Result of SIM4 for
pF1KSDA1538
seq1 = pF1KSDA1538.tfa, 3039 bp
seq2 = pF1KSDA1538/gi568815581r_7361943.tfa (gi568815581r:7361943_7566790), 204848 bp
>pF1KSDA1538 3039
>gi568815581r:7361943_7566790 (Chr17)
(complement)
1-1091 (99990-101080) 100% ->
1092-3039 (102901-104848) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCCCCCCCTGCAGAGGTGACGGACCCGTCCCATGCCCCCGCCGTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
99990 ATGCCCCCCCCTGCAGAGGTGACGGACCCGTCCCATGCCCCCGCCGTCCT
50 . : . : . : . : . :
51 GCGCCAGCTCAATGAACAGCGGCTCCGTGGCCTCTTCTGTGACGTCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100040 GCGCCAGCTCAATGAACAGCGGCTCCGTGGCCTCTTCTGTGACGTCACCC
100 . : . : . : . : . :
101 TCATAGCCGGAGACACCAAGTTCCCTGCTCACCGCAGCGTCCTGGCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100090 TCATAGCCGGAGACACCAAGTTCCCTGCTCACCGCAGCGTCCTGGCTGCT
150 . : . : . : . : . :
151 TCAAGTCCCTTCTTCAGAGAGGCCCTGCTCACTTCAGCCCCACTACCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100140 TCAAGTCCCTTCTTCAGAGAGGCCCTGCTCACTTCAGCCCCACTACCCCT
200 . : . : . : . : . :
201 TCCACCAGCTACTGGGGGCGCCGCACCCAACCCTGCCACCACCACAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100190 TCCACCAGCTACTGGGGGCGCCGCACCCAACCCTGCCACCACCACAGCTG
250 . : . : . : . : . :
251 CCTCTTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCGTCTTCTTCCTCTTCTTCCTCCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100240 CCTCTTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCGTCTTCTTCCTCTTCTTCCTCCTCT
300 . : . : . : . : . :
301 GCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCCCCCTCCAGCCTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100290 GCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCCCCCTCCAGCCTCTCC
350 . : . : . : . : . :
351 CCCTGCTTCTTCCCCACCCCGGGTCCTGGAGTTGCCAGGAGTCCCAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100340 CCCTGCTTCTTCCCCACCCCGGGTCCTGGAGTTGCCAGGAGTCCCAGCAG
400 . : . : . : . : . :
401 CTGCGTTTTCTGATGTCCTCAACTTCATCTACAGCGCCCGGCTCGCACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100390 CTGCGTTTTCTGATGTCCTCAACTTCATCTACAGCGCCCGGCTCGCACTG
450 . : . : . : . : . :
451 CCTGGTGGTGGAGGGGACGGGGCAGCTGTAGCAGAGATTGGAGCTTTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100440 CCTGGTGGTGGAGGGGACGGGGCAGCTGTAGCAGAGATTGGAGCTTTGGG
500 . : . : . : . : . :
501 GCGCCGTCTGGGCATCTCCCGCCTTCAGGGCCTGGGGGAGGGAGGTGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100490 GCGCCGTCTGGGCATCTCCCGCCTTCAGGGCCTGGGGGAGGGAGGTGATG
550 . : . : . : . : . :
551 CCTGGGTACCTCCTACCCCAGCCCCCATGGCCACCTCGCAGCCTGAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100540 CCTGGGTACCTCCTACCCCAGCCCCCATGGCCACCTCGCAGCCTGAAGAG
600 . : . : . : . : . :
601 GACAGCTTTGGGCCCGGGCCCAGGCCAGCTGGGGAGTGGGAGGGTGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100590 GACAGCTTTGGGCCCGGGCCCAGGCCAGCTGGGGAGTGGGAGGGTGACAG
650 . : . : . : . : . :
651 GGCTGAGGCCCAGGCCCCTGACTTGCAGTGCTCCCTGCCCCGGCGGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100640 GGCTGAGGCCCAGGCCCCTGACTTGCAGTGCTCCCTGCCCCGGCGGCCCC
