Result of SIM4 for
pF1KSDA1994
seq1 = pF1KSDA1994.tfa, 3219 bp
seq2 = pF1KSDA1994/gi568815585r_44334709.tfa (gi568815585r:44334709_44676074), 341366 bp
>pF1KSDA1994 3219
>gi568815585r:44334709_44676074 (Chr13)
(complement)
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2913-2964 (239980-240031) 100% ->
2965-3219 (241192-241446) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCACCAGCCGCCTGAGTCCACCGCCGCGGCCGCCGCCGCTGCAGACAT
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100001 ATGCACCAGCCGCCTGAGTCCACCGCCGCGGCCGCCGCCGCTGCAGACAT
50 . : . : . : . : . :
51 TAGCGCTAGGAAGATGGCGCACCCGGCAATGTTCCCTCGAAGGGGCAGCG
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100051 TAGCGCTAGGAAGATGGCGCACCCGGCAATGTTCCCTCGAAGGGGCAGCG
100 . : . : . : . : . :
101 GTAGTGGCAGCGCCTCTGCTCTCAATGCAGCAGGTACCGGCGTCGGTAGT
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100101 GTAGTGGCAGCGCCTCTGCTCTCAATGCAGCAGGTACCGGCGTCGGTAGT
150 . : . : . : . : . :
151 AATGCCACATCTTCCGAGGATTTTCCGCCTCCGTCGCTGCTTCAGCCGCC
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100151 AATGCCACATCTTCCGAGGATTTTCCGCCTCCGTCGCTGCTTCAGCCGCC
200 . : . : . : . : . :
201 GCCCCCTGCAGCATCTTCTACGTCGGGACCACAGCCTCCGCCTCCACAAA
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100201 GCCCCCTGCAGCATCTTCTACGTCGGGACCACAGCCTCCGCCTCCACAAA
250 . : . : . : . : . :
251 GCCTGAACCTCCTTTCGCAGGCTCAGCTGCAGGCACAGCCTCTTGCGCCA
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100251 GCCTGAACCTCCTTTCGCAGGCTCAGCTGCAGGCACAGCCTCTTGCGCCA
300 . : . : . : . : . :
301 GGCGGAACTCAAATGAAAAAGAAAAGTGGCTTCCAGATAACTAGCGTTAC
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100301 GGCGGAACTCAAATGAAAAAGAAAAGTGGCTTCCAGATAACTAGCGTTAC
350 . : . : . : . : . :
351 TCCTGCTCAGATCTCCGCTAGTATCAGCTCTAACAACAGTATAGCAGAGG
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100351 TCCTGCTCAGATCTCCGCTAGTATCAGCTCTAACAACAGTATAGCAGAGG
400 . : . : . : . : . :
401 ACACTGAGAGCTATGATGATCTGGATGAATCTCACACGGAAGATCTCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 ACACTGAGAGCTATGATGATCTGGATGAATCTCACACGGAAGATCTCTCT
450 . : . : . : . : . :
451 TCTTCGGAGATCCTTGATGTGTCACTTTCCAGGGCTACTGACTTAGGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 TCTTCGGAGATCCTTGATGTGTCACTTTCCAGGGCTACTGACTTAGGGGA
500 . : . : . : . : . :
501 GCCCGAACGCAGCTCCTCAGAAGAGACCCTAAATAACTTCCAGGAAGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 GCCCGAACGCAGCTCCTCAGAAGAGACCCTAAATAACTTCCAGGAAGCCG
550 . : . : . : . : . :
551 AGACACCTGGGGCAGTCTCTCCCAACCAGCCCCACCTTCCTCAGCCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 AGACACCTGGGGCAGTCTCTCCCAACCAGCCCCACCTTCCTCAGCCTCAT
600 . : . : . : . : . :
601 TTGCCTCACCTTCCACAACAGAATGTTGTGATCAATGGGAATGCTCATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 TTGCCTCACCTTCCACAACAGAATGTTGTGATCAATGGGAATGCTCATCC
650 . : . : . : . : . :
651 ACACCACCTCCATCACCACCATCAGATTCATCATGGGCACCACCTCCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 ACACCACCTCCATCACCACCATCAGATTCATCATGGGCACCACCTCCAAC
700 . : . : . : . : . :
701 ATGGTCACCACCATCCATCTCATGTTGCTGTGGCCAGTGCATCCATTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 ATGGTCACCACCATCCATCTCATGTTGCTGTGGCCAGTGCATCCATTACT
