seq1 = pF1KSDA1465.tfa, 2235 bp
seq2 = pF1KSDA1465/gi568815583f_74032755.tfa (gi568815583f:74032755_74234989), 202235 bp

>pF1KSDA1465 2235
>gi568815583f:74032755_74234989 (Chr15)

1-2235  (100001-102235)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCCCCCTTCGGGCCCTGTGGTTGGTCTGGGCGCTTCTAGGAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCCCCCTTCGGGCCCTGTGGTTGGTCTGGGCGCTTCTAGGAGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGATCATGCCCGGAGCCGTGCGCCTGCGTGGACAAGTACGCTCACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGATCATGCCCGGAGCCGTGCGCCTGCGTGGACAAGTACGCTCACCAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGCGGACTGCGCTTACAAAGAGTTGCGTGAGGTGCCGGAAGGACTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGCGGACTGCGCTTACAAAGAGTTGCGTGAGGTGCCGGAAGGACTGCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAACGTGACGACGCTTAGTCTGTCCGCGAACAAGATCACTGTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAACGTGACGACGCTTAGTCTGTCCGCGAACAAGATCACTGTGCTGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCGGGGCCTTCGCCGACGTCACACAGGTCACGTCGCTGTGGCTGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCGGGGCCTTCGCCGACGTCACACAGGTCACGTCGCTGTGGCTGGCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAATGAGGTGCGCACCGTGGAGCCAGGCGCACTGGCCGTGCTGAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAATGAGGTGCGCACCGTGGAGCCAGGCGCACTGGCCGTGCTGAGTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCAAGAACCTCGATCTGAGCCACAACTTCATATCCAGCTTTCCGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCAAGAACCTCGATCTGAGCCACAACTTCATATCCAGCTTTCCGTGGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGACCTGCGCAACCTGAGCGCGCTGCAGCTGCTCAAAATGAACCACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGACCTGCGCAACCTGAGCGCGCTGCAGCTGCTCAAAATGAACCACAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCTGGGCTCTCTGCCCCGGGACGCACTCGGTGCGCTACCCGACCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCTGGGCTCTCTGCCCCGGGACGCACTCGGTGCGCTACCCGACCTGCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCCTGCGCATCAACAACAACCGGCTGCGTACGCTGGCGCCTGGCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCCTGCGCATCAACAACAACCGGCTGCGTACGCTGGCGCCTGGCACCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGACGCGCTTAGCGCGCTGTCACACTTGCAACTCTATCACAATCCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGACGCGCTTAGCGCGCTGTCACACTTGCAACTCTATCACAATCCCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTGCGGCTGCGGCCTTGTGTGGCTGCAGGCCTGGGCCGCGAGCACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTGCGGCTGCGGCCTTGTGTGGCTGCAGGCCTGGGCCGCGAGCACCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGTCCTTACCCGAGCCCGACTCCATTGCTTGTGCCTCGCCTCCCGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGTCCTTACCCGAGCCCGACTCCATTGCTTGTGCCTCGCCTCCCGCGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCAGGGGGTGCCGGTGTACCGCCTGCCCGCCCTGCCCTGTGCACCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCAGGGGGTGCCGGTGTACCGCCTGCCCGCCCTGCCCTGTGCACCGCCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCGTGCATCTGAGTGCCGAGCCACCGCTTGAAGCACCCGGCACCCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCGTGCATCTGAGTGCCGAGCCACCGCTTGAAGCACCCGGCACCCCACTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGCGCAGGACTGGCGTTCGTGTTACACTGCATCGCCGACGGCCACCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGCGCAGGACTGGCGTTCGTGTTACACTGCATCGCCGACGGCCACCCTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCCTCGCCTGCAATGGCAACTTCAGATCCCCGGTGGCACCGTAGTCTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCCTCGCCTGCAATGGCAACTTCAGATCCCCGGTGGCACCGTAGTCTTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGCCACCGGTTCTGAGCGGGGAGGACGACGGGGTTGGGGCGGAGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGCCACCGGTTCTGAGCGGGGAGGACGACGGGGTTGGGGCGGAGGAAGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGGGAGAAGGAGATGGGGATTTGCTGACGCAGACCCAAGCCCAAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGGGAGAAGGAGATGGGGATTTGCTGACGCAGACCCAAGCCCAAACGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GACTCCAGCACCCGCTTGGCCGGCGCCCCCAGCCACACCGCGCTTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GACTCCAGCACCCGCTTGGCCGGCGCCCCCAGCCACACCGCGCTTCCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCCTCGCAAATGGCTCCCTGTTGGTGCCCCTCCTGAGTGCCAAGGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCCTCGCAAATGGCTCCCTGTTGGTGCCCCTCCTGAGTGCCAAGGAGGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGCGTCTACACTTGCCGTGCACACAATGAGCTGGGCGCCAACTCTACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGCGTCTACACTTGCCGTGCACACAATGAGCTGGGCGCCAACTCTACGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