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seq2 = pF1KSDA1882/gi568815590r_139631064.tfa (gi568815590r:139631064_140551373), 920310 bp

>pF1KSDA1882 3444
>gi568815590r:139631064_140551373 (Chr8)

(complement)

1-584  (100001-100584)   99% ->
585-730  (112177-112322)   100% ->
731-859  (116134-116262)   100% ->
860-886  (124733-124759)   100% ->
887-1008  (145676-145797)   100% ->
1009-1134  (153629-153754)   99% ->
1135-1351  (180194-180410)   100% ->
1352-1495  (191181-191324)   100% ->
1496-1622  (240000-240126)   100% ->
1623-1768  (250760-250905)   100% ->
1769-1854  (260296-260381)   100% ->
1855-1981  (263640-263766)   100% ->
1982-2114  (267353-267485)   100% ->
2115-2278  (275553-275716)   100% ->
2279-2431  (298445-298597)   100% ->
2432-2556  (329791-329915)   100% ->
2557-2699  (527295-527437)   100% ->
2700-2810  (562538-562648)   99% ->
2811-2959  (641074-641222)   100% ->
2960-3055  (665399-665495)   95% ->
3056-3279  (819172-819395)   100% ->
3280-3444  (820146-820310)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGTCCCTGACTACATGCAGTGTGCTGAGGACCACCAGACGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGTCCCTGACTACATGCAGTGTGCTGAGGACCACCAGACGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGGTGGTCCAGCCTGTGGGCATCGTCTCCGAGGAGAACTTCTTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTGGTGGTCCAGCCTGTGGGCATCGTCTCCGAGGAGAACTTCTTCAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATAAGAGGATTTGCTCTGTGAGTCAGATCAGCGTGCGGGACTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATAAGAGGATTTGCTCTGTGAGTCAGATCAGCGTGCGGGACTCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGAGTCCTCTACATCCGCTACAGGCACCACTACCCACCCGAGAACAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGAGTCCTCTACATCCGCTACAGGCACCACTACCCACCCGAGAACAACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGGGGCGACTTCCAGACCCACCGCAAAGTCGTGGGCCTCATCACCATCA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTGGGGTGACTTCCAGACCCACCGCAAAGTCGTGGGCCTCATCACCATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGACTGCTTCTCGGCCAAGGACTGGCCACAGACCTTCGAGAAGTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100251 CAGACTGCTTCTCGGCCAAGGACTGGCCACAGACCTTTGAGAAGTTCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCAGAAGGAGATCTACGGCTCCACACTGTATGACTCCCGGCTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCAGAAGGAGATCTACGGCTCCACACTGTATGACTCCCGGCTCTTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCGGGCTGCAGGGGGAGATCGTGGAGCAGCCGCGCACCGACGTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCGGGCTGCAGGGGGAGATCGTGGAGCAGCCGCGCACCGACGTGGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCTACCCCAATTACGAGGACTGCCAGACGGTGGAGAAGAGAATCGAGGAC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCTACCCCAACTACGAGGACTGCCAGACGGTGGAGAAGAGAATCGAGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCATCGAGTCACTGTTCATCGTGCTGGAGTCCAAGCGTCTGGACAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCATCGAGTCACTGTTCATCGTGCTGGAGTCCAAGCGTCTGGACAGAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACAGACAAGTCTGGGGATAAGATCCCCCTTCTCTGTGTCCCGTTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACAGACAAGTCTGGGGATAAGATCCCCCTTCTCTGTGTCCCGTTTGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAAAGGACTTTGTAGGACTGGACACAGACAGCAG         ACATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100551 AAAAGGACTTTGTAGGACTGGACACAGACAGCAGGTA...TAGACATTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAGAAGCGGTGCCAAGGCCGCATGCGGAAGCACGTGGGGGACCTGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112184 AAGAAGCGGTGCCAAGGCCGCATGCGGAAGCACGTGGGGGACCTGTGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCAGGCAGGGATGCTGCAGGACTCCCTGGTGCATTACCACATGTCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112234 GCAGGCAGGGATGCTGCAGGACTCCCTGGTGCATTACCACATGTCGGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGCTGCTGCGTTCTGTGAATGACTTTCTGTGGCTTGGAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112284 AGCTGCTGCGTTCTGTGAATGACTTTCTGTGGCTTGGAGGTA...CAGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GCCCTGGAAGGATTGTGTTCAGCTTCTGTCATCTATCACTATCCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116136 GCCCTGGAAGGATTGTGTTCAGCTTCTGTCATCTATCACTATCCTGGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AACTGGTGGGAAGAGTGGAGCTCGGAGGTTCCAGGGCAGCACCCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116186 AACTGGTGGGAAGAGTGGAGCTCGGAGGTTCCAGGGCAGCACCCTTCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CTGAAGCAGCCAATAGACACCGGCCAG         GGGCACAGGAAGTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 116236 CTGAAGCAGCCAATAGACACCGGCCAGGTG...CAGGGGCACAGGAAGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTCATTGATCCAG         GTGCCCTCACCACCAATGGCATCAACCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 124747 CTCATTGATCCAGGTA...CAGGTGCCCTCACCACCAATGGCATCAACCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGACACCAGTACTGAGATCGGACGTGCTAAGAACTGCCTTAGCCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145704 TGACACCAGTACTGAGATCGGACGTGCTAAGAACTGCCTTAGCCCTGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACATAATTGACAAGTATAAAGAGGCGATTTCCTATTACAGCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 145754 ACATAATTGACAAGTATAAAGAGGCGATTTCCTATTACAGCAAGGTG...

