seq1 = pF1KSDA1445.tfa, 3453 bp
seq2 = pF1KSDA1445/gi568815595r_122810146.tfa (gi568815595r:122810146_123061263), 251118 bp

>pF1KSDA1445 3453
>gi568815595r:122810146_123061263 (Chr3)

(complement)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-328  (112555-112758)   100% ->
329-428  (117729-117828)   100% ->
429-474  (121794-121839)   100% ->
475-537  (132206-132268)   100% ->
538-636  (132649-132747)   100% ->
637-850  (133261-133474)   99% ->
851-1136  (134587-134872)   99% ->
1137-1272  (137512-137647)   100% ->
1273-1480  (138817-139024)   100% ->
1481-1688  (139142-139349)   100% ->
1689-1806  (145374-145491)   100% ->
1807-1988  (145643-145824)   100% ->
1989-2132  (147263-147406)   100% ->
2133-2280  (147583-147730)   100% ->
2281-2506  (147840-148065)   100% ->
2507-2725  (148203-148421)   99% ->
2726-2896  (148922-149092)   100% ->
2897-3046  (149195-149344)   100% ->
3047-3091  (149729-149773)   97% ->
3092-3297  (150219-150424)   100% ->
3298-3453  (150963-151118)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTGTGGCTTCAGTCCGTCTCCTGTTGCCCACCACCTCGTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCTGTGGCTTCAGTCCGTCTCCTGTTGCCCACCACCTCGTCCCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCCTGATACCCCAGCCCAACAGCTAAGGTGTGGATGGACAGTAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGCCTGATACCCCAGCCCAACAGCTAAGGTGTGGATGGACAGTAGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTGGCTTCTCTCACTGGTCAGGG         GTCTTCTCCCCTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 GCTGGCTTCTCTCACTGGTCAGGGGTA...CAGGTCTTCTCCCCTGTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTCCCGGAGCTAGGACTGCAGAGGGGCCTATCATGGTGCTTGCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112572 CCTCCCGGAGCTAGGACTGCAGAGGGGCCTATCATGGTGCTTGCAGGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGGCTGTCTCGCTGTTGCTGCCCAGCCTCACACTGCTGGTGTCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112622 CCTGGCTGTCTCGCTGTTGCTGCCCAGCCTCACACTGCTGGTGTCCCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTCCAGCTCCCAGGATGTCTCCAGTGAGCCCAGCAGTGAGCAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112672 TCTCCAGCTCCCAGGATGTCTCCAGTGAGCCCAGCAGTGAGCAGCAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCGCCCTTAGCAAGCACCCCACCGTGGCCTTTGAAG         ACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 112722 TGCGCCCTTAGCAAGCACCCCACCGTGGCCTTTGAAGGTA...CAGACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGCCGTGGGTCTCTAACTTCACCTACCCTGGAGCCCGGGATTTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117733 GCAGCCGTGGGTCTCTAACTTCACCTACCCTGGAGCCCGGGATTTCTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCTGGCTTTGGACCCCTCCGGGAACCAGCTCATCGTGGGAGCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 117783 AGCTGGCTTTGGACCCCTCCGGGAACCAGCTCATCGTGGGAGCCAGGTA.