AATACGCGTGGCGGTGGCAGCAACCGGGCCCCCAAAACACGCGCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AATACGCGTGGCGGTGGCAGCAACCGGGCCCCCAAAACACGCGCCTGGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCGGGGGAGAACCCGACGGACAGGCCCCGACCTCTGAGCGCAAGTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CCGGGGGAGAACCCGACGGACAGGCCCCGACCTCTGAGCGCAAGTCCACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GCCAAGGGCCGGGGCAACAGCGTCCTGCCTTCCAAACCCGAGGGCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GCCAAGGGCCGGGGCAACAGCGTCCTGCCTTCCAAACCCGAGGGCAAAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CAAAGGCCAAGGCCTGGCCAAGGTCAGCATTCTCGGGGAGACCGAGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CAAAGGCCAAGGCCTGGCCAAGGTCAGCATTCTCGGGGAGACCGAGACGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGCCGGAGGAGGACACAAGTGAGGGAGAGGAGGCCGAAGACCAGATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGCCGGAGGAGGACACAAGTGAGGGAGAGGAGGCCGAAGACCAGATCCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCGGACCCGGCGGAGGAGCAGCGCTGTGGCAACGGGGACCCCTCTCGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GCGGACCCGGCGGAGGAGCAGCGCTGTGGCAACGGGGACCCCTCTCGGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CGTTTCTAACCACGCGTTCAACCAGAGCGCAGAGCTCAAGCCGCACGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CGTTTCTAACCACGCGTTCAACCAGAGCGCAGAGCTCAAGCCGCACGTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TCGAGCTGGGCGTCATCGCGCTGGATGTGGCGGAGCGCGAGGCGCGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TCGAGCTGGGCGTCATCGCGCTGGATGTGGCGGAGCGCGAGGCGCGGGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CAGCTGACTCCGCTGGCTGCGCGCTGGGGCCCTGGGCCCGGCGGGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CAGCTGACTCCGCTGGCTGCGCGCTGGGGCCCTGGGCCCGGCGGGGCTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CGGAGCCCCGCGACCCGGGCGGCGACCCCTGCGCCTACTCTATCTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CGGAGCCCCGCGACCCGGGCGGCGACCCCTGCGCCTACTCTATCTGTGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CAGCGGGGGGCGGCGCGGCAGTGCAGTGGTCCCGCGTAGAGGAAGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CAGCGGGGGGCGGCGCGGCAGTGCAGTGGTCCCGCGTAGAGGAAGGCGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AACGCCTACTGGTTCCGCGGCCTGCGGCCGGGTACCAACTACTCCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AACGCCTACTGGTTCCGCGGCCTGCGGCCGGGTACCAACTACTCCGTGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CCTGGCGCTGGCGGGCGAAGCCTGCCACGTGCAAGTGGTGTTTTCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CCTGGCGCTGGCGGGCGAAGCCTGCCACGTGCAAGTGGTGTTTTCCACCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AGAAGGAGCTCCCATCGCTGCTGGTCATAGTGGCAGTGAGCGTATTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AGAAGGAGCTCCCATCGCTGCTGGTCATAGTGGCAGTGAGCGTATTCCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CTGGTGCTGGCCACAGTGCCCCTTCTGGGCGCCGCCTGCTGCCATCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CTGGTGCTGGCCACAGTGCCCCTTCTGGGCGCCGCCTGCTGCCATCTGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GGCTAAACACCCGGGCAAGCCCTACCGTCTGATCCTGCGGCCTCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GGCTAAACACCCGGGCAAGCCCTACCGTCTGATCCTGCGGCCTCAGGCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CTGACCCTATGGAGAAGCGCATCGCCGCAGACTTCGACCCGCGTGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CTGACCCTATGGAGAAGCGCATCGCCGCAGACTTCGACCCGCGTGCTTCG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 TACCTCGAGTCCGAGAAAAGCTACCCGGCAGGCGGCGAGGCGGGCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 TACCTCGAGTCCGAGAAAAGCTACCCGGCAGGCGGCGAGGCGGGCGGCGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 GGAGCCAGAGGACGTGCAGGGGGAGGGCCTTGATGAAGACGCGGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GGAGCCAGAGGACGTGCAGGGGGAGGGCCTTGATGAAGACGCGGAGCAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 GAGACCCAAGTGGGGACCTGCAGAGAGAGGAGAGCCTGGCGGCCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 GAGACCCAAGTGGGGACCTGCAGAGAGAGGAGAGCCTGGCGGCCTGCTCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 CTGGTGGAGTCCCAGTCCAAGGCCAACCAAGAGGAGTTCGAGGCGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 CTGGTGGAGTCCCAGTCCAAGGCCAACCAAGAGGAGTTCGAGGCGGGCTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 TGAGTACAGCGATCGGCTGCCCCTGGGCGCCGAGGCGGTCAACATCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 TGAGTACAGCGATCGGCTGCCCCTGGGCGCCGAGGCGGTCAACATCGCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .
   2201 AGGAGATTAATGGCAACTACAGGCAGACGGCAGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 AGGAGATTAATGGCAACTACAGGCAGACGGCAGGC