
1733 GTGCAGAGGGCGCCTACCAGGTGCGGCTGTGCAAGGACGGCACGTGGACC
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102524 GTGCAGAGGGCGCCTACCAGGTGCGGCTGTGCAAGGACGGCACGTGGACC
1800 . : . : . : . : . :
1783 ACGGTGCTGGTGGACGACATGCTGCCCTGTGATGAGGCCGGCTGCCTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102574 ACGGTGCTGGTGGACGACATGCTGCCCTGTGATGAGGCCGGCTGCCTCCT
1850 . : . : . : . : . :
1833 CTTCTCACAG GCGCAGCGGAAGCAGCTGTGGGTGGCCCTCA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
102624 CTTCTCACAGGTG...CAGGCGCAGCGGAAGCAGCTGTGGGTGGCCCTCA
1900 . : . : . : . : . :
1874 TCGAGAAGGCGCTGGCCAAGCTGCACGGCTCCTACTTTGCGCTCCAGGCG
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102808 TCGAGAAGGCGCTGGCCAAGCTGCACGGCTCCTACTTTGCGCTCCAGGCG
1950 . : . : . : . : . :
1924 GGCCGCGCCATCGAAGGCCTGGCCACGCTCACCGGCGCCCCCTGTGAGAG
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102858 GGCCGCGCCATCGAAGGCCTGGCCACGCTCACCGGCGCCCCCTGTGAGAG
2000 . : . : . : . : . :
1974 CCTGGCGCTGCAGCTCAGCTCCACTAACCCCCGCGAGGAGCCCGTTGACA
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102908 CCTGGCGCTGCAGCTCAGCTCCACTAACCCCCGCGAGGAGCCCGTTGACA
2050 . : . : . : . : . :
2024 CTGACCTCATCTGGGCCAAAATGCTGAGTTCTAAGGAGGCTGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
102958 CTGACCTCATCTGGGCCAAAATGCTGAGTTCTAAGGAGGCTGGGTA...C
2100 . : . : . : . : . :
2067 GTTCCTCATGGGTGCCTCCTGTGGCGGGGGCAACATGAAGGTGGACGA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104462 AGGTTCCTCATGGGTGCCTCCTGTGGCGGGGGCAACATGAAGGTGGACGA
2150 . : . : . : . : . :
2115 TTCGGCCTACGAGAGCCTGGGCCTGCGCCCCCGGCATGCCTACTCCATCC
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104512 TTCGGCCTACGAGAGCCTGGGCCTGCGCCCCCGGCATGCCTACTCCATCC
2200 . : . : . : . : . :
2165 TGGATGTCCGAGATGTCCAGGGCACCAG GCTTCTGCGGCTC
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
104562 TGGATGTCCGAGATGTCCAGGGCACCAGGTA...CAGGCTTCTGCGGCTC
2250 . : . : . : . : . :
2206 CGAAACCCGTGGGGCCGTTTCTCCTGGAACGGCAGCTGGTCCGACGAGTG
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104687 CGAAACCCGTGGGGCCGTTTCTCCTGGAACGGCAGCTGGTCCGACGAGTG
2300 . : . : . : . : . :
2256 GCCACACTGGCCGGGGCACCTGCGTGGCGAGCTCATGCCGCACGGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104737 GCCACACTGGCCGGGGCACCTGCGTGGCGAGCTCATGCCGCACGGCAGCA
2350 . : . : . : . : . :
2306 GTGAGGGCGTCTTCTGGATGGAGTACGGCGACTTTGTCAG G
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104787 GTGAGGGTGTCTTCTGGATGGAGTACGGCGACTTTGTCAGGTA...CAGG
2400 . : . : . : . : . :
2347 TACTTCGACTCCGTGGACATCTGTAAGGTGCACTCGGACTGGCAGGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105214 TACTTCGACTCCGTGGACATCTGTAAGGTGCACTCGGACTGGCAGGAGGC
2450 . : . : . : . : . :
2397 GCGGGTGCAGGGCTGCTTTCCCAGCTCGGCCAGCGCGCCCGTGGGGGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105264 GCGGGTGCAGGGCTGCTTTCCCAGCTCGGCCAGCGCGCCCGTGGGGGTAA
2500 . : . : . : . : . :
2447 CAGCGCTCACGGTGCTGGAGCGGGCCTCGCTGGAGTTCGCGCTCTTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105314 CAGCGCTCACGGTGCTGGAGCGGGCCTCGCTGGAGTTCGCGCTCTTCCAG
