Result of SIM4 for
pF1KSDA1562
seq1 = pF1KSDA1562.tfa, 3405 bp
seq2 = pF1KSDA1562/gi568815594r_137421032.tfa (gi568815594r:137421032_137632088), 211057 bp
>pF1KSDA1562 3405
>gi568815594r:137421032_137632088 (Chr4)
(complement)
1-2487 (100001-102487) 100% ->
2488-2576 (103269-103357) 100% ->
2577-2740 (103448-103611) 100% ->
2741-3405 (110393-111057) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCACCAAATGAATGCTAAAATGCACTTTAGGTTTGTTTTTGCACTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCACCAAATGAATGCTAAAATGCACTTTAGGTTTGTTTTTGCACTTCT
50 . : . : . : . : . :
51 GATAGTATCTTTCAACCACGATGTACTGGGCAAGAATTTGAAATACAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GATAGTATCTTTCAACCACGATGTACTGGGCAAGAATTTGAAATACAGGA
100 . : . : . : . : . :
101 TTTATGAGGAACAGAGGGTTGGATCAGTAATTGCAAGACTATCAGAGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TTTATGAGGAACAGAGGGTTGGATCAGTAATTGCAAGACTATCAGAGGAT
150 . : . : . : . : . :
151 GTGGCTGATGTTTTATTGAAGCTTCCTAATCCTTCTACTGTTCGATTTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GTGGCTGATGTTTTATTGAAGCTTCCTAATCCTTCTACTGTTCGATTTCG
200 . : . : . : . : . :
201 AGCCATGCAGAGGGGAAATTCTCCTCTACTTGTAGTAAACGAGGATAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 AGCCATGCAGAGGGGAAATTCTCCTCTACTTGTAGTAAACGAGGATAATG
250 . : . : . : . : . :
251 GGGAAATCAGCATAGGGGCTACAATTGACCGTGAACAACTGTGCCAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 GGGAAATCAGCATAGGGGCTACAATTGACCGTGAACAACTGTGCCAGAAA
300 . : . : . : . : . :
301 AACTTGAACTGTTCCATAGAGTTTGATGTGATCACTCTACCCACAGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 AACTTGAACTGTTCCATAGAGTTTGATGTGATCACTCTACCCACAGAGCA
350 . : . : . : . : . :
351 TCTGCAGCTTTTCCATATTGAAGTTGAAGTGCTGGATATTAATGACAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 TCTGCAGCTTTTCCATATTGAAGTTGAAGTGCTGGATATTAATGACAATT
400 . : . : . : . : . :
401 CTCCCCAGTTTTCAAGATCTCTCATACCTATTGAGATATCTGAGAGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CTCCCCAGTTTTCAAGATCTCTCATACCTATTGAGATATCTGAGAGTGCA
450 . : . : . : . : . :
451 GCAGTTGGGACTCGCATTCCCCTGGACAGTGCATTTGATCCAGATGTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 GCAGTTGGGACTCGCATTCCCCTGGACAGTGCATTTGATCCAGATGTTGG
500 . : . : . : . : . :
501 GGAAAATTCCCTCCACACATACTCGCTCTCTGCCAATGATTTTTTTAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 GGAAAATTCCCTCCACACATACTCGCTCTCTGCCAATGATTTTTTTAATA
550 . : . : . : . : . :
551 TCGAGGTTCGGACCAGGACTGATGGAGCCAAGTATGCAGAACTCATAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 TCGAGGTTCGGACCAGGACTGATGGAGCCAAGTATGCAGAACTCATAGTG
600 . : . : . : . : . :
601 GTCAGAGAGTTAGATCGGGAGCTGAAGTCAAGCTACGAGCTTCAGCTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 GTCAGAGAGTTAGATCGGGAGCTGAAGTCAAGCTACGAGCTTCAGCTCAC
650 . : . : . : . : . :
651 TGCCTCAGACATGGGAGTACCTCAGAGGTCTGGCTCATCCATACTAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 TGCCTCAGACATGGGAGTACCTCAGAGGTCTGGCTCATCCATACTAAAAA
700 . : . : . : . : . :
701 TAAGCATTTCAGACTCCAATGACAACAGCCCTGCTTTTGAGCAGCAATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 TAAGCATTTCAGACTCCAATGACAACAGCCCTGCTTTTGAGCAGCAATCT
750 . : . : . : . : . :
751 TATATAATACAACTCTTAGAAAACTCCCCGGTTGGCACTTTGCTCTTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 TATATAATACAACTCTTAGAAAACTCCCCGGTTGGCACTTTGCTCTTAGA
800 . : . : . : . : . :
