seq1 = pF1KSDA1711.tfa, 3093 bp
seq2 = pF1KSDA1711/gi568815589r_86188680.tfa (gi568815589r:86188680_86437481), 248802 bp

>pF1KSDA1711 3093
>gi568815589r:86188680_86437481 (Chr9)

(complement)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-216  (108990-109142)   100% ->
217-397  (111968-112148)   99% ->
398-1485  (113522-114609)   100% ->
1486-1636  (115007-115157)   100% ->
1637-1723  (117812-117898)   100% ->
1724-1824  (118424-118524)   100% ->
1825-1882  (120206-120263)   100% ->
1883-1986  (126673-126776)   100% ->
1987-2076  (127465-127554)   100% ->
2077-2190  (127906-128019)   100% ->
2191-2268  (128193-128270)   100% ->
2269-2446  (128876-129053)   100% ->
2447-2494  (132243-132290)   100% ->
2495-2586  (132535-132626)   100% ->
2587-2702  (134281-134396)   100% ->
2703-3028  (135881-136206)   100% ->
3029-3093  (148738-148802)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCATTTTCTTTCTTCAGCAGAGGAAAGAACCCCTTTTGCCTGTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCATTTTCTTTCTTCAGCAGAGGAAAGAACCCCTTTTGCCTGTATA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTAGGATCATGG         ATTGAAGGATTCTCATTAAGCAAACTAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTAGGATCATGGGTA...TAGATTGAAGGATTCTCATTAAGCAAACTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAATTTCAACCTTCAAGACATTGAAAAAGATGTTGTGATCTGGGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109018 GGAATTTCAACCTTCAAGACATTGAAAAAGATGTTGTGATCTGGGAACAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTGACAGTGCTGCAGGGGACACAGGCATAACAAAAGAAGAGGCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109068 ACTGACAGTGCTGCAGGGGACACAGGCATAACAAAAGAAGAGGCACCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAAACGCCGATTAAAAGGGGACAG         GTGTCATTAATATTGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 109118 AGAAACGCCGATTAAAAGGGGACAGGTC...TAGGTGTCATTAATATTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTGAAACACCAGCCTTCAGTACCAGTTGGGCAGCTCTGGGTGGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111984 ATGTGAAACACCAGCCTTCAGTACCAGTTGGGCAGCTCTGGGTGGAATTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGCGGTTCTATGCTTTAGAATTTAATTTGGCTGATTTAGTGATAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112034 CTGCGGTTCTATGCTTTAGAATTTAATTTGGCTGATTTAGTGATAAGTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCGTGTCAAAGAATTGGTATCTCGGGAATTGAAGGATTGGCCTAAAAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 112084 TCGTGTCAAAGAATTGGTATCTCGGGAATTGAAGGATTGGCCCAAAAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCATTGCCATTGAAG         ATCCCTACTCTGTTAAAAGAAATGTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 112134 GCATTGCCATTGAAGGTA...CAGATCCCTACTCTGTTAAAAGAAATGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCAAGAACCCTAAATAGTCAACCTGTGTTTGAATATATACTTCATTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113548 GCAAGAACCCTAAATAGTCAACCTGTGTTTGAATATATACTTCATTGTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAGGACAACATACAAGTATTTTGCTCTTCCACACAAAATTACAAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113598 AAGGACAACATACAAGTATTTTGCTCTTCCACACAAAATTACAAAATCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCTTCTAAAGCCTCTGAATGCAATTACATGTATTTCAGAACATTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113648 GCCTTCTAAAGCCTCTGAATGCAATTACATGTATTTCAGAACATTCTAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAGTAATAAATCATCATCCAGATGTACAAACAAAAGATGATAAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113698 GAAGTAATAAATCATCATCCAGATGTACAAACAAAAGATGATAAGCTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAACTCAGTTTTGGCCCAAGGTCCTGGTGCTACCAGTTCAGCTGCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113748 AAACTCAGTTTTGGCCCAAGGTCCTGGTGCTACCAGTTCAGCTGCAAATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCTGTAAGGTACAGCCACTTACTCTTAAAGAGACTGCTGAAAGTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113798 CCTGTAAGGTACAGCCACTTACTCTTAAAGAGACTGCTGAAAGTTTTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGCCCACCAAAAGAAGAAATGGGAAATGAACACATCAGTGTCCACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113848 AGCCCACCAAAAGAAGAAATGGGAAATGAACACATCAGTGTCCACCCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AAACTCAGACTGTATCCAAGCAGATGTTAACTCTGATGATTACAAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113898 AAACTCAGACTGTATCCAAGCAGATGTTAACTCTGATGATTACAAGGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATAAAGTATACCATCCAGAAACAGGAAGGAAAAACGAGAAAGAGAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113948 