Result of SIM4 for
pF1KSDA1819
seq1 = pF1KSDA1819.tfa, 3459 bp
seq2 = pF1KSDA1819/gi568815587r_95878951.tfa (gi568815587r:95878951_96441895), 562945 bp
>pF1KSDA1819 3459
>gi568815587r:95878951_96441895 (Chr11)
(complement)
1-513 (100001-100513) 100% ->
514-2130 (348379-350004) 99% ->
2131-2334 (450173-450376) 100% ->
2335-2446 (456254-456365) 100% ->
2447-3459 (461933-462945) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGGGACACAGCGCCCCCGCAGGCCCCCGCAGGAGGGCTAGGGGGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGGGGACACAGCGCCCCCGCAGGCCCCCGCAGGAGGGCTAGGGGGGGC
50 . : . : . : . : . :
51 CTCTGGGGCGGGGCTCCTTGGAGGGGGCTCAGTCACCCCGAGAGTGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTCTGGGGCGGGGCTCCTTGGAGGGGGCTCAGTCACCCCGAGAGTGCACA
100 . : . : . : . : . :
101 GTGCTATCGTGGAGCGCCTCCGGGCTCGGATCGCTGTCTGCCGCCAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 GTGCTATCGTGGAGCGCCTCCGGGCTCGGATCGCTGTCTGCCGCCAACAC
150 . : . : . : . : . :
151 CACCTGAGCTGTGAAGGACGATATGAACGAGGTAGGGCCGAGAGCTCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CACCTGAGCTGTGAAGGACGATATGAACGAGGTAGGGCCGAGAGCTCAGA
200 . : . : . : . : . :
201 CCGGGAAAGAGAAAGCACCTTGCAGCTCCTGAGCCTTGTACAGCATGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 CCGGGAAAGAGAAAGCACCTTGCAGCTCCTGAGCCTTGTACAGCATGGCC
250 . : . : . : . : . :
251 AGGGGGCAAGGAAAGCTGGCAAACACACCAAGGCCACCGCCACTGCTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 AGGGGGCAAGGAAAGCTGGCAAACACACCAAGGCCACCGCCACTGCTGCC
300 . : . : . : . : . :
301 ACCACTACAGCCCCTCCACCGCCCCCTGCTGCCCCTCCTGCGGCCTCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 ACCACTACAGCCCCTCCACCGCCCCCTGCTGCCCCTCCTGCGGCCTCCCA
350 . : . : . : . : . :
351 AGCAGCAGCAACAGCAGCCCCACCGCCCCCACCAGACTATCACCATCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 AGCAGCAGCAACAGCAGCCCCACCGCCCCCACCAGACTATCACCATCACC
400 . : . : . : . : . :
401 ACCAGCAGCACCTGCTGAACAGTAGCAATAATGGTGGCAGTGGTGGGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 ACCAGCAGCACCTGCTGAACAGTAGCAATAATGGTGGCAGTGGTGGGATA
450 . : . : . : . : . :
451 AACGGAGAGCAGCAGCCGCCCGCTTCAACCCCAGGGGACCAGAGGAACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 AACGGAGAGCAGCAGCCGCCCGCTTCAACCCCAGGGGACCAGAGGAACTC
500 . : . : . : . : . :
501 AGCCCTGATTGCG CTCCAGGGTTCCTTGAAAAGAAAACAGG
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
100501 AGCCCTGATTGCGGTA...CAGCTCCAGGGTTCCTTGAAAAGAAAACAGG
550 . : . : . : . : . :
542 TAGTTAACCTATCTCCTGCCAACAGCAAGCGACCCAATGGCTTTGTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348407 TAGTTAACCTATCTCCTGCCAACAGCAAGCGACCCAATGGCTTTGTGGAC
600 . : . : . : . : . :
592 AACTCATTTCTTGATATCAAAAGAATTCGTGTTGGGGAGAATCTCTCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348457 AACTCATTTCTTGATATCAAAAGAATTCGTGTTGGGGAGAATCTCTCTGC
650 . : . : . : . : . :
642 AGGACAAGGTGGCCTCCAAATAAACAATGGACAAAGTCAGATTATGTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348507 AGGACAAGGTGGCCTCCAAATAAACAATGGACAAAGTCAGATTATGTCAG
700 . : . : . : . : . :
692 GGACCTTGCCTATGAGCCAAGCACCCCTGCGAAAGACTAACACTCTGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348557 GGACCTTGCCTATGAGCCAAGCACCCCTGCGAAAGACTAACACTCTGCCA
750 . : . : . : . : . :
742 TCCCATACACATTCTCCTGGCAATGGCCTGTTTAACATGGGCTTAAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348607 TCCCATACACATTCTCCTGGCAATGGCCTGTTTAACATGGGCTTAAAGGA
800 . : . : . : . : . :
