Result of SIM4 for
pF1KSDA1479
seq1 = pF1KSDA1479.tfa, 3033 bp
seq2 = pF1KSDA1479/gi568815583f_47659799.tfa (gi568815583f:47659799_47871782), 211984 bp
>pF1KSDA1479 3033
>gi568815583f:47659799_47871782 (Chr15)
1-109 (100001-100109) 100% ->
110-221 (100506-100617) 100% ->
222-282 (101180-101240) 100% ->
283-345 (101360-101422) 100% ->
346-447 (101532-101633) 100% ->
448-538 (101863-101953) 100% ->
539-658 (102402-102521) 100% ->
659-747 (103218-103306) 100% ->
748-965 (104052-104269) 100% ->
966-1097 (104376-104507) 100% ->
1098-1253 (104840-104995) 100% ->
1254-1427 (105085-105258) 100% ->
1428-1568 (106071-106211) 100% ->
1569-1646 (106307-106384) 100% ->
1647-1747 (106779-106879) 100% ->
1748-3033 (110699-111984) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAGGGTCTTCCTGCTTTGTGCCTACATACTGCTGCTGATGGTTTCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAGGGTCTTCCTGCTTTGTGCCTACATACTGCTGCTGATGGTTTCCCA
50 . : . : . : . : . :
51 GTTGAGGGCAGTCAGCTTTCCTGAAGATGATGAACCCCTTAATACTGTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GTTGAGGGCAGTCAGCTTTCCTGAAGATGATGAACCCCTTAATACTGTCG
100 . : . : . : . : . :
101 ACTATCACT ATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ACTATCACTGTA...CAGATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGC
150 . : . : . : . : . :
142 CCTTCAGGCAATGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100538 CCTTCAGGCAATGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAA
200 . : . : . : . : . :
192 AATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAG GGATCAAGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
100588 AATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGGTA...CAGGGATCAAGTTT
250 . : . : . : . : . :
233 ATACAGTAAACTTAAATGAAATGCCCAAAACAGAAGTAATACCCAACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101191 ATACAGTAAACTTAAATGAAATGCCCAAAACAGAAGTAATACCCAACAAG
300 . : . : . : . : . :
283 AAACTGACATGGCGATCAAGACAACAGGATCGAGAAAACTG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101241 GTG...CAGAAACTGACATGGCGATCAAGACAACAGGATCGAGAAAACTG
350 . : . : . : . : . :
324 TGCTATGAAAGGCAAGCATAAA GATGAATGCCACAACTTTA
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
101401 TGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGTG...TAGGATGAATGCCACAACTTTA
400 . : . : . : . : . :
365 TCAAAGTATTTGTTCCAAGAAACGATGAGATGGTTTTTGTTTGTGGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101551 TCAAAGTATTTGTTCCAAGAAACGATGAGATGGTTTTTGTTTGTGGTACC
450 . : . : . : . : . :
415 AATGCATTCAATCCCATGTGTAGATACTACAGG TTGAGTAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
101601 AATGCATTCAATCCCATGTGTAGATACTACAGGGTA...TAGTTGAGTAC
500 . : . : . : . : . :
456 CTTAGAATATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCAAGATGCCCATTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101871 CTTAGAATATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCAAGATGCCCATTTG
550 . : . : . : . : . :
506 ATGCCAGACAAACCAATGTTGCCCTCTTTGCTG ATGGGAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
101921 ATGCCAGACAAACCAATGTTGCCCTCTTTGCTGGTA...CAGATGGGAAG
600 . : . : . : . : . :
547 CTGTATTCTGCCACAGTGGCTGACTTCTTGGCCAGCGATGCCGTTATTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102410 CTGTATTCTGCCACAGTGGCTGACTTCTTGGCCAGCGATGCCGTTATTTA
650 . : . : . : . : . :
597 TCGAAGCATGGGTGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATATGATTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102460 TCGAAGCATGGGTGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATATGATTCCA
700 . : . : . : . : . :
647 AATGGATAAAAG AGCCACACTTTCTTCATGCCATAGAATAT
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
102510 AATGGATAAAAGGTA...CAGAGCCACACTTTCTTCATGCCATAGAATAT
750 . : . : . : . : . :
688 GGAAACTATGTCTATTTCTTCTTTCGAGAAATCGCTGTCGAACATAATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103247 GGAAACTATGTCTATTTCTTCTTTCGAGAAATCGCTGTCGAACATAATAA
800 . : . : . : . : . :
738 TTTAGGCAAG GCTGTGTATTCCCGCGTGGCCCGCATATGTA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
103297 TTTAGGCAAGGCA...CAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCCCGCATATGTA
850 . : . : . : . : . :
779 AAAACGACATGGGTGGTTCCCAGCGGGTCCTGGAGAAACACTGGACTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104083 AAAACGACATGGGTGGTTCCCAGCGGGTCCTGGAGAAACACTGGACTTCA
900 . : . : . : . : . :
829 TTTCTAAAGGCTCGGCTGAACTGTTCTGTCCCTGGAGATTCGTTTTTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104133 TTTCTAAAGGCTCGGCTGAACTGTTCTGTCCCTGGAGATTCGTTTTTCTA
950 . : . : . : . : . :
879 CTTTGATGTTCTGCAGTCTATTACAGACATAATACAAATCAATGGCATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104183 CTTTGATGTTCTGCAGTCTATTACAGACATAATACAAATCAATGGCATCC
1000 . : . : . : . : . :
929 CCACTGTGGTCGGGGTGTTTACCACGCAGCTCAATAG CATC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
104233 CCACTGTGGTCGGGGTGTTTACCACGCAGCTCAATAGGTG...CAGCATC
1050 . : . : . : . : . :
970 CCTGGTTCTGCTGTCTGTGCATTTAGCATGGATGACATTGAAAAAGTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104380 CCTGGTTCTGCTGTCTGTGCATTTAGCATGGATGACATTGAAAAAGTATT
1100 . : . : . : . : . :
1020 CAAAGGACGGTTTAAGGAACAGAAAACTCCAGATTCTGTTTGGACAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104430 CAAAGGACGGTTTAAGGAACAGAAAACTCCAGATTCTGTTTGGACAGCAG
1150 . : . : . : . : . :
1070 TTCCCGAAGACAAAGTGCCAAAGCCAAG GCCTGGCTGTTGT
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
104480 TTCCCGAAGACAAAGTGCCAAAGCCAAGGTA...CAGGCCTGGCTGTTGT
1200 . : . : . : . : . :
1111 GCAAAACACGGCCTTGCCGAAGCTTATAAAACCTCCATCGATTTCCCGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104853 GCAAAACACGGCCTTGCCGAAGCTTATAAAACCTCCATCGATTTCCCGGA
1250 . : . : . : . : . :
1161 TGAAACTCTGTCATTCATCAAATCTCATCCCCTGATGGACTCTGCCGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104903 TGAAACTCTGTCATTCATCAAATCTCATCCCCTGATGGACTCTGCCGTTC
1300 . : . : . : . : . :
1211 CACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACTCGGGTCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
104953 CACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACTCGGGTCAGGTG...T
1350 . : . : . : . : . :
1254 GTACAGACTGACGGCCATCTCAGTGGACCATTCAGCCGGACCCTACCA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105083 AGGTACAGACTGACGGCCATCTCAGTGGACCATTCAGCCGGACCCTACCA
1400 . : . : . : . : . :
1302 GAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAAGCTGGCATGGTACTTAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105133 GAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAAGCTGGCATGGTACTTAAAG
1450 . : . : . : . : . :
1352 TTCTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTTTGAACGACAGCGTATTACTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105183 TTCTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTTTGAACGACAGCGTATTACTGGAA