ATAAAGTATACCATCCAGAAACAGGAAGGAAAAACGAGAAAGAGAAAGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GGAAGGAAGGGCAAGCATCTGTTGACTGTTGATCAGAAACGTGGAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113998 GGAAGGAAGGGCAAGCATCTGTTGACTGTTGATCAGAAACGTGGAGAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGTTGTCTGTGGCAGCACACGTAATAATGAGTCAGAGAGCACTTTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114048 TGTTGTCTGTGGCAGCACACGTAATAATGAGTCAGAGAGCACTTTGGATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TAGAAGGCTTCCAAAATCCCACAGCTAAAGAGTGTGAGGGACTTGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114098 TAGAAGGCTTCCAAAATCCCACAGCTAAAGAGTGTGAGGGACTTGCCACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TTAGATAACAAGGCTGATCTTGATGGAGAAAGTACAGAAGGTACTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114148 TTAGATAACAAGGCTGATCTTGATGGAGAAAGTACAGAAGGTACTGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 ACTAGAAGACTCTCTAAACCACTTTACCCACTCAGTACAGGGCCAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114198 ACTAGAAGACTCTCTAAACCACTTTACCCACTCAGTACAGGGCCAGACAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CAGAAATGATTCCCTCTGATGAAGAGGAGGAGGACGACGAAGAAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114248 CAGAAATGATTCCCTCTGATGAAGAGGAGGAGGACGACGAAGAAGAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAGGAAGAAGAACCTAGGCTCACCATTAACCAAAGGGAAGATGAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114298 GAGGAAGAAGAACCTAGGCTCACCATTAACCAAAGGGAAGATGAAGATGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CATGGCTAATGAAGATGAGTTAGACAACACCTACACTGGGTCAGGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114348 CATGGCTAATGAAGATGAGTTAGACAACACCTACACTGGGTCAGGGGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 AGGACGCCCTATCTGAAGAGGATGATGAGTTAGGCGAAGCTGCTAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114398 AGGACGCCCTATCTGAAGAGGATGATGAGTTAGGCGAAGCTGCTAAGTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GAAGACGTGAAAGAATGTGGAAAACATGTAGAAAGAGCTCTCCTAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114448 GAAGACGTGAAAGAATGTGGAAAACATGTAGAAAGAGCTCTCCTAGTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 ACTTAATAAAATAAGTCTCAAGGAAGAAAATGTATGTGAAGAAAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114498 ACTTAATAAAATAAGTCTCAAGGAAGAAAATGTATGTGAAGAAAAAAATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 CACCTGTGGATCAGTCTGATTTTTTTTATGAATTCAGTAAACTTATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114548 CACCTGTGGATCAGTCTGATTTTTTTTATGAATTCAGTAAACTTATCTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 ACCAAAGGCAAG         TCTCCTACGGTAGTGTGCAGCTTATGCAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 114598 ACCAAAGGCAAGGTA...CAGTCTCCTACGGTAGTGTGCAGCTTATGCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 ACGAGAGGGTCATCTAAAGAAGGACTGTCCTGAAGACTTCAAAAGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115036 ACGAGAGGGTCATCTAAAGAAGGACTGTCCTGAAGACTTCAAAAGAATCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 AGCTAGAACCTCTGCCACCATTAACACCCAAGTTTTTAAATATCTTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115086 AGCTAGAACCTCTGCCACCATTAACACCCAAGTTTTTAAATATCTTAGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 CAAGTCTGTATCCAGTGTTATA         AGGATTTTTCTCCAACAAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 115136 CAAGTCTGTATCCAGTGTTATAGTA...CAGAGGATTTTTCTCCAACAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 TATAGAAGATCAGGCTCGTGAACATATTCGGCAAAACCTAGAAAGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117831 TATAGAAGATCAGGCTCGTGAACATATTCGGCAAAACCTAGAAAGTTTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 TAAGACAGGACTTTCCAG         GAACTAAATTGAGCCTGTTTGGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 117881 TAAGACAGGACTTTCCAGGTA...CAGGAACTAAATTGAGCCTGTTTGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 TCCTCCAAAAATGGATTTGGGTTCAAACAGAGTGACCTTGACGTCTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118447 TCCTCCAAAAATGGATTTGGGTTCAAACAGAGTGACCTTGACGTCTGTAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 GACAATTAATGGACTTGAAACTGCTGAG         GGATTGGACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 118497 GACAATTAATGGACTTGAAACTGCTGAGGTA...TAGGGATTGGACTGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 TCAGAACTATTGAAGAATTAGCAAGAGTCCTCAGAAAACATTCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 120219 TCAGAACTATTGAAGAATTAGCAAGAGTCCTCAGAAAACATTCAGGTA..