792 GGTAAAGAAGGAGCCAGGAGAGACTCTGTCTTGCAGTAAGCACATGGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348657 GGTAAAGAAGGAGCCAGGAGAGACTCTGTCTTGCAGTAAGCACATGGATG
850 . : . : . : . : . :
842 GCCAAATGACCCAAGAGAATATTTTTCCTAATAGGTACGGAGACGACCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348707 GCCAAATGACCCAAGAGAATATTTTTCCTAATAGGTACGGAGACGACCCT
900 . : . : . : . : . :
892 GGAGAACAACTGATGGATCCTGAGCTGCAGGAACTGTTCAATGAACTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348757 GGAGAACAACTGATGGATCCTGAGCTGCAGGAACTGTTCAATGAACTGAC
950 . : . : . : . : . :
942 CAACATATCTGTGCCTCCCATGAGTGACCTTGAACTGGAGAACATGATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348807 CAACATATCTGTGCCTCCCATGAGTGACCTTGAACTGGAGAACATGATCA
1000 . : . : . : . : . :
992 ATGCCACCATAAAGCAGGATGACCCATTTAACATTGACTTGGGTCAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348857 ATGCCACCATAAAGCAGGATGACCCATTTAACATTGACTTGGGTCAGCAA
1050 . : . : . : . : . :
1042 AGCCAGAGGAGCACACCTAGGCCCTCCTTACCCATGGAGAAAATAGTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348907 AGCCAGAGGAGCACACCTAGGCCCTCCTTACCCATGGAGAAAATAGTGAT
1100 . : . : . : . : . :
1092 CAAAAGTGAATACTCACCGGGCTTGACTCAGGGCCCCTCAGGCTCTCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
348957 CAAAAGTGAATACTCACCGGGCTTGACTCAGGGCCCCTCAGGCTCTCCTC
1150 . : . : . : . : . :
1142 AGCTGAGGCCCCCATCAGCTGGCCCCGCATTCTCCATGGCCAACTCTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349007 AGCTGAGGCCCCCATCAGCTGGCCCCGCATTCTCCATGGCCAACTCTGCC
1200 . : . : . : . : . :
1192 CTCTCCACTTCGTCTCCAATCCCTTCAGTCCCTCAGAGCCAGGCTCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349057 CTCTCCACTTCGTCTCCAATCCCTTCAGTCCCTCAGAGCCAGGCTCAGCC
1250 . : . : . : . : . :
1242 TCAGACAGGCTCCGGAGCAAGCCGGGCCTTGCCAAGCTGGCAGGAAGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349107 TCAGACAGGCTCCGGAGCAAGCCGGGCCTTGCCAAGCTGGCAGGAAGTAT
1300 . : . : . : . : . :
1292 CCCATGCCCAGCAGCTCAAACAGATAGCTGCTAATCGTCAGCAGCATGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349157 CCCATGCCCAGCAGCTCAAACAGATAGCTGCTAATCGTCAGCAGCATGCC
1350 . : . : . : . : . :
1342 CGGATGCAGCAGCACCAGCAGCAGCACCAGCCTACCAACTGGTCAGCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349207 CGGATGCAGCAGCACCAGCAGCAGCACCAGCCTACCAACTGGTCAGCCTT
1400 . : . : . : . : . :
1392 GCCCTCCTCTGCTGGACCATCACCAGGTCCATTTGGGCAGGAGAAAATCC
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349257 GCCCTCTTCTGCTGGACCATCACCAGGTCCATTTGGGCAGGAGAAAATCC
1450 . : . : . : . : . :
1442 CCAGCCCTTCTTTTGGTCAGCAGACATTCAGCCCACAGAGCTCCCCCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349307 CCAGCCCTTCTTTTGGTCAGCAGACATTCAGCCCACAGAGCTCCCCCATG
1500 . : . : . : . : . :
1492 CCTGGGGTAGCTGGCGGCAGCGGCCAGTCGAAAGTAATGGCTAACTACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349357 CCTGGGGTAGCTGGCGGCAGCGGCCAGTCGAAAGTAATGGCTAACTACAT
1550 . : . : . : . : . :
1542 GTACAAGGCCGGCCCCTCAGCCCAGGGTGGGCACCTAGATGTCCTCATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349407 GTACAAGGCCGGCCCCTCAGCCCAGGGTGGGCACCTAGATGTCCTCATGC
1600 . : . : . : . : . :
1592 AGCAAAAGCCTCAGGATCTCAGTCGAAGTTTTATTAACAACCCGCACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349457 AGCAAAAGCCTCAGGATCTCAGTCGAAGTTTTATTAACAACCCGCACCCA
1650 . : . : . : . : . :
1642 GCCATGGAGCCCCGTCAGGGCAACACCAAGCCTTTGTTTCATTTTAACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349507 GCCATGGAGCCCCGTCAGGGCAACACCAAGCCTTTGTTTCATTTTAACTC
1700 . : . : . : . : . :
