seq1 = pF1KSDA1778.tfa, 975 bp
seq2 = pF1KSDA1778/gi568815585r_76785174.tfa (gi568815585r:76785174_76986091), 200918 bp

>pF1KSDA1778 975
>gi568815585r:76785174_76986091 (Chr13)

(complement)

1-975  (99944-100918)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCTGGCGGACAGCACACGTGGATTACCCAACGGGGGCGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99944 ATGGCTCTGGCGGACAGCACACGTGGATTACCCAACGGGGGCGGCGGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCGGCAGTGGCTCCTCGTCGTCCTCCGCGGAGCCACCGCTCTTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99994 GGGCGGCAGTGGCTCCTCGTCGTCCTCCGCGGAGCCACCGCTCTTCCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATCGTGGAGCTGAACGTGGGGGGCCAGGTGTACGTGACCCGGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 ACATCGTGGAGCTGAACGTGGGGGGCCAGGTGTACGTGACCCGGCGCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGGTGGTGTCGGTGCCCGACTCGCTGCTCTGGCGCATGTTCACGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100094 ACGGTGGTGTCGGTGCCCGACTCGCTGCTCTGGCGCATGTTCACGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGCCGCAGGAGCTGGCCCGGGACAGCAAAGGCCGCTTCTTTCTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100144 GCAGCCGCAGGAGCTGGCCCGGGACAGCAAAGGCCGCTTCTTTCTGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGACGGCTTCCTCTTCCGCTACATCCTGGATTACCTGCGGGACTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100194 GGGACGGCTTCCTCTTCCGCTACATCCTGGATTACCTGCGGGACTTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCGTGCTGCCCGACTACTTCCCCGAGCGCAGCCGGCTGCAGCGCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100244 CTCGTGCTGCCCGACTACTTCCCCGAGCGCAGCCGGCTGCAGCGCGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGAGTACTTCGAGCTGCCAGAGCTCGTGCGCCGCCTCGGGGCGCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100294 CGAGTACTTCGAGCTGCCAGAGCTCGTGCGCCGCCTCGGGGCGCCCCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCCCGGCCCGGGGCCGCCGCCCTCGCGGCGCGGGGTGCACAAGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100344 AGCCCGGCCCGGGGCCGCCGCCCTCGCGGCGCGGGGTGCACAAGGAGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCGCTGGGTGACGAGCTGCTGCCGCTTGGCTACTCGGAGCCCGAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100394 TCGCTGGGTGACGAGCTGCTGCCGCTTGGCTACTCGGAGCCCGAACAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAGGGCGCCTCTGCCGGGGCGCCGTCGCCCACGCTGGAGCTGGCTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100444 GGAGGGCGCCTCTGCCGGGGCGCCGTCGCCCACGCTGGAGCTGGCTAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAGTCCGTCCGGGGGCGCGGCGGGCCCGCTGCTCACGCCGTCCCAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100494 GCAGTCCGTCCGGGGGCGCGGCGGGCCCGCTGCTCACGCCGTCCCAGTCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGACGGCAGCCGGCGCTCGGGCTACATCACCATCGGCTACCGCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100544 CTGGACGGCAGCCGGCGCTCGGGCTACATCACCATCGGCTACCGCGGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACACCATCGGGCGGGACGCGCAGGCGGACGCCAAGTTCCGGCGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100594 CTACACCATCGGGCGGGACGCGCAGGCGGACGCCAAGTTCCGGCGAGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGCGCATCACCGTTTGCGGAAAGACGTCGCTGGCCAAGGAGGTGTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100644 CGCGCATCACCGTTTGCGGAAAGACGTCGCTGGCCAAGGAGGTGTTTGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GACACCCTGAACGAAAGCCGGGACCCCGACCGTCCCCCGGAGCGCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100694 GACACCCTGAACGAAAGCCGGGACCCCGACCGTCCCCCGGAGCGCTACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCGCGCTATTACCTCAAGTTCAACTTCCTGGAGCAGGCCTTCGACAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100744 CTCGCGCTATTACCTCAAGTTCAACTTCCTGGAGCAGGCCTTCGACAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTCCGAGTCGGGCTTCCACATGGTGGCGTGCAGCTCCACGGGCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100794 TGTCCGAGTCGGGCTTCCACATGGTGGCGTGCAGCTCCACGGGCACCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCTTTGCCAGCAGCACCGACCAGAGCGAGGACAAGATCTGGACCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100844 GCCTTTGCCAGCAGCACCGACCAGAGCGAGGACAAGATCTGGACCAGCTA

    950     .    :    .    :    .
    951 CACCGAGTACGTCTTCTGCAGGGAG
        |||||||||||||||||||||||||
 100894 CACCGAGTACGTCTTCTGCAGGGAG