Result of SIM4 for
pF1KSDA1862
seq1 = pF1KSDA1862.tfa, 3090 bp
seq2 = pF1KSDA1862/gi568815591f_149620007.tfa (gi568815591f:149620007_149834044), 214038 bp
>pF1KSDA1862 3090
>gi568815591f:149620007_149834044 (Chr7)
1-34 (99633-99666) 100% ->
35-154 (100002-100121) 100% ->
155-310 (100829-100984) 100% ->
311-466 (101374-101529) 100% ->
467-598 (102416-102547) 100% ->
599-772 (102777-102950) 100% ->
773-928 (103728-103883) 100% ->
929-1126 (104646-104843) 100% ->
1127-1300 (105309-105482) 100% ->
1301-1474 (105881-106054) 100% ->
1475-1627 (108517-108669) 100% ->
1628-1810 (109182-109364) 100% ->
1811-2005 (110141-110335) 99% ->
2006-2146 (110422-110562) 100% ->
2147-2251 (111666-111770) 100% ->
2252-3090 (113200-114038) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCGGGAGAACTACGAGACGCTGGTCTCTGTGG GGACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
99633 ATGCGGGAGAACTACGAGACGCTGGTCTCTGTGGGTA...CAGGGACAGC
50 . : . : . : . : . :
42 TGAGCTGCTCCCCCTCTCTGCTTTCCTGTCACCCTCAGAGCCTGGAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100009 TGAGCTGCTCCCCCTCTCTGCTTTCCTGTCACCCTCAGAGCCTGGAAGAG
100 . : . : . : . : . :
92 CTGTTGGGGGAGGGAGCCACGCTGATGAGGGGCAGGAGCCTGCTGGTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100059 CTGTTGGGGGAGGGAGCCACGCTGATGAGGGGCAGGAGCCTGCTGGTTGT
150 . : . : . : . : . :
142 GGAGATCCCCAGG GGGGACAGCCCCGGCACAGCCTGCACCT
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
100109 GGAGATCCCCAGGGTA...CAGGGGGACAGCCCCGGCACAGCCTGCACCT
200 . : . : . : . : . :
183 CACAGCCCTGGTGCAGCTGGTGAAGGAGATCCCAGAGTTCTTGTTTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100857 CACAGCCCTGGTGCAGCTGGTGAAGGAGATCCCAGAGTTCTTGTTTGGAG
250 . : . : . : . : . :
233 AAGTCAAGGGCGCTATGGACAGCCCCGAGAGCGAGAGCCGGGGAGCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100907 AAGTCAAGGGCGCTATGGACAGCCCCGAGAGCGAGAGCCGGGGAGCCAGC
300 . : . : . : . : . :
283 CTGGATGGAGAGAGAGCGAGCCCCGAGG CAGCTGCGGCAAG
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
100957 CTGGATGGAGAGAGAGCGAGCCCCGAGGGTA...CAGCAGCTGCGGCAAG
350 . : . : . : . : . :
324 AGAGCCCTGCCCTCTCCGAGGCCTGCTCAGCTGCCTTCCAGACGGCCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101387 AGAGCCCTGCCCTCTCCGAGGCCTGCTCAGCTGCCTTCCAGACGGCCCTA
400 . : . : . : . : . :
374 CCAGCCAGCCCCACCTGGCCACCACGCCCACCGACAGCTCGTGTTCCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101437 CCAGCCAGCCCCACCTGGCCACCACGCCCACCGACAGCTCGTGTTCCAGT
450 . : . : . : . : . :
424 GGCCCAACTGGTGACGGGGTCCAGGGAAGTCCTCTCCCCATCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
101487 GGCCCAACTGGTGACGGGGTCCAGGGAAGTCCTCTCCCCATCAGTG...C
500 . : . : . : . : . :
467 AAACTGCCGACAAACCGTGGCCTACAAGGAAGGAAGGCCCAGGAGCCC
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102414 AGAAACTGCCGACAAACCGTGGCCTACAAGGAAGGAAGGCCCAGGAGCCC
550 . : . : . : . : . :
515 TGGGCGGGGAGCCCAGCCCTCCCACCCATAGCCCCAGCAGGAGGAAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102464 TGGGCGGGGAGCCCAGCCCTCCCACCCATAGCCCCAGCAGGAGGAAGAGC
600 . : . : . : . : . :
565 CACAGAGGACAGGAGAGAGGGACCTCAGAGGCCG GAATTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
102514 CACAGAGGACAGGAGAGAGGGACCTCAGAGGCCGGTG...CAGGAATTTC
650 . : . : . : . : . :