750 . : . : . : . : . :
751 GGTGGGCCACCCTCAAGCCCAGTATCTAGAAAACTCTCTACAACTGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 GGTGGGCCACCCTCAAGCCCAGTATCTAGAAAACTCTCTACAACTGGAAG
800 . : . : . : . : . :
801 CTCTGACAGTATCACACCAGTTGCACCAACTTCTGCTGTATCATCCAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 CTCTGACAGTATCACACCAGTTGCACCAACTTCTGCTGTATCATCCAGTG
850 . : . : . : . : . :
851 GTTCACCTGCATCTGTAATGACTAATATGCGTGCTCCAAGTACTACAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 GTTCACCTGCATCTGTAATGACTAATATGCGTGCTCCAAGTACTACAGGT
900 . : . : . : . : . :
901 GGAATAGGTATAAATTCTGTTACTGGCACTAGTACAGTAAATAATGTTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 GGAATAGGTATAAATTCTGTTACTGGCACTAGTACAGTAAATAATGTTAA
950 . : . : . : . : . :
951 CATTACTGCTGTGGGTAGTTTTAATCCTAATGTGACAAGCAGCATCCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
100951 CATTACTGCTGTGGGTAGTTTTAATCCTAATGTGACAAGCAGCATGCTTG
1000 . : . : . : . : . :
1001 GTAATGTTAATATAAGTACAAGCAATATTCCTAGTGCTGCTGGTGTGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 GTAATGTTAATATAAGTACAAGCAATATTCCTAGTGCTGCTGGTGTGAGT
1050 . : . : . : . : . :
1051 GTTGGGCCTGGAGTTACCAGTGGTGTTAATGTGAATATCTTGAGTGGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 GTTGGGCCTGGAGTTACCAGTGGTGTTAATGTGAATATCTTGAGTGGCAT
1100 . : . : . : . : . :
1101 GGGCAATGGTACTATTTCTTCCTCTGCTGCTGTTAGCAGTGTTCCTAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 GGGCAATGGTACTATTTCTTCCTCTGCTGCTGTTAGCAGTGTTCCTAATG
1150 . : . : . : . : . :
1151 CAGCTGCAGGGATGACTGGGGGATCGGTTTCAAGTCAGCAGCAACAACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 CAGCTGCAGGGATGACTGGGGGATCGGTTTCAAGTCAGCAGCAACAACCA
1200 . : . : . : . : . :
1201 ACAGTTAACACTTCGAGGTTCAGAGTTGTGAAGTTAGATTCTAGTTCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 ACAGTTAACACTTCGAGGTTCAGAGTTGTGAAGTTAGATTCTAGTTCTGA
1250 . : . : . : . : . :
1251 GCCCTTTAAAAAAGGTAGATGGACTTGCACTGAGTTCTATGAAAAAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 GCCCTTTAAAAAAGGTAGATGGACTTGCACTGAGTTCTATGAAAAAGAAA
1300 . : . : . : . : . :
1301 ATGCTGTACCTGCTACAGAAGGTGTGCTGATAAATAAAGTGGTGGAGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101301 ATGCTGTACCTGCTACAGAAGGTGTGCTGATAAATAAAGTGGTGGAGACT
1350 . : . : . : . : . :
1351 GTAAAGCAAAATCCGATAGAAGTGACTTCTGAAAGGGAGAGCACTAGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 GTAAAGCAAAATCCGATAGAAGTGACTTCTGAAAGGGAGAGCACTAGTGG
1400 . : . : . : . : . :
1401 GAGTTCAGTGAGCAGTAGTGTCAGCACACTGAGTCACTATACAGAGAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101401 GAGTTCAGTGAGCAGTAGTGTCAGCACACTGAGTCACTATACAGAGAGTG
1450 . : . : . : . : . :
1451 TGGGAAGTGGAGAGATGGGAGCCCCTACTGTGGTGGTGCAGCAGCAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101451 TGGGAAGTGGAGAGATGGGAGCCCCTACTGTGGTGGTGCAGCAGCAGCAG
1500 . : . : . : . : . :
1501 CAGCAACAACAACAACAACAGCAACAACCAGCTCTCCAAGGTGTGACCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101501 CAGCAACAACAACAACAACAGCAACAACCAGCTCTCCAAGGTGTGACCCT
1550 . : . : . : . : . :
1551 CCAACAGATGGATTTTGGTAGCACTGGTCCACAGAGTATTCCAGCAGTTA
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101551 CCAACAGATGGATTTTGGTAGCACTGGTCCACAGAGTATTCCAGCAGTTA