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883     GTCTGAGAAACATCTTACCTATTACAACAGCAAAGGTGCCAATTGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120269 .TAGGTCTGAGAAACATCTTACCTATTACAACAGCAAAGGTGCCAATTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 GAAGTTCTTCCATTTGAGAAGTGGTCTGGAAGTAGATATCAGTTTGTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126719 GAAGTTCTTCCATTTGAGAAGTGGTCTGGAAGTAGATATCAGTTTGTATA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 ACACATTG         GCCCTTCATAACACAAGGCTTTTATCTGCTTAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 126769 ACACATTGGTA...CAGGCCCTTCATAACACAAGGCTTTTATCTGCTTAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 TCCGCCATTGATCCCAGAGTGAAGTATTTGTGCTATACCATGAAAGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127498 TCCGCCATTGATCCCAGAGTGAAGTATTTGTGCTATACCATGAAAGTATT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 TACAAAG         ATGTGTGATATTGGTGATGCATCTAGAGGCAGCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127548 TACAAAGGTG...TAGATGTGTGATATTGGTGATGCATCTAGAGGCAGCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 TATCATCGTATGCATATACTCTTATGGTGCTATATTTTCTCCAGCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127940 TATCATCGTATGCATATACTCTTATGGTGCTATATTTTCTCCAGCAGAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 AATCCACCAGTCATTCCTGTCCTTCAAGAG         ATATACAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 127990 AATCCACCAGTCATTCCTGTCCTTCAAGAGGTA...CAGATATACAAAGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 TGAAAAGAAACCTGAAATATTTGTTGATGGCTGGAATATTTATTTTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128204 TGAAAAGAAACCTGAAATATTTGTTGATGGCTGGAATATTTATTTTTTTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 ATCAAATAGATGAACTG         CCTACCTATTGGTCAGAATGTGGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 128254 ATCAAATAGATGAACTGGTA...TAGCCTACCTATTGGTCAGAATGTGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 AAAAATACAGAATCTGTTGGGCAGTTATGGTTGGGCCTTCTTCGTTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128900 AAAAATACAGAATCTGTTGGGCAGTTATGGTTGGGCCTTCTTCGTTTCTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 CACAGAGGAATTTGATTTTAAAGAACATGTTATTAGCATCAGGAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128950 CACAGAGGAATTTGATTTTAAAGAACATGTTATTAGCATCAGGAGAAAAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 GTCTGCTTACAACTTTTAAGAAACAGTGGACCTCAAAATACATTGTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129000 GTCTGCTTACAACTTTTAAGAAACAGTGGACCTCAAAATACATTGTTATT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 GAAG         ATCCCTTTGATTTGAATCATAATCTTGGAGCTGGATT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129050 GAAGGTA...TAGATCCCTTTGATTTGAATCATAATCTTGGAGCTGGATT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 ATCAAGGAAAA         TGACAAATTTTATAATGAAGGCTTTTATCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 132280 ATCAAGGAAAAGTG...TAGTGACAAATTTTATAATGAAGGCTTTTATCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 ATGGTAGAAGAGTATTTGGTATTCCTGTCAAGGGATTTCCAAAGGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132565 ATGGTAGAAGAGTATTTGGTATTCCTGTCAAGGGATTTCCAAAGGACTAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 CCCTCAAAAATG         GAATACTTTTTTGATCCAGATGTGTTAAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 132615 CCCTCAAAAATGGTA...TAGGAATACTTTTTTGATCCAGATGTGTTAAC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 TGAAGGAGAGCTGGCCCCAAATGATAGATGTTGTCGAATTTGTGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134310 TGAAGGAGAGCTGGCCCCAAATGATAGATGTTGTCGAATTTGTGGAAAAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 TCGGACACTTCATGAAGGACTGTCCTATGAGGAGAAA         AGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 134360 TCGGACACTTCATGAAGGACTGTCCTATGAGGAGAAAGTA...CAGAGTA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 AGACGGCGGCGAGATCAGGAAGATGCCCTGAACCAAAGATACCCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135885 AGACGGCGGCGAGATCAGGAAGATGCCCTGAACCAAAGATACCCTGAGAA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2757 CAAGGAAAAAAGAAGCAAAGAGGACAAAGAAATTCACAACAAGTACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135935 CAAGGAAAAAAGAAGCAAAGAGGACAAAGAAATTCACAACAAGTACACAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807 AAAGGGAGGTGTCAACAAAAGAAGATAAGCCCATACAGTGCACACCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135985 AAAGGGAGGTGTCAACAAAAGAAGATAAGCCCATACAGTGCACACCTCAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857 AAAGCCAAGCCAATGCGGGCAGCTGCTGACCTGGGGAGGGAGAAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136035 AAAGCCAAGCCAATGCGGGCAGCTGCTGACCTGGGGAGGGAGAAGATCCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 CAGGCCACCAGTAGAAAAATGGAAGAGACAGGATGACAAAGACTTAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136085 CAGGCCACCAGTAGAAAAATGGAAGAGACAGGATGACAAAGACTTAAGAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2957 AAAAACGTTGTTTTATTTGTGGAAGAGAAGGGCACATTAAAAAGGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136135 AAAAACGTTGTTTTATTTGTGGAAGAGAAGGGCACATTAAAAAGGAATGC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3007 CCACAGTTTAAAGGCTCTTCAG         GTAGCCTTTCCAGTAAATA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 136185 CCACAGTTTAAAGGCTCTTCAGGTA...TAGGTAGCCTTTCCAGTAAATA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3048 TATGACTCAGGGAAAAGCCTCAGCGAAGAGGACCCAGCAGGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148757 TATGACTCAGGGAAAAGCCTCAGCGAAGAGGACCCAGCAGGAATCA