seq1 = pF1KSDA1899.tfa, 3072 bp
seq2 = pF1KSDA1899/gi568815583r_22899823.tfa (gi568815583r:22899823_23139543), 239721 bp

>pF1KSDA1899 3072
>gi568815583r:22899823_23139543 (Chr15)

(complement)

1-146  (100001-100146)   100% ->
147-200  (102392-102445)   100% ->
201-309  (102539-102647)   100% ->
310-406  (106720-106816)   100% ->
407-486  (107515-107594)   100% ->
487-622  (108524-108659)   100% ->
623-737  (112238-112352)   100% ->
738-827  (113339-113428)   100% ->
828-921  (114714-114807)   100% ->
922-1168  (115351-115597)   100% ->
1169-1371  (117383-117585)   100% ->
1372-1487  (120210-120325)   100% ->
1488-1756  (121503-121771)   100% ->
1757-1955  (128213-128411)   100% ->
1956-2144  (129411-129599)   100% ->
2145-2327  (130663-130845)   100% ->
2328-2412  (133192-133276)   100% ->
2413-2533  (133372-133492)   100% ->
2534-2712  (133934-134112)   100% ->
2713-2838  (135317-135442)   100% ->
2839-2927  (136391-136479)   100% ->
2928-3028  (138875-138975)   100% ->
3029-3072  (139678-139721)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCGGCACGGGCCACCGTGGAGTCGGTTGGACGCGCAGCAGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCGGCACGGGCCACCGTGGAGTCGGTTGGACGCGCAGCAGGAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACGTGCGGGAGCTCGTCCGGGGTGTCGCCGGCCTCCAGGACGAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACGTGCGGGAGCTCGTCCGGGGTGTCGCCGGCCTCCAGGACGAGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCCCAACTTCCAGCTCGCCCTAAACTTCGCCTGGTCCAACTTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100101 ACCCCAACTTCCAGCTCGCCCTAAACTTCGCCTGGTCCAACTTCAGGTG.

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    147      ATTTCATCGTTTCTTGGATGTCAACAGCCACAAAATAGAAAAAAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ..TAGATTTCATCGTTTCTTGGATGTCAACAGCCACAAAATAGAAAAAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATCGAAGG         AATTTATGAAAAATTTGTCATTCATTCTGATC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102437 AATCGAAGGGTA...TAGAATTTATGAAAAATTTGTCATTCATTCTGATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAAGCAAAGCTGCTAGTTGGAAGAGATTAACGGAGGAATTTCTAAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102571 TAAGCAAAGCTGCTAGTTGGAAGAGATTAACGGAGGAATTTCTAAATGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCACTTCCCAGTATAAAGGAAATAAAG         ACAGATGCACATTA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102621 CCACTTCCCAGTATAAAGGAAATAAAGGTA...AAGACAGATGCACATTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTCCATACTGTCACTTCTTCTGTGTCTGTCAGACTCTCCTTCAAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106734 TTCCATACTGTCACTTCTTCTGTGTCTGTCAGACTCTCCTTCAAACAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTTATGTGGAGACACCAAGAAATAAAGAAGTGG         AAAAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106784 GTTATGTGGAGACACCAAGAAATAAAGAAGTGGGTA...TAGAAAAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GATGATTTCGACTGGGGAAAATACTTGATGGAAGATGAAGAAATGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107523 GATGATTTCGACTGGGGAAAATACTTGATGGAAGATGAAGAAATGGACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGTCCGTACATGGACACACCA         AATTGGTCTGAAGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 107573 TGGTCCGTACATGGACACACCAGTA...CAGAATTGGTCTGAAGAAAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AAGAGGAAAATGATCAACAGCCCTTAAGCAGAGAGGACTCTGGAATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108543 AAGAGGAAAATGATCAACAGCCCTTAAGCAGAGAGGACTCTGGAATTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTAGACAGGACACCGTTAGAAGAACAAGATCAAAACAGAAAACTGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108593 