seq1 = pF1KSDA1537.tfa, 1770 bp
seq2 = pF1KSDA1537/gi568815588r_68245771.tfa (gi568815588r:68245771_68504800), 259030 bp

>pF1KSDA1537 1770
>gi568815588r:68245771_68504800 (Chr10)

(complement)

1-130  (100001-100130)   100% ->
131-248  (103064-103181)   100% ->
249-350  (107920-108021)   100% ->
351-474  (110350-110473)   100% ->
475-536  (110665-110726)   100% ->
537-602  (111598-111663)   100% ->
603-672  (118673-118742)   100% ->
673-774  (120649-120750)   100% ->
775-891  (120887-121003)   100% ->
892-1059  (123402-123569)   100% ->
1060-1157  (125280-125377)   100% ->
1158-1277  (127829-127948)   100% ->
1278-1407  (140688-140817)   100% ->
1408-1502  (141117-141211)   100% ->
1503-1551  (149400-149448)   100% ->
1552-1629  (158717-158794)   100% ->
1630-1770  (158890-159030)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAAACTGAGTATCAAAGGACTCATTGAATCTGCTCTGAGCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTAAACTGAGTATCAAAGGACTCATTGAATCTGCTCTGAGCTTTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCACTTTGGATTCTGACTATCCCCCCTTGCAGCAATTCTTTGTTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCACTTTGGATTCTGACTATCCCCCCTTGCAGCAATTCTTTGTTGTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAACATTGCCTGAAACACGGTCTTAAAG         TAAGAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 TGGAACATTGCCTGAAACACGGTCTTAAAGGTA...CAGTAAGAAAATCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTTTGAGTTACAACAAAACCATCTGGGGCCCTTTGGAACTGGTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103075 TTTTTGAGTTACAACAAAACCATCTGGGGCCCTTTGGAACTGGTGGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGTACCCCGAAGCAGAGGAAATAGGAGCTAGTGTCCGGGATCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103125 GCTGTACCCCGAAGCAGAGGAAATAGGAGCTAGTGTCCGGGATCTACCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTCTGAA         GACCCCTCTGGGTCGAGCAAGAGCGTGGCTTCGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103175 GTCTGAAGTA...TAGGACCCCTCTGGGTCGAGCAAGAGCGTGGCTTCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTAGCCCTCATGCAAAAAAAAATGGCCGATTACTTACGTTGCTTAATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107954 TTAGCCCTCATGCAAAAAAAAATGGCCGATTACTTACGTTGCTTAATTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCAGAGGGATCTCTTGAG         TGAGTTTTATGAGTATCACGCAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 108004 TCAGAGGGATCTCTTGAGGTT...CAGTGAGTTTTATGAGTATCACGCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TAATGATGGAAGAAGAAGGAGCAGTAATTGTTGGGCTGCTGGTTGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110373 TAATGATGGAAGAAGAAGGAGCAGTAATTGTTGGGCTGCTGGTTGGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATGTGATCGATGCTAATCTGTGTGTGAAGGGAGAGGATTTAGACTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110423 AATGTGATCGATGCTAATCTGTGTGTGAAGGGAGAGGATTTAGACTCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 A         GTTGGAGTGATTGATTTTTCTATGTATTTAAAGAATGAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110473 AGTA...CAGGTTGGAGTGATTGATTTTTCTATGTATTTAAAGAATGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGATATTGGAAATAAAGAAAG         GAATGTTCAAATTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110705 AAGATATTGGAAATAAAGAAAGGTA...TAGGAATGTTCAAATTGCTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATATTAGACCAAAAGAATTATGTTGAAGAATTAAATAGACAACTGAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 111617 ATATTAGACCAAAAGAATTATGTTGAAGAATTAAATAGACAACTGAAGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    603       CAGCACAGTCAGCAGCCTCCATTCAAGAGTTGATTCATTAGAAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111667 ...CAGCAGCACAGTCAGCAGCCTCCATTCAAGAGTTGATTCATTAGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGTCAAATACTAAGCTGATTGAAGAG         TTAGCAATAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 118717 AGTCAAATACTAAGCTGATTGAAGAGGTA...TAGTTAGCAATAGCAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 AATAACATCATTAAACTCCAGGAAGAAAATCATCAATTACGAAGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120664 AATAACATCATTAAACTCCAGGAAGAAAATCATCAATTACGAAGTGAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TAAATTGATTTTAATGAAAACACAGCAGCACCTAGAG         GTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 120714 TAAATTGATTTTAATGAAAACACAGCAGCACCTAGAGGTA...TAGGTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCAAAGTAGATGTGGAAACTGAGCTTCAAACATATAAGCATTCTCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120891 