seq1 = pF1KSDA1831.tfa, 1884 bp
seq2 = pF1KSDA1831/gi568815584r_23469637.tfa (gi568815584r:23469637_23677357), 207721 bp

>pF1KSDA1831 1884
>gi568815584r:23469637_23677357 (Chr14)

(complement)

1-379  (99905-100283)   100% ->
380-1151  (100902-101673)   100% ->
1152-1270  (105438-105556)   100% ->
1271-1803  (105898-106430)   100% ->
1804-1884  (107641-107721)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCCCGGGGGCAAGTTCGACTTTGACGACGGGGGCTGCTACGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99905 ATGTCCCCCGGGGGCAAGTTCGACTTTGACGACGGGGGCTGCTACGTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTGGGAGGCGGGGCGGGCACATGGCTACGGCGTGTGCACGGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99955 GGGCTGGGAGGCGGGGCGGGCACATGGCTACGGCGTGTGCACGGGCCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCCCAGGGCGAGTACAGCGGCTGCTGGGCACACGGCTTCGAGTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100005 GCGCCCAGGGCGAGTACAGCGGCTGCTGGGCACACGGCTTCGAGTCACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGTCTTCACGGGGCCCGGCGGACACAGCTACCAGGGCCACTGGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100055 GGCGTCTTCACGGGGCCCGGCGGACACAGCTACCAGGGCCACTGGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCAAGCGCGAAGGGCTGGGCGTGGAGCGCAAGAGCCGCTGGACGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100105 GGGCAAGCGCGAAGGGCTGGGCGTGGAGCGCAAGAGCCGCTGGACGTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGGCGAGTGGCTGGGCGGGCTGAAGGGGCGCAGCGGCGTGTGGGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100155 GCGGCGAGTGGCTGGGCGGGCTGAAGGGGCGCAGCGGCGTGTGGGAAAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGTCCGGCCTGCGCTACGCCGGGCTCTGGAAGGACGGTTTCCAGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100205 GTGTCCGGCCTGCGCTACGCCGGGCTCTGGAAGGACGGTTTCCAGGACGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTACGGCACTGAGACCTACTCCGACGGAG         GCACCTACCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100255 CTACGGCACTGAGACCTACTCCGACGGAGGTG...CAGGCACCTACCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCCAGTGGCAGGCCGGGAAGCGCCACGGCTACGGGGTACGCCAGAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100914 GCCAGTGGCAGGCCGGGAAGCGCCACGGCTACGGGGTACGCCAGAGTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCTACCATCAGGCGGCGCTGCTGCGCTCGCCCCGCCGCACCTCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100964 CCCTACCATCAGGCGGCGCTGCTGCGCTCGCCCCGCCGCACCTCCCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TTCCGGCCACAGCGACCCCCCGACGCCACCCCCGCCCCTGCCCTTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101014 TTCCGGCCACAGCGACCCCCCGACGCCACCCCCGCCCCTGCCCTTGCCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCGACGAGGGAGGCAGCCCCGCCTCGGGCTCCCGGGGCGGCTTCGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101064 GCGACGAGGGAGGCAGCCCCGCCTCGGGCTCCCGGGGCGGCTTCGTGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCGGGCCCGGGGACGCCGACGGCGCGTCGTCCCGAAAGCGCACTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101114 GCCGGGCCCGGGGACGCCGACGGCGCGTCGTCCCGAAAGCGCACTCCGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGCCGGCGGATTCTTTCGCCGTTCGCTGCTGCTCAGCGGGCTCCGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101164 GGCCGGCGGATTCTTTCGCCGTTCGCTGCTGCTCAGCGGGCTCCGAGCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCGGACGTCGCAGCTCCCTGGGCAGCAAGCGAGGCTCCCTGCGCAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101214 GCGGACGTCGCAGCTCCCTGGGCAGCAAGCGAGGCTCCCTGCGCAGCGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GTGAGCAGCGAGGTGGGCAGCACCGGACCGCCCGGCTCGGAGGCCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101264 GTGAGCAGCGAGGTGGGCAGCACCGGACCGCCCGGCTCGGAGGCCAGCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCCCCCGGCCGCAGCGCCGCCCGCCCTCATCGAGGGCTCGGCCACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101314 GCCCCCGGCCGCAGCGCCGCCCGCCCTCATCGAGGGCTCGGCCACAGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGTACGCGGGCGAGTGGCGCGCAGATCGGCGCAGCGGCTTCGGCGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101364 TGTACGCGGGCGAGTGGCGCGCAGATCGGCGCAGCGGCTTCGGCGTCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CAGCGCTCCAACGGGCTGCGCTACGAGGGCGAGTGGCTGGGCAACCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101414 