GTAGACAGGACACCGTTAGAAGAACAAGATCAAAACAGAAAACTGGATCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTGTATCAGTTGGAAAG         ATGAGCCAGATGACCGAAGCTGGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 108643 TTGTATCAGTTGGAAAGGTA...CAGATGAGCCAGATGACCGAAGCTGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGGAACATCATGTGGTCCATCAGTACTGGACAGCCAGGCCCTCCCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112262 TGGAACATCATGTGGTCCATCAGTACTGGACAGCCAGGCCCTCCCAGTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCTCATAGTTTACATTTGCACTCTAATTTAGCTGCTGTCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 112312 CCTCATAGTTTACATTTGCACTCTAATTTAGCTGCTGTCTGGTA...TAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GGACCAACACTTGTACAGCAGTGATCCATTGTATGTTCCAGATGACAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113339 GGACCAACACTTGTACAGCAGTGATCCATTGTATGTTCCAGATGACAGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTTTGGTTACTGAGACTCAGGTTATTCGGGAAACCCTATG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 113389 TTTTGGTTACTGAGACTCAGGTTATTCGGGAAACCCTATGGTA...CAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TTACTTTCAGGAGTGAAAAAGCTCTTTATATTTCAGTTGATAGATGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114715 TTACTTTCAGGAGTGAAAAAGCTCTTTATATTTCAGTTGATAGATGGGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGTAACTGTGAGAAACAATATTATAGTAACTCATTTAACACAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 114765 GGTAACTGTGAGAAACAATATTATAGTAACTCATTTAACACATGTA...T

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    922   AGCTGTTTACGATCTGTGCTGGAACAAATAGCAGCATATGGCCAGGTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115349 AGAGCTGTTTACGATCTGTGCTGGAACAAATAGCAGCATATGGCCAGGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GTGTTTCGACTCCAGGAGTTCATTGATGAAGTCATGGGACACAGTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115399 GTGTTTCGACTCCAGGAGTTCATTGATGAAGTCATGGGACACAGTTCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GAGCATGCTGCCTGGAAGTGGGTCTGTTCCTAAGAAGTCAACTGAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115449 GAGCATGCTGCCTGGAAGTGGGTCTGTTCCTAAGAAGTCAACTGAAGCTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CCTTTAGAACCTACCAGGCTTTCATGTGGGCCCTGTACAAATATTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115499 CCTTTAGAACCTACCAGGCTTTCATGTGGGCCCTGTACAAATATTTCATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AGTTTCAAAGAGGAACTTGCAGAAATTGAGAAGTGCATCATCAATAATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 115549 AGTTTCAAAGAGGAACTTGCAGAAATTGAGAAGTGCATCATCAATAATGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1169         ATACTACAATAACTCTTGCAATAGTGGTGGACAAGTTGGCAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115599 TA...CAGATACTACAATAACTCTTGCAATAGTGGTGGACAAGTTGGCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CTCGATTGTCTCAGCTCAAGGTTCTGCACAAAGTGTTTAGTACTGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117425 CTCGATTGTCTCAGCTCAAGGTTCTGCACAAAGTGTTTAGTACTGGAGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GCAGAAGTTCCACCTGATACTCGAAATGTCGTCCGGGCCTCTCACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117475 GCAGAAGTTCCACCTGATACTCGAAATGTCGTCCGGGCCTCTCACCTGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TAACACCCTGTACAAGGCCATTCTTGAATATGACAATGTTGGAGAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117525 TAACACCCTGTACAAGGCCATTCTTGAATATGACAATGTTGGAGAAGCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CTGAGCAAACC         GTCTCCCTCCTTTTCTCTCTCTGGGTGGAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 117575 CTGAGCAAACCGTA...CAGGTCTCCCTCCTTTTCTCTCTCTGGGTGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ACGGTGCGGCCTTACCTGCAGACGGTGGACGAGTGGATCGTGCACGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120240 