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1009    TATAAGAATGCGGGAGTGATTGAGTTAGAAGCGTGCATCAAGGCTGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 153626 CAGTATAAGAATGCGGGAGTGATTGAGTTGGAAGCGTGCATCAAGGCTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 ACGTGTCCTTGCAATTCAGAAACGGAGCATGGAAGCATCAGAATTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153676 ACGTGTCCTTGCAATTCAGAAACGGAGCATGGAAGCATCAGAATTTCTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGAATGCAGTTTACATTAACCTTCGACAG         CTTTCTGAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 153726 AGAATGCAGTTTACATTAACCTTCGACAGGTG...CAGCTTTCTGAGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAGAAAATTCAGCGCTACAGCATCCTCTCCGAGCTCTATGAGCTGATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180206 GAGAAAATTCAGCGCTACAGCATCCTCTCCGAGCTCTATGAGCTGATCGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CTTCCATCGCAAGTCTGCGTTCTTCAAGCGCGTGGCCGCCATGCAGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180256 CTTCCATCGCAAGTCTGCGTTCTTCAAGCGCGTGGCCGCCATGCAGTGCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TGGCCCCAAGCATCGCGGAGCCTGGGTGGAGGGCCTGCTACAAACTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180306 TGGCCCCAAGCATCGCGGAGCCTGGGTGGAGGGCCTGCTACAAACTCCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CTGGAAACGCTGCCCGGCTACAGTCTGTCGCTGGATCCCAAAGATTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180356 CTGGAAACGCTGCCCGGCTACAGTCTGTCGCTGGATCCCAAAGATTTCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CAGAG         GCACGCACAGAGGCTGGGCTGCGGTCCAGATGCGTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180406 CAGAGGTA...CAGGCACGCACAGAGGCTGGGCTGCGGTCCAGATGCGTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TGCTCCATGAATTGGTCTACGCCTCCCGAAGGATGGGGAACCCTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191217 TGCTCCATGAATTGGTCTACGCCTCCCGAAGGATGGGGAACCCTGCCCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TCTGTCAGACACCTGTCCTTCCTTCTACAGACCATGCTGGACTTCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191267 TCTGTCAGACACCTGTCCTTCCTTCTACAGACCATGCTGGACTTCTTGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GGATCAGG         AAAAGAAAGATGTGGCCCAAAGCCTAGAGAACT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 191317 GGATCAGGGTG...CAGAAAAGAAAGATGTGGCCCAAAGCCTAGAGAACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 ATACGTCCAAGTGTCCTGGGACCATGGAGCCCATCGCCCTCCCTGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240033 ATACGTCCAAGTGTCCTGGGACCATGGAGCCCATCGCCCTCCCTGGCGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CTCACCCTGCCACCGGTGCCCTTCACCAAGCTTCCCATCGTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 240083 CTCACCCTGCCACCGGTGCCCTTCACCAAGCTTCCCATCGTCAGGTG...