801 TCTGAATGCCACGGATCCAGATGAGGGCGCTAATGGGAAAATTGTATATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 TCTGAATGCCACGGATCCAGATGAGGGCGCTAATGGGAAAATTGTATATT
850 . : . : . : . : . :
851 CCTTCAGCAGTCATGTGTCTCCCAAAATTATGGAGACTTTTAAAATTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 CCTTCAGCAGTCATGTGTCTCCCAAAATTATGGAGACTTTTAAAATTGAT
900 . : . : . : . : . :
901 TCTGAAAGAGGACATTTGACTCTTTTCAAGCAAGTGGATTATGAAATCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 TCTGAAAGAGGACATTTGACTCTTTTCAAGCAAGTGGATTATGAAATCAC
950 . : . : . : . : . :
951 CAAATCCTATGAGATTGATGTTCAGGCTCAAGATTTGGGTCCAAATTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 CAAATCCTATGAGATTGATGTTCAGGCTCAAGATTTGGGTCCAAATTCAA
1000 . : . : . : . : . :
1001 TCCCAGCCCATTGCAAAATTATAATTAAGGTTGTGGATGTTAATGACAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 TCCCAGCCCATTGCAAAATTATAATTAAGGTTGTGGATGTTAATGACAAT
1050 . : . : . : . : . :
1051 AAACCTGAAATTAACATCAACCTCATGTCCCCTGGAAAAGAAGAAATATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 AAACCTGAAATTAACATCAACCTCATGTCCCCTGGAAAAGAAGAAATATC
1100 . : . : . : . : . :
1101 TTATATTTTTGAAGGGGATCCTATTGATACATTTGTTGCTTTGGTCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 TTATATTTTTGAAGGGGATCCTATTGATACATTTGTTGCTTTGGTCAGAG
1150 . : . : . : . : . :
1151 TTCAGGACAAGGATTCTGGGCTGAATGGAGAAATAGTTTGTAAGCTTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 TTCAGGACAAGGATTCTGGGCTGAATGGAGAAATAGTTTGTAAGCTTCAT
1200 . : . : . : . : . :
1201 GGACATGGTCACTTTAAACTTCAGAAGACATATGAAAACAATTATTTAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 GGACATGGTCACTTTAAACTTCAGAAGACATATGAAAACAATTATTTAAT
1250 . : . : . : . : . :
1251 CTTAACTAATGCCACACTGGATAGAGAAAAGAGATCTGAGTATAGTTTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 CTTAACTAATGCCACACTGGATAGAGAAAAGAGATCTGAGTATAGTTTGA
1300 . : . : . : . : . :
1301 CTGTAATCGCTGAGGACAGGGGGACACCCAGTCTCTCTACAGTGAAACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101301 CTGTAATCGCTGAGGACAGGGGGACACCCAGTCTCTCTACAGTGAAACAT
1350 . : . : . : . : . :
1351 TTTACAGTTCAAATCAATGATATCAATGACAATCCACCCCACTTCCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 TTTACAGTTCAAATCAATGATATCAATGACAATCCACCCCACTTCCAGAG
1400 . : . : . : . : . :
1401 AAGCCGATATGAATTTGTAATTTCAGAAAATAACTCACCAGGGGCATATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101401 AAGCCGATATGAATTTGTAATTTCAGAAAATAACTCACCAGGGGCATATA
1450 . : . : . : . : . :
1451 TCACCACTGTTACAGCCACAGATCCTGATCTTGGAGAAAATGGGCAAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101451 TCACCACTGTTACAGCCACAGATCCTGATCTTGGAGAAAATGGGCAAGTG
1500 . : . : . : . : . :
1501 ACATACACCATCTTGGAGAGTTTTATTCTAGGAAGTTCCATAACTACATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101501 ACATACACCATCTTGGAGAGTTTTATTCTAGGAAGTTCCATAACTACATA
1550 . : . : . : . : . :
1551 TGTAACCATTGACCCATCTAATGGAGCCATCTATGCCCTCAGAATCTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101551 TGTAACCATTGACCCATCTAATGGAGCCATCTATGCCCTCAGAATCTTTG
1600 . : . : . : . : . :
1601 ATCATGAAGAAGTGAGTCAGATCACTTTTGTGGTAGAAGCAAGAGATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101601 ATCATGAAGAAGTGAGTCAGATCACTTTTGTGGTAGAAGCAAGAGATGGA
1650 . : . : . : . : . :
1651 GGAAGCCCGAAGCAACTGGTAAGCAATACCACAGTTGTGCTCACCATCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101651 GGAAGCCCGAAGCAACTGGTAAGCAATACCACAGTTGTGCTCACCATCAT