CCAAAGTAGATGTGGAAACTGAGCTTCAAACATATAAGCATTCTCGTCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GGGCTAGATGAAATGTACAATGAAGCCAGAAGGCAGCTTCGAGATGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120941 GGGCTAGATGAAATGTACAATGAAGCCAGAAGGCAGCTTCGAGATGAATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TCAGTTACGACAG         GATGTAGAGAATGAGCTAGCAGTACAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 120991 TCAGTTACGACAGGTA...CAGGATGTAGAGAATGAGCTAGCAGTACAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTAGTATGAAGCATGAGATTGAACTTGCCATGAAGTTGCTGGAGAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123430 TTAGTATGAAGCATGAGATTGAACTTGCCATGAAGTTGCTGGAGAAAGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 ATCCATGAGAAACAAGATACTCTGATAGGCCTTCGACAACAACTAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123480 ATCCATGAGAAACAAGATACTCTGATAGGCCTTCGACAACAACTAGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGTTAAAGCAATTAACATAGAGATGTATCAAAAGTTGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 123530 AGTTAAAGCAATTAACATAGAGATGTATCAAAAGTTGCAGGTA...TAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GTTCTGAAGATGGCTTGAAAGAAAAAAATGAAATAATTGCCCGACTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125281 GTTCTGAAGATGGCTTGAAAGAAAAAAATGAAATAATTGCCCGACTAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GAAAAAACCAATAAAATTACTGCAGCCATGAGGCAGCTGGAACAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 125331 GAAAAAACCAATAAAATTACTGCAGCCATGAGGCAGCTGGAACAAAGGTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1158       ATTGCAGCAAGCAGAGAAGGCGCAAATGGAAGCTGAAGATGAGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125381 ...CAGATTGCAGCAAGCAGAGAAGGCGCAAATGGAAGCTGAAGATGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ATGAGAAATATCTACAAGAATGTCTCAGTAAATCTGATAGTCTGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127873 ATGAGAAATATCTACAAGAATGTCTCAGTAAATCTGATAGTCTGCAGAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CAAATCTCCCAAAAGGAGAAACAGCT         GGTGCAACTGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 127923 CAAATCTCCCAAAAGGAGAAACAGCTGTG...AAGGGTGCAACTGGAAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TGACTTGAAGATTGAGAAGGAATGGAGGCAGACTTTGCAGGAAGATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140703 TGACTTGAAGATTGAGAAGGAATGGAGGCAGACTTTGCAGGAAGATCTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AAAAGGAGAAAGATGCCTTATCTCATCTTAGAAATGAGACTCAACAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140753 AAAAGGAGAAAGATGCCTTATCTCATCTTAGAAATGAGACTCAACAAATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ATTAGTCTTAAAAAA         GAGTTCCTTAACCTCCAGGATGAAAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 140803 ATTAGTCTTAAAAAAGTA...AAGGAGTTCCTTAACCTCCAGGATGAAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TCAGCAGTTGAAAAAAATATATCATGAACAAGAGCAAGCTCTTCAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141143 TCAGCAGTTGAAAAAAATATATCATGAACAAGAGCAAGCTCTTCAAGAAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TCGGCAACAAGCTTAGCGA         ATCAAAACTTAAAATTGAAGAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 141193 TCGGCAACAAGCTTAGCGAGTA...TAGATCAAAACTTAAAATTGAAGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 ATAAAAGAAGCCAACAAAGCATTGCAG         GGACTGGTTTGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 149422 ATAAAAGAAGCCAACAAAGCATTGCAGGTG...TAGGGACTGGTTTGGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 GAAAGACAAAGAAGCAACACATTGTAAACTTTGTGAAAAGGAATTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158731 GAAAGACAAAGAAGCAACACATTGTAAACTTTGTGAAAAGGAATTCTCAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 TCTCTAAGAGAAAG         CACCACTGTAGAAATTGTGGGGAAATT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 158781 TCTCTAAGAGAAAGGTA...TAGCACCACTGTAGAAATTGTGGGGAAATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 TTCTGTAATGCCTGCTCTGACAACGAACTACCTTTGCCTTCTTCACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158917 TTCTGTAATGCCTGCTCTGACAACGAACTACCTTTGCCTTCTTCACCAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 ACCAGTACGGGTTTGTGATTCCTGTCATGCATTGCTCATTCAGAGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 158967 ACCAGTACGGGTTTGTGATTCCTGTCATGCACTGCTCATTCAGAGATGCT

   1900     .    :
   1757 CATCTAACTTGCCC
        ||||||||||||||
 159017 CATCTAACTTGCCC