seq1 = pF1KSDA1473.tfa, 1593 bp
seq2 = pF1KSDA1473/gi568815579r_22291519.tfa (gi568815579r:22291519_22502885), 211367 bp

>pF1KSDA1473 1593
>gi568815579r:22291519_22502885 (Chr19)

(complement)

1-34  (99467-99500)   97% ->
35-130  (100002-100097)   98% ->
131-1593  (109905-111367)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTCGTGG         GTATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||>>>...>>>|||||||
  99467 ATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTTGTGGGTG...CAGGTATTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGCCTCTAAGCCAGACCTGATCACCTGTCTGGAGCAAGGAAAAGAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 TGCCTCTAAGCCAGACCTGATCACCTGTCTGGAGCAAGGAAAAGAACCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAATGTGAAGAGACATGAGATGGTAGCTGAACCCCCAG         TT
        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||>>>...>>>||
 100059 GGAATGTGAAGAGACATGAGATGGTAACTGAACCCCCAGGTA...CAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTATGTTCTTATTTTGCCCGAGACCTTTGGCCAAAGCAGGGCAAAAAAAA
        |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 109907 GTATATTCTTATTTTGCCCAAGACCTTTGGCCAAAGCAGGGCAAAAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTATTTCCAAAAAGTGATACTGAGAAGATATAAAAAATGTGGATGTGAAA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
 109957 TTATTTCCAAAAAGTGATACTGAGAACATATAAAAAATGTGGACGTGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTTACAGTTAAGAAAATACTGTAAAAGCATGGATGAGTGTAAGGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110007 ATTTACAGTTAAGAAAATACTGTAAAAGCATGGATGAGTGTAAGGTGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAGAATGTTACAATGGACTTAACCAGTGTTTGACGACTACCCAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 110057 AAAGAATGTTACAATGGACTTAACCAGTGTTTGACAACTACCCAGAACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AATATTTCAATGTGACAAATATGTGAAAGTCTTTCATAAATTTTCAAATT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110107 AATATTTCAATATGACAAATATGTGAAAGTCTTTCATAAATTTTCAAATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAAACAGACATACGATAAGACATACTGGAAAGAAATCTTTCAAATGTAAA
        |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
 110157 CAAACAGACATAAGATAGGACATACTGGAAAGAAATCTTTCAAGTGTAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAATGTGAAAAGTCATTTTGCATGCTTTCACACTTAGCTCAACATAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110207 GAATGTGAAAAGTCATTTTGCATGCTTTCACACTTAGCTCAACATAAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AATTCATAGTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAAAGAATGTGGGAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110257 AATTCATAGTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAAAGAATGTGGGAAAGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATAATGAGACCTCAAACCTTTCTACACATAAAAGAATTCATACTGGAAAG
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110307 ATAATGAGGCCTCAAACCTTTCTACACATAAAAGAATTCATACTGGAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAACCCTACAAATGCGAAGAGTGTGGAAAAGCCTTTAACCGGCTCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110357 AAACCCTACAAATGCGAAGAGTGTGGAAAAGCCTTTAACCGGCTCTCACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTTACTACACATAAGATAATTCATACTGGAAAGAAACCCTACAAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110407 CCTTACTACACATAAGATAATTCATACTGGAAAGAAACCCTACAAATGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGGAGTGTGGCAAAGCTTTTAACCAATCTGCAAACCTTACTACACATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110457 AGGAGTGTGGCAAAGCTTTTAACCAATCTGCAAACCTTACTACACATAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110507 AGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAGAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TTTTAGCCAGTCCTCAACCCTTACTGCACATAAGATAATTCATGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110557 TTTTAGCCAGTCCTCAACCCTTACTGCACATAAGATAATTCATGCTGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AGAAACCTTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAGCCAGTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110607 AGAAACCTTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAGCCAGTCCTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ACCCTTACTACACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAATTCTACAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110657 ACCCTTACTACACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAATTCTACAAATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGAAGAATGTGGTAAGGCCTTTAGCCAGTTATCCCACCTTACTACACATA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 110707 TGAAGAATGTGGTAAGGCCTTTAGCCGGTTATCCCACCTTACTACACATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGAGAATTCATTCTGGAGAGAAACCCTACAAGTGTGAAGAATGTGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110757 AGAGAATTCATTCTGGAGAGAAACCCTACAAGTGTGAAGAATGTGGCAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GCTTTTAAACAATCCTCAACCCTTACTACACATAAGAGAATTCATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110807 GCTTTTAAACAATCCTCAACCCTTACTACACATAAGAGAATTCATGCTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGAGAAATTCTACAAATGTGAAGTATGTAGCAAAGCCTTTAGCCGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110857 AGAGAAATTCTACAAATGTGAAGTATGTAGCAAAGCCTTTAGCCGGTTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CACACCTTACTACACATAAGAGAATTCATACTGGAGAGAAGCCCTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110907 CACACCTTACTACACATAAGAGAATTCATACTGGAGAGAAGCCCTACAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCTATCGTCACAACTTACTACACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 110957 TGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCTATCATCACAACTTACTACACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111007 TAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AAGCTTTTAACCAGTCCTCAACTCTTTCTAAACATAAGGTAATTCATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111057 AAGCTTTTAACCAGTCCTCAACTCTTTCTAAACATAAGGTAATTCATACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GGAGAGAAGCCCTACAAATATGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCAGTC
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 111107 GGAGAGAAGCCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCAGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 CTCACACCTTACTACACATAAGATGATTCATACTGGAGAGAAACCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111157 CTCACACCTTACTACACATAAGATGATTCATACTGGAGAGAAACCCTACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AGTGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACAACTCCTCTATTCTTAACAGA
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111207 AGTGTGAAGAATGCGGCAAAGCCTTTAACAACTCCTCTATTCTTAACAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 CATAAGATGATTCATACTGGAGAGAAACTCTACAAACCTGAAAGTTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111257 CATAAGATGATTCATACTGGAGAGAAACTCTACAAACCTGAAAGTTGTAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 CAATGCTTGTGACAACATTGCAAAGATTTCCAAATATAAAAGAAATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111307 CAATGCTTGTGACAACATTGCAAAGATTTCCAAATATAAAAGAAATTGTG

   1600     .    :
   1583 CTGGTGAGAAA
        |||||||||||
 111357 CTGGTGAGAAA