ACGGTGCGGCCTTACCTGCAGACGGTGGACGAGTGGATCGTGCACGGGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CCTGTGGGATGGCGCCAGGGAGTTCATCATCCAGAG         AAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 120290 CCTGTGGGATGGCGCCAGGGAGTTCATCATCCAGAGGTG...TAGAAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AAAATGTTCCAGTTAATCACAGAGACTTCTGGTATGCAACTTACACGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121508 AAAATGTTCCAGTTAATCACAGAGACTTCTGGTATGCAACTTACACGTTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TATAGCGTATCAGAAAAGACAGAAAATGAAGAAAAAATGAGTGATAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121558 TATAGCGTATCAGAAAAGACAGAAAATGAAGAAAAAATGAGTGATAACGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TAGTGCGAGTTCCGGCAGTGACCAGGGGCCCTCCAGCAGGCAGCACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121608 TAGTGCGAGTTCCGGCAGTGACCAGGGGCCCTCCAGCAGGCAGCACACCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TGGTGTCCTTCCTCAAACCTGTCCTGAAGCAGATCATAATGGCTGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121658 TGGTGTCCTTCCTCAAACCTGTCCTGAAGCAGATCATAATGGCTGGCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TCGATGCAGCTGCTGAAGAACCTGCAGTGTGCGGAGAGCACCACCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121708 TCGATGCAGCTGCTGAAGAACCTGCAGTGTGCGGAGAGCACCACCTGCCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GGCAGGAGCCAGAG         ATGCAGAAAGAAAAAGTTTATACACTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 121758 GGCAGGAGCCAGAGGTA...CAGATGCAGAAAGAAAAAGTTTATACACTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TCTTTCTGGAATCTGTACAGTCCCGTCTTCGACATGGAGAAGATTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128240 TCTTTCTGGAATCTGTACAGTCCCGTCTTCGACATGGAGAAGATTCCACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CCACAGGTTCTTACTGAGCAACAGGCAACCAAGGAGAACCTGATGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128290 CCACAGGTTCTTACTGAGCAACAGGCAACCAAGGAGAACCTGATGAAGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GCAGTCCATTGCTGAAAGCCATCTTGAACTGGATGATGTTCATGATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128340 GCAGTCCATTGCTGAAAGCCATCTTGAACTGGATGATGTTCATGATCCAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TGCTTGCCATTAACTTTGCAAG         GATGTATTTGGAGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 128390 TGCTTGCCATTAACTTTGCAAGGTG...AAGGATGTATTTGGAGCAGAGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GACTTTCACGAGAAGTTTGCTGGTGGTGATGTATGTGTGGATAGATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129430 GACTTTCACGAGAAGTTTGCTGGTGGTGATGTATGTGTGGATAGATCATC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 GGAATCTGTGACATGCCAGACTTTTGAATTAACGCTGAGATCCTGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129480 GGAATCTGTGACATGCCAGACTTTTGAATTAACGCTGAGATCCTGCCTCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ATCCTCATATTGACAAGCAGTATCTAGATTGCTGTGGAAATCTCATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129530 ATCCTCATATTGACAAGCAGTATCTAGATTGCTGTGGAAATCTCATGCAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 ACTCTAAAAAAAGATTACAG         GTTGGTAGAATACTTGCAAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 129580 ACTCTAAAAAAAGATTACAGGTA...CAGGTTGGTAGAATACTTGCAAGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TATGAGGAATTTTTTCTTAATGGAAGGAGGAGATACCATGTATGACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130684 TATGAGGAATTTTTTCTTAATGGAAGGAGGAGATACCATGTATGACTTCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 ACACGTCAATTTTTGATAAAATAAGAGAAAAGGAAACATGGCAGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130734 ACACGTCAATTTTTGATAAAATAAGAGAAAAGGAAACATGGCAGAATGTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 