1700 . : . : . : . : . :
1701 TGACGAAAATGACAACGTTCCTGTGGTTATAGGGCCTGCATTGCGTAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101701 TGACGAAAATGACAACGTTCCTGTGGTTATAGGGCCTGCATTGCGTAATA
1750 . : . : . : . : . :
1751 ATACGGCAGAAATCACCATTCCCAAAGGGGCTGAAAGTGGCTTTCATGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101751 ATACGGCAGAAATCACCATTCCCAAAGGGGCTGAAAGTGGCTTTCATGTC
1800 . : . : . : . : . :
1801 ACAAGAATAAGGGCAATTGACAGAGACTCTGGTGTGAATGCTGAACTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101801 ACAAGAATAAGGGCAATTGACAGAGACTCTGGTGTGAATGCTGAACTCAG
1850 . : . : . : . : . :
1851 CTGCGCCATAGTAGCAGGTAATGAGGAGAATATCTTCATAATTGATCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101851 CTGCGCCATAGTAGCAGGTAATGAGGAGAATATCTTCATAATTGATCCAC
1900 . : . : . : . : . :
1901 GATCATGTGACATCCATACCAACGTTAGCATGGATTCTGTTCCCTACACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101901 GATCATGTGACATCCATACCAACGTTAGCATGGATTCTGTTCCCTACACA
1950 . : . : . : . : . :
1951 GAATGGGAGCTGTCAGTTATCATTCAGGACAAAGGCAATCCTCAGCTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101951 GAATGGGAGCTGTCAGTTATCATTCAGGACAAAGGCAATCCTCAGCTACA
2000 . : . : . : . : . :
2001 TACCAAAGTCCTTCTGAAGTGCATGATCTTTGAATATGCAGAGTCGGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102001 TACCAAAGTCCTTCTGAAGTGCATGATCTTTGAATATGCAGAGTCGGTGA
2050 . : . : . : . : . :
2051 CAAGTACAGCAATGACTTCAGTAAGCCAGGCATCCTTGGATGTCTCCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102051 CAAGTACAGCAATGACTTCAGTAAGCCAGGCATCCTTGGATGTCTCCATG
2100 . : . : . : . : . :
2101 ATAATAATTATTTCCTTAGGAGCAATTTGTGCAGTGTTGCTGGTTATTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102101 ATAATAATTATTTCCTTAGGAGCAATTTGTGCAGTGTTGCTGGTTATTAT
2150 . : . : . : . : . :
2151 GGTGCTATTTGCAACTAGGTGTAACCGCGAGAAGAAAGACACTAGATCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102151 GGTGCTATTTGCAACTAGGTGTAACCGCGAGAAGAAAGACACTAGATCCT
2200 . : . : . : . : . :
2201 ATAACTGCAGGGTGGCCGAATCAACTTACCAGCACCACCCAAAAAGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102201 ATAACTGCAGGGTGGCCGAATCAACTTACCAGCACCACCCAAAAAGGCCA
2250 . : . : . : . : . :
2251 TCCCGGCAGATTCACAAAGGGGACATCACATTGGTGCCTACCATAAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102251 TCCCGGCAGATTCACAAAGGGGACATCACATTGGTGCCTACCATAAATGG
2300 . : . : . : . : . :
2301 CACTCTGCCCATCAGATCTCATCACAGATCGTCTCCATCTTCATCTCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102301 CACTCTGCCCATCAGATCTCATCACAGATCGTCTCCATCTTCATCTCCTA
2350 . : . : . : . : . :
2351 CCTTAGAAAGAGGGCAGATGGGCAGCCGGCAGAGTCACAACAGTCACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102351 CCTTAGAAAGAGGGCAGATGGGCAGCCGGCAGAGTCACAACAGTCACCAG
2400 . : . : . : . : . :
2401 TCACTCAACAGTTTGGTGACAATCTCATCAAACCACGTGCCAGAGAATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102401 TCACTCAACAGTTTGGTGACAATCTCATCAAACCACGTGCCAGAGAATTT
2450 . : . : . : . : . :
2451 CTCATTAGAACTCACCCACGCCACTCCTGCTGTTGAG CAGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
102451 CTCATTAGAACTCACCCACGCCACTCCTGCTGTTGAGGTA...CAGCAGG
2500 . : . : . : . : . :
2492 TCTCTCAGCTTCTTTCAATGCTTCACCAGGGGCAATATCAGCCAAGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103273 TCTCTCAGCTTCTTTCAATGCTTCACCAGGGGCAATATCAGCCAAGACCA
2550 . : . : . : . : . :
