seq1 = pF1KSDA1852.tfa, 2376 bp
seq2 = pF1KSDA1852/gi568815579r_57878304.tfa (gi568815579r:57878304_58100740), 222437 bp

>pF1KSDA1852 2376
>gi568815579r:57878304_58100740 (Chr19)

(complement)

1-31  (99422-99452)   100% ->
32-88  (100002-100058)   100% ->
89-177  (100845-100933)   100% ->
178-304  (112020-112146)   100% ->
305-400  (112439-112534)   100% ->
401-2376  (120462-122437)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCATCAACCCGTGGGCCTCCTGGG         GTGCCCTTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  99422 ATGGCAGCCATCAACCCGTGGGCCTCCTGGGGTG...CAGGTGCCCTTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGACCAATCTTGGGGGATGACAGCTGTTGACCCATGGGCCTCCTGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100012 GGACCAATCTTGGGGGATGACAGCTGTTGACCCATGGGCCTCCTGGGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     89       CTCTGTGTCCTCAGTATCCTGCCTGGCACGTGGAGGGAAGCCTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 ...TAGCTCTGTGTCCTCAGTATCCTGCCTGGCACGTGGAGGGAAGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GAGGAGGGGAGGAGGGCCACTGGGCTCCCAGCAGCCCAGGTTCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100889 GAGGAGGGGAGGAGGGCCACTGGGCTCCCAGCAGCCCAGGTTCAGGTG..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    178     GAACCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCCGTGGACTTCACCCAAGAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100939 .TAGGAACCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCCGTGGACTTCACCCAAGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGTGGGGGCAGCTGGACCTTGTTCAGAGGACCCTGTACCGTGATGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112066 AGTGGGGGCAGCTGGACCTTGTTCAGAGGACCCTGTACCGTGATGTGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGGAGACCTATGGTCACCTGCTCTCTGTGG         GAAATCAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 112116 CTGGAGACCTATGGTCACCTGCTCTCTGTGGGTA...TAGGAAATCAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGCCAAGCCTGAGGTCATCTCCCTGTTGGAGCAAGGAGAAGAGCCGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112449 TGCCAAGCCTGAGGTCATCTCCCTGTTGGAGCAAGGAGAAGAGCCGTGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CAGTGGAGCAGGCATGTCCTCAACGCACTTGTCCAG         AATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 112499 CAGTGGAGCAGGCATGTCCTCAACGCACTTGTCCAGGTG...CAGAATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GTGAGAAATCTTGAAAGCAAAGCATTGATCCCAGCACAGAGCATTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120467 GTGAGAAATCTTGAAAGCAAAGCATTGATCCCAGCACAGAGCATTTTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGAAGAACAATCCCATGGCATGAAGTTGGAAAGATATATATGGGATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120517 GGAAGAACAATCCCATGGCATGAAGTTGGAAAGATATATATGGGATGATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTTGGTTCTCCAGGTTAGAAGTTTTGGGATGTAAAGACCAATTAGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120567 CTTGGTTCTCCAGGTTAGAAGTTTTGGGATGTAAAGACCAATTAGAAATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TACCACATGAACCAGAGTACAGCTATGAGGCAGATGGTCTTCATGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120617 TACCACATGAACCAGAGTACAGCTATGAGGCAGATGGTCTTCATGCAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCAAGTACTATCCCAGAGAAGCTCTGAATTCTGTGGACTTGGGGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120667 GCAAGTACTATCCCAGAGAAGCTCTGAATTCTGTGGACTTGGGGCAGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTAGCCAGAACTTAAACTTTGTTCCATCTCAGAGAGTTTCTCAGATAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120717 TTAGCCAGAACTTAAACTTTGTTCCATCTCAGAGAGTTTCTCAGATAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CATTTCTATAAGCCTGATACACATGCTCAAAGTTGGAGATGTGACTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120767 CATTTCTATAAGCCTGATACACATGCTCAAAGTTGGAGATGTGACTCAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATAATGTATGCAGATAAGGTTACCTGTGAAAATAATGATTATGACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120817 CATAATGTATGCAGATAAGGTTACCTGTGAAAATAATGATTATGACAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTGTTTATCAGTCCATTCAACCTATTTACCCTGCAAGAATACAAACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120867 CTGTTTATCAGTCCATTCAACCTATTTACCCTGCAAGAATACAAACTGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GATAATCTTTTCAAATGTACTGATGCTGTTAAATCTTTCAATCATATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120917 GATAATCTTTTCAAATGTACTGATGCTGTTAAATCTTTCAATCATATAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACATTTTGGTGATCATAAAGGAATTCACACAGGAGAAAAACTCTATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120967 ACATTTTGGTGATCATAAAGGAATTCACACAGGAGAAAAACTCTATGAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATAAGGAATGCCATCAAATCTTTAACCAGAGCCCATCATTTAATGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121017 ATAAGGAATGCCATCAAATCTTTAACCAGAGCCCATCATTTAATGAACAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCAAGGCTTCATGTTGGAGAAAACCAGTATAATTACAAAGAATATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121067 CCAAGGCTTCATGTTGGAGAAAACCAGTATAATTACAAAGAATATGAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TATCTTTTATTTCTCATCCTTTATGGAACATCAAAAAATTGGTACTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121117 TATCTTTTATTTCTCATCCTTTATGGAACATCAAAAAATTGGTACTGTAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGAAAGCGTATAAATACAATGAATGGGAGAAAGTCTTTGGGTATGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121167 