1600 . : . : . : . : . :
1601 GTATACCACAGAGTATTTCTCAGTCACAGATCTCACAAGTACAATTACAG
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101601 GTATACCACAGAGTATTTCTCAGTCACAGATCTCACAAGTACAATTACAG
1650 . : . : . : . : . :
1651 TCTCAAGAACTGAGCTATCAGCAAAAGCAAGGTCTTCAGCCAGTACCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101651 TCTCAAGAACTGAGCTATCAGCAAAAGCAAGGTCTTCAGCCAGTACCTCT
1700 . : . : . : . : . :
1701 GCAAGCCACTATGAGTGCTGCAACTGGTATCCAGCCATCGCCTGTAAATG
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101701 GCAAGCCACTATGAGTGCTGCAACTGGTATCCAGCCATCGCCTGTAAATG
1750 . : . : . : . : . :
1751 TGGTTGGTGTAACTTCAGCTTTAGGTCAGCAGCCTTCCATTTCCAGTTTG
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101751 TGGTTGGTGTAACTTCAGCTTTAGGTCAGCAGCCTTCCATTTCCAGTTTG
1800 . : . : . : . : . :
1801 GCTCAACCCCAGCTACCATATTCTCAGGCGGCTCCTCCAGTGCAAACTCC
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101801 GCTCAACCCCAGCTACCATATTCTCAGGCGGCTCCTCCAGTGCAAACTCC
1850 . : . : . : . : . :
1851 CCTTCCAGGGGCACCACCACCCCAACAGTTACAGTATGGACAACAGCAAC
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101851 CCTTCCAGGGGCACCACCACCCCAACAGTTACAGTATGGACAACAGCAAC
1900 . : . : . : . : . :
1901 CAATGGTTTCTACACAGATGGCCCCAGGCCATGTCAAATCAGTGACTCAA
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101901 CAATGGTTTCTACACAGATGGCCCCAGGCCATGTCAAATCAGTGACTCAA
1950 . : . : . : . : . :
1951 AATCCTGCTTCAGAGTATGTACAACAGCAGCCAATTCTTCAAACAGCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101951 AATCCTGCTTCAGAGTATGTACAACAGCAGCCAATTCTTCAAACAGCAAT
2000 . : . : . : . : . :
2001 GTCCTCCGGACAGCCCAGTTCTGCAGGAGTAGGAGCAGGAACAACAGTGA
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102001 GTCCTCCGGACAGCCCAGTTCTGCAGGAGTAGGAGCAGGAACAACAGTGA
2050 . : . : . : . : . :
2051 TTCCTGTGGCTCAGCCACAGGGTATCCAGCTGCCAGTGCAGCCCACAGCA
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102051 TTCCTGTGGCTCAGCCACAGGGTATCCAGCTGCCAGTGCAGCCCACAGCA
2100 . : . : . : . : . :
2101 GTCCCAGCACAACCTGCAGGGGCATCTGTCCAGCCTGTTGGCCAGGCTCC
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102101 GTCCCAGCACAACCTGCAGGGGCATCTGTCCAGCCTGTTGGCCAGGCTCC
2150 . : . : . : . : . :
2151 GGCAGCAGTGTCTGCTGTACCTACTGGCAGTCAGATTGCAAATATTGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102151 GGCAGCAGTGTCTGCTGTACCTACTGGCAGTCAGATTGCAAATATTGGTC
2200 . : . : . : . : . :
2201 AGCAAGCAAACATACCTACTGCAGTGCAGCAGCCCTCTACCCAGGTTCCA
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102201 AGCAAGCAAACATACCTACTGCAGTGCAGCAGCCCTCTACCCAGGTTCCA
2250 . : . : . : . : . :
2251 CCTTCAGTTATTCAGCAGGGTGCTCCTCCATCTTCGCAAGTGGTTCCACC
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102251 CCTTCAGTTATTCAGCAGGGTGCTCCTCCATCTTCGCAAGTGGTTCCACC
2300 . : . : . : . : . :
2301 TGCTCAAACTGGGATTATTCATCAGGGAGTTCAAACTAGTGCTCCAAGCC
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102301 TGCTCAAACTGGGATTATTCATCAGGGAGTTCAAACTAGTGCTCCAAGCC
2350 . : . : . : . : . :
2351 TTCCTCAACAATTGGTTATTGCATCCCAAAGTTCCTTGTTAACTGTGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102351 TTCCTCAACAATTGGTTATTGCATCCCAAAGTTCCTTGTTAACTGTGCCT
2400 . : . : . : . : . :