1500 . : . : . : . : . :
1402 GAGATTGAAGCCTACAACCATGCAAA GTGCAGTGCTGAGAA
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
105233 GAGATTGAAGCCTACAACCATGCAAAGTA...TAGGTGCAGTGCTGAGAA
1550 . : . : . : . : . :
1443 TGAGGAAGACAAAAAGGTCATCTCATTACAGTTGGATAAAGATCACCACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106086 TGAGGAAGACAAAAAGGTCATCTCATTACAGTTGGATAAAGATCACCACG
1600 . : . : . : . : . :
1493 CTTTATATGTGGCGTTCTCTAGCTGCATTATCCGCATCCCCCTCAGTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106136 CTTTATATGTGGCGTTCTCTAGCTGCATTATCCGCATCCCCCTCAGTCGC
1650 . : . : . : . : . :
1543 TGTGAGCGTTATGGATCATGTAAAAA GTCTTGTATTGCATC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
106186 TGTGAGCGTTATGGATCATGTAAAAAGTA...CAGGTCTTGTATTGCATC
1700 . : . : . : . : . :
1584 TCGTGACCCGTATTGTGGCTGGTTAAGCCAGGGATCCTGTGGTAGAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106322 TCGTGACCCGTATTGTGGCTGGTTAAGCCAGGGATCCTGTGGTAGAGTGA
1750 . : . : . : . : . :
1634 CCCCAGGGATGCT GCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
106372 CCCCAGGGATGCTGTA...AAGGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTC
1800 . : . : . : . : . :
1675 CATAACCACAGTGCTGAAGGATATGAACAAGACACAGAATTCGGCAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106807 CATAACCACAGTGCTGAAGGATATGAACAAGACACAGAATTCGGCAACAC
1850 . : . : . : . : . :
1725 AGCTCATCTAGGGGACTGCCATG GTGTACGATGGGAAGTCC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
106857 AGCTCATCTAGGGGACTGCCATGGTA...CAGGTGTACGATGGGAAGTCC
1900 . : . : . : . : . :
1766 AGTCTGGAGAGTCCAACCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110717 AGTCTGGAGAGTCCAACCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGT
1950 . : . : . : . : . :
1816 GTCTTTGCTGCTTTTGTTTTGGGGGCATTCATTGCAGGTGTGGCAGTATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110767 GTCTTTGCTGCTTTTGTTTTGGGGGCATTCATTGCAGGTGTGGCAGTATA
2000 . : . : . : . : . :
1866 CTGCTATCGAGACATGTTTGTTCGGAAAAACAGAAAGATCCATAAAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110817 CTGCTATCGAGACATGTTTGTTCGGAAAAACAGAAAGATCCATAAAGATG
2050 . : . : . : . : . :
1916 CAGAGTCCGCCCAGTCATGCACAGACTCCAGTGGAAGTTTTGCCAAACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110867 CAGAGTCCGCCCAGTCATGCACAGACTCCAGTGGAAGTTTTGCCAAACTG
2100 . : . : . : . : . :
1966 AATGGTCTCTTTGACAGCCCTGTCAAGGAATACCAACAGAATATTGATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110917 AATGGTCTCTTTGACAGCCCTGTCAAGGAATACCAACAGAATATTGATTC
2150 . : . : . : . : . :
2016 TCCTAAACTGTATAGTAACCTGCTAACCAGTCGGAAAGAGCTACCACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110967 TCCTAAACTGTATAGTAACCTGCTAACCAGTCGGAAAGAGCTACCACCCA
2200 . : . : . : . : . :
2066 ATGGAGATACTAAATCCATGGTAATGGACCATCGAGGGCAACCTCCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111017 ATGGAGATACTAAATCCATGGTAATGGACCATCGAGGGCAACCTCCAGAG
2250 . : . : . : . : . :
2116 TTGGCTGCTCTTCCTACTCCTGAGTCTACACCCGTGCTTCACCAGAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111067 TTGGCTGCTCTTCCTACTCCTGAGTCTACACCCGTGCTTCACCAGAAGAC
2300 . : . : . : . : . :
2166 CCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCAGAAAAGGCCCATGGCCATGGAGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111117 CCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCAGAAAAGGCCCATGGCCATGGAGCTT
2350 . : . : . : . : . :
