seq1 = pF1KSDA1721.tfa, 3453 bp
seq2 = pF1KSDA1721/gi568815585r_20683725.tfa (gi568815585r:20683725_21002738), 319014 bp

>pF1KSDA1721 3453
>gi568815585r:20683725_21002738 (Chr13)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-175  (134038-134143)   100% ->
176-317  (139881-140022)   100% ->
318-456  (146974-147112)   100% ->
457-573  (158853-158969)   100% ->
574-727  (159691-159844)   100% ->
728-840  (175560-175672)   100% ->
841-998  (180450-180607)   100% ->
999-1173  (180861-181035)   100% ->
1174-1350  (192772-192948)   100% ->
1351-1493  (193514-193656)   100% ->
1494-1639  (194158-194303)   100% ->
1640-1817  (195105-195282)   100% ->
1818-1977  (201749-201908)   100% ->
1978-2147  (202414-202583)   100% ->
2148-2322  (203400-203574)   100% ->
2323-2616  (205682-205975)   100% ->
2617-2797  (206483-206663)   100% ->
2798-2916  (212159-212277)   100% ->
2917-3047  (214123-214253)   100% ->
3048-3165  (215141-215258)   100% ->
3166-3258  (215682-215774)   100% ->
3259-3453  (218820-219014)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCGGCGGCGCTGGGGCCCCCAGAAGTGATCGCTCAGCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGCGGCGGCGCTGGGGCCCCCAGAAGTGATCGCTCAGCTGGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGGCTAAAGTTCTGATG         GCACCACCTTCCATGGTCAATA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGGCTAAAGTTCTGATGGTG...AAGGCACCACCTTCCATGGTCAATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGAACAACGCCAGCATGCAGAGCACATATTCTTATCATTTAGGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134060 ATGAACAACGCCAGCATGCAGAGCACATATTCTTATCATTTAGGAAATCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAATCACCATTTGCAGTTTGCAAGCATATTTTGG         AAACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 134110 AAATCACCATTTGCAGTTTGCAAGCATATTTTGGGTA...CAGAAACTAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAAAGTGGACTATGTCCTCTTTCAAGCTGCCACAGCCATAATGGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139888 TAAAGTGGACTATGTCCTCTTTCAAGCTGCCACAGCCATAATGGAAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGTCCGAGAGTGGATTCTCTTGGAAAAAGGTAGCATCGAGTCTCTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139938 TTGTCCGAGAGTGGATTCTCTTGGAAAAAGGTAGCATCGAGTCTCTGCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACATTCCTTTTAACCTATGTCTTACAAAGGCCCAA         CCTTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 139988 ACATTCCTTTTAACCTATGTCTTACAAAGGCCCAAGTA...CAGCCTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAGTATGTTCGGGAACAGATTCTACTAGCAGTAGCAGTAATTGTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146980 AAAGTATGTTCGGGAACAGATTCTACTAGCAGTAGCAGTAATTGTAAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGGATCATTAGATAAATCAATTGACTGCAAAAGCATTTTTCATGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147030 GAGGATCATTAGATAAATCAATTGACTGCAAAAGCATTTTTCATGAAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCCAGTTGATTAGTAGTGGCAATCCCACTGTG         CAAACTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 147080 AGCCAGTTGATTAGTAGTGGCAATCCCACTGTGGTA...CAGCAAACTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGCCTGTTCTATTCTGACTGCGCTATTGAGTGAATTTTCAAGTTCAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158861 GGCCTGTTCTATTCTGACTGCGCTATTGAGTGAATTTTCAAGTTCAAGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAACTAGCAACATTGGATTGAGCATGGAATTCCATGGTAACTGCAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158911 AAACTAGCAACATTGGATTGAGCATGGAATTCCATGGTAACTGCAAAAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTTTTTCAG         GAAGAAGACCTTCGTCAGATCTTCATGTTAAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 158961 GTTTTTCAGGTA...TAGGAAGAAGACCTTCGTCAGATCTTCATGTTAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTTGAAGTTCTGCAGGAGTTCAGCAGGCGGGAAAACCTCAATGCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159723 TGTTGAAGTTCTGCAGGAGTTCAGCAGGCGGGAAAACCTCAATGCTCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGTCTTCAGTATTTCAGCGTTACCTTGCACTCGCCAATCAAGTCTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159773 