700 . : . : . : . : . :
701 TCCCCTGCCCCCAGTGTGGAAAAAGCTTCATCCATCCCAAACGGCTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100690 TCCCCTGCCCCCAGTGTGGAAAAAGCTTCATCCATCCCAAACGGCTGCAG
750 . : . : . : . : . :
751 ACCCATGAGGCCCAGTGCCGACGAGGGGCCAGCACGCGGGGGTCTACAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100740 ACCCATGAGGCCCAGTGCCGACGAGGGGCCAGCACGCGGGGGTCTACAGG
800 . : . : . : . : . :
801 GCTGGGAGCTGGGGGCGCTGGCCCTGGTGGTCCTGCAGGGGTGGACGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100790 GCTGGGAGCTGGGGGCGCTGGCCCTGGTGGTCCTGCAGGGGTGGACGCCT
850 . : . : . : . : . :
851 CAGCCCTGCCTCCACCAGTGGGCTTCCGAGGGGGCCCCGAGCACGTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100840 CAGCCCTGCCTCCACCAGTGGGCTTCCGAGGGGGCCCCGAGCACGTGGTG
900 . : . : . : . : . :
901 AAGGTGGTGGGCGGCCACGTGCTGTATGTGTGCGCGGCCTGCGAGCGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100890 AAGGTGGTGGGCGGCCACGTGCTGTATGTGTGCGCGGCCTGCGAGCGTTC
950 . : . : . : . : . :
951 CTACGTGACCCTGTCCAGTCTGAAGAGACACAGCAATGTACACTCGTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100940 CTACGTGACCCTGTCCAGTCTGAAGAGACACAGCAATGTACACTCGTGGC
1000 . : . : . : . : . :
1001 GGAGGAAGTACCCCTGCCGCTATTGTGAGAAAGTGTTTGCTCTGGCGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100990 GGAGGAAGTACCCCTGCCGCTATTGTGAGAAAGTGTTTGCTCTGGCGGAG
1050 . : . : . : . : . :
1051 TACCGCACGAAGCATGAAGTGTGGCACACGGGGGAGCGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
101040 TACCGCACGAAGCATGAAGTGTGGCACACGGGGGAGCGCAGGTG...CAG
1100 . : . : . : . : . :
1092 GTACCAGTGCATCTTCTGTTGGGAGACCTTTGTCACTTACTATAACCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102901 GTACCAGTGCATCTTCTGTTGGGAGACCTTTGTCACTTACTATAACCTGA
1150 . : . : . : . : . :
1142 AGACCCACCAGCGAGCCTTCCACGGCATTAGCCCGGGCCTCCTTGCCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102951 AGACCCACCAGCGAGCCTTCCACGGCATTAGCCCGGGCCTCCTTGCCAGT
1200 . : . : . : . : . :
1192 GAGAAGACACCCAATGGAGGCTACAAGCCCAAGCTCAATACACTCAAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103001 GAGAAGACACCCAATGGAGGCTACAAGCCCAAGCTCAATACACTCAAGCT
1250 . : . : . : . : . :
1242 CTACCGCCTGCTCCCCATGCGGGCAGCCAAGCGGCCCTACAAGACCTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103051 CTACCGCCTGCTCCCCATGCGGGCAGCCAAGCGGCCCTACAAGACCTACA
1300 . : . : . : . : . :
1292 GCCAGGGAGCCCCGGAGGCTCCCCTTTCTCCAACCCTCAACACACCGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103101 GCCAGGGAGCCCCGGAGGCTCCCCTTTCTCCAACCCTCAACACACCGGCC
1350 . : . : . : . : . :
1342 CCTGTGGCAATGCCAGCCAGCCCGCCGCCTGGGCCTCCACCTGCCCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103151 CCTGTGGCAATGCCAGCCAGCCCGCCGCCTGGGCCTCCACCTGCCCCAGA
1400 . : . : . : . : . :
1392 GCCTGGCCCTCCACCCTCTGTCATCACTTTTGCCCACCCAGCCCCCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103201 GCCTGGCCCTCCACCCTCTGTCATCACTTTTGCCCACCCAGCCCCCTCTG
1450 . : . : . : . : . :