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    429      GAACTACCTCTTCAGACTCAGCCTTGCCAATGTCTCTCTTCTTCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117833 ..CAGGAACTACCTCTTCAGACTCAGCCTTGCCAATGTCTCTCTTCTTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 G         GCCACAGAGTGGGCCTCCAGTGAGGACACGCGCCGCTCCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121839 GGTA...CAGGCCACAGAGTGGGCCTCCAGTGAGGACACGCGCCGCTCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCCAAAGCAAAGGGAAGACTGAG         GAGGAGTGTCAGAACTAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 132246 GCCAAAGCAAAGGGAAGACTGAGGTA...CAGGAGGAGTGTCAGAACTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTGCGAGTCCTGATCGTCGCCGGCCGGAAGGTGTTCATGTGTGGAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132667 GTGCGAGTCCTGATCGTCGCCGGCCGGAAGGTGTTCATGTGTGGAACCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGCCTTTTCCCCCATGTGCACCAGCAGACAG         GTGGGGAACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 132717 TGCCTTTTCCCCCATGTGCACCAGCAGACAGGTG...CAGGTGGGGAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCAGCCGGACTACTGAGAAGATCAATGGTGTGGCCCGCTGCCCCTATGAC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133271 TCAGCCGGACTATTGAGAAGATCAATGGTGTGGCCCGCTGCCCCTATGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCACGCCACAACTCCACAGCTGTCATCTCCTCCCAGGGGGAGCTCTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133321 CCACGCCACAACTCCACAGCTGTCATCTCCTCCCAGGGGGAGCTCTATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGCCACGGTCATCGACTTCTCAGGTCGGGACCCTGCCATCTACCGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133371 AGCCACGGTCATCGACTTCTCAGGTCGGGACCCTGCCATCTACCGCAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGGCAGTGGGCCACCGCTTCGCACTGCCCAATATAACTCCAAGTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133421 TGGGCAGTGGGCCACCGCTTCGCACTGCCCAATATAACTCCAAGTGGCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AATG         AGCCAAACTTCGTGGCAGCCTATGATATTGGGCTGTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133471 AATGGTA...CAGAGCCAAACTTCGTGGCAGCCTATGATATTGGGCTGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGCATACTTCTTCCTGCGGGAGAACGCAGTGGAGCACGACTGTGGACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134624 TGCATACTTCTTCCTGCGGGAGAACGCAGTGGAGCACGACTGTGGACGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCGTGTACTCTCGCGTGGCCCGCGTGTGCAAGAATGACGTGGGGGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134674 CCGTGTACTCTCGCGTGGCCCGCGTGTGCAAGAATGACGTGGGGGGCCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTCCTGCTGGAGGACACATGGACCACATTCATGAAGGCCCGGCTCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134724 TTCCTGCTGGAGGACACATGGACCACATTCATGAAGGCCCGGCTCAACTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTCCCGCCCGGGCGAGGTCCCCTTCTACTATAACGAGCTGCAGAGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134774 CTCCCGCCCGGGCGAGGTCCCCTTCTACTATAACGAGCTGCAGAGTGCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCCACTTGCCAGAGCAGGACCTCATCTATGGAGTTTTCACAACCAACGT 
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 134824 TCCACTTGCCGGAGCAGGACCTCATCTATGGAGTTTTCACAACCAACGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1137         AAACAGCATCGCGGCTTCTGCTGTCTGCGCCTTCAACCTCAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134874 TG...CAGAAACAGCATCGCGGCTTCTGCTGTCTGCGCCTTCAACCTCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGCTATCTCCCAGGCTTTCAATGGCCCATTTCGCTACCAGGAGAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137554 TGCTATCTCCCAGGCTTTCAATGGCCCATTTCGCTACCAGGAGAACCCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GGGCTGCCTGGCTCCCCATAGCCAACCCCATCCCCAATTTCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 137604 GGGCTGCCTGGCTCCCCATAGCCAACCCCATCCCCAATTTCCAGGTA...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1273    TGTGGCACCCTGCCTGAGACCGGTCCCAACGAGAACCTGACGGAGCG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138814 CAGTGTGGCACCCTGCCTGAGACCGGTCCCAACGAGAACCTGACGGAGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CAGCCTGCAGGACGCGCAGCGCCTCTTCCTGATGAGCGAGGCCGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138864 CAGCCTGCAGGACGCGCAGCGCCTCTTCCTGATGAGCGAGGCCGTGCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CGGTGACACCCGAGCCCTGTGTCACCCAGGACAGCGTGCGCTTCTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138914 CGGTGACACCCGAGCCCTGTGTCACCCAGGACAGCGTGCGCTTCTCACAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CTCGTGGTGGACCTGGTGCAGGCTAAAGACACGCTCTACCATGTACTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138964 