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seq2 = pF1KSDA1809/gi568815596r_60352578.tfa (gi568815596r:60352578_60653270), 300693 bp

>pF1KSDA1809 2319
>gi568815596r:60352578_60653270 (Chr2)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-385  (106971-107300)   100% ->
386-487  (184438-184539)   100% ->
488-2230  (190847-192589)   99% ->
2231-2319  (200605-200693)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCGCCGCAAGCAAGGCAAACCCCAGCACTTAAGCAAACGGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCGCCGCAAGCAAGGCAAACCCCAGCACTTAAGCAAACGGGAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGC         CCGAGCCTCTTGAAGCCATTCTTACAGATGATGAAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGCGTA...CAGCCGAGCCTCTTGAAGCCATTCTTACAGATGATGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGACCACGGCCCGTTGGGAGCTCCAGAAGGGGATCATGACCTCCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107007 CAGACCACGGCCCGTTGGGAGCTCCAGAAGGGGATCATGACCTCCTCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTGGGCAGTGCCAGATGAACTTCCCATTGGGGGACATTCTTATTTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107057 TGTGGGCAGTGCCAGATGAACTTCCCATTGGGGGACATTCTTATTTTTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGAGCACAAACGGAAACAATGCAATGGCAGCCTCTGCTTAGAAAAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107107 CGAGCACAAACGGAAACAATGCAATGGCAGCCTCTGCTTAGAAAAAGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGATAAGCCACCTTCCCCTTCACCAATCGAGATGAAAAAAGCATCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107157 TGGATAAGCCACCTTCCCCTTCACCAATCGAGATGAAAAAAGCATCCAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCGTGGAGGTTGGCATCCAGGTCACGCCAGAGGATGACGATTGTTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107207 CCCGTGGAGGTTGGCATCCAGGTCACGCCAGAGGATGACGATTGTTTATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AACGTCATCTAGAGGAATTTGCCCCAAACAGGAACACATAGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 107257 AACGTCATCTAGAGGAATTTGCCCCAAACAGGAACACATAGCAGGTA...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    386    ATAAACTTCTGCACTGGAGGGGCCTCTCCTCCCCTCGTTCTGCACAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184435 CAGATAAACTTCTGCACTGGAGGGGCCTCTCCTCCCCTCGTTCTGCACAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGAGCTCTAATCCCCACGCCTGGGATGAGTGCAGAATATGCCCCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184485 GGAGCTCTAATCCCCACGCCTGGGATGAGTGCAGAATATGCCCCGCAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TATTT         GTAAAGATGAGCCCAGCAGCTACACATGTACAACTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184535 TATTTGTA...CAGGTAAAGATGAGCCCAGCAGCTACACATGTACAACTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCAAACAGCCATTCACCAGTGCATGGTTTCTCTTGCAACACGCACAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190883 GCAAACAGCCATTCACCAGTGCATGGTTTCTCTTGCAACACGCACAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACTCATGGATTAAGAATCTACTTAGAAAGCGAACACGGAAGTCCCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190933 ACTCATGGATTAAGAATCTACTTAGAAAGCGAACACGGAAGTCCCCTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCCGCGGGTTGGTATCCCTTCAGGACTAGGTGCAGAATGTCCTTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190983 CCCGCGGGTTGGTATCCCTTCAGGACTAGGTGCAGAATGTCCTTCCCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CACCTCTCCATGGGATTCATATTGCAGACAATAACCCCTTTAACCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191033 CACCTCTCCATGGGATTCATATTGCAGACAATAACCCCTTTAACCTGCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGAATACCAGGATCAGTATCGAGAGAGGCTTCCGGCCTGGCAGAAGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191083 AGAATACCAGGATCAGTATCGAGAGAGGCTTCCGGCCTGGCAGAAGGGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTTTCCACCCACTCCCCCCCTGTTTAGTCCACCACCGAGACATCACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191133 CTTTCCACCCACTCCCCCCCTGTTTAGTCCACCACCGAGACATCACTTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ACCCCCACCGCATAGAGCGCCTGGGGGCGGAAGAGATGGCCCTGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191183 ACCCCCACCGCATAGAGCGCCTGGGGGCGGAAGAGATGGCCCTGGCCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CATCACCCGAGTGCCTTTGACAGGGTGCTGCGGTTGAATCCAATGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191233 CATCACCCGAGTGCCTTTGACAGGGTGCTGCGGTTGAATCCAATGGCTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GGAGCCTCCCGCCATGGATTTCTCTAGGAGACTTAGAGAGCTGGCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191283 GGAGCCTCCCGCCATGGATTTCTCTAGGAGACTTAGAGAGCTGGCAGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ACACGTCTAGCCCACCGCTGTCCCCAGGCCGGCCCAGCCCTATGCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191333 ACACGTCTAGCCCACCGCTGTCCCCAGGCCGGCCCAGCCCTATGCAAAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TTACTGCAACCATTCCAGCCAGGTAGCAAGCCGCCCTTCCTGGCGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191383 TTACTGCAACCATTCCAGCCAGGTAGCAAGCCGCCCTTCCTGGCGACGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCCCCTCCCTCCTCTGCAATCCGCCCCTCCTCCCTCCCAGCCCCCGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191433 