1442 TCATTGTCCATGGGGGCAGTAGCAGTGGTGGAGGGGGGAGTGGGACGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103251 TCATTGTCCATGGGGGCAGTAGCAGTGGTGGAGGGGGGAGTGGGACGGCC
1500 . : . : . : . : . :
1492 AGCACAGGAGGGTCCCAAGCTGCCTCGGTTATCACTTACACTGCTCCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103301 AGCACAGGAGGGTCCCAAGCTGCCTCGGTTATCACTTACACTGCTCCCCC
1550 . : . : . : . : . :
1542 GAGGCCACCCAAGAAACGAGAATACCCACCTCCTCCCCCTGAGCCTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103351 GAGGCCACCCAAGAAACGAGAATACCCACCTCCTCCCCCTGAGCCTGCAG
1600 . : . : . : . : . :
1592 CCACACCCACCAGCCCAGCCACAGCAGTCAGCCCAGCCACCGCTGCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103401 CCACACCCACCAGCCCAGCCACAGCAGTCAGCCCAGCCACCGCTGCAGGG
1650 . : . : . : . : . :
1642 CCAGCCATGGCCACCACCACGGAGGAGGCCAAGGGCCGGAATCCACGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103451 CCAGCCATGGCCACCACCACGGAGGAGGCCAAGGGCCGGAATCCACGGGC
1700 . : . : . : . : . :
1692 TGGAAGGACTCTGACTTACACAGCCAAGCCAGTGGGCGGGATTGGTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103501 TGGAAGGACTCTGACTTACACAGCCAAGCCAGTGGGCGGGATTGGTGGAG
1750 . : . : . : . : . :
1742 GTGGGGGTCCCCCCACAGGGGCTGGCCGGGGCCCCTCTCAGCTGCAGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103551 GTGGGGGTCCCCCCACAGGGGCTGGCCGGGGCCCCTCTCAGCTGCAGGCT
1800 . : . : . : . : . :
1792 CCACCTCCACTGTGTCAGATCACTGTGCGAATAGGGGAGGAGGCCATCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103601 CCACCTCCACTGTGTCAGATCACTGTGCGAATAGGGGAGGAGGCCATCGT
1850 . : . : . : . : . :
1842 CAAGCGCCGCATCTCAGAGACTGACCTGCGTCCTGGGGAGCTGAGCGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103651 CAAGCGCCGCATCTCAGAGACTGACCTGCGTCCTGGGGAGCTGAGCGGAG
1900 . : . : . : . : . :
1892 AGGAGATGGAGGAGAGTGAGGAGGACGAAGAGGAGGAGGACGAAGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103701 AGGAGATGGAGGAGAGTGAGGAGGACGAAGAGGAGGAGGACGAAGAGGAG
1950 . : . : . : . : . :
1942 GAGGAGGAGGATGAGGAGGAATCAAAGGCTGGTGGGGAGGACCAGCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103751 GAGGAGGAGGATGAGGAGGAATCAAAGGCTGGTGGGGAGGACCAGCTCTG
2000 . : . : . : . : . :
1992 GAGGCCCTACTACTCCTACAAGCCTAAGCGCAAGGCTGGAGCTGCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103801 GAGGCCCTACTACTCCTACAAGCCTAAGCGCAAGGCTGGAGCTGCTGGAG
2050 . : . : . : . : . :
2042 GTGCCAGTGTGGGGGGCAGTGGGCTGCCCCGAGGCCGCCGGCCACCACGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103851 GTGCCAGTGTGGGGGGCAGTGGGCTGCCCCGAGGCCGCCGGCCACCACGT
2100 . : . : . : . : . :
2092 TGGAGGCAGAAGCTGGAACGGAGGAGCTGGGAGGAAACCCCAGCGGCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103901 TGGAGGCAGAAGCTGGAACGGAGGAGCTGGGAGGAAACCCCAGCGGCCGA
2150 . : . : . : . : . :
2142 GAGCCCAGCGGGACGTGCCCGCACAGAGCGGAGGCACCGATGCGGGGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103951 GAGCCCAGCGGGACGTGCCCGCACAGAGCGGAGGCACCGATGCGGGGACT
2200 . : . : . : . : . :
2192 GTGCCCAGACCTTCACCACCCTGAGAAAGCTGCGGAAGCACCAAGAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104001 GTGCCCAGACCTTCACCACCCTGAGAAAGCTGCGGAAGCACCAAGAGGCC
2250 . : . : . : . : . :