1692 AGATCAAGCGAACCAGCAGATGCCTTCTGTTTTGCCTTCCCAGAACAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349557 AGATCAAGCGAACCAGCAGATGCCTTCTGTTTTGCCTTCCCAGAACAAGC
1750 . : . : . : . : . :
1742 CTTCTCTCCTACACTACACCCAACAGCAACAGCAGCAACAGCAGCAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349607 CTTCTCTCCTACACTACACCCAACAGCAACAGCAGCAACAGCAGCAGCAG
1800 . : . : . : . : . :
1792 CAGCAGCAGCAGCAGCAGCA A CAGCA GCAGCAGCAGCAACA
||||||||||||||||||||--|-|||||------|||||||||||||||
349657 CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACA
1850 . : . : . : . : . :
1833 GCAACAGCAACAGCAACAGCAGAGTTCAATTTCAGCTCAACAACAGCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349707 GCAACAGCAACAGCAACAGCAGAGTTCAATTTCAGCTCAACAACAGCAAC
1900 . : . : . : . : . :
1883 AGCAGCAGAGCTCAATTTCAGCCCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349757 AGCAGCAGAGCTCAATTTCAGCCCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAG
1950 . : . : . : . : . :
1933 CAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349807 CAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCA
2000 . : . : . : . : . :
1983 ACAACCATCTTCTCAGCCTGCCCAATCTCTACCAAGCCAGCCTTTGCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349857 ACAACCATCTTCTCAGCCTGCCCAATCTCTACCAAGCCAGCCTTTGCTAA
2050 . : . : . : . : . :
2033 GGTCACCTTTGCCACTTCAGCAAAAGCTCCTACTTCAGCAAATGCAGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349907 GGTCACCTTTGCCACTTCAGCAAAAGCTCCTACTTCAGCAAATGCAGAAT
2100 . : . : . : . : . :
2083 CAGCCCATTGCAGGAATGGGATACCAAGTCTCCCAACAACAGAGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
349957 CAGCCCATTGCAGGAATGGGATACCAAGTCTCCCAACAACAGAGACAGGT
2150 . : . : . : . : . :
2131 GATCAACACTCTGTGGTAGGCCAGAACACAGGCCCCAGTCCAA
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
350007 A...TAGGATCAACACTCTGTGGTAGGCCAGAACACAGGCCCCAGTCCAA
2200 . : . : . : . : . :
2174 GTCCTAACCCCTGCTCAAATCCAAACACTGGAAGTGGTTACATGAACTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
450216 GTCCTAACCCCTGCTCAAATCCAAACACTGGAAGTGGTTACATGAACTCC
2250 . : . : . : . : . :
2224 CAGCAATCACTGTTGAATCAGCAATTGATGGGAAAGAAGCAGACTCTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
450266 CAGCAATCACTGTTGAATCAGCAATTGATGGGAAAGAAGCAGACTCTACA
2300 . : . : . : . : . :
2274 GAGGCAGATCATGGAGCAGAAACAGCAACTTCTTCTCCAGCAGCAGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
450316 GAGGCAGATCATGGAGCAGAAACAGCAACTTCTTCTCCAGCAGCAGATGC
2350 . : . : . : . : . :
2324 TGGCTGACGCG GAGAAAATTGCTCCACAAGATCAGATAAAC
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
450366 TGGCTGACGCGGTA...AAGGAGAAAATTGCTCCACAAGATCAGATAAAC
2400 . : . : . : . : . :
2365 CGACATTTGTCAAGGCCACCTCCAGATTATAAAGACCAAAGAAGAAATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456284 CGACATTTGTCAAGGCCACCTCCAGATTATAAAGACCAAAGAAGAAATGT
2450 . : . : . : . : . :
2415 GGGCAATATGCAACCAACTGCTCAGTATTCTG GTGGCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
456334 GGGCAATATGCAACCAACTGCTCAGTATTCTGGTA...CAGGTGGCTCAT
2500 . : . : . : . : . :
2456 CCACAATAAGCTTAAACTCTAACCAGGCTTTGGCAAACCCAGTTTCAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
461942 CCACAATAAGCTTAAACTCTAACCAGGCTTTGGCAAACCCAGTTTCAACA
2550 . : . : . : . : . :
2506 CACACCATTTTAACTCCCAATTCCAGCCTCCTGTCTACTTCTCACGGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
461992 CACACCATTTTAACTCCCAATTCCAGCCTCCTGTCTACTTCTCACGGGAC
2600 . : . : . : . : . :
