seq1 = pF1KSDA1686.tfa, 3522 bp
seq2 = pF1KSDA1686/gi568815586f_19029800.tfa (gi568815586f:19029800_19469784), 439985 bp

>pF1KSDA1686 3522
>gi568815586f:19029800_19469784 (Chr12)

1-89  (100001-100089)   98% ->
90-169  (100252-100331)   100% ->
170-227  (102594-102651)   100% ->
228-311  (224141-224224)   100% ->
312-432  (225246-225366)   100% ->
433-537  (227634-227738)   100% ->
538-610  (231150-231222)   100% ->
611-711  (235951-236051)   100% ->
712-827  (239971-240086)   100% ->
828-1295  (244717-245184)   100% ->
1296-1761  (253481-253946)   100% ->
1762-1845  (257674-257757)   100% ->
1846-1965  (260878-260997)   100% ->
1966-2019  (261845-261898)   100% ->
2020-2082  (290763-290825)   100% ->
2083-2163  (292511-292591)   100% ->
2164-2313  (292719-292868)   100% ->
2314-2415  (306716-306817)   100% ->
2416-2527  (313524-313635)   100% ->
2528-2574  (316043-316089)   100% ->
2575-2695  (318600-318720)   100% ->
2696-2814  (324085-324203)   100% ->
2815-3024  (328429-328638)   100% ->
3025-3159  (329613-329747)   100% ->
3160-3284  (331783-331907)   100% ->
3285-3430  (336165-336310)   100% ->
3431-3522  (339894-339985)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGATCTAAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGAC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTACGGGATCACCAGGGGCGGCCGAGTCTTCTTCATCAA         CG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100051 TTACGGGATCACCAGGGGCGGCCGAGTCTTCTTCATCAAGTA...CAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100254 AGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAG         ATTTGCCTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100304 GTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAGGTA...TAGATTTGCCTACTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102607 CTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGTG..

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    228     CCATAATGAAAGGAAAGTGACCTGCAAACATCCAGTCACAGGACAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102657 .CAGCCATAATGAAAGGAAAGTGACCTGCAAACATCCAGTCACAGGACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCATCACAGGACAATTGTATTTTTGTAGTGAATGAACA         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 224187 CCATCACAGGACAATTGTATTTTTGTAGTGAATGAACAGTA...CAGGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGTTGCAACCATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225249 TGTTGCAACCATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TAAATGAAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGATTATGCAGTGCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225299 TAAATGAAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGATTATGCAGTGCATCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATGAGCCCTGTAGGCAGA         ACTTCACGAGCTTCAAAAAAAGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 225349 ATGAGCCCTGTAGGCAGAGTA...TAGACTTCACGAGCTTCAAAAAAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TCATAATTTTGGAAAGAGGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227657 TCATAATTTTGGAAAGAGGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CGGTTGTCAGACGAGGTTGGCTTTATAAACAG         GACAGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 227707 CGGTTGTCAGACGAGGTTGGCTTTATAAACAGGTA...CAGGACAGTACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231159 GGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTTGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTTTTATTATAGAG         ATGAGAAAGAAGAGGGTATCCTGGGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 231209 CTTTTATTATAGAGGTA...TAGATGAGAAAGAAGAGGGTATCCTGGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCTTTGCTTACCTCTGAAGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 235978 GCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCTTTGCTTACCTCTGAAGATCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ATTAATCGCAAATATGCTTTTAAG         GCAGCCCATCCAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 236028 ATTAATCGCAAATATGCTTTTAAGGTA...CAGGCAGCCCATCCAAACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239988 GCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 240038 TGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    828         AGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240088 TA...CAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244759 CAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244809 ATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244859 GCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244909 AATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244959 CAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245009 TCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245059 TCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245109 GAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGG         AGTAATTTCTTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 245159 AGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGGTA...TAGAGTAATTTCTTACCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253496 AACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253546 ACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253596 AGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253646 AGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 ACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253696 ACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253746 CACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253796 AATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253846 AGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253896 CAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 G         CATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253946 GGTA...TAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 257714 TGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGGTG...

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1846    CCAGAGGAGCTTACGCTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260875 CAGCCAGAGGAGCTTACGCTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CGAACTGAGTAGTATCCGGGAGCATACGTTAGCACAGCTCATGCAGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260925 CGAACTGAGTAGTATCCGGGAGCATACGTTAGCACAGCTCATGCAGCTAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AGCTTGAGGCCCACAGCCCAAAG         AATGAAATTCTTTCACAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 260975 AGCTTGAGGCCCACAGCCCAAAGGTC...TAGAATGAAATTCTTTCACAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAG         CTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 261863 CATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAGGTG...TAGCTGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 ACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 290768 ACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ATATTGAT         GCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 290818 ATATTGATGTA...TAGGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 292544 GTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAAGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2164        TACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292594 A...TAGTACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 AAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292762 AAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 GATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292812 GATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CACTGCC         GAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292862 CACTGCCGTA...TAGGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 TAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 306750 TAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CACCTTGGTGAAGTTCAG         ACGGAATCAGCAGGAATTCAGCG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 306800 CACCTTGGTGAAGTTCAGGTA...TAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 TGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 313547 TGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 TGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 313597 TGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTA...CAGGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 ATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 316045 ATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGTA..

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575     GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 316095 .AAGGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 TGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318646 TGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 GAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAG         GTTCCCACTTTCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 318696 GAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGTC...TAGGTTCCCACTTTCCTGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2712 TGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324101 TGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 TAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324151 TAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 ACG         GAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCTGTTTGGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324201 ACGGTA...AAGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCTGTTTGGC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 TGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 328467 TGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 GAAGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 328517 GAAGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 ATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 328567 ATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 TAATCCATTTAGGACTACTCAG         ACTCGAAGGAGGGATGATA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 328617 TAATCCATTTAGGACTACTCAGGTA...CAGACTCGAAGGAGGGATGATA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 AGGAACTGGACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 329632 AGGAACTGGACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 ACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 329682 ACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAATGT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3144 GGACTTCAGCAAAGAG         TTAAAAAAAACTGAAAACATTTCAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 329732 GGACTTCAGCAAAGAGGTA...CAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCAT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3185 ATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 331808 ATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3235 ATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 331858 ATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3285          CCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 331908 GTA...CAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3326 AGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 336206 AGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACT

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3376 GTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 336256 GTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAAT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3426 GGCAG         TGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 336306 GGCAGGTA...TAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCAT

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3467 CGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 339930 CGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATG

   3750     .
   3517 TGTGTG
        ||||||
 339980 TGTGTG