AGAAAGCGTATAAATACAATGAATGGGAGAAAGTCTTTGGGTATGACTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TTCCTTACTCAACATACAAGCACTTACACTGCAGAGAAACCCTATGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121217 TTCCTTACTCAACATACAAGCACTTACACTGCAGAGAAACCCTATGACTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CAATGAATGTGGGACGTCTTTCATCTGGAGCTCTTACCTTATTCAACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121267 CAATGAATGTGGGACGTCTTTCATCTGGAGCTCTTACCTTATTCAACATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AGAAAACTCATACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTGATAAATGTGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121317 AGAAAACTCATACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTGATAAATGTGGAAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GTTTTTAGGAATCGCTCAGCCCTTACGAAACATGAACGGACTCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121367 GTTTTTAGGAATCGCTCAGCCCTTACGAAACATGAACGGACTCACACTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 AATAAAACCCTATGAATGTAATAAATGTGGAAAAGCCTTCAGCTGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121417 AATAAAACCCTATGAATGTAATAAATGTGGAAAAGCCTTCAGCTGGAATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CTCATCTTATTGTACATAAGAGAATTCATACAGGAGAAAAACCTTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121467 CTCATCTTATTGTACATAAGAGAATTCATACAGGAGAAAAACCTTATGTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TGTAATGAGTGTGGGAAATCTTTCAACTGGAACTCTCATCTTATTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121517 TGTAATGAGTGTGGGAAATCTTTCAACTGGAACTCTCATCTTATTGGACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TCAGAGGACTCATACAGGAGAGAAACCTTTTGAATGTACTGAATGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121567 TCAGAGGACTCATACAGGAGAGAAACCTTTTGAATGTACTGAATGTGGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 AATCATTCAGCTGGAGCTCCCATCTTATTGCCCATATGAGAATGCATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121617 AATCATTCAGCTGGAGCTCCCATCTTATTGCCCATATGAGAATGCATACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GGAGAGAAACCCTTTAAATGTGATGAATGTGAAAAAGCTTTTAGGGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121667 GGAGAGAAACCCTTTAAATGTGATGAATGTGAAAAAGCTTTTAGGGACTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CTCAGCCCTTAGTAAACATGAAAGAACTCATTCTGGAGCAAAACCATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121717 CTCAGCCCTTAGTAAACATGAAAGAACTCATTCTGGAGCAAAACCATATA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 AATGTACTGAATGTGGAAAATCCTTCAGCTGGAGCTCCCATCTTATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121767 AATGTACTGAATGTGGAAAATCCTTCAGCTGGAGCTCCCATCTTATTGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CATCAGAGAACTCACACGGGAGAGAAACCATATAACTGTCAGGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121817 CATCAGAGAACTCACACGGGAGAGAAACCATATAACTGTCAGGAATGTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 CAAAGCATTCAGAGAACGCTCAGCCCTCACTAAACATGAGATAATTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121867 CAAAGCATTCAGAGAACGCTCAGCCCTCACTAAACATGAGATAATTCATT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 CTGGAATTAAGCCCTATGAATGTAATAAATGTGGAAAATCCTGTAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121917 CTGGAATTAAGCCCTATGAATGTAATAAATGTGGAAAATCCTGTAGCCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 ATGGCTCACCTTGTTAGACATCAAAGGACTCATACTGGAGAAAAACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121967 ATGGCTCACCTTGTTAGACATCAAAGGACTCATACTGGAGAAAAACCCTA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 TGAATGCAATAAATGTGGAAAATCCTTCAGTCAGAGCTGTCACCTTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122017 TGAATGCAATAAATGTGGAAAATCCTTCAGTCAGAGCTGTCACCTTGTTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 CTCATCGGAGAATTCACACTGGTGAGAAACCCTATAAATGTAATCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122067 CTCATCGGAGAATTCACACTGGTGAGAAACCCTATAAATGTAATCAGTGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 GAAAGATCCTTTAACTGTAGTTCTCACCTCATTGCACACCGGAGAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122117 GAAAGATCCTTTAACTGTAGTTCTCACCTCATTGCACACCGGAGAACTCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 TACTGGAGAGAAACCATACAGGTGTAATGAATGTGGGAAAGCATTTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122167 TACTGGAGAGAAACCATACAGGTGTAATGAATGTGGGAAAGCATTTAATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 AGAGTTCATCCCTTATTGTACACCTAAGAAACCATACTGGAGAAAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122217 AGAGTTCATCCCTTATTGTACACCTAAGAAACCATACTGGAGAAAAGCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 TACAAATGTAATCATTGTGAAAAAGCATTTTGTAAGAATTCTTCCCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122267 TACAAATGTAATCATTGTGAAAAAGCATTTTGTAAGAATTCTTCCCTTAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 TATTCATCAGAGAATGCATAGTGGAGAGAAACGCTTTATATGCAGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122317 TATTCATCAGAGAATGCATAGTGGAGAGAAACGCTTTATATGCAGTGAAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 GTGGAAAAGCCTTTAGTGGTCACTCAGCCCTACTTCAACACCAGAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122367 GTGGAAAAGCCTTTAGTGGTCACTCAGCCCTACTTCAACACCAGAGAAAT

   2400     .    :    .    :
   2356 CACAGTGAAGAGAAACTGAAT
        |||||||||||||||||||||
 122417 CACAGTGAAGAGAAACTGAAT