seq1 = pF1KSDA1813.tfa, 2007 bp
seq2 = pF1KSDA1813/gi568815588f_100902539.tfa (gi568815588f:100902539_101107165), 204627 bp

>pF1KSDA1813 2007
>gi568815588f:100902539_101107165 (Chr10)

1-408  (100001-100408)   100% ->
409-1068  (100969-101628)   100% ->
1069-1326  (102920-103177)   100% ->
1327-2007  (103947-104627)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCATTGTGCAGACTCTGCCAGTGCCACTGGAGCCTGCTCCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCATTGTGCAGACTCTGCCAGTGCCACTGGAGCCTGCTCCTGAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCACTGCCCCACAAGCTCCAGTCATGGGTAGTGTGAGCAGCCTTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCACTGCCCCACAAGCTCCAGTCATGGGTAGTGTGAGCAGCCTTATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGCCGGCCCTGTCCCGGGGGGCCAGCTCCTCCCCGCCACCACGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGCCGGCCCTGTCCCGGGGGGCCAGCTCCTCCCCGCCACCACGGCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTGGGCCCACCTTCTTCCGCCAGCAGGATGGCCTGCTACGGGGTGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTGGGCCCACCTTCTTCCGCCAGCAGGATGGCCTGCTACGGGGTGGCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGGCACAGGAGCCGCTGTGCCCAGCTGTGCCCCCTAGGAAGGCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGGCACAGGAGCCGCTGTGCCCAGCTGTGCCCCCTAGGAAGGCTGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGTCACCAGCTTCACCTACATCAATGAGGACTTCCGGACAGAGTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGTCACCAGCTTCACCTACATCAATGAGGACTTCCGGACAGAGTCACCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCAGCCCAAGCAGTGATGTTGAGGATGCCCGAGAGCAGCGGGCACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCAGCCCAAGCAGTGATGTTGAGGATGCCCGAGAGCAGCGGGCACACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCCCACCTCCGCGGCCCACCACCAAAGCTCATCCCTGTCTCTGGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCCCACCTCCGCGGCCCACCACCAAAGCTCATCCCTGTCTCTGGAAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAGAAG         AACATGGAGAAGATCCTGATCCGCCCAACAGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGAGAAGGTG...CAGAACATGGAGAAGATCCTGATCCGCCCAACAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTCAAGCCAGTGCTGCCCAAACCTCGAGGGGCTCCGTCCCTGCCTAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101002 TTCAAGCCAGTGCTGCCCAAACCTCGAGGGGCTCCGTCCCTGCCTAGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATGGGTCCTCGGGCCACCGGGCTGTCTGGGAGCCAGGGCAGCCTGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101052 CATGGGTCCTCGGGCCACCGGGCTGTCTGGGAGCCAGGGCAGCCTGACGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGCTGTTTGGGGGCCCTGCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101102 AGCTGTTTGGGGGCCCTGCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCTGCTGACAAACCCCTGGCATTTAGTGGCTGGGCCAGTGGCTGCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101152 GCTGCTGACAAACCCCTGGCATTTAGTGGCTGGGCCAGTGGCTGCCCATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGGGACGCTATCCGACTCTGGCCGAAACTCACTGTCCAGCCTGCCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101202 AGGGACGCTATCCGACTCTGGCCGAAACTCACTGTCCAGCCTGCCCACCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACAGCACCGGAGGTGCCGAGCCAACCACCAGCTCCCCAGGCGGGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101252 ACAGCACCGGAGGTGCCGAGCCAACCACCAGCTCCCCAGGCGGGCACCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCTTCCCATGGCTCTGGGCGAGGGGCACTGCCTGGGCCAGCCCGAGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101302 CCTTCCCATGGCTCTGGGCGAGGGGCACTGCCTGGGCCAGCCCGAGGGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCCTACTGGGCCCTCCCACTCAGACAGTGGCCGGTCCTCCTCCAGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101352 CCCTACTGGGCCCTCCCACTCAGACAGTGGCCGGTCCTCCTCCAGCAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCACAGGCTCCCTAGGGGGCCGTGTGGCTGGGGGGCTTTTGGGCAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101402 GCACAGGCTCCCTAGGGGGCCGTGTGGCTGGGGGGCTTTTGGGCAGTGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ACTCGGGCCTCCCCTGACAGCAGCTCCTGTGGGGAGCGCTCACCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101452 ACTCGGGCCTCCCCTGACAGCAGCTCCTGTGGGGAGCGCTCACCACCACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCCGCCTCCACCTCCTTCGGATGAGGCCCTGCTGCACTGTGTCCTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101502 