2216 CAAGGAAAGAAACCCCTCAGTTTTTTCCGTCTAGTCCGCCACCTCATTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111167 CAAGGAAAGAAACCCCTCAGTTTTTTCCGTCTAGTCCGCCACCTCATTCC
2400 . : . : . : . : . :
2266 CCATTAAGTCATGGGCATATCCCCAGTGCCATTGTTCTTCCAAATGCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111217 CCATTAAGTCATGGGCATATCCCCAGTGCCATTGTTCTTCCAAATGCTAC
2450 . : . : . : . : . :
2316 CCATGACTACAACACGTCTTTCTCAAACTCCAATGCTCACAAAGCTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111267 CCATGACTACAACACGTCTTTCTCAAACTCCAATGCTCACAAAGCTGAAA
2500 . : . : . : . : . :
2366 AGAAGCTTCAAAACATTGATCACCCTCTCACAAAGTCATCCAGTAAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111317 AGAAGCTTCAAAACATTGATCACCCTCTCACAAAGTCATCCAGTAAGAGA
2550 . : . : . : . : . :
2416 GATCACCGGCGTTCTGTTGATTCCAGAAATACCCTCAATGATCTCCTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111367 GATCACCGGCGTTCTGTTGATTCCAGAAATACCCTCAATGATCTCCTGAA
2600 . : . : . : . : . :
2466 GCATCTGAATGACCCAAATAGTAACCCCAAAGCCATCATGGGAGACATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111417 GCATCTGAATGACCCAAATAGTAACCCCAAAGCCATCATGGGAGACATCC
2650 . : . : . : . : . :
2516 AGATGGCACACCAGAACTTAATGCTGGATCCCATGGGATCGATGTCTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111467 AGATGGCACACCAGAACTTAATGCTGGATCCCATGGGATCGATGTCTGAG
2700 . : . : . : . : . :
2566 GTCCCACCTAAAGTCCCTAACCGGGAGGCATCGCTATACTCCCCTCCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111517 GTCCCACCTAAAGTCCCTAACCGGGAGGCATCGCTATACTCCCCTCCTTC
2750 . : . : . : . : . :
2616 AACTCTCCCCAGAAATAGCCCAACCAAGCGAGTGGATGTCCCCACCACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111567 AACTCTCCCCAGAAATAGCCCAACCAAGCGAGTGGATGTCCCCACCACTC
2800 . : . : . : . : . :
2666 CTGGAGTCCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGAGGTTATCACAAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111617 CTGGAGTCCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGAGGTTATCACAAAAAT
2850 . : . : . : . : . :
2716 TCCTCCCAGAGGCACTCTATATCTGCTATGCCTAAAAACTTAAACTCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111667 TCCTCCCAGAGGCACTCTATATCTGCTATGCCTAAAAACTTAAACTCACC
2900 . : . : . : . : . :
2766 AAATGGTGTTTTGTTATCCAGACAGCCTAGTATGAACCGTGGAGGATATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111717 AAATGGTGTTTTGTTATCCAGACAGCCTAGTATGAACCGTGGAGGATATA
2950 . : . : . : . : . :
2816 TGCCCACCCCCACTGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGAACACCAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111767 TGCCCACCCCCACTGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGAACACCAGTG
3000 . : . : . : . : . :
2866 AGTGTTCATCTGCAGCCTTCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTACACCAGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111817 AGTGTTCATCTGCAGCCTTCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTACACCAGTAA
3050 . : . : . : . : . :
2916 TGGCACTCTTCCTAGGACGGGACTAAAGAGGACGCCGTCCTTAAAACCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111867 TGGCACTCTTCCTAGGACGGGACTAAAGAGGACGCCGTCCTTAAAACCTG
3100 . : . : . : . : . :
2966 ACGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCTCAAACCCCATCTGTCAGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111917 ACGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCTCAAACCCCATCTGTCAGACCA
3150 . : .
3016 CTGAACAAATACACATAC
||||||||||||||||||
111967 CTGAACAAATACACATAC