CTCGTGGTGGACCTGGTGCAGGCTAAAGACACGCTCTACCATGTACTCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CATTGGCACCG         AGTCGGGCACCATCCTGAAGGCGCTGTCCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 139014 CATTGGCACCGGTG...CAGAGTCGGGCACCATCCTGAAGGCGCTGTCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CGGCGAGCCGCAGCCTCCACGGCTGCTACCTGGAGGAGCTGCACGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139172 CGGCGAGCCGCAGCCTCCACGGCTGCTACCTGGAGGAGCTGCACGTGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CCCCCCGGGCGCCGCGAGCCCCTGCGCAGCCTGCGCATCCTGCACAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139222 CCCCCCGGGCGCCGCGAGCCCCTGCGCAGCCTGCGCATCCTGCACAGCGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CCGCGCGCTCTTCGTGGGGCTGAGAGACGGCGTCCTGCGGGTCCCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139272 CCGCGCGCTCTTCGTGGGGCTGAGAGACGGCGTCCTGCGGGTCCCACTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AGAGGTGCGCCGCCTACCGCAGCCAGGG         GGCATGCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 139322 AGAGGTGCGCCGCCTACCGCAGCCAGGGGTA...CAGGGCATGCCTGGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GCCCGGGACCCGTACTGTGGCTGGGACGGGAAGCAGCAACGTTGCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145387 GCCCGGGACCCGTACTGTGGCTGGGACGGGAAGCAGCAACGTTGCAGCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 ACTCGAGGACAGCTCCAACATGAGCCTCTGGACCCAGAACATCACCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145437 ACTCGAGGACAGCTCCAACATGAGCCTCTGGACCCAGAACATCACCGCCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 GTCCT         GTGCGGAATGTGACACGGGATGGGGGCTTCGGCCCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145487 GTCCTGTG...CAGGTGCGGAATGTGACACGGGATGGGGGCTTCGGCCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TGGTCACCATGGCAACCATGTGAGCACTTGGATGGGGACAACTCAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145679 TGGTCACCATGGCAACCATGTGAGCACTTGGATGGGGACAACTCAGGCTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TTGCCTGTGTCGAGCTCGATCCTGTGATTCCCCTCGACCCCGCTGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145729 TTGCCTGTGTCGAGCTCGATCCTGTGATTCCCCTCGACCCCGCTGTGGGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 GCCTTGACTGCCTGGGGCCAGCCATCCACATCGCCAACTGCTCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 145779 GCCTTGACTGCCTGGGGCCAGCCATCCACATCGCCAACTGCTCCAGGTA.

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989      GAATGGGGCGTGGACCCCGTGGTCATCGTGGGCGCTGTGCAGCAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145829 ..CAGGAATGGGGCGTGGACCCCGTGGTCATCGTGGGCGCTGTGCAGCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GTCCTGTGGCATCGGCTTCCAGGTCCGCCAGCGAAGTTGCAGCAACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147308 GTCCTGTGGCATCGGCTTCCAGGTCCGCCAGCGAAGTTGCAGCAACCCTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 CTCCCCGCCACGGGGGCCGCATCTGCGTGGGCAAGAGCCGGGAGGAACG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 147358 CTCCCCGCCACGGGGGCCGCATCTGCGTGGGCAAGAGCCGGGAGGAACGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2133         GTTCTGTAATGAGAACACGCCTTGCCCGGTGCCCATCTTCTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147408 TG...CAGGTTCTGTAATGAGAACACGCCTTGCCCGGTGCCCATCTTCTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GGCTTCCTGGGGCTCCTGGAGCAAGTGCAGCAGCAACTGTGGAGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147625 GGCTTCCTGGGGCTCCTGGAGCAAGTGCAGCAGCAACTGTGGAGGGGGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 TGCAGTCGCGGCGTCGGGCCTGCGAGAACGGCAACTCCTGCCTGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147675 TGCAGTCGCGGCGTCGGGCCTGCGAGAACGGCAACTCCTGCCTGGGCTGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 GGCGTG         GAGTTCAAGACGTGCAACCCCGAGGGCTGCCCCGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147725 GGCGTGGTG...CAGGAGTTCAAGACGTGCAACCCCGAGGGCTGCCCCGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 AGTGCGGCGCAACACCCCCTGGACGCCGTGGCTGCCCGTGAACGTGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147875 AGTGCGGCGCAACACCCCCTGGACGCCGTGGCTGCCCGTGAACGTGACGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 AGGGCGGGGCACGGCAGGAGCAGCGGTTCCGCTTCACCTGCCGCGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147925 AGGGCGGGGCACGGCAGGAGCAGCGGTTCCGCTTCACCTGCCGCGCGCCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 CTTGCAGACCCGCACGGCCTGCAGTTCGGCAGGAGAAGGACCGAGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147975 CTTGCAGACCCGCACGGCCTGCAGTTCGGCAGGAGAAGGACCGAGACGAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 GACCTGTCCCGCGGACGGCTCCGGCTCCTGCGACACCGACG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 148025 GACCTGTCCCGCGGACGGCTCCGGCTCCTGCGACACCGACGGTA...CAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 CCCTGGTGGAGGACCTCCTGCGCAGCGGGAGCACCTCCCCGCACACGGTG