2550 . : . : . : . : . :
2497 GAGGGCAGCAG GCGCTCGGACGCCGTGGACAGCCACCTGCT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
105364 GAGGGCAGCAGGTG...CAGGCGCTCGGACGCCGTGGACAGCCACCTGCT
2600 . : . : . : . : . :
2538 GGACCTGTGCATCCTGGTGTTCCGGGCCACGTTCGGCAGCGGCGGCCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105493 GGACCTGTGCATCCTGGTGTTCCGGGCCACGTTCGGCAGCGGCGGCCACC
2650 . : . : . : . : . :
2588 TCAGCCTGGGCCGCCTCCTGGCCCACAGTAAGCGCGCGGTCAAGAAGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105543 TCAGCCTGGGCCGCCTCCTGGCCCACAGTAAGCGCGCGGTCAAGAAGTTC
2700 . : . : . : . : . :
2638 GTCAGCTGCGACGTCATGCTGGAGCCTGGCGAGTACGCTGTGGTGTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105593 GTCAGCTGCGACGTCATGCTGGAGCCTGGCGAGTACGCTGTGGTGTGCTG
2750 . : . : . : . : . :
2688 CGCCTTCAACCACTGGGGGCCGCCCCTGCCGGGCACCCCTGCCCCCCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105643 CGCCTTCAACCACTGGGGGCCGCCCCTGCCGGGCACCCCTGCCCCCCAGG
2800 . : . : . : . : . :
2738 CCTCCAGCCCCTCGGCAGGGGTCCCGAGAGCCTCCCCAGAG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105693 GTA...TAGCCTCCAGCCCCTCGGCAGGGGTCCCGAGAGCCTCCCCAGAG
2850 . : . : . : . : . :
2779 CCGCCGGGCCACGTGCTGGCTGTGTACAGCTCGAGGCTGGTCATGGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105808 CCGCCGGGCCACGTGCTGGCTGTGTACAGCTCGAGGCTGGTCATGGTGGA
2900 . : . : . : . : . :
2829 GCCCGTGGAAGCCCAGCCGACCACGCTGGCCGACGCCATCATCCTGCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105858 GCCCGTGGAAGCCCAGCCGACCACGCTGGCCGACGCCATCATCCTGCTCA
2950 . : . : . : . : . :
2879 CCGAGAGCCGCGGAGAGCGGCACGAG GGCCGTGAGGGCATG
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
105908 CCGAGAGCCGCGGAGAGCGGCACGAGGTG...CAGGGCCGTGAGGGCATG
3000 . : . : . : . : . :
2920 ACCTGCTACTACCTGACACACGGTTGGGCGGGGCTCATCGTGGTGGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106040 ACCTGCTACTACCTGACACACGGTTGGGCGGGGCTCATCGTGGTGGTGGA
3050 . : . : . : . : . :
2970 GAACCGACACCCCAAGGCCTACCTGCACGTGCAGTGTGACTGCACCGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106090 GAACCGACACCCCAAGGCCTACCTGCACGTGCAGTGTGACTGCACCGACA
3100 . : . : . : . : . :
3020 GCTTCAACGTGGTGTCCACACGCGGCAGCCTGCGTACCCAGGATAGCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106140 GCTTCAACGTGGTGTCCACACGCGGCAGCCTGCGTACCCAGGATAGCGTG
3150 . : . : . : . : . :
3070 CCACCCCTGCACAG GCAGGTCCTGGTGATCTTGTCCCAGCT
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
106190 CCACCCCTGCACAGGTG...CAGGCAGGTCCTGGTGATCTTGTCCCAGCT
3200 . : . : . : . : . :
3111 AGAGGGCAACGCCGGCTTCTCTATCACCCACCGCCTGGCACATCGCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106528 AGAGGGCAACGCCGGCTTCTCTATCACCCACCGCCTGGCACATCGCAAGG
3250 . : . : . : . : . :
3161 CAGCCCAGGCCTTCCTCAGTGACTGGACAGCCTCCAAGGGGACCCACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106578 CAGCCCAGGCCTTCCTCAGTGACTGGACAGCCTCCAAGGGGACCCACAGC
3300 . : . : . : . : .
3211 CCCCCGCTCACGCCAGAGGTCGCCGGTCTGCATGGGCCCCGACCGCTG
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106628 CCCCCACTCACGCCAGAGGTCGCCGGTCTGCATGGGCCCCGACCGCTG