seq1 = pF1KSDA1950.tfa, 1494 bp
seq2 = pF1KSDA1950/gi568815591f_2600452.tfa (gi568815591f:2600452_2812875), 212424 bp

>pF1KSDA1950 1494
>gi568815591f:2600452_2812875 (Chr7)

1-304  (100001-100304)   100% ->
305-472  (102271-102438)   100% ->
473-601  (108137-108265)   100% ->
602-771  (108624-108793)   100% ->
772-948  (109189-109365)   100% ->
949-1494  (111879-112424)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCAGTGTAGACCCGCACAGGAGTTCAGCTTCGGGCCCCGGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCAGTGTAGACCCGCACAGGAGTTCAGCTTCGGGCCCCGGGCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGGACGCTCTGGTCTCCACTGACGCAGCCCTGCAGCAGCTGTATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGGACGCTCTGGTCTCCACTGACGCAGCCCTGCAGCAGCTGTATGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGCCTTCTCCCCTGCCGAGCGGCTCTTCCTGGCCGAGGCCTACAACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGCCTTCTCCCCTGCCGAGCGGCTCTTCCTGGCCGAGGCCTACAACCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGAGGACGCTCTTCTGCACCCTGCTCATCCGCACGGGCTTCGACTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGAGGACGCTCTTCTGCACCCTGCTCATCCGCACGGGCTTCGACTGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGAGCCGACCCGAGGCTCCCGAGGACTTCCAGACCTTCCACGCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGAGCCGACCCGAGGCTCCCGAGGACTTCCAGACCTTCCACGCCTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCAGCACCGGAAGCCCCGCCTGGCTCGGAAGCACATCTACCTACAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCAGCACCGGAAGCCCCGCCTGGCTCGGAAGCACATCTACCTACAGCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATAG         ACCTGAGCGAGGAGCCGGTGGGAAGCTCCCTGCTGCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATAGGTA...CAGACCTGAGCGAGGAGCCGGTGGGAAGCTCCCTGCTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCAGCTGTGCAGCTGCACAGAGGCCTTCTTCCTGGGCCTGCGCGTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102308 CCAGCTGTGCAGCTGCACAGAGGCCTTCTTCCTGGGCCTGCGCGTCAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCCTGCCGTCGGTGGCAGCCGCGTCCATCCGCTGCTCCTCGCGGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102358 GCCTGCCGTCGGTGGCAGCCGCGTCCATCCGCTGCTCCTCGCGGCCCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGGGACTCTGACAGGCTCCAGCTCCACACAG         ACGGCATCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102408 CGGGACTCTGACAGGCTCCAGCTCCACACAGGTG...CAGACGGCATCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTCCTTCTTGAAGAACAACAAGCCAGGGGACGCGCTGTGTGTGCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108147 GTCCTTCTTGAAGAACAACAAGCCAGGGGACGCGCTGTGTGTGCTGGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCACACTGTCTGACCTGTACCCCCATGAGGCCTGGAGCTTCACCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108197 TCACACTGTCTGACCTGTACCCCCATGAGGCCTGGAGCTTCACCTTCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAGTTCCTTCCAGGGCACG         AAGTGGGCGTCTGCAGCTTCGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 108247 AAGTTCCTTCCAGGGCACGGTG...CAGAAGTGGGCGTCTGCAGCTTCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCGGTTCTCAGGGGAATTCCCGAAGTCGGGGCCCAGCGCCCCTGATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108646 CCGGTTCTCAGGGGAATTCCCGAAGTCGGGGCCCAGCGCCCCTGATCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCCTGGTAGAGGCAGCAGCAGACGGCCCCGAGGCCCCCCTGCAGGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108696 CCCTGGTAGAGGCAGCAGCAGACGGCCCCGAGGCCCCCCTGCAGGACAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGCTGGGCCCTGTGCTTCAGTGCCCTGGGGATGGTTCAGTGCTGCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 108746 GGCTGGGCCCTGTGCTTCAGTGCCCTGGGGATGGTTCAGTGCTGCAAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    772        GTCACGTGCCACGAGCTCTGCCACCTTCTGGGCCTGGGGAACT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108796 G...CAGGTCACGTGCCACGAGCTCTGCCACCTTCTGGGCCTGGGGAACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GCCGCTGGCTCCGCTGCCTCATGCAGGGTGCGCTCAGCCTGGACGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109232 GCCGCTGGCTCCGCTGCCTCATGCAGGGTGCGCTCAGCCTGGACGAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTGCGGCGGCCCCTGGACCTCTGTCCCATCTGCCTGAGGAAGCTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109282 CTGCGGCGGCCCCTGGACCTCTGTCCCATCTGCCTGAGGAAGCTGCAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGTCCTGGGTTTCAGGCTCATCGAGAGGTACCAG         AGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 109332 TGTCCTGGGTTTCAGGCTCATCGAGAGGTACCAGGTG...TAGAGACTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACACCTGGACTCAGGCGGTGGTGGGGACGTGGCCCAGCCAGGAGGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111886 ACACCTGGACTCAGGCGGTGGTGGGGACGTGGCCCAGCCAGGAGGCGGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAGCCGTCAGTGTGGGAGGACACCCCGCCTGCCAGCGCCGACTCGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111936 GAGCCGTCAGTGTGGGAGGACACCCCGCCTGCCAGCGCCGACTCGGGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GTGCTGTGAGAGTGACTCGGAGCCCGGCACCAGTGTGTCGGAGCCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111986 GTGCTGTGAGAGTGACTCGGAGCCCGGCACCAGTGTGTCGGAGCCCCTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CCCCTGATGCCGGGAGTCACACCTTCGCCTCAGGGCCAGAGGAAGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 112036 CCCCTGATGCCGGGAGTCACACCTTCGCCTCGGGGCCAGAGGAAGGGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AGCTACCTGGCAGCCTCAGAGGCTCCGCTGCCACCTGGGGGCCCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112086 AGCTACCTGGCAGCCTCAGAGGCTCCGCTGCCACCTGGGGGCCCTGCGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GGCCATCAAGGAGCATGAACGGTGGCTGGCCATGTGCATCCAGGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112136 GGCCATCAAGGAGCATGAACGGTGGCTGGCCATGTGCATCCAGGCCCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AGCGGGAAGTGGCAGAGGAGGACCTGGTGCAGGTGGACAGAGCCGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112186 AGCGGGAAGTGGCAGAGGAGGACCTGGTGCAGGTGGACAGAGCCGTGGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GCCCTCGACCGCTGGGAGATGTTCACGGGCCAGCTCCCGGCCACCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112236 GCCCTCGACCGCTGGGAGATGTTCACGGGCCAGCTCCCGGCCACCAGGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GGACCCACCCAGCAGCAGGGACAGCGTGGGGCTGCGCAAGGTGCTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112286 GGACCCACCCAGCAGCAGGGACAGCGTGGGGCTGCGCAAGGTGCTGGGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 ACAAGTTCTCCTCCCTGAGGAGGAAGCTGAGTGCCCGAAAACTCGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112336 ACAAGTTCTCCTCCCTGAGGAGGAAGCTGAGTGCCCGAAAACTCGCCAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .
   1456 GCAGAGTCGGCCCCCCGTCCCTGGGATGGGGAAGAGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112386 GCAGAGTCGGCCCCCCGTCCCTGGGATGGGGAAGAGAGT