CCCCCTCCCTCCTCTGCAATCCGCCCCTCCTCCCTCCCAGCCCCCGGTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGTCCAAGTCATGCGAGTTCTGCGGCAAGACGTTCAAATTTCAGAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191483 AGTCCAAGTCATGCGAGTTCTGCGGCAAGACGTTCAAATTTCAGAGCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CTGGTGGTGCACCGGCGCAGCCACACGGGCGAGAAGCCCTACAAGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191533 CTGGTGGTGCACCGGCGCAGCCACACGGGCGAGAAGCCCTACAAGTGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CCTGTGCGACCACGCGTGCACCCAGGCCAGCAAGCTGAAGCGCCACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191583 CCTGTGCGACCACGCGTGCACCCAGGCCAGCAAGCTGAAGCGCCACATGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 AGACGCACATGCACAAATCGTCCCCCATGACGGTCAAGTCCGACGACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191633 AGACGCACATGCACAAATCGTCCCCCATGACGGTCAAGTCCGACGACGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 CTCTCCACCGCCAGCTCCCCGGAACCCGGCACCAGCGACTTGGTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191683 CTCTCCACCGCCAGCTCCCCGGAACCCGGCACCAGCGACTTGGTGGGCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CGCCAGCAGCGCGCTCAAGTCCGTGGTGGCCAAGTTCAAGAGCGAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191733 CGCCAGCAGCGCGCTCAAGTCCGTGGTGGCCAAGTTCAAGAGCGAGAACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 ACCCCAACCTGATCCCGGAGAACGGGGACGAGGAGGAAGAGGAGGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191783 ACCCCAACCTGATCCCGGAGAACGGGGACGAGGAGGAAGAGGAGGACGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GAGGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGCTGACGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191833 GAGGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGCTGACGGAGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CGAGAGGGTGGACTACGGCTTCGGGCTGAGCCTGGAGGCGGCGCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191883 CGAGAGGGTGGACTACGGCTTCGGGCTGAGCCTGGAGGCGGCGCGCCACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 ACGAGAACAGCTCGCGGGGCGCGGTCGTGGGCGTGGGCGACGAGAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191933 ACGAGAACAGCTCGCGGGGCGCGGTCGTGGGCGTGGGCGACGAGAGCCGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 GCCCTGCCCGACGTCATGCAGGGCATGGTGCTCAGCTCCATGCAGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191983 GCCCTGCCCGACGTCATGCAGGGCATGGTGCTCAGCTCCATGCAGCACTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CAGCGAGGCCTTCCACCAGGTCCTGGGCGAGAAGCATAAGCGCGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192033 CAGCGAGGCCTTCCACCAGGTCCTGGGCGAGAAGCATAAGCGCGGCCACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 TGGCCGAGGCCGAGGGCCACAGGGACACTTGCGACGAAGACTCGGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192083 TGGCCGAGGCCGAGGGCCACAGGGACACTTGCGACGAAGACTCGGTGGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GGCGAGTCGGACCGCATAGACGATGGCACTGTTAATGGCCGCGGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192133 GGCGAGTCGGACCGCATAGACGATGGCACTGTTAATGGCCGCGGCTGCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CCCGGGCGAGTCGGCCTCGGGGGGCCTGTCCAAAAAGCTGCTGCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192183 CCCGGGCGAGTCGGCCTCGGGGGGCCTGTCCAAAAAGCTGCTGCTGGGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 GCCCCAGCTCGCTGAGCCCCTTCTCTAAGCGCATCAAGCTCGAGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192233 GCCCCAGCTCGCTGAGCCCCTTCTCTAAGCGCATCAAGCTCGAGAAGGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 TTCGACCTGCCCCCGGCCGCGATGCCCAACACGGAGAACGTGTACTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192283 TTCGACCTGCCCCCGGCCGCGATGCCCAACACGGAGAACGTGTACTCGCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974 GTGGCTCGCCGGCTACGCGGCCTCCAGGCAGCTCAAAGATCCCTTCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192333 GTGGCTCGCCGGCTACGCGGCCTCCAGGCAGCTCAAAGATCCCTTCCTTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 GCTTCGGAGACTCCAGACAATCGCCTTTTGCCTCCTCGTCGGAGCACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192383 GCTTCGGAGACTCCAGACAATCGCCTTTTGCCTCCTCGTCGGAGCACTCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2074 TCGGAGAACGGGAGCTTGCGCTTCTCCACACCGCCCGGGGAGCTGGACGG
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192433 TCGGAGAACGGGAGTTTGCGCTTCTCCACACCGCCCGGGGAGCTGGACGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2124 AGGGATCTCGGGGCGCAGCGGCACGGGAAGTGGAGGGAGCACGCCCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192483 AGGGATCTCGGGGCGCAGCGGCACGGGAAGTGGAGGGAGCACGCCCCATA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2174 TTAGTGGTCCGGGCCCGGGCAGGCCCAGCTCAAAAGAGGGCAGACGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192533 TTAGTGGTCCGGGCCCGGGCAGGCCCAGCTCAAAAGAGGGCAGACGCAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2224 GACACTT         GTTCTTCACACACCCCCATTCGGCGTAGTACCCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192583 GACACTTGTG...TAGGTTCTTCACACACCCCCATTCGGCGTAGTACCCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2265 GAGAGCTCAAGATGTGTGGCAGTTTTCGGATGGAAGCTCGAGAGCCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200639 GAGAGCTCAAGATGTGTGGCAGTTTTCGGATGGAAGCTCGAGAGCCCTTA

   2350     .
   2315 AGTTC
        |||||
 200689 AGTTC