2542 AGTTTTCGAGGAAACAAATATTCCAGGAGCTACAG ATATGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
103323 AGTTTTCGAGGAAACAAATATTCCAGGAGCTACAGGTA...CAGATATGC
2600 . : . : . : . : . :
2583 CCTTCAAGACATGGACAAATTTAGCTTGAAAGACAGTGGCCGTGGTGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103454 CCTTCAAGACATGGACAAATTTAGCTTGAAAGACAGTGGCCGTGGTGACA
2650 . : . : . : . : . :
2633 GTGAGGCAGGAGACAGTGATTATGATTTGGGGCGAGATTCTCCAATAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103504 GTGAGGCAGGAGACAGTGATTATGATTTGGGGCGAGATTCTCCAATAGAT
2700 . : . : . : . : . :
2683 AGGCTGTTGGGTGAAGGATTCAGCGACCTGTTTCTCACAGATGGAAGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103554 AGGCTGTTGGGTGAAGGATTCAGCGACCTGTTTCTCACAGATGGAAGAAT
2750 . : . : . : . : . :
2733 TCCAGCAG CTATGAGACTCTGCACGGAGGAGTGCAGGGTCC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
103604 TCCAGCAGGTA...CAGCTATGAGACTCTGCACGGAGGAGTGCAGGGTCC
2800 . : . : . : . : . :
2774 TGGGACACTCTGACCAGTGCTGGATGCCACCACTGCCCTCACCGTCTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110426 TGGGACACTCTGACCAGTGCTGGATGCCACCACTGCCCTCACCGTCTTCT
2850 . : . : . : . : . :
2824 GATTATAGGAGTAACATGTTCATTCCAGGGGAAGAATTCCCAACGCAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110476 GATTATAGGAGTAACATGTTCATTCCAGGGGAAGAATTCCCAACGCAACC
2900 . : . : . : . : . :
2874 CCAGCAGCAGCATCCACATCAGAGTCTTGAGGATGACGCTCAGCCTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110526 CCAGCAGCAGCATCCACATCAGAGTCTTGAGGATGACGCTCAGCCTGCAG
2950 . : . : . : . : . :
2924 ATTCCGGTGAAAAGAAGAAGAGTTTTTCCACCTTTGGAAAGGACTCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110576 ATTCCGGTGAAAAGAAGAAGAGTTTTTCCACCTTTGGAAAGGACTCCCCA
3000 . : . : . : . : . :
2974 AACGATGAGGACACTGGGGATACCAGCACATCATCTCTGCTCTCGGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110626 AACGATGAGGACACTGGGGATACCAGCACATCATCTCTGCTCTCGGAAAT
3050 . : . : . : . : . :
3024 GAGCAGTGTGTTCCAGCGTCTCTTACCGCCTTCCCTGGACACCTATTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110676 GAGCAGTGTGTTCCAGCGTCTCTTACCGCCTTCCCTGGACACCTATTCTG
3100 . : . : . : . : . :
3074 AATGCAGTGAGGTGGATCGGTCCAACTCCCTGGAGCGCAGGAAGGGACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110726 AATGCAGTGAGGTGGATCGGTCCAACTCCCTGGAGCGCAGGAAGGGACCC
3150 . : . : . : . : . :
3124 TTGCCAGCCAAAACTGTGGGTTACCCACAGGGGGTAGCGGCATGGGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110776 TTGCCAGCCAAAACTGTGGGTTACCCACAGGGGGTAGCGGCATGGGCAGC
3200 . : . : . : . : . :
3174 CAGTACGCATTTTCAAAATCCCACCACCAACTGTGGGCCGCCACTTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110826 CAGTACGCATTTTCAAAATCCCACCACCAACTGTGGGCCGCCACTTGGAA
3250 . : . : . : . : . :
3224 CTCACTCCAGTGTGCAGCCTTCTTCAAAATGGCTGCCAGCCATGGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110876 CTCACTCCAGTGTGCAGCCTTCTTCAAAATGGCTGCCAGCCATGGAGGAG
3300 . : . : . : . : . :
3274 ATCCCTGAAAATTATGAGGAAGATGATTTTGACAATGTGCTCAACCACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110926 ATCCCTGAAAATTATGAGGAAGATGATTTTGACAATGTGCTCAACCACCT
3350 . : . : . : . : . :
3324 CAATGATGGGAAACACGAACTCATGGATGCCAGTGAACTGGTGGCAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110976 CAATGATGGGAAACACGAACTCATGGATGCCAGTGAACTGGTGGCAGAGA
3400 . : . : . :
3374 TTAACAAACTGCTTCAAGATGTCCGCCAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||
111026 TTAACAAACTGCTTCAAGATGTCCGCCAGAGC