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1623    GCATGTGAAACTATTGAACCTTCCTGCTAGCCTCCGGCCACACAAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 250757 CAGGCATGTGAAACTATTGAACCTTCCTGCTAGCCTCCGGCCACACAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TGAAAAGCTTGCTGGGTCAGAACGTGTCAACCAAAAGTCCTTTCATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 250807 TGAAAAGCTTGCTGGGTCAGAACGTGTCAACCAAAAGTCCTTTCATCTAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 TCACCAATTATCGCACACAACCGTGGAGAAGAGCGGAACAAGAAAATAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 250857 TCACCAATTATCGCACACAACCGTGGAGAAGAGCGGAACAAGAAAATAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1769         ATTTCCAGTGGGTTCAAGGAGATGTGTGTGAAGTTCAGCTGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 250907 TA...TAGATTTCCAGTGGGTTCAAGGAGATGTGTGTGAAGTTCAGCTGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TGGTATATAACCCAATGCCGTTTGAACTTCGAGTTGAAAACATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 260338 TGGTATATAACCCAATGCCGTTTGAACTTCGAGTTGAAAACATGGTA...

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1855    GGGCTGCTCACCAGCGGAGTGGAGTTCGAGTCTCTCCCTGCGGCGCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263637 TAGGGGCTGCTCACCAGCGGAGTGGAGTTCGAGTCTCTCCCTGCGGCGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TTCTCTTCCGGCTGAATCTGGTCTGTACCCAGTGACGCTCGTCGGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263687 TTCTCTTCCGGCTGAATCTGGTCTGTACCCAGTGACGCTCGTCGGGGTCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 CGCAGACGACTGGAACGATTACTGTGAACG         GTTACCATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 263737 CGCAGACGACTGGAACGATTACTGTGAACGGTA...CAGGTTACCATACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 ACGGTCTTCGGTGTGTTCAGTGACTGTTTGCTGGATAACCTGCCGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267364 ACGGTCTTCGGTGTGTTCAGTGACTGTTTGCTGGATAACCTGCCGGGAAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 AAAAACCAGTGGCTCCACAGTGGAAGTCATTCCCGCGTTGCCAAGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267414 AAAAACCAGTGGCTCCACAGTGGAAGTCATTCCCGCGTTGCCAAGACTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 AGATCAGCACCTCTCTGCCCAG         ATCTGCACATTCATTGCAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 267464 AGATCAGCACCTCTCTGCCCAGGTA...TAGATCTGCACATTCATTGCAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 CCTTCTTCTGGTGATGAAATATCTACTAATGTATCTGTCCAGCTTTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275572 CCTTCTTCTGGTGATGAAATATCTACTAATGTATCTGTCCAGCTTTACAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 TGGAGAAAGTCAGCAACTAATCATTAAATTGGAAAATATTGGAATGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275622 TGGAGAAAGTCAGCAACTAATCATTAAATTGGAAAATATTGGAATGGAAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 CATTGGAGAAACTGGAGGTCACCTCGAAAGTTCTCACCACTAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 275672 CATTGGAGAAACTGGAGGTCACCTCGAAAGTTCTCACCACTAAAGGTA..

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279     AAAAATTGTATGGCGACTTCTTGAGCTGGAAGCTAGAGGAAACCCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275722 .CAGAAAAATTGTATGGCGACTTCTTGAGCTGGAAGCTAGAGGAAACCCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 TGCCCAGTTCCCTTTGCAGCCTGGGAAGGTGGCCACGTTCACAATCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 298491 TGCCCAGTTCCCTTTGCAGCCTGGGAAGGTGGCCACGTTCACAATCAACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 TCAAAGTGAAGCTGGATTTCTCCTGCCAGGAGAATCTCCTGCAGGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 298541 TCAAAGTGAAGCTGGATTTCTCCTGCCAGGAGAATCTCCTGCAGGATCTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 AGTGATG         ATGGAATCAGTGTGAGTGGCTTTCCCCTGTCCAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 298591 AGTGATGGTA...TAGATGGAATCAGTGTGAGTGGCTTTCCCCTGTCCAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 TCCTTTTCGGCAGGTCGTTCGGCCCCGAGTGGAGGGCAAACCTGTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 329825 TCCTTTTCGGCAGGTCGTTCGGCCCCGAGTGGAGGGCAAACCTGTGAACC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 CACCCGAGAGCAACAAAGCAGGCGACTACAGCCACGTGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 329875 CACCCGAGAGCAACAAAGCAGGCGACTACAGCCACGTGAAGGTG...TAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 ACCCTGGAAGCTGTCCTGAATTTCAAATACTCTGGAGGCCCGGGCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 527295 ACCCTGGAAGCTGTCCTGAATTTCAAATACTCTGGAGGCCCGGGCCACAC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 TGAAGGATATTACAGGAATCTCTCCCTGGGGCTGCATGTAGAAGTCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 527345 TGAAGGATATTACAGGAATCTCTCCCTGGGGCTGCATGTAGAAGTCGAGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 CGTCTGTATTTTTCACCCGAGTCAGCACCCTCCCAGCAACCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 527395 CGTCTGTATTTTTCACCCGAGTCAGCACCCTCCCAGCAACCAGGTA...C