2401 CCCCAGCCACAAGGAGTAGAACCAGTAGCTCAAGGAATTGTTTCACAGCA
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102401 CCCCAGCCACAAGGAGTAGAACCAGTAGCTCAAGGAATTGTTTCACAGCA
2450 . : . : . : . : . :
2451 GTTGCCTGCAGTTAGTTCTTTGCCCTCTGCTAGTAGTATTTCTGTTACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102451 GTTGCCTGCAGTTAGTTCTTTGCCCTCTGCTAGTAGTATTTCTGTTACAA
2500 . : . : . : . : . :
2501 GTCAGGTTAGTTCAACTGGTCCTTCTGGAATGCCTTCTGCCCCAACAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102501 GTCAGGTTAGTTCAACTGGTCCTTCTGGAATGCCTTCTGCCCCAACAAAC
2550 . : . : . : . : . :
2551 TTGGTTCCACCACAAAATATAGCACAAACCCCTGCTACCCAAAATGGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102551 TTGGTTCCACCACAAAATATAGCACAAACCCCTGCTACCCAAAATGGTAA
2600 . : . : . : . : . :
2601 TTTGGTTCAAAGTGTTAGTCAACCTCCCTTGATAGCAACTAATACAAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102601 TTTGGTTCAAAGTGTTAGTCAACCTCCCTTGATAGCAACTAATACAAATT
2650 . : . : . : . : . :
2651 TGCCTTTGGCACAACAGATACCACTAAGTTCTACCCAGTTCTCCGCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102651 TGCCTTTGGCACAACAGATACCACTAAGTTCTACCCAGTTCTCCGCACAA
2700 . : . : . : . : . :
2701 TCATTAGCTCAGGCAATTGGAAGCCAAATTGAAGATGCCAGGCGTGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102701 TCATTAGCTCAGGCAATTGGAAGCCAAATTGAAGATGCCAGGCGTGCAGC
2750 . : . : . : . : . :
2751 GGAGCCCTCCTTAGTTGGCTTACCTCAGACTATCAGTGGTGACAGTGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102751 GGAGCCCTCCTTAGTTGGCTTACCTCAGACTATCAGTGGTGACAGTGGGG
2800 . : . : . : . : . :
2801 GAATGTCAGCAGTTTCAGATGGGAGTAGCAGCAGCCTAGCAGCCTCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102801 GAATGTCAGCAGTTTCAGATGGGAGTAGCAGCAGCCTAGCAGCCTCTGCT
2850 . : . : . : . : . :
2851 TCTCTTTTCCCGTTGAAGGTGCTACCGCTGACGACACCCCTGGTGGATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102851 TCTCTTTTCCCGTTGAAGGTGCTACCGCTGACGACACCCCTGGTGGATGG
2900 . : . : . : . : . :
2901 CGAGGATGAGAG CTCCTCTGGTGCAAGTGTGGTAGCTATTG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
102901 CGAGGATGAGAGGTA...CAGCTCCTCTGGTGCAAGTGTGGTAGCTATTG
2950 . : . : . : . : . :
2942 ACAACAAAATCGAGCAAGCTATG GATCTAGTGAAAAGCCAT
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
240009 ACAACAAAATCGAGCAAGCTATGGTA...CAGGATCTAGTGAAAAGCCAT
3000 . : . : . : . : . :
2983 TTGATGTATGCGGTCAGAGAAGAAGTGGAGGTCCTCAAAGAGCAAATCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241210 TTGATGTATGCGGTCAGAGAAGAAGTGGAGGTCCTCAAAGAGCAAATCAA
3050 . : . : . : . : . :
3033 AGAACTAATAGAGAAAAATTCCCAGCTGGAGCAGGAGAACAATCTGCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241260 AGAACTAATAGAGAAAAATTCCCAGCTGGAGCAGGAGAACAATCTGCTGA
3100 . : . : . : . : . :
3083 AGACACTGGCCAGTCCTGAGCAGCTTGCCCAGTTTCAGGCCCAGCTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241310 AGACACTGGCCAGTCCTGAGCAGCTTGCCCAGTTTCAGGCCCAGCTGCAG
3150 . : . : . : . : . :
3133 ACTGGCTCCCCCCCTGCCACCACCCAGCCACAGGGCACCACACAGCCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241360 ACTGGCTCCCCCCCTGCCACCACCCAGCCACAGGGCACCACACAGCCCCC
3200 . : . : . : .
3183 CGCCCAGCCAGCATCGCAGGGCTCAGGACCAACCGCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241410 CGCCCAGCCAGCATCGCAGGGCTCAGGACCAACCGCA