seq1 = pF1KSDA1750.tfa, 1251 bp
seq2 = pF1KSDA1750/gi568815590r_97176594.tfa (gi568815590r:97176594_97377844), 201251 bp

>pF1KSDA1750 1251
>gi568815590r:97176594_97377844 (Chr8)

(complement)

1-1251  (100001-101251)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGGCCGAAGTCGGGGTCGAAAGTCCTCCCGCGCCAAAAACCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGGCCGAAGTCGGGGTCGAAAGTCCTCCCGCGCCAAAAACCGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAAGGCCGCGCCAAAGCCCGAGTCCGCCCTGCTCCAGACGACGCCCCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100051 CAAAGGCCGCGCCAAAGCCCGAGTCCGCCCTGCTCCGGACGACGCCCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGACCCGGACCCTTCACAGTACCAGAGTCTCGGGGAAGACACCCAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGACCCGGACCCTTCACAGTACCAGAGTCTCGGGGAAGACACCCAGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCACAGGTGCAGGCTGGCGCGGGGTGGGGTGGCCTGGAAGCCGCTGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCACAGGTGCAGGCTGGCGCGGGGTGGGGTGGCCTGGAAGCCGCTGCGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCGCAGCTCCTCCGGCTCGGGGAGGAGGCCGCCTGCCGGCTCCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCGCAGCTCCTCCGGCTCGGGGAGGAGGCCGCCTGCCGGCTCCCCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTGTGGCCTCGCGCTGCGGGCCCGAGCTGCGGGGGACCACGGGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTGTGGCCTCGCGCTGCGGGCCCGAGCTGCGGGGGACCACGGGCAGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGCCAGGCCCGGCCCGGGGAAGGCCGCATCTCTCTCGGAGCGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGGCCAGGCCCGGCCCGGGGAAGGCCGCATCTCTCTCGGAGCGCCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCAGACACTGTCTTCGTGGGAACAGCGGGAACCGTGGGAAGGCCGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCAGACACTGTCTTCGTGGGAACAGCGGGAACCGTGGGAAGGCCGAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGCCCCCCGCGTTGGAAACCGGCGTGGCCCTGCCGGGAAGAAGGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGCCCCCCGCGTTGGAAACCGGCGTGGCCCTGCCGGGAAGAAGGCCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAAACCTGTAGCACCGCGGGGAGGGGGCCTCAGGTCATAGCTGGTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAAACCTGTAGCACCGCGGGGAGGGGGCCTCAGGTCATAGCTGGTGGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCAGAAGAAAGGGGCGGCAGGGGAGAATACCTCGGTGTCAGCTGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCAGAAGAAAGGGGCGGCAGGGGAGAATACCTCGGTGTCAGCTGGGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAAAGAAGGAAGAGAGGGATGCAGGGTCGGGGCCCCCAGCGACGGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAAAGAAGGAAGAGAGGGATGCAGGGTCGGGGCCCCCAGCGACGGAAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGCATGGATACGCTGGAGAACGTGCAGCTGAAGCTGGAGAACATGAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGCATGGATACGCTGGAGAACGTGCAGCTGAAGCTGGAGAACATGAACGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCAGGCGGACAGGGCCTACCTTCGGCTCTCCAGGAAGTTTGGGCAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCAGGCGGACAGGGCCTACCTTCGGCTCTCCAGGAAGTTTGGGCAGTTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GACTGCAGCACTTGGAGCGCAGGAACCACCTCATCCAAAATATCCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GACTGCAGCACTTGGAGCGCAGGAACCACCTCATCCAAAATATCCCGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTGGGGGCAAGCATTTCAGAACCATCCCCAGCTAGCATCCTTTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTGGGGGCAAGCATTTCAGAACCATCCCCAGCTAGCATCCTTTCTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAGCCAAGAGAAAGAGGTACTGAGCTACTTAAACAGCTTGGAAGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAGCCAAGAGAAAGAGGTACTGAGCTACTTAAACAGCTTGGAAGTGGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGCTCGGCCTTGCCAGATTGGGCTACAAAATCAAGTTCTACTTCGATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGCTCGGCCTTGCCAGATTGGGCTACAAAATCAAGTTCTACTTCGATCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACCCGTATTTCCAAAATAAGGTGCTCATCAAGGAATATGGGTGTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACCCGTATTTCCAAAATAAGGTGCTCATCAAGGAATATGGGTGTGGTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TTCTGGCCAGGTGGTGTCTCGTTCTACTCCAATCCAGTGGCTCCCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TTCTGGCCAGGTGGTGTCTCGTTCTACTCCAATCCAGTGGCTCCCAGGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGATCTCCAGTCCCTAAGCCAGGGAAACCCAGAAAACAACCGTAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATGATCTCCAGTCCCTAAGCCAGGGAAACCCAGAAAACAACCGTAGTTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTTGGGTGGTTTTCAAACCACAGCTCCATTGAGTCTGACAAGATTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTTGGGTGGTTTTCAAACCACAGCTCCATTGAGTCTGACAAGATTGTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GATAATCAACGAAGAATTGTGGCCCAATCCCTTGCAGTTCTACCTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GATAATCAACGAAGAATTGTGGCCCAATCCCTTGCAGTTCTACCTTTTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTGAAGGGGCTCGTGTAGAGAAAGGAAAGGAAAAAGAAGGCAGGCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTGAAGGGGCTCGTGTAGAGAAAGGAAAGGAAAAAGAAGGCAGGCAAGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCAGGAAAGCAGCCAATGGAGACTACTCAGCCTGGGGTGAGCCAATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCAGGAAAGCAGCCAATGGAGACTACTCAGCCTGGGGTGAGCCAATCCAA

   1250 
   1251 C
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 101251 C