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2700   TACCCGGCAGTGTCACCTGCTCCTGGATGTCTTCAACTCCACCGAGCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 562536 AGTACCCGGCAGTGTCACCTGCTCCTGGATGTCTTCAACTCCACCGAGCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 TGAGCTGACCGTCAGCACCAGGAGCAGCGAGGCACTCATCCTGCACGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 562586 TGAGCTGACCGTCAGCACCAGGAGCAGCGAGGCACTCATCCTGCACGCCG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 GCGAGTGCCAGCG         AATGGCTATTCAAGTGGACAAGTTCAAC
        | |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 562636 GTGAGTGCCAGCGGTA...TAGAATGGCTATTCAAGTGGACAAGTTCAAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 TTTGAGAGTTTCCCGGAGTCCCCTGGGGAGAAGGGGCAATTTGCAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 641102 TTTGAGAGTTTCCCGGAGTCCCCTGGGGAGAAGGGGCAATTTGCAAACCC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 CAAGCAGCTGGAGGAAGAGCGGCGGGAAGCCCGAGGCCTGGAGATCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 641152 CAAGCAGCTGGAGGAAGAGCGGCGGGAAGCCCGAGGCCTGGAGATCCACA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 GCAAGCTGGGCATCTGCTGGA         G  AATCCCCTCCCTGAAGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>|-- |-||||||||||||||
 641202 GCAAGCTGGGCATCTGCTGGAGAA...AAGGCTCA CCCCTCCCTGAAGC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2978 GCAGTGGCGAGGCGAGTGTGGAAGGACTCCTGAACCAGCTCGTCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 665418 GCAGTGGCGAGGCGAGTGTGGAAGGACTCCTGAACCAGCTCGTCCTGGAG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3028 CACCTGCAGCTGGCGCCTCTGCAGTGGG         ATGTGCTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 665468 CACCTGCAGCTGGCGCCTCTGCAGTGGGGTG...CAGATGTGCTGGTGGA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3069 CGGACAGCCATGTGACCGCGAGGCTGTGGCGGCCTGCCAGGTGGGCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 819185 CGGACAGCCATGTGACCGCGAGGCTGTGGCGGCCTGCCAGGTGGGCGACC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3119 CCGTGCGCCTGGAGGTGCGGCTGACCAACCGGAGCCCGCGCAGCGTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 819235 CCGTGCGCCTGGAGGTGCGGCTGACCAACCGGAGCCCGCGCAGCGTAGGG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3169 CCCTTCGCCCTCACTGTGGTCCCCTTCCAGGACCACCAGAACGGCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 819285 CCCTTCGCCCTCACTGTGGTCCCCTTCCAGGACCACCAGAACGGCGTGCA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3219 CAACTACGACCTGCACGACACCGTCTCCTTCGTGGGCTCCAGCACCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 819335 CAACTACGACCTGCACGACACCGTCTCCTTCGTGGGCTCCAGCACCTTCT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3269 ACCTCGACGCG         GTGCAGCCGTCCGGCCAGTCGGCCTGCCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 819385 ACCTCGACGCGGTG...CAGGTGCAGCCGTCCGGCCAGTCGGCCTGCCTC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3310 GGGGCCCTCCTCTTCCTCTACACGGGAGACTTCTTCCTCCACATCCGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 820176 GGGGCCCTCCTCTTCCTCTACACGGGAGACTTCTTCCTCCACATCCGGTT

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3360 CCACGAGGACAGCACCAGCAAGGAGCTGCCACCCTCTTGGTTCTGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 820226 CCACGAGGACAGCACCAGCAAGGAGCTGCCACCCTCTTGGTTCTGCCTGC

   3600     .    :    .    :    .    :    .
   3410 CCAGTGTGCACGTGTGTGCCCTGGAGGCGCAGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 820276 CCAGTGTGCACGTGTGTGCCCTGGAGGCGCAGGCC