CCCGCCTCCACCTCCTTCGGATGAGGCCCTGCTGCACTGTGTCCTGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GAAAGCTCCGAGACCGGGAGGCAGAGCTTCAGCAGCTGCGGGACAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101552 GAAAGCTCCGAGACCGGGAGGCAGAGCTTCAGCAGCTGCGGGACAGTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GACGAGAATGAGGCTACCATGTGCCAG         GCATACGAGGAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101602 GACGAGAATGAGGCTACCATGTGCCAGGTG...CAGGCATACGAGGAGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GCAGCGGCACTGGCAGCGAGAGCGTGAGGCCCTGCGAGAGGACTGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102934 GCAGCGGCACTGGCAGCGAGAGCGTGAGGCCCTGCGAGAGGACTGTGCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CCCAGGCACAGCGGGCACAGCGGGCCCAACAGCTGCTGCAGCTGCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102984 CCCAGGCACAGCGGGCACAGCGGGCCCAACAGCTGCTGCAGCTGCAGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TTCCAGCTGCAGCAGGAGAAGCGGCAATTGCAGGACGACTTCGCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103034 TTCCAGCTGCAGCAGGAGAAGCGGCAATTGCAGGACGACTTCGCACAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GCTGCAGGAGCGCGAACAGCTGGAGCGGCGCTGCGCCACCTTGGAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103084 GCTGCAGGAGCGCGAACAGCTGGAGCGGCGCTGCGCCACCTTGGAGCGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AGCAGCGGGAGCTCGGGCCGAGGCTTGAGGAGACCAAGTGGGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103134 AGCAGCGGGAGCTCGGGCCGAGGCTTGAGGAGACCAAGTGGGAGGTG...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1327    GTGTGCCAGAAATCAGGCGAGATCTCCCTGCTGAAGCAGCAGCTGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103944 CAGGTGTGCCAGAAATCAGGCGAGATCTCCCTGCTGAAGCAGCAGCTGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 AGAGTCTCAGGCAGAGCTGGTGCAGAAGGGCAGCGAGCTGGTGGCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103994 AGAGTCTCAGGCAGAGCTGGTGCAGAAGGGCAGCGAGCTGGTGGCTCTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GGGTGGCGCTGCGGGAGGCCCGTGCTACGCTGCGGGTCAGTGAGGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104044 GGGTGGCGCTGCGGGAGGCCCGTGCTACGCTGCGGGTCAGTGAGGGCCGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GCGCGGGGTCTACAGGAGGCCGCCCGAGCTCGGGAGCTGGAGCTGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104094 GCGCGGGGTCTACAGGAGGCCGCCCGAGCTCGGGAGCTGGAGCTGGAAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CTGTTCCCAGGAGCTGCAGCGACACCGCCAGGAAGCTGAGCAGCTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104144 CTGTTCCCAGGAGCTGCAGCGACACCGCCAGGAAGCTGAGCAGCTGCGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 AGAAAGCTGGGCAGTTGGATGCTGAGGCGGCCGGACTCCGGGAGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104194 AGAAAGCTGGGCAGTTGGATGCTGAGGCGGCCGGACTCCGGGAGCCCCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 GTGCCACCTGCCACCGCTGACCCATTCCTCCTGGCGGAGAGTGATGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 104244 GTGCCACCTGCCACCGCTGACCCATTCCTCCTGGCAGAGAGTGATGAGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CAAAGTGCAGCGGGCAGCAGCCGGGGTTGGGGGCAGCTTGCGGGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104294 CAAAGTGCAGCGGGCAGCAGCCGGGGTTGGGGGCAGCTTGCGGGCCCAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 TGGAGCGATTGCGGGTGGAGCTGCAGCGGGAGCGGCGGCGGGGTGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104344 TGGAGCGATTGCGGGTGGAGCTGCAGCGGGAGCGGCGGCGGGGTGAGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 CAGCGGGACAGCTTTGAGGGGGAGCGGCTGGCCTGGCAGGCAGAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104394 CAGCGGGACAGCTTTGAGGGGGAGCGGCTGGCCTGGCAGGCAGAGAAGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 GCAGGTGATCCGCTACCAGAAGCAGCTGCAGCACAACTACATCCAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104444 GCAGGTGATCCGCTACCAGAAGCAGCTGCAGCACAACTACATCCAGATGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 ACCGGCGCAACCGGCAGCTAGAGCAGGAGCTGCAGCAGCTCAGCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104494 ACCGGCGCAACCGGCAGCTAGAGCAGGAGCTGCAGCAGCTCAGCCTGGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 CTGGAGGCCCGGGAGCTCGCTGACCTGGGCCTGGCCGAGCAGGCCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104544 CTGGAGGCCCGGGAGCTCGCTGACCTGGGCCTGGCCGAGCAGGCCCCCTG

   2000     .    :    .    :    .    :
   1974 CATCTGCCTGGAGGAGATCACTGCTACTGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104594 CATCTGCCTGGAGGAGATCACTGCTACTGAGATC