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148203 CCCTGGTGGAGGTCCTCCTGCGCAGCGGGAGCACCTCCCCGCACACGGTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 AGCGGGGGCTGGGCCGCCTGGGGCCCGTGGTCGTCCTGCTCCCGGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148253 AGCGGGGGCTGGGCCGCCTGGGGCCCGTGGTCGTCCTGCTCCCGGGACTG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 CGAGCTGGGCTTCCGCGTCCGCAAGAGAACGTGCACTAACCCGGAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148303 CGAGCTGGGCTTCCGCGTCCGCAAGAGAACGTGCACTAACCCGGAGCCCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 GCAACGGGGGCCTGCCCTGCGTGGGCGATGCTGCCGAGTACCAGGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148353 GCAACGGGGGCCTGCCCTGCGTGGGCGATGCTGCCGAGTACCAGGACTGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 AACCCCCAGGCTTGCCCAG         TTCGGGGTGCTTGGTCCTGCTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 148403 AACCCCCAGGCTTGCCCAGGTA...CAGTTCGGGGTGCTTGGTCCTGCTG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 GACCTCATGGTCTCCATGCTCAGCTTCCTGTGGTGGGGGTCACTATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148944 GACCTCATGGTCTCCATGCTCAGCTTCCTGTGGTGGGGGTCACTATCAAC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 GCACCCGTTCCTGCACCAGCCCCGCACCCTCCCCAGGTGAGGACATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148994 GCACCCGTTCCTGCACCAGCCCCGCACCCTCCCCAGGTGAGGACATCTGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 CTCGGGCTGCACACGGAGGAGGCACTATGTGCCACACAGGCCTGCCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 149044 CTCGGGCTGCACACGGAGGAGGCACTATGTGCCACACAGGCCTGCCCAGG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2897         AAGGCTGGTCGCCCTGGTCTGAGTGGAGTAAGTGCACTGACG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149094 TA...CAGAAGGCTGGTCGCCCTGGTCTGAGTGGAGTAAGTGCACTGACG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 ACGGAGCCCAGAGCCGAAGCCGGCACTGTGAGGAGCTCCTCCCAGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149237 ACGGAGCCCAGAGCCGAAGCCGGCACTGTGAGGAGCTCCTCCCAGGGTCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2989 AGCGCCTGTGCTGGAAACAGCAGCCAGAGCCGCCCCTGCCCCTACAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149287 AGCGCCTGTGCTGGAAACAGCAGCCAGAGCCGCCCCTGCCCCTACAGCGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3039 GATTCCCG         TCATCCTGCCAGCCTCCAGCATGGAGGAGGCCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 149337 GATTCCCGGTA...CAGTCATCCTGCCAGCCTCCAGCATGGAGGAGGCCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3080 CCGGCTGTGCAG         GGTTCAATCTCATCCACTTGGTGGCCACG
        ||| ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 149762 CCGACTGTGCAGGTA...TAGGGTTCAATCTCATCCACTTGGTGGCCACG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 GGCATCTCCTGCTTCTTGGGCTCTGGGCTCCTGACCCTAGCAGTGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150248 GGCATCTCCTGCTTCTTGGGCTCTGGGCTCCTGACCCTAGCAGTGTACCT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3171 GTCTTGCCAGCACTGCCAGCGTCAGTCCCAGGAGTCCACACTGGTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150298 GTCTTGCCAGCACTGCCAGCGTCAGTCCCAGGAGTCCACACTGGTCCATC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3221 CTGCCACCCCCAACCATTTGCACTACAAGGGCGGAGGCACCCCGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150348 CTGCCACCCCCAACCATTTGCACTACAAGGGCGGAGGCACCCCGAAGAAT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3271 GAAAAGTACACACCCATGGAATTCAAG         ACCCTGAACAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 150398 GAAAAGTACACACCCATGGAATTCAAGGTG...CAGACCCTGAACAAGAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3312 TAACTTGATCCCTGATGACAGAGCCAACTTCTACCCATTGCAGCAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150977 TAACTTGATCCCTGATGACAGAGCCAACTTCTACCCATTGCAGCAGACCA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3362 ATGTGTACACGACTACTTACTACCCAAGCCCCCTGAACAAACACAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151027 ATGTGTACACGACTACTTACTACCCAAGCCCCCTGAACAAACACAGCTTC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :
   3412 CGGCCCGAGGCCTCACCTGGACAACGGTGCTTCCCCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151077 CGGCCCGAGGCCTCACCTGGACAACGGTGCTTCCCCAACAGC