seq1 = pF1KSDA1963.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KSDA1963/gi568815592r_70761666.tfa (gi568815592r:70761666_71056429), 294764 bp

>pF1KSDA1963 969
>gi568815592r:70761666_71056429 (Chr6)

(complement)

1-591  (100001-100591)   100% ->
592-736  (162158-162302)   100% ->
737-885  (194452-194600)   100% ->
886-969  (194681-194764)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTCCGCGCTTTTCACCCGCTTCTTTATCCTCCTGCCCTGGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTCCGCGCTTTTCACCCGCTTCTTTATCCTCCTGCCCTGGATCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATTGTCATCATCATGCTCGACGTGGACACGCGCAGGCCAGTGCCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATTGTCATCATCATGCTCGACGTGGACACGCGCAGGCCAGTGCCCCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCCCGCGCCCCTACTTCTCTCCCTACGCGGTGGGCCGCGGGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACCCCGCGCCCCTACTTCTCTCCCTACGCGGTGGGCCGCGGGGGCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGACTCCCGCTCCGCAGGGGCGGCCCGGCTCACGGGACCCAAAAGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGACTCCCGCTCCGCAGGGGCGGCCCGGCTCACGGGACCCAAAAGCGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGTCTCGGCCGCAGCCACAGCCGGAGCCGCAGCTGCCCACCATCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGTCTCGGCCGCAGCCACAGCCGGAGCCGCAGCTGCCCACCATCTATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCATCACGCCCACCTACAGCCGCCCGGTGCAGAAAGCGGAGCTGACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCATCACGCCCACCTACAGCCGCCCGGTGCAGAAAGCGGAGCTGACCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGCCAACACGTTCCGCCAGGTGGCGCAGCTGCACTGGATCCTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGCCAACACGTTCCGCCAGGTGGCGCAGCTGCACTGGATCCTGGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGACGCGGCGGCGCGCAGCGAGCTGGTGAGCCGCTTCCTGGCGCGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGACGCGGCGGCGCGCAGCGAGCTGGTGAGCCGCTTCCTGGCGCGGGCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCTGCCCAGCACTCACCTGCACGTGCCCACGCCGCGGCGCTACAAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCTGCCCAGCACTCACCTGCACGTGCCCACGCCGCGGCGCTACAAGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCGGGCTGCCGCGCGCCACTGAGCAGCGCAACGCGGGCCTCGCCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCGGGCTGCCGCGCGCCACTGAGCAGCGCAACGCGGGCCTCGCCTGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCGCCAGAGGCACCAGCACCAGCGCGCGCAGCCCGGCGTGCTCTTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCGCCAGAGGCACCAGCACCAGCGCGCGCAGCCCGGCGTGCTCTTCTTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGACGACGACAACACCTATAGTCTGGAGCTCTTCCAGGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100551 CTGACGACGACAACACCTATAGTCTGGAGCTCTTCCAGGAGGTA...TAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATGCGAACCACCCGCAAGGTCTCCGTCTGGCCTGTGGGCCTGGTTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162158 ATGCGAACCACCCGCAAGGTCTCCGTCTGGCCTGTGGGCCTGGTTGGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCGGCGCTACGAACGTCCGCTGGTGGAAAACGGCAAAGTTGTTGGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162208 GCGGCGCTACGAACGTCCGCTGGTGGAAAACGGCAAAGTTGTTGGCTGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACACCGGCTGGAGAGCAGACAGGCCTTTTGCCATCGACATGGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 162258 ACACCGGCTGGAGAGCAGACAGGCCTTTTGCCATCGACATGGCAGGTG..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    737     GATTTGCTGTAAGTCTTCAAGTCATTTTGTCCAATCCAAAAGCTGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162308 .AAGGATTTGCTGTAAGTCTTCAAGTCATTTTGTCCAATCCAAAAGCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 ATTTAAGCGTCGTGGATCCCAGCCAGGGATGCAAGAATCTGACTTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194498 ATTTAAGCGTCGTGGATCCCAGCCAGGGATGCAAGAATCTGACTTTCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AACAGATAACAACAGTCGAAGAACTGGAACCGAAAGCAAATAACTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194548 AACAGATAACAACAGTCGAAGAACTGGAACCGAAAGCAAATAACTGCACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AAG         GTTCTCGTGTGGCACACTCGGACAGAGAAGGTTAATCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194598 AAGGTA...CAGGTTCTCGTGTGGCACACTCGGACAGAGAAGGTTAATCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    924 AGCCAACGAGCCAAAGTACCACCTGGACACAGTGAAAATTGAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194719 AGCCAACGAGCCAAAGTACCACCTGGACACAGTGAAAATTGAGGTA