606 TCCTGGGAACAGCCCCTTGCAAGGCCTCATCAACTGTCTGAAGGAAATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102784 TCCTGGGAACAGCCCCTTGCAAGGCCTCATCAACTGTCTGAAGGAAATCC
700 . : . : . : . : . :
656 TTGTGCCTGGGCCCCGGCACCCCGAGACATCCCCAAGCTTCTTGCCACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102834 TTGTGCCTGGGCCCCGGCACCCCGAGACATCCCCAAGCTTCTTGCCACCT
750 . : . : . : . : . :
706 CTCCCTAGCCTGGGCACGTCCAGGCTAACCAGAGCAGACCTGGGGCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102884 CTCCCTAGCCTGGGCACGTCCAGGCTAACCAGAGCAGACCTGGGGCCTGG
800 . : . : . : . : . :
756 GAGCCCGCCCTGGGCAG TGAAGACCGAGGCGGTTTCAGGGG
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
102934 GAGCCCGCCCTGGGCAGGTG...TAGTGAAGACCGAGGCGGTTTCAGGGG
850 . : . : . : . : . :
797 ATTGTCCCCTCCAGGGTCTGCTACACTGTCTGAAGGAGCTCCCCGAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103752 ATTGTCCCCTCCAGGGTCTGCTACACTGTCTGAAGGAGCTCCCCGAGGCC
900 . : . : . : . : . :
847 CAGGACAGGCATCCCAGTCCCTCAGGAGTGGGGAACCGACGGCTACAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103802 CAGGACAGGCATCCCAGTCCCTCAGGAGTGGGGAACCGACGGCTACAGGA
950 . : . : . : . : . :
897 GAATCCAGGAGCCTGGAAAAGGGGTTCTGGAG GGCCTGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
103852 GAATCCAGGAGCCTGGAAAAGGGGTTCTGGAGGTA...CAGGGCCTGGAT
1000 . : . : . : . : . :
938 ACCTCCTGACCCCTCCTCCCCATCCTGATCTTGGAGCTGGCGGTCTGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104655 ACCTCCTGACCCCTCCTCCCCATCCTGATCTTGGAGCTGGCGGTCTGCTC
1050 . : . : . : . : . :
988 TCTGTGAAGATGGAGAACAGCTGGGTCCAGAGCCCCCCAGGACCTGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104705 TCTGTGAAGATGGAGAACAGCTGGGTCCAGAGCCCCCCAGGACCTGCATC
1100 . : . : . : . : . :
1038 CTGTCAGCCTGGCAGGCAGCCCCTCAGTCCCTCAGCCACTGGAGACACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104755 CTGTCAGCCTGGCAGGCAGCCCCTCAGTCCCTCAGCCACTGGAGACACCA
1150 . : . : . : . : . :
1088 GAGGGGTCCCCCAACCCAGCTGGGGCCCTGAGGCTCAAG CT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
104805 GAGGGGTCCCCCAACCCAGCTGGGGCCCTGAGGCTCAAGGTG...CAGCT
1200 . : . : . : . : . :
1129 GCCAGTGCCTCAAGCTCACCGCTGGAAGCCCTGGAAGCCTGTCTGAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105311 GCCAGTGCCTCAAGCTCACCGCTGGAAGCCCTGGAAGCCTGTCTGAAGGG
1250 . : . : . : . : . :
1179 CATTCCCCCAAATGGGTCGTCACCTTCCCAGCTGCCACCCACTTCTTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105361 CATTCCCCCAAATGGGTCGTCACCTTCCCAGCTGCCACCCACTTCTTGTT
1300 . : . : . : . : . :
1229 CCCAGAACCCCCAGCCAGGAGACTCTAGGTCTCAGAAGCCTGAACTGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105411 CCCAGAACCCCCAGCCAGGAGACTCTAGGTCTCAGAAGCCTGAACTGCAA
1350 . : . : . : . : . :
1279 CCCCACAGATCACACAGTGAAG AAGCGACCAGAGAGCCTGT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
105461 CCCCACAGATCACACAGTGAAGGTA...CAGAAGCGACCAGAGAGCCTGT
1400 . : . : . : . : . :
1320 TCTGCCTCTGGGTCTGCAGAGCTGTGTGAGAGATGGCCCCAGCAGGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105900 TCTGCCTCTGGGTCTGCAGAGCTGTGTGAGAGATGGCCCCAGCAGGCCCC
1450 . : . : . : . : . :
1370 TGGCCCCCCGAGGAACCCCCACCAGCTTCTCCTCATCCAGCAGCACCGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105950 TGGCCCCCCGAGGAACCCCCACCAGCTTCTCCTCATCCAGCAGCACCGAC
1500 . : . : . : . : . :
