seq1 = pF1KSDA1504.tfa, 1278 bp
seq2 = pF1KSDA1504/gi568815582r_20697727.tfa (gi568815582r:20697727_20899004), 201278 bp

>pF1KSDA1504 1278
>gi568815582r:20697727_20899004 (Chr16)

(complement)

1-1278  (100001-101278)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGCCTGTAACATTAGCATCCAGGGTCCCAGCATATATAATAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGCCTGTAACATTAGCATCCAGGGTCCCAGCATATATAATAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTAAAAATATAATAAATCCTCATGAAAAAGTTCAAATGAAGTCAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCTAAAAATATAATAAATCCTCATGAAAAAGTTCAAATGAAGTCAATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGCAAATTCTCCTATAAAGGCACAACAGGATCAATTACAAGTAAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGCAAATTCTCCTATAAAGGCACAACAGGATCAATTACAAGTAAAAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AATATAAAAGCAAGTCTTCACAATGTCAAAAGTTCCTTACCTCTTTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AATATAAAAGCAAGTCTTCACAATGTCAAAAGTTCCTTACCTCTTTTTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TACTAAGTCCTCTACTTCTGTGGGGCAGTTGCAGTCTCCTACCTTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TACTAAGTCCTCTACTTCTGTGGGGCAGTTGCAGTCTCCTACCTTGAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CACCTATCTGTATGCAAAAGCAAGGAAAAAATGAACATCTTGCATTTAAT
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CACCTATCTATATGCAAAAGCAAGGAAAAAATGAACATCTTGCATTTAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCAAATCTAAGGCTTCAACAGTTGGTTCAGAATTGGTACTTGTTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCAAATCTAAGGCTTCAACAGTTGGTTCAGAATTGGTACTTGTTTCTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCGTTCCAACTGTTCATCATGTTTCTGATTTGGAAATGAGCTCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCGTTCCAACTGTTCATCATGTTTCTGATTTGGAAATGAGCTCTACTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGACTGTTTACCTGTGTTGGCTGATTGGGAGGATGTGGTTTTACTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGACTGTTTACCTGTGTTGGCTGATTGGGAGGATGTGGTTTTACTGCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCATCTCAGCCTGAGGAAAACGTAGACTGTACAGTTCCCATTAGTGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCATCTCAGCCTGAGGAAAACGTAGACTGTACAGTTCCCATTAGTGACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGACTTAGAGATTTCATTTAATTCTGGAGAAAGATTAATGGTTTTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGACTTAGAGATTTCATTTAATTCTGGAGAAAGATTAATGGTTTTGAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AATTGGAAATGTCAAGTCATGAAAACTTTGGAGACATAGAGGAAACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AATTGGAAATGTCAAGTCATGAAAACTTTGGAGACATAGAGGAAACTCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAAAAATCTGAGACTTCTAAGTCTATTGTGTACAAGAGTCCTCACACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAAAAATCTGAGACTTCTAAGTCTATTGTGTACAAGAGTCCTCACACTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TATTTATAATGTAAAAGAAGCCAAAGATCCAGGTTCAGATATTTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TATTTATAATGTAAAAGAAGCCAAAGATCCAGGTTCAGATATTTCTGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTAAGTTACCTGAACACAAATCAAGTACCTTCAACAGAGTTAATGCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTAAGTTACCTGAACACAAATCAAGTACCTTCAACAGAGTTAATGCCAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGTCTCATCCTTTAGTTTTGGGGAAACATCCTCTTCTTTCAGGTGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATGTCTCATCCTTTAGTTTTGGGGAAACATCCTCTTCTTTCAGGTGGTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAAAGGAATCCATGCAGTCCCCAAGCTTTCCCACCAGCAAAAAAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAAAAGGAATCCATGCAGTCCCCAAGCTTTCCCACCAGCAAAAAAACAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTTCACTATTCATGAAGAAAAGCCTACATCATCTGATTGCTCCCCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTTCACTATTCATGAAGAAAAGCCTACATCATCTGATTGCTCCCCAGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGAAGTTCTTCCTGGAGGCGTCTCCCATCTATATTAACTTCTACAGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGAAGTTCTTCCTGGAGGCGTCTCCCATCTATATTAACTTCTACAGTTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCTACAAGAGCCATGGAAGAGTGGGAAAATGACACCTCCATTATGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCTACAAGAGCCATGGAAGAGTGGGAAAATGACACCTCCATTATGCAAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GTGGTCGGAGATCTAAGAGACTTGTTGTTTCTAATAATGGACCGAACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GTGGTCGGAGATCTAAGAGACTTGTTGTTTCTAATAATGGACCGAACCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGAAAAGTCTTCTATTGTTGCCCTATCGGGAAATACCAAGAAAACAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGAAAAGTCTTCTATTGTTGCCCTATCGGGAAATACCAAGAAAACAGAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ATGTTGTGGTTATTTCAAATGGGAACAAACACTTCAAAAGGAAAGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 ATGTTGTGGTTATTTCAAATGGGAACAAACACTTCAAAAGGAAAGAGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACAGCATGGTTCCATCTCATTCCACAGGGGGACTCACTTTTAGTTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ACAGCATGGTTCCATCTCATTCCACAGGGGGACTCACTTTTAGTTCTCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAAACAAGCCATATTTGTGACAGAAATTTAAGTATTTCCACCAAAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GAAACAAGCCATATTTGTGACAGAAATTTAAGTATTTCCACCAAAAATTC

   1250     .    :    .    :    .
   1251 TTTGAGACTCAGGCCTTCAATGAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTTGAGACTCAGGCCTTCAATGAGGAAT