2242 CACGGTGGGGGCTCCCACAGCTCCCGGGCCGGACGGAGGCCCTCCACCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104051 CACGGTGGGGGCTCCCACAGCTCCCGGGCCGGACGGAGGCCCTCCACCCG
2300 . : . : . : . : . :
2292 CTTTACCTGCCCCCACTGCGCCAAGGTGTGCAAGACCGCAGCTGCCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104101 CTTTACCTGCCCCCACTGCGCCAAGGTGTGCAAGACCGCAGCTGCCCTGA
2350 . : . : . : . : . :
2342 GCCGCCACGGGCAGAGGCATGCTGCTGAGCGGCCCGGGGGCACCCCAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104151 GCCGCCACGGGCAGAGGCATGCTGCTGAGCGGCCCGGGGGCACCCCAACC
2400 . : . : . : . : . :
2392 CCTGTCATTGCCTATTCCAAGGGCAGCGCTGGCACCAGGCCCGGGGATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104201 CCTGTCATTGCCTATTCCAAGGGCAGCGCTGGCACCAGGCCCGGGGATGT
2450 . : . : . : . : . :
2442 CAAGGAGGAAGCCCCCCAAGAGATGCAAGTCTCCTCATCCAGCGGTGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104251 CAAGGAGGAAGCCCCCCAAGAGATGCAAGTCTCCTCATCCAGCGGTGAGG
2500 . : . : . : . : . :
2492 CAGGTGGCGGGAGCACTGCTGCTGAGGAAGCTTCCGAGACCGCCTCACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104301 CAGGTGGCGGGAGCACTGCTGCTGAGGAAGCTTCCGAGACCGCCTCACTC
2550 . : . : . : . : . :
2542 CAGGACCCTATCATTTCAGGGGGTGAGGAGCCCCCAGTAGTGGCAAGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104351 CAGGACCCTATCATTTCAGGGGGTGAGGAGCCCCCAGTAGTGGCAAGCGG
2600 . : . : . : . : . :
2592 GGGCAGCTATGTATACCCACCTGTGCAGGAATTTCCACTGGCCTTGATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104401 GGGCAGCTATGTATACCCACCTGTGCAGGAATTTCCACTGGCCTTGATTG
2650 . : . : . : . : . :
2642 GGGGCGGCCGGGAACCTGGCGGTGGCAGGGGAAAATCTGGGAGTGAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104451 GGGGCGGCCGGGAACCTGGCGGTGGCAGGGGAAAATCTGGGAGTGAAGGG
2700 . : . : . : . : . :
2692 CCAGTGGGGGCTGGTGAGGGGGACCGGATGGAGGGGATAGGGGCTGCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104501 CCAGTGGGGGCTGGTGAGGGGGACCGGATGGAGGGGATAGGGGCTGCCAA
2750 . : . : . : . : . :
2742 AGTCACTTTCTACCCTGAGCCCTACCCGCTCGTCTATGGCCCCCAGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104551 AGTCACTTTCTACCCTGAGCCCTACCCGCTCGTCTATGGCCCCCAGCTCC
2800 . : . : . : . : . :
2792 TTGCCGCCTACCCTTACAACTTCAGTAACTTGGCCGCTCTCCCGGTTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104601 TTGCCGCCTACCCTTACAACTTCAGTAACTTGGCCGCTCTCCCGGTTGCT
2850 . : . : . : . : . :
2842 CTCAACATGGTCCTACCTGATGAGAAGGGTGCGGGGGCCCTTCCCTTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104651 CTCAACATGGTCCTACCTGATGAGAAGGGTGCGGGGGCCCTTCCCTTCCT
2900 . : . : . : . : . :
2892 ACCAGGGGTCTTTGGCTACGCAGTGAATCCTCAAGCAGCACCCCCTGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104701 ACCAGGGGTCTTTGGCTACGCAGTGAATCCTCAAGCAGCACCCCCTGCCC
2950 . : . : . : . : . :
2942 CACCAACACCACCTCCCCCAACTCTTCCTCCACCAATTCCCCCTAAGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104751 CACCAACACCACCTCCCCCAACTCTTCCTCCACCAATTCCCCCTAAGGGA
3000 . : . : . : . : .
2992 GAAGGGGAAAGGGCAGGGGTTGAGAGAACCCAGAAGGGCGATGTGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104801 GAAGGGGAAAGGGCAGGGGTTGAGAGAACCCAGAAGGGCGATGTGGGG