TGTCTTCAGTATTTCAGCGTTACCTTGCACTCGCCAATCAAGTCTTGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGGAACTTTCTTCCTCCAAATT         TGGGCAGACATTATATAGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 159823 TGGAACTTTCTTCCTCCAAATTATA...AACTGGGCAGACATTATATAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TATGTTTGAATCCTCGCAAAATGTGCTGTTGAAGCCAACAGAGTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175579 TATGTTTGAATCCTCGCAAAATGTGCTGTTGAAGCCAACAGAGTCCTGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGGAGACTCTTCTGGACAGCAGAGTTATGGAGCTTTTCTTCACA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 175629 GGGAGACTCTTCTGGACAGCAGAGTTATGGAGCTTTTCTTCACAGTA...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    841    GTACATCGAAAAATCAGAGAAGATTCAGATATGGCACAAGATTCTCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180447 CAGGTACATCGAAAAATCAGAGAAGATTCAGATATGGCACAAGATTCTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCAGTGCCTTGCCCAGTTAGCTTCTCTTCATGGACCCATCTTCCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180497 GCAGTGCCTTGCCCAGTTAGCTTCTCTTCATGGACCCATCTTCCCAGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGGATCACAAGTTGATTATCTAGCACACTTCATTGAGGGATTACTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180547 AAGGATCACAAGTTGATTATCTAGCACACTTCATTGAGGGATTACTGAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACTATCAATGG         AATTGAAATAGAAGATTCTGAAGCTGTGGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 180597 ACTATCAATGGGTA...TAGAATTGAAATAGAAGATTCTGAAGCTGTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GATCTCCAGCATTATCAGCAACCTGATAACCGTGTTCCCACGAAATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180891 GATCTCCAGCATTATCAGCAACCTGATAACCGTGTTCCCACGAAATGTTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TAACTGCCATTCCAAGTGAACTTTTCTCCTCCTTTGTTAACTGCCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180941 TAACTGCCATTCCAAGTGAACTTTTCTCCTCCTTTGTTAACTGCCTCACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CACCTCACTTGTTCTTTTGGGCGAAGTGCTGCATTGGAAGAAGTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 180991 CACCTCACTTGTTCTTTTGGGCGAAGTGCTGCATTGGAAGAAGTGGTG..

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174     CTTGATAAAGATGACATGGTATACATGGAAGCATATGATAAATTGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181041 .TAGCTTGATAAAGATGACATGGTATACATGGAAGCATATGATAAATTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TGGAGTCCTGGTTAACTTTGGTTCAAGATGACAAACATTTCCATAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192818 TGGAGTCCTGGTTAACTTTGGTTCAAGATGACAAACATTTCCATAAAGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TTTTTTACCCAACATGCAGTTCAAGTTTTCAATTCCTATATTCAGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192868 TTTTTTACCCAACATGCAGTTCAAGTTTTCAATTCCTATATTCAGTGCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CCTAGCTGCTCCAGATGGCACAAGAAATTTG         ACTGCCAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 192918 CCTAGCTGCTCCAGATGGCACAAGAAATTTGGTG...TAGACTGCCAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GTGTGGCCTCTCGTGAGGAGGAAGAAATAAGTGAACTTCAAGAGGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193524 GTGTGGCCTCTCGTGAGGAGGAAGAAATAAGTGAACTTCAAGAGGATGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CGAGACCAGTTTTCTGATCAACTGGCCAGTGTAGGAATGCTAGGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193574 CGAGACCAGTTTTCTGATCAACTGGCCAGTGTAGGAATGCTAGGAAGAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TGCTGCAGAACACTGTATACCTCTTCTGACAAG         TTTATTAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 193624 TGCTGCAGAACACTGTATACCTCTTCTGACAAGGTA...TAGTTTATTAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AAGAAAGAGTAACAAGACTCCATGGTCAGTTACAACGACATCAGCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194166 AAGAAAGAGTAACAAGACTCCATGGTCAGTTACAACGACATCAGCAACAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 TTACTTGCTTCACCGGGTTCAAGCACTGTTGACAACAAAATGCTTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194216 TTACTTGCTTCACCGGGTTCAAGCACTGTTGACAACAAAATGCTTGATGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TCTCTATGAAGATATTCACTGGCTTATTTTAGTTACAG         GCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 194266 TCTCTATGAAGATATTCACTGGCTTATTTTAGTTACAGGTT...AAGGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 ACCTCTTAGCTGATGATACTCAGGGAGAGACTCCGCTAATACCTCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195108 ACCTCTTAGCTGATGATACTCAGGGAGAGACTCCGCTAATACCTCCAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 ATAATGGAATATTCCATTAAGCATTCATCTGAAGTTGACATTAATACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195158 ATAATGGAATATTCCATTAAGCATTCATCTGAAGTTGACATTAATACAAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 ACTTCAAATTTTGGGATCTCCAGGAGAAAAGGCTTCTTCCATCCCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195208 ACTTCAAATTTTGGGATCTCCAGGAGAAAAGGCTTCTTCCATCCCAGGGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ACAACAGAACAGATTCTGTGATTAG         GCTGTTGTCTGCCATT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 195258 ACAACAGAACAGATTCTGTGATTAGGTA...CAGGCTGTTGTCTGCCATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CTCAGAGTTTCAGAAGTTGAATCTCGAGCAATAAGAGCAGATCTCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201765 CTCAGAGTTTCAGAAGTTGAATCTCGAGCAATAAGAGCAGATCTCACTCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TCTACTAAGTCCCCAGATGGGCAAAGATATTGTTTGGTTTTTAAAACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201815 TCTACTAAGTCCCCAGATGGGCAAAGATATTGTTTGGTTTTTAAAACGCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 GGGCAAAGACTTATCTCCTGGTGGATGAAAAACTGTATGATCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 201865 GGGCAAAGACTTATCTCCTGGTGGATGAAAAACTGTATGATCAGGTC...

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1978    ATAAGTCTGCCATTCAGTACAGCGTTCGGAGCAGATACAGAGGGTTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202411 AAGATAAGTCTGCCATTCAGTACAGCGTTCGGAGCAGATACAGAGGGTTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TCAGTGGATAATTGGCTACCTCTTACAAAAAGTCATCAGTAACCTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202461 TCAGTGGATAATTGGCTACCTCTTACAAAAAGTCATCAGTAACCTCTCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 TCTGGAGTAGTGAGCAGGACCTTGCAAATGACACTGTGCAGCTCCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202511 TCTGGAGTAGTGAGCAGGACCTTGCAAATGACACTGTGCAGCTCCTTGTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 ACTTTGGTGGAAAGAAGAGAAAG         GGCAAACTTAGTAATTCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 202561 ACTTTGGTGGAAAGAAGAGAAAGGTT...TAGGGCAAACTTAGTAATTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 ATGTGAGAACTGGTGGAATTTAGCTAAGCAGTTTGCAAGCCGAAGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203418 ATGTGAGAACTGGTGGAATTTAGCTAAGCAGTTTGCAAGCCGAAGCCCAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 CTCTTAATTTCTTGTCAAGTCCTGTGCAGAGGACATTGATGAAGGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203468 CTCTTAATTTCTTGTCAAGTCCTGTGCAGAGGACATTGATGAAGGCTCTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GTCTTAGGAGGTTTTGCACATATGGACACAGAAACCAAACAGCAGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203518 GTCTTAGGAGGTTTTGCACATATGGACACAGAAACCAAACAGCAGTATTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GACAGAG         GTTCTTCAGCCACTTCAGCAGCGATTCTTAAGAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203568 GACAGAGGTA...TAGGTTCTTCAGCCACTTCAGCAGCGATTCTTAAGAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 TGATAAACCAAGAAAACTTCCAGCAGATGTGTCAGCAAGAGGAAGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205716 TGATAAACCAAGAAAACTTCCAGCAGATGTGTCAGCAAGAGGAAGTCAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 CAGGAAATCACTGCCACACTAGAGGCCCTGTGTGGCATTGCTGAGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205766 CAGGAAATCACTGCCACACTAGAGGCCCTGTGTGGCATTGCTGAGGCTAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 CCAGATTGACAACGTAGCAATCCTGTTTAATTTTTTAATGGACTTCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205816 CCAGATTGACAACGTAGCAATCCTGTTTAATTTTTTAATGGACTTCCTTA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 CCAATTGCATTGGATTGATGGAAGTTTACAAGAATACCCCAGAGACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205866 