2556 AAGAATGCCATCATTATCTACAGCAGTTCAGAATATGGGGATGTATGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462042 AAGAATGCCATCATTATCTACAGCAGTTCAGAATATGGGGATGTATGGAA
2650 . : . : . : . : . :
2606 ATCTGCCTTGTAATCAACCTAACACATACAGTGTCACTTCAGGAATGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462092 ATCTGCCTTGTAATCAACCTAACACATACAGTGTCACTTCAGGAATGAAT
2700 . : . : . : . : . :
2656 CAATTGACCCAACAGAGAAACCCAAAGCAATTGTTAGCAAATCAAAACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462142 CAATTGACCCAACAGAGAAACCCAAAGCAATTGTTAGCAAATCAAAACAA
2750 . : . : . : . : . :
2706 CCCTATGATGCCACGGCCACCTACCTTAGGGCCAAGTAATAATAACAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462192 CCCTATGATGCCACGGCCACCTACCTTAGGGCCAAGTAATAATAACAATG
2800 . : . : . : . : . :
2756 TAGCCACTTTTGGAGCTGGATCTGTTGGTAATTCACAACAATTGAGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462242 TAGCCACTTTTGGAGCTGGATCTGTTGGTAATTCACAACAATTGAGACCA
2850 . : . : . : . : . :
2806 AATTTAACCCATAGTATGGCAAGCATGCCACCACAGAGAACATCAAACGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462292 AATTTAACCCATAGTATGGCAAGCATGCCACCACAGAGAACATCAAACGT
2900 . : . : . : . : . :
2856 AATGATCACATCCAACACAACTGCACCAAACTGGGCCTCTCAAGAAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462342 AATGATCACATCCAACACAACTGCACCAAACTGGGCCTCTCAAGAAGGAA
2950 . : . : . : . : . :
2906 CAAGCAAACAGCAAGAAGCCCTGACGTCTGCAGGAGTCCGCTTCCCCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462392 CAAGCAAACAGCAAGAAGCCCTGACGTCTGCAGGAGTCCGCTTCCCCACA
3000 . : . : . : . : . :
2956 GGTACACCTGCAGCCTATACCCCAAATCAGTCACTGCAACAGGCAGTAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462442 GGTACACCTGCAGCCTATACCCCAAATCAGTCACTGCAACAGGCAGTAGG
3050 . : . : . : . : . :
3006 TAGCCAGCAATTTTCCCAGAGGGCAGTGGCTCCTCCTAACCAGTTAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462492 TAGCCAGCAATTTTCCCAGAGGGCAGTGGCTCCTCCTAACCAGTTAACAC
3100 . : . : . : . : . :
3056 CAGCAGTGCAAATGAGACCCATGAACCAAATGAGCCAAACACTAAATGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462542 CAGCAGTGCAAATGAGACCCATGAACCAAATGAGCCAAACACTAAATGGG
3150 . : . : . : . : . :
3106 CAAACCATGGGTCCCCTCAGGGGTCTGAATCTCAGACCCAATCAGCTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462592 CAAACCATGGGTCCCCTCAGGGGTCTGAATCTCAGACCCAATCAGCTAAG
3200 . : . : . : . : . :
3156 CACACAGATTTTGCCTAATTTGAATCAGTCAGGAACAGGGTTGAATCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462642 CACACAGATTTTGCCTAATTTGAATCAGTCAGGAACAGGGTTGAATCAGT
3250 . : . : . : . : . :
3206 CGAGGACGGGCATCAACCAGCCACCATCCCTGACGCCCAGCAATTTTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462692 CGAGGACGGGCATCAACCAGCCACCATCCCTGACGCCCAGCAATTTTCCT
3300 . : . : . : . : . :
3256 TCACCCAACCAAAGTTCCAGGGCTTTTCAAGGAACTGACCACAGCAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462742 TCACCCAACCAAAGTTCCAGGGCTTTTCAAGGAACTGACCACAGCAGTGA
3350 . : . : . : . : . :
3306 CTTAGCTTTTGACTTCCTCAGCCAACAAAATGATAACATGGGCCCTGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462792 CTTAGCTTTTGACTTCCTCAGCCAACAAAATGATAACATGGGCCCTGCCC
3400 . : . : . : . : . :
3356 TAAACAGTGATGCTGATTTCATTGATTCTTTATTGAAGACAGAGCCTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462842 TAAACAGTGATGCTGATTTCATTGATTCTTTATTGAAGACAGAGCCTGGT
3450 . : . : . : . : . :
3406 AATGATGACTGGATGAAAGACATCAATCTTGATGAAATCTTGGGGAACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462892 AATGATGACTGGATGAAAGACATCAATCTTGATGAAATCTTGGGGAACAA
3500
3456 TTCC
||||
462942 TTCC