CAGCGCTCCAACGGGCTGCGCTACGAGGGCGAGTGGCTGGGCAACCGGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GCACGGCTACGGGCGCACCACCCGCCCCGACGGCTCCCGCGAGGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101464 GCACGGCTACGGGCGCACCACCCGCCCCGACGGCTCCCGCGAGGAGGGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGTACAAGCGCAACCGGCTGGTGCACGGCGGGCGCGTCCGCAGTCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101514 AGTACAAGCGCAACCGGCTGGTGCACGGCGGGCGCGTCCGCAGTCTCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CCTCTGGCCCTTCGGCGGGGCAAGGTTAAGGAGAAGGTGGACAGGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101564 CCTCTGGCCCTTCGGCGGGGCAAGGTTAAGGAGAAGGTGGACAGGGCTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CGAGGGCGCCCGTCGAGCCGTGAGTGCTGCCCGTCAGCGCCAGGAGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101614 CGAGGGCGCCCGTCGAGCCGTGAGTGCTGCCCGTCAGCGCCAGGAGATCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CCGCTGCCAG         GGCAGCAGACGCCCTCCTAAAGGCAGTGGCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101664 CCGCTGCCAGGTG...CAGGGCAGCAGACGCCCTCCTAAAGGCAGTGGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GCCAGCAGTGTCGCTGAGAAGGCCGTGGAGGCAGCTCGAATGGCCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105469 GCCAGCAGTGTCGCTGAGAAGGCCGTGGAGGCAGCTCGAATGGCCAAACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GATAGCCCAGGACCTGCAGCCCATGCTAGAGGCCCCAG         GCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105519 GATAGCCCAGGACCTGCAGCCCATGCTAGAGGCCCCAGGTG...CAGGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GCAGACCCAGGCAGGACTCAGAAGGTTCCGACACGGAGCCCCTGGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105901 GCAGACCCAGGCAGGACTCAGAAGGTTCCGACACGGAGCCCCTGGATGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GACAGCCCTGGGGTATATGAGAACGGACTGACCCCCTCAGAGGGATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105951 GACAGCCCTGGGGTATATGAGAACGGACTGACCCCCTCAGAGGGATCCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TGAACTGCCCAGCAGTCCTGCCTCCTCCCGCCAACCCTGGCGACCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106001 TGAACTGCCCAGCAGTCCTGCCTCCTCCCGCCAACCCTGGCGACCCCCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 CCTGCCGGAGCCCACTGCCTCCTGGAGGGGACCAGGGTCCCTTCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106051 CCTGCCGGAGCCCACTGCCTCCTGGAGGGGACCAGGGTCCCTTCTCCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CCCAAAGCTTGGCCTGAGGAGTGGGGGGGGGCAGGCGCACAGGCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106101 CCCAAAGCTTGGCCTGAGGAGTGGGGGGGGGCAGGCGCACAGGCAGAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 ACTAGCTGGCTATGAGGCTGAGGATGAGGCTGGGATGCAAGGGCCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106151 ACTAGCTGGCTATGAGGCTGAGGATGAGGCTGGGATGCAAGGGCCAGGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 CCAGAGACGGTTCCCCACTCCTCGGAGGCTGCAGCGACAGTTCAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106201 CCAGAGACGGTTCCCCACTCCTCGGAGGCTGCAGCGACAGTTCAGGAAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 CTTCGAGAGGAGGAGGGGGAGGATGAAGAGCCCCTGCCCCCGCTGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106251 CTTCGAGAGGAGGAGGGGGAGGATGAAGAGCCCCTGCCCCCGCTGAGGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CCCAGCAGGCACGGAGCCTGAGCCCATCGCCATGCTGGTCCTGAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106301 CCCAGCAGGCACGGAGCCTGAGCCCATCGCCATGCTGGTCCTGAGGGGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 CGTCCTCGAGGGGTCCTGATGCTGGGTGCCTGACAGAAGAGCTCGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106351 CGTCCTCGAGGGGTCCTGATGCTGGGTGCCTGACAGAAGAGCTCGGGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 CCCGCTGCAACCGAGAGGCCTGCCCAGCCG         GGAGCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 106401 CCCGCTGCAACCGAGAGGCCTGCCCAGCCGGTG...TAGGGAGCTGCCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 CCCCCTGGTGGTGGGAGCCGTGGCCCTCCTGGACCTCAGCCTGGCATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107652 CCCCCTGGTGGTGGGAGCCGTGGCCCTCCTGGACCTCAGCCTGGCATTCC

   1900     .    :    .    :
   1865 TGTTCTCCCAGCTCCTCACC
        ||||||||||||||||||||
 107702 TGTTCTCCCAGCTCCTCACC