1420 TGGGACCTGGATTTTGGGAGTCCTGTGGGGAACCAGGGGCAGCATCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106000 TGGGACCTGGATTTTGGGAGTCCTGTGGGGAACCAGGGGCAGCATCCTGG
1550 . : . : . : . : . :
1470 AAAAG GAAGCCCACCAGGAAGCTCCCCACTGCAGGGTCTGG
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106050 AAAAGGTG...CAGGAAGCCCACCAGGAAGCTCCCCACTGCAGGGTCTGG
1600 . : . : . : . : . :
1511 AGAATTGTCTCAAGGAGATACCTGTGCCTGTGCTGCGGCCTGCCTGGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108553 AGAATTGTCTCAAGGAGATACCTGTGCCTGTGCTGCGGCCTGCCTGGCCC
1650 . : . : . : . : . :
1561 TGCTCCTCAGCAGCAGACAGGGGACCGAGGAGAGCAGAGCCCAGGAACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108603 TGCTCCTCAGCAGCAGACAGGGGACCGAGGAGAGCAGAGCCCAGGAACTG
1700 . : . : . : . : . :
1611 GACAGCAGACAAGGAAG GACTGAGGGCTGAGGCCTGCGAGT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
108653 GACAGCAGACAAGGAAGGTA...CAGGACTGAGGGCTGAGGCCTGCGAGT
1750 . : . : . : . : . :
1652 CAGCCCGTCTCGGGCAGGGTAGGGGAGAAGCGCCCACCCGGAGCCTCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109206 CAGCCCGTCTCGGGCAGGGTAGGGGAGAAGCGCCCACCCGGAGCCTCCAT
1800 . : . : . : . : . :
1702 CTGGTCAGCCCACAGGTGTTCACCTCCAGCTGCGTCCCCGCCTGCCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109256 CTGGTCAGCCCACAGGTGTTCACCTCCAGCTGCGTCCCCGCCTGCCACCA
1850 . : . : . : . : . :
1752 GCGGGGGTTCAAAGACCCTGGGGCCACCAGGCCAGGAGTGTGGAGGTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109306 GCGGGGGTTCAAAGACCCTGGGGCCACCAGGCCAGGAGTGTGGAGGTGGC
1900 . : . : . : . : . :
1802 TCCCAGAGG GGTCTGCCCCCAAGCCCTCCCCGCTGCACTGC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
109356 TCCCAGAGGGTG...CAGGGTCTGCCCCCAAGCCCTCCCCGCTGCACTGC
1950 . : . : . : . : . :
1843 CTGGAGAGCGCCCTGAGGGGGATCTTGCCTGTAAGGCCCTTGCGCTTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110173 CTGGAGAGCGCCCTGAGGGGGATCTTGCCTGTAAGGCCCTTGCGCTTCGC
2000 . : . : . : . : . :
1893 CTGCGTGGGAGGCCCCAGCCCCAGCCCCAGCCCCGGCTCCAGCTCGAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110223 CTGCGTGGGAGGCCCCAGCCCCAGCCCCAGCCCCGGCTCCAGCTCGAGCT
2050 . : . : . : . : . :
1943 TCAGCGGCTCTGAAGGAGAAGACCCGAGGCCAGAGCCTGAGCTCTGGAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
110273 TCAGCGGCTCTGAAGGAGAAGACCCGAGGCCAGAGCCTGATCTCTGGAAG
2100 . : . : . : . : . :
1993 CCGCTCCCCCAGG AGAGGGACCGCCTTCCCAGCTGTAAGCC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
110323 CCGCTCCCCCAGGGTG...TAGAGAGGGACCGCCTTCCCAGCTGTAAGCC
2150 . : . : . : . : . :
2034 TCCTGTCCCTCTGTCCCCATGTCCTGGTGGGACCCCTGCTGGCAGCAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110450 TCCTGTCCCTCTGTCCCCATGTCCTGGTGGGACCCCTGCTGGCAGCAGTG
2200 . : . : . : . : . :
2084 GCGGCAGCCCTGGTGAAGACCCCAGGAGAACAGAGCCCAGGTACTGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110500 GCGGCAGCCCTGGTGAAGACCCCAGGAGAACAGAGCCCAGGTACTGCAGC
2250 . : . : . : . : . :
2134 GGCCTCGGTGCAG GTACAGCTCAGGATCCCTGCCCGGTTTC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
110550 GGCCTCGGTGCAGGTG...TAGGTACAGCTCAGGATCCCTGCCCGGTTTC
2300 . : . : . : . : . :
2175 TCAGCTGGAGAAAAGGCCCAGGGTTAGTGAAGCATCCAGAGGCCTGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111694 TCAGCTGGAGAAAAGGCCCAGGGTTAGTGAAGCATCCAGAGGCCTGGAGC
2350 . : . : . : . : . :
2225 TTGGACATGGAAGACCCAGAGTTGCAG CCAAGACCCATGAG
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