CCAATTGCATTGGATTGATGGAAGTTTACAAGAATACCCCAGAGACTGTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 AATCTCATTATAGAAGTTTTTGTTGAAGTTGCACATAAACAGATATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205916 AATCTCATTATAGAAGTTTTTGTTGAAGTTGCACATAAACAGATATGCTA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 TCTTGGAGAG         TCCAAAGCTATGAACTTATATGAAGCCTGCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 205966 TCTTGGAGAGGTA...CAGTCCAAAGCTATGAACTTATATGAAGCCTGCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 TTACTTTGTTGCAAGTGTATTCTAAGAATAATTTAGGGCGGCAAAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206514 TTACTTTGTTGCAAGTGTATTCTAAGAATAATTTAGGGCGGCAAAGAATA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GATGTTACAGCAGAAGAAGAGCAATACCAAGACCTGCTTCTCATTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206564 GATGTTACAGCAGAAGAAGAGCAATACCAAGACCTGCTTCTCATTATGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 ACTTCTTACTAACCTGCTGTCAAAAGAATTCATAGATTTCAGTGATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206614 ACTTCTTACTAACCTGCTGTCAAAAGAATTCATAGATTTCAGTGATACAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798          ATGAAGTGTTTAGAGGACATGAGCCAGGTCAAGCAGCAAAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206664 GTA...TAGATGAAGTGTTTAGAGGACATGAGCCAGGTCAAGCAGCAAAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 AGATCTGTGTCAGCAGCGGATGTTGTGTTGTATGGAGTAAACCTAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212200 AGATCTGTGTCAGCAGCGGATGTTGTGTTGTATGGAGTAAACCTAATTCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 GCCCTTGATGTCACAGGATCTCTTGAAG         TTTCCAACCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 212250 GCCCTTGATGTCACAGGATCTCTTGAAGGTA...CAGTTTCCAACCCTTT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2930 GTAATCAGTACTACAAATTAATCACATTTATCTGTGAGATTTTTCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214136 GTAATCAGTACTACAAATTAATCACATTTATCTGTGAGATTTTTCCTGAA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 AAAATACCACAGCTTCCTGAGGATCTGTTTAAAAGTCTGATGTACTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214186 AAAATACCACAGCTTCCTGAGGATCTGTTTAAAAGTCTGATGTACTCCCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 AGAATTAGGAATGACATC         AATGAGTTCGGAGGTTTGCCAGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 214236 AGAATTAGGAATGACATCATA...CAGAATGAGTTCGGAGGTTTGCCAGC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 TTTGCCTGGAGGCCTTGACACCGTTAGCTGAACAGTGTGCAAAAGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215164 TTTGCCTGGAGGCCTTGACACCGTTAGCTGAACAGTGTGCAAAAGCACAA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 GAAACAGACTCACCACTTTTTCTAGCAACACGGCACTTTCTTAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 215214 GAAACAGACTCACCACTTTTTCTAGCAACACGGCACTTTCTTAAGGTA..

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3166     CTGGTTTTTGATATGCTGGTTTTGCAAAAGCACAACACAGAGATGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215264 .CAGCTGGTTTTTGATATGCTGGTTTTGCAAAAGCACAACACAGAGATGA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3212 CCACTGCGGCTGGCGAAGCTTTCTACACGTTGGTGTGTTTGCACCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 215728 CCACTGCGGCTGGCGAAGCTTTCTACACGTTGGTGTGTTTGCACCAGGTA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3259       GCTGAATATTCTGAACTGGTCGAAACATTACTATCAAGTCAGCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215778 ...TAGGCTGAATATTCTGAACTGGTCGAAACATTACTATCAAGTCAGCA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3303 AGACCCAGTTATTTACCAGAGATTAGCAGATGCCTTCAACAAGCTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218864 AGACCCAGTTATTTACCAGAGATTAGCAGATGCCTTCAACAAGCTCACTG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3353 CAAGCAGCACTCCTCCTACGCTGGATCGGAAGCAGAAGATGGCCTTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218914 CAAGCAGCACTCCTCCTACGCTGGATCGGAAGCAGAAGATGGCCTTCTTA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3403 AAGAGTTTAGAAGAATTTATGGCAAATGTTGGTGGTCTCCTTTGTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218964 AAGAGTTTAGAAGAATTTATGGCAAATGTTGGTGGTCTCCTTTGTGTAAA

   3650 
   3453 A
        |
 219014 A