TCTTTTCTTAATGTCCAACTCCAAGAAGCAGTAGGACAGCGTTATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130784 TCTTTTCTTAATGTCCAACTCCAAGAAGCAGTAGGACAGCGTTATCCTGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 AGATAGTTCACG         TCTATCTATATCTTTTGAAAATGTTGACA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 130834 AGATAGTTCACGGTA...TAGTCTATCTATATCTTTTGAAAATGTTGACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 CAGCTAAGAAGAAGCTGCCTGTTCATATCTTAGATGGTCTGACCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133221 CAGCTAAGAAGAAGCTGCCTGTTCATATCTTAGATGGTCTGACCCTCAGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 TACAAG         GTCCCATGGCCCGTGGACATTGTTATAAGTTTGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133271 TACAAGGTA...TAGGTCCCATGGCCCGTGGACATTGTTATAAGTTTGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 ATGTCAAAAAATTTATAATCAAGTGTTTCTTCTCTTATTGCAAATAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133407 ATGTCAAAAAATTTATAATCAAGTGTTTCTTCTCTTATTGCAAATAAAGT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 GGGCAAAATATAGTCTGGATGTTTTACTTTTTGGTG         AACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 133457 GGGCAAAATATAGTCTGGATGTTTTACTTTTTGGTGGTA...TAGAACTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 GTTAGTACTGCAGAAAAACCACGACTTAAAGAAGGCCTTATACATGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133939 GTTAGTACTGCAGAAAAACCACGACTTAAAGAAGGCCTTATACATGAACA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 AGACACAGTTGCTCAGTTCGGACCACAAAAAGAACCAGTAAGACAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133989 AGACACAGTTGCTCAGTTCGGACCACAAAAAGAACCAGTAAGACAGCAGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TTCATCGCATGTTCCTCTTAAGAGTGAAGCTCATGCATTTCGTGAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134039 TTCATCGCATGTTCCTCTTAAGAGTGAAGCTCATGCATTTCGTGAACAGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 TTGCACAACTACATCATGACCAGG         ATTCTACACAGTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 134089 TTGCACAACTACATCATGACCAGGGTT...AAGATTCTACACAGTACAGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 GCTGGAGTTTCAACATCAAGTCGAGGAAGCCAAGGATTTAGATCAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135334 GCTGGAGTTTCAACATCAAGTCGAGGAAGCCAAGGATTTAGATCAATTGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 TTAAAATTCACTATAGGTATCTGTCAACCATCCATGACCGGTGTCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135384 TTAAAATTCACTATAGGTATCTGTCAACCATCCATGACCGGTGTCTGCTG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 AGAGAAAAG         GTCAGCTTTGTGAAAGAAGCTATCATGAAGGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 135434 AGAGAAAAGGTA...CAGGTCAGCTTTGTGAAAGAAGCTATCATGAAGGT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 GTTGAACTTGGCTCTCATGTTTGCAGACGGTTGGCAGGCAGGCCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136423 GTTGAACTTGGCTCTCATGTTTGCAGACGGTTGGCAGGCAGGCCTGGGCA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 CTTGGCG         AATGGAATCTATAGAGAAAATGGAATCTGATTTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136473 CTTGGCGGTA...TAGAATGGAATCTATAGAGAAAATGGAATCTGATTTT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2962 AAAAACTGCCATATGTTTCTTGTAACCATTTTAAACAAAGCCGTCTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138909 AAAAACTGCCATATGTTTCTTGTAACCATTTTAAACAAAGCCGTCTGTAG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3012 AGGATCCTTTCCCCATT         TGGAATCTCTAGCGTTGTCACTCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 138959 AGGATCCTTTCCCCATTGTG...CAGTGGAATCTCTAGCGTTGTCACTCA

   3250     .    :    .    :
   3053 TGGCTGGCATGGAACAAAGT
        ||||||||||||||||||||
 139702 TGGCTGGCATGGAACAAAGT