111744 TTGGACATGGAAGACCCAGAGTTGCAGGTG...TAGCCAAGACCCATGAG
2400 . : . : . : . : . :
2266 AGGCTGCTCCCCCAGGGCCCGCCTGAGCTGCCCAGTGAGTCTCCCCCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113214 AGGCTGCTCCCCCAGGGCCCGCCTGAGCTGCCCAGTGAGTCTCCCCCTCC
2450 . : . : . : . : . :
2316 GGAGCTGCCCCCTCCGGAAGCTGCGCCTCCTGTGTTGCCAGCCTCCTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113264 GGAGCTGCCCCCTCCGGAAGCTGCGCCTCCTGTGTTGCCAGCCTCCTCCC
2500 . : . : . : . : . :
2366 TGCAGCCGCCATGCCACTGTGGGAAGCCCCTGCAGCAGGAGCTGCACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113314 TGCAGCCGCCATGCCACTGTGGGAAGCCCCTGCAGCAGGAGCTGCACAGC
2550 . : . : . : . : . :
2416 CTCGGTGCTGCCCTTGCGGAGAAGCTGGATCGGCTCGCCACAGCGCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113364 CTCGGTGCTGCCCTTGCGGAGAAGCTGGATCGGCTCGCCACAGCGCTGGC
2600 . : . : . : . : . :
2466 AGGCCTGGCTCAGGAAGTGGCCACCATGAGGACCCAGGTGAATCGGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113414 AGGCCTGGCTCAGGAAGTGGCCACCATGAGGACCCAGGTGAATCGGCTGG
2650 . : . : . : . : . :
2516 GGAGGCGCCCCCAAGGCCCTGGGCCAATGGGCCAAGCTTCCTGGATGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113464 GGAGGCGCCCCCAAGGCCCTGGGCCAATGGGCCAAGCTTCCTGGATGTGG
2700 . : . : . : . : . :
2566 ACCCTCCCACGGGGACCTCGCTGGGCTCATGGCCCTGGTCACAGACATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113514 ACCCTCCCACGGGGACCTCGCTGGGCTCATGGCCCTGGTCACAGACATCT
2750 . : . : . : . : . :
2616 GCCCTACTGGAGGCAGAAGGGACCCACGAGGCCTAAACCAAAGATCCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113564 GCCCTACTGGAGGCAGAAGGGACCCACGAGGCCTAAACCAAAGATCCTGC
2800 . : . : . : . : . :
2666 GTGGCCAGGGAGAGAGCTGCAGGGCTGGTGACCTGCAAGGACTCTCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113614 GTGGCCAGGGAGAGAGCTGCAGGGCTGGTGACCTGCAAGGACTCTCCAGA
2850 . : . : . : . : . :
2716 GGGACCGCTCGCCGGGCACGTCCGCTGCCTCCAGACGCTCCCCCGGCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113664 GGGACCGCTCGCCGGGCACGTCCGCTGCCTCCAGACGCTCCCCCGGCAGA
2900 . : . : . : . : . :
2766 ACCTCCTGGGCTCCACTGCAGCTCTTCCCAGCAGCTGCTGTCCTCTACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113714 ACCTCCTGGGCTCCACTGCAGCTCTTCCCAGCAGCTGCTGTCCTCTACAC
2950 . : . : . : . : . :
2816 CCAGCTGCCATGCTGCGCCGCCTGCACACCCCCTCCTCGCACATACCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113764 CCAGCTGCCATGCTGCGCCGCCTGCACACCCCCTCCTCGCACATACCGGG
3000 . : . : . : . : . :
2866 GGCCACCAGAGCCCCCTTCCCCCTTTAGTGCCTGCTGCCTTACCCCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113814 GGCCACCAGAGCCCCCTTCCCCCTTTAGTGCCTGCTGCCTTACCCCTGCA
3050 . : . : . : . : . :
2916 GGGAGCCTCTCCTCCTGCAGCCAGTGCAGATGCAGACGTGCCGACCTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113864 GGGAGCCTCTCCTCCTGCAGCCAGTGCAGATGCAGACGTGCCGACCTCAG
3100 . : . : . : . : . :
2966 GAGTGGCACCAGACGGGATCCCAGAGCGGCCCAAGGAGCCGAGCAGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113914 GAGTGGCACCAGACGGGATCCCAGAGCGGCCCAAGGAGCCGAGCAGCCTG
3150 . : . : . : . : . :
3016 CTGGGAGGAGTGCAGAGGGCCCTCCAGGAAGAACTGTGGGGTGGGGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113964 CTGGGAGGAGTGCAGAGGGCCCTCCAGGAAGAACTGTGGGGTGGGGAGCA
3200 . : . : .
3066 CAGGGACCCGAGATGGGGGGCGCAT
|||||||||||||||||||||||||
114014 CAGGGACCCGAGATGGGGGGCGCAT